Comunicando con Rmarkdown

Abstract

Este documento es una guía de Rmarkdown

Título 1

Título 2

Título 3

Título 4

texto en negritas

texto en negritas

texto en cursivas

texto en cursivas

Podemos escribir texto en color rojo

• Elemento 1

• Elemento 2

  • Elemento 2.1

  • Elemento 2.2

1. Elemento 1

2. Elemento 2

Texto alineado a la derecha

Para generar notas al pie de página¹

“Comprender las cosas que nos rodean es la mejor preparación para comprender las cosas que hay más allá.” —Hipatía

“Comprender las cosas que nos rodean es la mejor preparación para comprender las cosas que hay más allá.”

–Hipatía

Links y bibliografía

Visualizar más información de rmarkdown en Rmarkdown.

Para aprender R, les recomiendo el libro “R para ciencia de datos” de Wickham & Grolemund (2017).

Expresiones matemáticas

Ejemplo 1: Utilice integración por parte para evaluar la siguiennte integral \(\displaystyle\int x e^{x+5} dx\).

Ejemplo 2: Utilice integración por parte para evaluar la siguiennte integral \[\displaystyle\int xe^{x+5} dx\].

Muestra el código pero no lo ejecuta

# Media de largo y ancho de pétalos y sépalos de las flores por especie
flores %>% 
    group_by(Especie) %>% 
    drop_na() %>% 
    summarise(
        Largo_sep_media = mean(Largo.Sepalo),
        Ancho_sep_media = mean(Ancho.Sepalo),
        Largo_pet_media = mean(Largo.Petalo),
        Ancho_pet_media = mean(Ancho.Petalo))

No quiero mostrar el código pero lo ejecuta y no muestra los resultados

No se muestra el código, pero si los resultados:

## # A tibble: 3 × 5
##   Especie    Largo_sep_media Ancho_sep_media Largo_pet_media Ancho_pet_media
##   <fct>                <dbl>           <dbl>           <dbl>           <dbl>
## 1 setosa                5.01            3.43            1.46           0.246
## 2 versicolor            5.94            2.77            4.26           1.33 
## 3 virginica             6.59            2.97            5.55           2.03

Continua renderizando aunque el código muestre error

# Media de largo y ancho de pétalos y sépalos de las flores por especie
flores %>% 
    group_by(Especie) %>% 
    drop_na() %>% 
    summarise(
        Largo_sep_media = mean(Largo.Sepalo),
        Ancho_sep_media = mean(Ancho.Sepalo),
        Largo_pet_media = mean(Largo.Petalo),
        Ancho_pet_media = mean(Ancho.Petalo))

## # A tibble: 3 × 5
##   Especie    Largo_sep_media Ancho_sep_media Largo_pet_media Ancho_pet_media
##   <fct>                <dbl>           <dbl>           <dbl>           <dbl>
## 1 setosa                5.01            3.43            1.46           0.246
## 2 versicolor            5.94            2.77            4.26           1.33 
## 3 virginica             6.59            2.97            5.55           2.03

Cuando quiero que se muestre el código y los resultados

# Media de largo y ancho de pétalos y sépalos de las flores por especie
flores %>% 
    group_by(Especie) %>% 
    drop_na() %>% 
    summarise(
        Largo_sep_media = mean(Largo.Sepalo),
        Ancho_sep_media = mean(Ancho.Sepalo),
        Largo_pet_media = mean(Largo.Petalo),
        Ancho_pet_media = mean(Ancho.Petalo))

## # A tibble: 3 × 5
##   Especie    Largo_sep_media Ancho_sep_media Largo_pet_media Ancho_pet_media
##   <fct>                <dbl>           <dbl>           <dbl>           <dbl>
## 1 setosa                5.01            3.43            1.46           0.246
## 2 versicolor            5.94            2.77            4.26           1.33 
## 3 virginica             6.59            2.97            5.55           2.03

Tablas

Derecha	Izquierda	Default	Centro
12	12	12	12
123	123	123

kableExtra

t1 <- flores %>% 
    group_by(Especie) %>% 
    drop_na() %>% 
    summarise(
        Largo_sep_media = mean(Largo.Sepalo),
        Ancho_sep_media = mean(Ancho.Sepalo),
        Largo_pet_media = mean(Largo.Petalo),
        Ancho_pet_media = mean(Ancho.Petalo))

kable(t1, caption="Promedio de pétalos y sépalos por especie",align = "c")

Promedio de pétalos y sépalos por especie

Especie	Largo_sep_media	Ancho_sep_media	Largo_pet_media	Ancho_pet_media
setosa	5.006	3.428	1.462	0.246
versicolor	5.936	2.770	4.260	1.326
virginica	6.588	2.974	5.552	2.026

Imágenes

Rmarkdown de Allison Horst

Rmarkdown gráfico

Gráficos

flores %>% 
  ggplot(aes(x=Ancho.Sepalo, y=Largo.Sepalo)) +
  geom_point() + facet_wrap(vars(Especie), ncol = 1)

Código dentro de una línea

Podemos incluir código dentro del texto, por ejemplo:

Nuestra data flores contiene la información de nrow(flores) flores. Los pétalos de las 3 especies de flores descritas tienen una dimensión promedio de sus pétalos de 1.2 cm de ancho y 3.76 cm de largo.

Bibliografía

Wickham, H., & Grolemund, G. (2017). R for data science (2e). O’Reilly.

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1. Esta es una nota al pie↩︎