Actividades

Se carga la libreria “pylr”, se importa el archivo necesario para cargar los datos y se definen las variables para poder acceder al conjunto de datos a utilizar.

library("plyr")
source("cargar_datos.R")

nombre1= "NICOLAS ANTONIO RODRIGUEZ DIAZ"
nombre2= "SAMOTH GODOY MADUENO"

datos = cargar_datos(nombre1,nombre2)
knitr::kable(head(datos[,2:ncol(datos)]))
diagnostico comorbilidad sexo prom_edad ds_edad egreso DE freq
3rd Degree Sideburns Alien DNA Femenino 67 0.38 Alta 129 37
3rd Degree Sideburns Alien DNA Masculino 25 3.45 Alta 121 38
3rd Degree Sideburns Alien DNA Masculino 117 1.32 Fallecido(a) 71 3
3rd Degree Sideburns Alien DNA Otro 109 1.22 Alta 62 8
3rd Degree Sideburns Alien DNA Otro 73 4.10 Fallecido(a) 173 1
3rd Degree Sideburns Baldness Femenino 107 0.49 Alta 17 41

2.1 Describa cada una de las variables del conjunto de datos indicando su clasificación según tipo: medición y precisión.

Nombre hospital

presicion = politomica medicion = nominal

Diagnostico

presicion = politomica medicion = nominal

Comorbilidad

presicion = politomica medicion = ordinal

Sexo

presicion = politomica medicion = nominal

Prom_edad

presicion = discreta medicion = ratio

DS_edad

presicion = continua medicion = ratio

Egreso

presicion = dicotomica medicion = nominal

DE

presicion = discreta medicion = ratio

Freq

presicion = discreta medicion = ratio

2.2 Considerando la letalidad de los/las pacientes atendidos/atendidas en su establecimiento hospitalario:

1. ¿Cuál es la probabilidad que tiene un/una paciente de fallecer en su establecimiento hospitalario? Indique la tasa de mortalidad hospitalaria de su establecimiento.

Fallecidos = (datos[datos$egreso == "Fallecido(a)",])
ProbFall = nrow(Fallecidos)/nrow(datos)
ProbFall
## [1] 0.3270189

Por lo que la probabilidad que tiene un paciente de fallecer en el Hospital Dr. Frambuesa es de 0.3270189.

2. ¿Cuál es el diagnóstico principal que tienen mayor probabilidad de fallecimiento (letalidad) en su hospital según cada sexo biológico?

Se segmentan a los pacientes por el sexo

MFall = (Fallecidos[Fallecidos$sexo == "Masculino",])
FFall = (Fallecidos[Fallecidos$sexo == "Femenino",])
OFall = (Fallecidos[Fallecidos$sexo == "Otro",])

Se establecen los diagnósticos para determinar el con mayor probabilidad:

Enfermedades = c("3rd Degree Sideburns", "Broken Heart", "Broken Wind", "Chronic Nosehair", " Corrugated Ankles", "Discrete Itching", "Fake Blood", "Gastric Ejections", "Golf Stones", "Gut Rot", "Heaped Piles", "Infectious Laughter", "Invisibility", "Iron Lungs", "Kidney Beans", "King Complex", "Ruptured Nodules", "Sleeping Illness", "Spare Ribs", "Sweaty Palms", "The Squits", "Transparency", "TV Personalities", "Uncommon Cold", "Unexpected Swelling")

Ahora se encontrará el diagnóstico con mayor probabilidad de fallecimiento para todos los sexos de los pacientes.

Para el sexo masculino:

probM = 0
for (i in 1:25) {
  if ((nrow((MFall[MFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(MFall) > probM)
    probM=(nrow((MFall[MFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(MFall)
    
}
probM
## [1] 0.05442177
tabla_MFall = sort(table(MFall$diagnostico), decreasing=TRUE)[1]
EnfermedadMasLetalM = data.frame(tabla_MFall)
EnfermedadMasLetalM
##                  tabla_MFall
## Chronic Nosehair           8

Siendo el diagnóstico “Chronic Nosehair” el con mayor probabilidad de fallecimiento para el sexo masculino, con una probabilidad del 0.05442177.

Para el sexo femenino:

probF = 0
for (i in 1:25) {
  if ((nrow((FFall[FFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(FFall) > probF)
    probF=(nrow((FFall[FFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(FFall)
  
}
probF
## [1] 0.05185185
tabla_FFall = sort(table(FFall$diagnostico), decreasing=TRUE)[1]
EnfermedadMasLetalF = data.frame(tabla_FFall)
EnfermedadMasLetalF
##                      tabla_FFall
## 3rd Degree Sideburns           7

Siendo el diagnóstico “3rd Degree Sideburns” el con mayor probabilidad de fallecimiento para el sexo femenino, con una probabilidad del 0.05185185.

Para el sexo otro:

probO = 0
for (i in 1:25) {
  if ((nrow((OFall[OFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(OFall) > probO)
    probO=(nrow((OFall[OFall$diagnostico == Enfermedades[i],])))/nrow(OFall)
  
}
probO
## [1] 0.08695652
tabla_OFall = sort(table(OFall$diagnostico), decreasing=TRUE)[1]
EnfermedadMasLetalO = data.frame(tabla_OFall)
EnfermedadMasLetalO
##            tabla_OFall
## Fake Blood           4

Siendo el diagnóstico “Fake Blood” el con mayor probabilidad de fallecimiento para el sexo femenino, con una probabilidad del 0.08695652.

3. ¿Cuál es la comorbilidad que presenta mayor probabilidad de aparición en personas adultas fallecidas en su establecimiento hospitalario?

Se segmentan los pacientes por su mayoría de edad del dataframe de Fallecidos:

DieciochoFall = (Fallecidos[Fallecidos$prom_edad >= 18,])

Se encuentra el nombre de la comorbilidad con mayor frecuencia en personas fallecidas.

tablaCormoFall = sort(table(DieciochoFall$comorbilidad), decreasing=TRUE)[1] 
CormoMasLetal = data.frame(tablaCormoFall)
CormoMasLetal
##           tablaCormoFall
## Alien DNA             35

Siendo, la cormobilidad “Alien DNA”, estando presente en 35 pacientes. Luego se calcula su probabilidad de aparecer en el total de pacientes.

ComorMax = CormoMasLetal[1,1]
MaxProbComor = ComorMax/nrow(DieciochoFall)
MaxProbComor
## [1] 0.1202749

La comorbolidad “Alien DNA” es la más presente en personas adultas fallecidas en el Hospital, con un 0.1202749 de probabilidad de aparición.

4. Usando como base el diagnóstico principal con mayor probabilidad de fallecimiento (letalidad) en su hospital: ¿cuál es la probabilidad de que si el próximo año se hospitalizan 100 personas con esa patología, N de ellas fallezcan?

Se obtienen las frecuencias de los diagnósticos más común para las personas fallecidas:

tablaDiagFall = sort(table(Fallecidos$diagnostico), decreasing=TRUE)[1]
DiagnMasLetal = data.frame(tablaDiagFall)
DiagnMasLetal
##                  tablaDiagFall
## Sleeping Illness            18

Por lo que la enfermedad que presenta mayor cantidad de falleciedos es “Sleeping Illness”.

5. ¿Qué puede concluir de los resultados con relación a las características y gestión de su establecimiento hospitalario?

La tasa de mortabilidad en nuestro recinto hospitalario es mas alta que en el hosptal publico Padre Hurtado, lo que con lleva que poseemos la mayor tasa entre privados y publicos. Ademas las tasas del sector privado no superan los 10% por lo que los recursos y atencion para el sistema publico son totalmente desiguales y diferentes.En cuanto a las enfermedades mas mortales diferenciadas por sexo estan: Chronic Nosehair, 3rd Degree Sideburns y Fake Blood, ordenadas por Masculino, Femenino y Otro sea el caso. Ademàs que un paciente presente otra enfermedad aparte de la que ya posee es 0.1202749 (personas fallecidas) y la enfermedad es Alien DNA.

2.3 Considerando la estancia de los/las pacientes atendidos/atendidas en su establecimiento hospitalario:

1. ¿Cuál es el promedio de día de estadas (DE) de su establecimiento hospitalario?

total_de = sum(datos$DE) #Suma de la columna DE
columnas = nrow(datos) #Columnas totales del data.frame
prom = total_de/columnas #Calculo promedio
prom
## [1] 100.662

Por lo que el promedio de días de estadas del Hospital Dr. Frambuesa es de 100 (días).

2. ¿Cuál es la probabilidad de que un paciente pediátrico (menor a 18 años) sea dado de alta de la patología más frecuente después de 30 días de estada? Asuma en ambos casos una distribución normal y una desviación estándar típica de 0.2 para los DE.

#Patologia mas frecuente, menor 18 agnos y mayor a 30 dias de estadia

pediatricos = (datos[datos$prom_edad < 18,]) #Menor 18 agnos
mas_30 = (pediatricos[pediatricos$DE > 30,]) #Menor 18 agnos y mayor a 30 DE
tabla_mas30 = sort(table(mas_30$diagnostico), decreasing=TRUE)[1]
EnfermedadMasLetal = data.frame(tabla_mas30) #Enfermedad mas letal con menos a 18 agnos y mayor a 30 dias de DE
EnfermedadMasLetal
##              tabla_mas30
## King Complex           8
#frecuencia total
total_mas30 = nrow(pediatricos[pediatricos$DE > 30,]) #Total columnas mas de 30 dias DE y menor a 18 agnos 
total_mas30
## [1] 114
probabilidad = EnfermedadMasLetal[1,1] /total_mas30
probabilidad #Probabilidad
## [1] 0.07017544

La probabilidad de que un paciente pediátrico sea dado de alta posterior a los 30 días de estada corresponde a 0.07017544.

3. ¿Cuál es la probabilidad de que si usted es o ustedes son hospitalizados en su establecimiento hospitalario sean dados de alta antes de los 10 días? Al igual que el ejercicio anterior, asuma una distribución normal y una desviación estándar típica de 0.2 para los DE.

total_men10dias = nrow(datos[datos$DE < 10,]) #total de columnas DE con menor a 10 dias
total_men10dias
## [1] 39
total_ed = nrow(datos) #total de columnas
probab= total_men10dias/total_ed #promedio
probab
## [1] 0.03888335

La probabilidad de que nosotros seamos dados de alta anterior a los 10 días de hospitalización corresponde a un 0.03888335.

4. ¿Qué puede concluir de los resultados con relación a las características y gestión de su establecimiento hospitalario?

Como centro médico Hospital Dr. Frambuesa podemos concluir que llegan pacientes con alto riesgo vital debido a su cormobilidad y diagnóstico, debido a sus alto número de días de estada que presentan, tanto los pacientes adultos como los pediátricos. Además la posibilidad de obtener el alta médica es casi nula, verificando los afirmado anteriormente.

2.4 Considerando elementos propios de la atención hospitalaria.