DADOS

dados=read.csv("C:/Users/Samsung/Documents/Doutorado CENA_USP/Aulas e disciplinas/Metodos agronomicos/Pratica 2/data.csv")
str(dados)
## 'data.frame':    6 obs. of  10 variables:
##  $ amostra      : chr  "A1" "A2" "A3" "A1" ...
##  $ grupo        : int  1 1 1 2 2 2
##  $ MF.fresca    : num  206 175 232 142 131 ...
##  $ MF.ms        : num  82 71.5 96.9 60.1 54.5 ...
##  $ FRACIO.fresca: num  60.7 53.1 60 43.2 35.9 ...
##  $ RSA          : num  19.3 19.8 19.4 15.1 12.5 ...
##  $ LFSA         : num  3.47 2.6 3.43 2.58 2.27 2.1
##  $ RA.fresca    : num  144.4 121.1 170.7 98.9 95.1 ...
##  $ RA.ms        : num  57.4 49.5 71.3 41.7 39.6 32.4
##  $ IAF.LI       : num  394 305 376 242 210 ...
dados

C - Área específica de folhas (AEF, cm2 g-1)

dados$AEF=dados$IAF.LI/dados$LFSA
dados

D - Proporção de folhas na sub-amostra (FSA)

dados$FSA=dados$LFSA/(dados$LFSA+dados$RSA)
dados

E - Peso seco da fração de folha na amostra (FA, g MS)

dados$FA=(dados$LFSA+dados$RSA+dados$RA.ms)*dados$FSA
dados

F - Área total de folhas na amostra (AFA, cm2)

dados$AFA=(dados$FA*dados$AEF)
dados

F - Área total de folhas na amostra (AFA, cm2)

dados$IAF=(dados$AFA/2500)
dados

Média

mean1=mean(dados[-c(4:6),]$IAF)
mean1
## [1] 0.5223502
mean2=mean(dados[-c(1:3),]$IAF)
mean2
## [1] 0.2993721
meangeral=mean(dados$IAF)
meangeral
## [1] 0.4108611

Desvio padrão

dp1=sd(dados[-c(4:6),]$IAF)
dp1
## [1] 0.1176421
dp2=sd(dados[-c(1:3),]$IAF)
dp2
## [1] 0.03208892
dpgeral=sd(dados$IAF)
dpgeral
## [1] 0.1444421

Coeficiente de variação

cv1=sd(dados[-c(4:6),]$IAF)/mean(dados[-c(4:6),]$IAF)*100
cv1
## [1] 22.52169
cv2=sd(dados[-c(1:3),]$IAF)/mean(dados[-c(1:3),]$IAF)*100
cv2
## [1] 10.71874
cvgeral=sd(dados$IAF)/mean(dados$IAF)*100
cvgeral
## [1] 35.15594

Anova e Tukey

library(emmeans)
mod = lm(IAF~grupo, data = dados)
anova(mod)
medias=emmeans(mod,~grupo)
pairs(medias)
##  contrast estimate     SE df t.ratio p.value
##  1 - 2       0.223 0.0704  4 3.167   0.0339
pwpp(medias)

multcomp::cld(medias)