Instalar bibliotecas
Las bibliotecas son un conjunto de funciones que no vienen con R. Algunas pueden facilitar el manejo de datos o añadir análisis estadísticos especializados, funciones para análisis espaciales y análisis para el manejo de datos genómicos; entre muchos otros.
La instalación de paquetes se puede realizar de diversas formas, no siempre están disponibles todas, entre algunas que veremos se encuentran:
- Panel Packages en RStudio
- Función install.packages(“biblioteca”)
- Instalación desde GitHub de click aquí para mayor información
- install_github(“DeveloperName/PackageName”)
- githubinstall(“PackageName”)
- devtools::install_github(“hoxo-m/githubinstall”)
- Instalación utilizando Bioconductor, da click aquí para mayor información.
Instalar bibliotecas desde RStudio
Para el siguiente ejercicio, vamos a instalar la biblioteca ggplot2, que es una biblioteca que se utiliza para edición de imágenes.
Priemro, vamos a seleccionar el panel inferior izquierdo en la pestaña que dice Packages y luego presionamos el botón Install. Se desplegará una nueva pestaña en donde escribiremos ggplot2, podrás notar que mientras escribes te da recomendaciones con base a la similitud del nombre.
Selecciona ggplot2 y presiona Install, observa en tu panel de consola como se inicia la instalación de la biblioteca. Una vez instalada la biblioteca la podrás ver listada en la pestaña de bibliotecas.
En la pestaña de paquetes podrás apreciar una descripción del paquete y la versión que está instalada. Siempre es importante considerar la versión a instalar de la biblioteca porque no siempre son compatibles con la versión de R que tenemos instalada.
Para activar la biblioteca lo podemos hacer de tres formas:
- Activar la casilla que se encuentra en el panel Packages
- Utilizar el comando library(biblioteca), por ej. library(ggplot2)
- Utilizar el comando require ( )
El comando require( ) difiere del comando library( ) en que retorna un valor lógico. El comando require( ) también nos permite llamar una biblioteca en caso de que se le necesite o bien instalarla, por ejemplo:
if(!require(ggplot2)) {install.packages(“ggplot2”) library(ggplot2)}
Puedes encontrar más información en este enlace
Para desactivar la biblioteca de tu environment, puedes realizar lo siguiente:
- Ir a la pestaña de Packages y desactivar la casilla del paquete
- Utilizar el comando detach(“package:ggplot2”, unload = TRUE)
- Utilizar el comando unloadNamespace(“ggplot2”)