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Guía de instalación del subsistema ubuntu

By: Tere Parra

Contenido:

Sobre mí
Instalación del subsistema Ubuntu para windows 10
Instalación del subsistema Ubuntu para windows 11

1.Sobre mí

Me presento, mi nombre es Tere, actualmente me encuentro en el octavo semestre de la licenciatura en biología en la Universidad Autonoma de Yucatán (UADY), llevo aproximadamente dos años especializandome en bioinformática y seré la encargada de impartir este curso. En esta sección, me gustaría poder contarte un poco de mi trayectoria y experiencia en bioinformática.

Mi interés inicio cuando estaba en cuarto semestre de la licenciatura y gracias a la participación que tuve durante una competencia llamada Liga de diseño del concurso internacional de biología sintética o mejor conocida como: iGEM (International Genetically Engineered Machine). El objetivo de la competencia, era utilizar herramientas computacionales que respaldarán un futuro estudio de laboratorio, esto incluia diseñar primers, circuitos genéticos, plásmidos, analisis bioinformáticos, entre otros, todo de manera in silico. Para esta competencia, mi equipo y yo propusimos desarrollar un sistema bacteriano que fuera capaz de degradar compuestos azoicos del río Atoyac, Puebla. Nuestra pregunta era, ¿Cúales enzimas eran mejores para poder degradar este compuesto?. Por esta razón, tuve que aprender a programar y utilizar diferentes softwares bioinformáticos que comprobaran cual enzima tenía mejor afinidad por el compuesto tóxico. Gracias a un maravilloso equipo de trabajo, ganamos medalla de oro, una nominación al mejor enfoque en biología computacional y caracterizar una nueva enzima con la capacidad de degradar compuestos azoicos.

Más tarde, me converti en asesora principal de una startup llamada: Synthetic Biobots. Conformada por un grupo de chicos entusiasmados por participar en iGEM. Tras mucho esfuerzo, ganaron medalla de oro y llevaron su proyecto a Bostón, EUA. Ahora se encuentran desarrollando su ídea a lado de una empresa líder en biología sintetica, llamada Ginkgo Bioworks. Todo el proyecto lo elaboraron con mucho esfuerzo y utilizando únicamente herramientas bioinformáticas.

Para 2022 recibi una beca por parte de Let´s learn BioIT-School, después de quedar dentro del top 10 de candidatos para un intercambio en “Computer- Aided Drug Design”, tras presentar un examen en python y biología molecular. Este intercambio, en conjunto con una beca por parte del CONACYT, me han permitido desarrollarme en proyectos de investigación sobre Machine Learning, Inteligencia Artificial, Transcriptómica, genómica, proteomica, química computacional y bioinformática estructural. Mi trabajo de investigación reciente intenta comprender porque algunos pacientes con cáncer de páncreas mueren antes y otros después, especificamente, ¿qué factores influyen y determinan este suceso?. Para ello, he tenido que aprender a programar en bash, python y R, así como utilizar paquetes y librerias para realizar analisis másivos de datos transcriptómicos provenientes de pacientes con diferentes tipos de cáncer. Esto me ha permitido encontrar nuevos marcadores moleculares, dianas terapeuticas, oncogenes, entre otros.

Recientemente, me encuentro impartiendo clases a estudiantes de posgrado y de licenciatura. Tambíen, me estoy preparando para ir al Laboratorio Fred Hutchinson Cancer Center, ubicado en seattle, washington, EUA. Es por lo anteriormente mencionado que me gustaría agradecerles a ustedes, ya que parte del dinero recaudado de este curso, me servirá para comenzar mi vida en Seattle. Tambíen hago mención al Dr. Blanco Melo por confíar en mi, cubrir parte de los gastos y abrirme las puertas de su laboratorio

En fín, espero que este curso sea de su agrado y puedan consultarme ante cualquier duda.

Mi correo: demariterealvarado@gmail.com

Mi linkedin: https://www.linkedin.com/in/maria-teresa-alvarado-parra-303ab6166/

Nota: amo a los gatos, pero ellos no parecen hacerlo

Notas pre-clases.

En cada una de mis clases podrán acceder a resumenes, guías y ejercicios. Todos tendrán un formato como este y han sido hechas por mí. Cada una de estas guías y resumenes estan diseñadas para que puedas seguirme durante las clases y no te pierdas en ningún momento.

¿Puedes compartir estas guías? Por supuesto que sí. Solo recuerda citarme.

Ahora sí, instalemos el subsistema Ubuntu

Es importante mencionar que este subsistema está presente a partir de windows 10. Por tanto, las computadoras por debajo del 2016, no tienen acceso a este programa, pero no se preocupen. En caso de que esto suceda, les proporcionaré un tutorial para que puedan trabajar a partir de una maquina virtual. Si este es su caso, por favor, mandenme un correo.

Las personas que tienen una computadora Mac, por defecto ya tienen acceso a la terminal de UNIX y no será necesario descargar o modificar nada. Para entrar, solo busquen: Terminal y ¡listo!

Usuarios con Windows 10

Pasos:

Lo primer que hay que hacer es ir al menu de inicio de windows y entrar a configuración

Ahora entraremos a la sección de aplicaciones y caracteristicas

En la parte de abajo encontraras una sección que dice: Caracteristicas de los programas (programs and features) dale click.

Esto abrira otra ventana. En el lado izquiero encontraras una nueva sección con un ícono que dice: Activar o desactivar las caracteristicas de windows (Turn windows features on or of), le damos click y nos saldrá una ventana con muchas listas.

Le das palomita a la icono que dice: Subsistema de windows para linux y luego okey.

Cerramos todas las ventanas y nos vamos a la tienda de windows (microsoft store). Buscamos ubuntu y lo instalamos (instalar la primera opción que aparece en la imagen)

Una vez que se términe de instalar, abrimos el programa y esperamos a que cargue

Cuando termine de cargar te pedira un nombre de usuario.

Mi recomendación es que se pongan un nombre corto y lo apunten en una nota.

Importante: Linux solo acepta nombres escritos completamente en minusculas

De igual manera te pedira una contraseña.

Ojo: Parecera que no estas escribiendo, pero en realidad lo que hace ubuntu es ocultar esa contraseña (incluso de ti). Así que teclea con mucho cuidado tu contraseña y apuntalo en tus notas.

Ubuntu te pedira nuevamente esa contraseña, escribela de nuevo, tal cual como en la anterior. Si todo salió bien, la términal se mostrará así:

Perfecto, ahora estarás listo para el curso

Para usuarios con Windows 11

En el ménu de windows escribe: Activar o desactivar las caracteristicas de windows. De todas las listas, pon con una palomita a la que dice: Subsistema de windows para linux, y luego aprieta okey.

Abre Microsoft Store, busca ubuntu y descargalo