差异基因筛选
- Differential expression
analysis:差异基因是在不同组织中表达发生明显变化的基因,是导致细胞状态发生变化的关键基因,
是表达谱分析的主要对象。
- 火山图: 火山图可用于展示两组样本间基因表达水平差异的分布状况。
横轴log2 fold change差异表达倍数(Fold Change值,简称FC,根据log2 fold
change值的正负判断这些基因的表达量是上升了还是下降了),差异越大的基因分布X轴在两端。
纵坐标用-log10
p-value表示,对P值进行-log10的转化,-log10(p-value=0.05)约等于1.30,(-log10(0.01))=2,可知纵轴越往上走P值越小,而P值越小表示越显著。所以我们进行-log10(p
-value)转化后,值越大就表示差异越显著。
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