ANALIDE DE DADOS DE FAVA VERDE

Analise de variância Multivariada - Manova

Montagem dos dados:

DADOS_THE = read.table("TERESINA.csv", header = T, sep = ";", dec = ",")
DADOS_THI = read.table("TIANGUA.csv", header = T, sep = ";", dec = ",")
dados.geral = rbind(DADOS_THE,
                    DADOS_THI)
dados.geral$AMBIENTE = as.factor(dados.geral$AMBIENTE)
dados.geral$ACESSO = as.factor(dados.geral$ACESSO)
dados.geral$BLOC = as.factor(dados.geral$BLOC)

ANOVAS por variável:

anova.geral = manova(as.matrix(dados.geral[,4:10])~ ACESSO*AMBIENTE + BLOC%in%AMBIENTE, 
                     data = dados.geral)
summary.aov(anova.geral)
##  Response NDF :
##                 Df Sum Sq Mean Sq   F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11   4067     370   18.1764 5.734e-16 ***
## AMBIENTE         1  37052   37052 1821.6660 < 2.2e-16 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11    444      40    1.9854   0.04395 *  
## AMBIENTE:BLOC    6    134      22    1.0946   0.37498    
## Residuals       66   1342      20                        
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response NDM :
##                 Df  Sum Sq Mean Sq  F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11  4303.8   391.3   4.0032 0.0001757 ***
## AMBIENTE         1 17604.2 17604.2 180.1170 < 2.2e-16 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11  1059.8    96.3   0.9858 0.4682851    
## AMBIENTE:BLOC    6   266.8    44.5   0.4550 0.8388911    
## Residuals       66  6450.7    97.7                       
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response CVV :
##                 Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11 4043.3  367.57 24.4607 < 2.2e-16 ***
## AMBIENTE         1  988.0  988.04 65.7501 1.692e-11 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11  131.6   11.96  0.7960    0.6433    
## AMBIENTE:BLOC    6   46.4    7.74  0.5149    0.7949    
## Residuals       66  991.8   15.03                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response PVV :
##                 Df  Sum Sq Mean Sq  F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11 11242.3  1022.0  21.1009 < 2.2e-16 ***
## AMBIENTE         1  6588.7  6588.7 136.0317 < 2.2e-16 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11  4459.6   405.4   8.3703 5.473e-09 ***
## AMBIENTE:BLOC    6   348.6    58.1   1.1994    0.3177    
## Residuals       66  3196.7    48.4                       
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response NGV :
##                 Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11 1.1788  0.1072  1.4043    0.1921    
## AMBIENTE         1 3.3190  3.3190 43.4912 8.457e-09 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11 1.2051  0.1096  1.4356    0.1784    
## AMBIENTE:BLOC    6 0.1802  0.0300  0.3935    0.8807    
## Residuals       66 5.0367  0.0763                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response P100 :
##                 Df  Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11 24059.3 2187.21  7.9516 1.324e-08 ***
## AMBIENTE         1    97.2   97.18  0.3533   0.55428    
## ACESSO:AMBIENTE 11  1745.8  158.71  0.5770   0.84070    
## AMBIENTE:BLOC    6  3461.7  576.95  2.0975   0.06518 .  
## Residuals       66 18154.4  275.07                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
##  Response IG. :
##                 Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## ACESSO          11 5870.3  533.66 13.3532 6.120e-13 ***
## AMBIENTE         1 2150.4 2150.45 53.8082 4.090e-10 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11 3998.6  363.51  9.0956 1.245e-09 ***
## AMBIENTE:BLOC    6  172.6   28.77  0.7200    0.6349    
## Residuals       66 2637.7   39.97                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

MANOVA:

anova(anova.geral)
## Analysis of Variance Table
## 
##                 Df  Pillai approx F num Df den Df    Pr(>F)    
## (Intercept)      1 0.99897   8346.1      7     60 < 2.2e-16 ***
## ACESSO          11 3.12394      4.8     77    462 < 2.2e-16 ***
## AMBIENTE         1 0.98012    422.5      7     60 < 2.2e-16 ***
## ACESSO:AMBIENTE 11 1.62281      1.8     77    462 0.0001119 ***
## AMBIENTE:BLOC    6 0.64087      1.1     42    390 0.3003743    
## Residuals       66                                             
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

ANALISE DE CORRELAÇÃO CANÔNICA

Significância adotada = 5%

Correlação Canônica por ambiente:

library(MVar.pt)

Teresina:

cca.teresina = CCA(dados.geral[1:48,4:5], dados.geral[1:48,6:ncol(dados.geral)], test = "Bartlett")
cca.teresina$var.UV
##      Variancia % da Variancia % acumulada da Variancia
## U1V1 0.2546354       69.00952                 69.00952
## U2V2 0.1143505       30.99048                100.00000
cca.teresina$sigtest
##   Pares Canonicos Lambda de Wilks Qui-Quadrado aproximado
## 1            U1V1         0.66013                17.85858
## 2            U2V2         0.88565                 5.22166
##   Densidade Qui-Quadrado Grau de Liberdade Valor-p
## 1               18.30704                10  0.0574
## 2                9.48773                 4  0.2653
cca.teresina$corr.UV
##      Correlacao
## U1V1  0.5046141
## U2V2  0.3381576

Tianguá:

cca.tiangua = CCA(dados.geral[48:96,4:5], dados.geral[48:96,6:ncol(dados.geral)], test = "Bartlett")
cca.tiangua$var.UV
##      Variancia % da Variancia % acumulada da Variancia
## U1V1 0.1934261       58.29408                 58.29408
## U2V2 0.1383848       41.70592                100.00000
cca.tiangua$sigtest
##   Pares Canonicos Lambda de Wilks Qui-Quadrado aproximado
## 1            U1V1         0.69496                16.01188
## 2            U2V2         0.86162                 6.55365
##   Densidade Qui-Quadrado Grau de Liberdade Valor-p
## 1               18.30704                10 0.09929
## 2                9.48773                 4 0.16144
cca.tiangua$corr.UV
##      Correlacao
## U1V1  0.4398023
## U2V2  0.3720011

Correlação Canônica geral (Teresina e Tianguá):

cca.geral = CCA(dados.geral[,4:5], dados.geral[,6:ncol(dados.geral)], test = "Bartlett")
cca.geral$var.UV
##       Variancia % da Variancia % acumulada da Variancia
## U1V1 0.48161723         85.409                   85.409
## U2V2 0.08227792         14.591                  100.000
cca.geral$sigtest
##   Pares Canonicos Lambda de Wilks Qui-Quadrado aproximado
## 1            U1V1         0.47573                67.60409
## 2            U2V2         0.91772                 7.81332
##   Densidade Qui-Quadrado Grau de Liberdade Valor-p
## 1               18.30704                10 0.00000
## 2                9.48773                 4 0.09866
cca.geral$corr.UV
##      Correlacao
## U1V1  0.6939865
## U2V2  0.2868413