Exposición Regresión Logística

Germám Gómez López - Jorge Alan Retamoza Flores - Erick Abraham Bernal Amparano

05/04/2022

library(pacman)
p_load("xfun", "dplyr","DT")

Cargar Datos

Aquí utilizamos un csv con los datos de los pasageros del titanic para tratar de predecir quienes fueron las personas que se salvaron en base a su edad y su sexo.

df <- read.csv(file = "train.csv")

datatable(df)

Seleccionar Variables

Modificamos nuestro dataframe para tener solo las variables que utilizaremos para predecir

df %>%
  select(Survived, Sex, Age) -> dfsel
head(dfsel)
##   Survived    Sex Age
## 1        0   male  22
## 2        1 female  38
## 3        1 female  26
## 4        1 female  35
## 5        0   male  35
## 6        0   male  NA

Entrenar Modelo

model <- glm(formula = Survived ~ Sex + Age, data=dfsel, family = 'binomial')
summary(model)
## 
## Call:
## glm(formula = Survived ~ Sex + Age, family = "binomial", data = dfsel)
## 
## Deviance Residuals: 
##     Min       1Q   Median       3Q      Max  
## -1.7405  -0.6885  -0.6558   0.7533   1.8989  
## 
## Coefficients:
##              Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
## (Intercept)  1.277273   0.230169   5.549 2.87e-08 ***
## Sexmale     -2.465920   0.185384 -13.302  < 2e-16 ***
## Age         -0.005426   0.006310  -0.860     0.39    
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
## 
##     Null deviance: 964.52  on 713  degrees of freedom
## Residual deviance: 749.96  on 711  degrees of freedom
##   (177 observations deleted due to missingness)
## AIC: 755.96
## 
## Number of Fisher Scoring iterations: 4

Realizar Predicciones

y_pred <- predict(object = model, newdata = dfsel, type = 'response')
y_pred <- ifelse(test = y_pred > 0.5, yes = 1, no = 0)
y_pred
##   1   2   3   4   5   6   7   8   9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20 
##   0   1   1   1   0  NA   0   0   1   1   1   1   0   0   1   1   0  NA   1  NA 
##  21  22  23  24  25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  37  38  39  40 
##   0   0   1   0   1   1  NA   0  NA  NA   0  NA  NA   0   0   0  NA   0   1   1 
##  41  42  43  44  45  46  47  48  49  50  51  52  53  54  55  56  57  58  59  60 
##   1   1  NA   1   1  NA  NA  NA  NA   1   0   0   1   1   0  NA   1   0   1   0 
##  61  62  63  64  65  66  67  68  69  70  71  72  73  74  75  76  77  78  79  80 
##   0   1   0   0  NA  NA   1   0   1   0   0   1   0   0   0   0  NA  NA   0   1 
##  81  82  83  84  85  86  87  88  89  90  91  92  93  94  95  96  97  98  99 100 
##   0   0  NA   0   1   1   0  NA   1   0   0   0   0   0   0  NA   0   0   1   0 
## 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 
##   1  NA   0   0   0   0   1  NA   0  NA   0   1   0   1   1   0   0   0   0   1 
## 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 
##   0  NA   0   1   0   0  NA   0  NA   0   0   0   1   1   0   0   1   0   0   0 
## 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 
##  NA   1   1   0   0   0   0   1   0   0   0   1   0   0  NA   0   1   0  NA  NA 
## 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 
##   0   1   0   0   0   0  NA   1  NA   0   0   0   1   0   0   0  NA   1   0   0 
## 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 
##  NA  NA   0   0   1  NA  NA   0   0   0   1   0   1   0   1   1  NA   0  NA   1 
## 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 
##   0  NA   0   0   0   1   0   0   1   0   0   1   0   0  NA   1   1   0   1   0 
## 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 
##   0   0   0  NA   0   0   0   0   0  NA   1   0   0   1   0  NA   0   1   0   0 
## 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 
##  NA  NA   0   0   0   0   1   1   0   0  NA   1   0   0   1   1  NA   1   1   1 
## 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 
##  NA   0   0   0  NA   0   0   0   1   1  NA   0   1   0  NA   1   1  NA   0   1 
## 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 
##   0   0   0   0  NA   0   0   0   0   1   1   1   0   1   0  NA   0   1  NA   1 
## 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 
##  NA  NA   0  NA  NA   0  NA   1   0   1   1   1   1   0   0   1   1   0   1   1 
## 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 
##   0   0   1   1  NA   1   0   1   1   1  NA   0   0   0  NA  NA   0   1   0   0 
## 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 
##   0   1   0   0   0   1   1  NA   0   0   0  NA   0   0  NA   0   1   1  NA  NA 
## 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 
##   0   0   1   0  NA   0   1  NA  NA   1   0   0   0   0   1  NA   1   0   0   0 
## 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 
##   1   1   0   1  NA   0   0   1  NA   1   0   0   0   1   1   0   1   0   0   1 
## 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 
##   0   0   1   0   1   0   0   0   0  NA  NA  NA   1  NA   0  NA   1   1   0   1 
## 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 
##  NA   0   0   1   0  NA   1   1  NA   0   0  NA   1   0   0   1   1   1   0   0 
## 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 
##   1   0   0   1  NA   0   1   0   1   0   0  NA   0   0  NA   0   0  NA   1  NA 
## 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 
##   0   0   0   0  NA   0  NA   0  NA   1  NA   0   1   1   1  NA   0   0   0   1 
## 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 
##   0  NA   0   1   0  NA   1   0   0   0  NA   0   0   0   0  NA   1  NA   1   0 
## 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 
##   0   1  NA   1   1   0   1  NA   0   0   0  NA   0   1   0   0   1  NA   1   0 
## 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 
##   1   0  NA   1  NA   0   1  NA   0   0   1  NA   0  NA   1   1   0   1  NA   1 
## 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 
##   1   1   1   0   0   0   1  NA   0   0   0   0  NA   0   1   0   1  NA   1   1 
## 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 
##  NA   0   0  NA  NA   0   0   1  NA   0   0   1   0  NA   0   0   1   1  NA   0 
## 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 
##   1   1   0   0  NA   1   0   0   0  NA   0   1   0  NA   0   0  NA   0  NA   0 
## 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 
##   1  NA  NA   0   0   0   0   0   1   1   1  NA  NA  NA   0   1   0   1   1   0 
## 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 
##   0   0   0   0   0   0   0   1   0  NA   0   0   0  NA   1   1   0   0   1  NA 
## 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 
##   0   1   1  NA   1   0   0   0  NA   1  NA   1   0  NA   1   0  NA   1   0   0 
## 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 
##   0   0   0   0   0   0   0  NA   0  NA   1   0   0   0  NA   0   0   1   1   0 
## 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 
##  NA   0   0   0   0   0   0   0   0   1   0   1  NA   0   0   0   0  NA   0   0 
## 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 
##   1   0   1   0   0   0   1   0   1  NA   1  NA   0   0   0   0   1   1  NA   0 
## 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 
##   1   0   0   0   0   0   1  NA   0   1   1   0  NA   0   0   0   1   0  NA  NA 
## 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 
##  NA   0   1   0   0   0   0   1   0   0   1   0   0   0   1   0   0   0   0   1 
## 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 
##  NA   0   0   1   0   1  NA   1  NA   0   0   0   1  NA   1   0  NA   1  NA   1 
## 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 
##   1   1   0  NA   0   0   1   0   0   0  NA   0  NA  NA   0   0   1   1   0   1 
## 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 
##   0   1   0   0   0   0   0   1   0   1   0   0   0   1   0  NA   1   0   0   0 
## 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 
##   1   0   0   1   0  NA  NA   0  NA   1   1   0  NA   0   0   1   0  NA   0  NA 
## 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 
##   0   0   1   0   0   0  NA   0   0  NA   0   0   1   1   1   1   1   0   1  NA 
## 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 
##   0   0   1  NA   0   1   1   0  NA   0   0   1   0   0   1   1   0   0  NA   1 
## 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 
##   1   0   1   0   0   1   0   1  NA   0   0

El modelo realiza las predicciones y pone como 1 cuando determina que es mayor al 50% de probabilidad y 0 en caso contrario.

Comparar la Realidad con las Predicciones

dfsel %>%
  mutate(predicciones = y_pred) %>%
  select(predicciones, everything()) %>%
  mutate(comp = predicciones == Survived) -> dfres
mean(dfres$comp, na.rm = TRUE)
## [1] 0.780112

Al comparar las predicciones con los datos reales nos podemos percatar de que nuestro modelo tiene un 78% de presición.

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