Chapter 02: R Basics

軟體安裝順序

1. Revolution R Open Math Library
2. Revolution R Open (RRO)
3. GitHub Desktop
4. RStudio

RStudio教學與設定

RStudio教學

• RStudio - R軟體的整合式開發環境介面教學http://www.r-software.org/paper/rstudio-rruantidezhengheshikaifahuanjingjiemianjiaoxue

RStudio設定

• Tools –> Global Options:

  • General: 確認R版本、預設工作目錄、文字檔編碼方式

  • Appearance: 設定程式碼字型、字型大小、風格主題

  • Pane Layout: 設定四個子工作視窗要擺那些東西

  • Packages: 設定Packages從哪裡下載、從MRAN下載要關掉HTTPS

  • Git/SVN: 設定版本控制、Git.exe的檔案位址

  • Publishing: 發布App到網頁、設定shinyapps.io的帳號

R的Help文件與範例

• help (明確知道要看哪一個function的help時):

help(read.csv) # or ?(read.csv)

## starting httpd help server ... done

• help.search (搜尋關鍵字):

??read.csv # or help.search(read.csv)

• args(functionname) 查看某個frunction有哪些參數

args(read.csv)

## function (file, header = TRUE, sep = ",", quote = "\"", dec = ".", 
##     fill = TRUE, comment.char = "", ...) 
## NULL

• example (看function的程式範例):

example(read.table)

## 
## rd.tbl> ## using count.fields to handle unknown maximum number of fields
## rd.tbl> ## when fill = TRUE
## rd.tbl> test1 <- c(1:5, "6,7", "8,9,10")
## 
## rd.tbl> tf <- tempfile()
## 
## rd.tbl> writeLines(test1, tf)
## 
## rd.tbl> read.csv(tf, fill = TRUE) # 1 column
##   X1
## 1  2
## 2  3
## 3  4
## 4  5
## 5  6
## 6  7
## 7  8
## 8  9
## 9 10
## 
## rd.tbl> ncol <- max(count.fields(tf, sep = ","))
## 
## rd.tbl> read.csv(tf, fill = TRUE, header = FALSE,
## rd.tbl+          col.names = paste0("V", seq_len(ncol)))
##   V1 V2 V3
## 1  1 NA NA
## 2  2 NA NA
## 3  3 NA NA
## 4  4 NA NA
## 5  5 NA NA
## 6  6  7 NA
## 7  8  9 10
## 
## rd.tbl> unlink(tf)
## 
## rd.tbl> ## "Inline" data set, using text=
## rd.tbl> ## Notice that leading and trailing empty lines are auto-trimmed
## rd.tbl> 
## rd.tbl> read.table(header = TRUE, text = "
## rd.tbl+ a b
## rd.tbl+ 1 2
## rd.tbl+ 3 4
## rd.tbl+ ")
##   a b
## 1 1 2
## 2 3 4

• help(package = “packagename”) 關於套件的資訊

help(package = "base")

• vignette(package = “packagename”) 查看套件裡面有哪些附帶文件

vignette(package = "e1071")
#得知e1071套件中有一名為"svmdoc"的vignette
vignette("svmdoc")
#以PDF viewer開啟svmdoc說明黨

• 從rseek.org網站搜尋資訊

#RSiteSearch("read.csv")

• 終極搜尋，在所有套件中搜尋關鍵字

#install.packages("sos")
#library("sos")
#???acf

安裝R的Package

1. 從RStudio介面安裝:
   

2. 下指令安裝，並指定Repository(當預設的Repository沒有要求的Package或特定版本，而必須另外指定時):

#install.packages("rmarkdown", repos = "http://cran.us.r-project.org", type = "source")

3. 直接從GitHub安裝:

#require(devtools)
#install_github("wch/ggplot2")

R有6871個套件，我怎麼知道甚麼統計方法要用哪一個套件？

Ans: https://cran.r-project.org/web/views

#install.packages("ctv")
#library("ctv")
#install.views("TimeSeries")