library(tools4DCE)Ce document explique comment récupérer des listes floristiques ou faunistiques depuis Hubeau (https://hubeau.eaufrance.fr/page/api-hydrobiologie) et de les transmettre à l’API SEEE pour divers calculs d’indicateurs (https://www.seee.eaufrance.fr/).
A partir de la plateforme Hubeau, on télécharge les listes faunistiques invertébrés disponibles sur la station 04207400. On se limite aux opérations pour lesquels un indice I2M2 a été calculé (faute de pouvoir rapatrier le protocole de prélèvement depuis hubeau).
Liste des opérations avec I2M2
station_etudiee<-"04207400"
stations_op<-import_hubeau_indices_hbio(liste_stations = station_etudiee, indice="inv")
stations_op<-stations_op%>%subset(CdParametre=="7613")On importe les listes faunistiques depuis HubEau et on ne retient que les données qui correspondent à une date où l’I2M2 est calculé.
donnees<-import_hubeau_liste_hbio(liste_stations = c(station_etudiee), indice="inv")
donnees<-donnees%>%subset(date_prelevement%in%stations_op$DatePrel)On met en forme les listes conformément au format d’entrée du script du SEEE Outil diagnostic invertébrés (https://seee.eaufrance.fr/api/indicateurs/ODInvertebres/1.0.2) - format identique à celui du script I2M2 v1.0.6
donnees$CODE_OPERATION <-
paste0(donnees$code_station_hydrobio, "*", donnees$date_prelevement)
donnees$CODE_STATION <- donnees$code_station_hydrobio
donnees$DATE <- format(donnees$date_prelevement, "%d/%m/%Y")
donnees$TYPO_NATIONALE <- "P12-A"
donnees$CODE_PHASE <- donnees$code_lot
donnees$CODE_TAXON <- donnees$code_appel_taxon
donnees$RESULTAT <- donnees$resultat_taxon
donnees$CODE_REMARQUE <- donnees$code_type_resultat
donnees <-
donnees %>% select(
CODE_OPERATION,
CODE_STATION,
DATE,
TYPO_NATIONALE,
CODE_PHASE,
CODE_TAXON,
RESULTAT,
CODE_REMARQUE
)Appel de l’API sur le SEEE
calcule_SEEE_I2M2(donnees)## CODE_OPERATION CODE_STATION DATE CODE_PAR
## 1 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8058
## 2 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8057
## 3 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8056
## 4 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8055
## 5 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8054
## 6 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 7613
## 7 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8050
## 8 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8058
## 9 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8057
## 10 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8056
## 11 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8055
## 12 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8054
## 13 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 7613
## 14 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8050
## 15 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8058
## 16 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8057
## 17 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8056
## 18 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8055
## 19 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8054
## 20 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 7613
## 21 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8050
## 22 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8058
## 23 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8057
## 24 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8056
## 25 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8055
## 26 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8054
## 27 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 7613
## 28 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8050
## 29 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8058
## 30 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8057
## 31 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8056
## 32 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8055
## 33 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8054
## 34 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 7613
## 35 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8050
## 36 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8058
## 37 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8057
## 38 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8056
## 39 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8055
## 40 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8054
## 41 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 7613
## 42 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8050
## LIB_PAR RESULTAT
## 1 IndiceShannonI2M2 0.3943
## 2 AverageScorePerTaxonI2M2 0.3788
## 3 PolyvoltinismeI2M2 0.3262
## 4 OvovivipariteI2M2 0.1381
## 5 RichesseI2M2 0.6270
## 6 Ind Invert Multimetrique 0.3543
## 7 NbTaxonsI2M2Contributifs 43.0000
## 8 IndiceShannonI2M2 0.3876
## 9 AverageScorePerTaxonI2M2 0.3109
## 10 PolyvoltinismeI2M2 0.0708
## 11 OvovivipariteI2M2 0.0726
## 12 RichesseI2M2 0.5643
## 13 Ind Invert Multimetrique 0.2560
## 14 NbTaxonsI2M2Contributifs 44.0000
## 15 IndiceShannonI2M2 0.4475
## 16 AverageScorePerTaxonI2M2 0.2695
## 17 PolyvoltinismeI2M2 0.3831
## 18 OvovivipariteI2M2 0.1941
## 19 RichesseI2M2 0.3762
## 20 Ind Invert Multimetrique 0.3253
## 21 NbTaxonsI2M2Contributifs 36.0000
## 22 IndiceShannonI2M2 0.0412
## 23 AverageScorePerTaxonI2M2 0.5072
## 24 PolyvoltinismeI2M2 0.3911
## 25 OvovivipariteI2M2 0.1175
## 26 RichesseI2M2 0.3762
## 27 Ind Invert Multimetrique 0.2927
## 28 NbTaxonsI2M2Contributifs 37.0000
## 29 IndiceShannonI2M2 0.5354
## 30 AverageScorePerTaxonI2M2 0.4155
## 31 PolyvoltinismeI2M2 0.2514
## 32 OvovivipariteI2M2 0.1720
## 33 RichesseI2M2 0.3448
## 34 Ind Invert Multimetrique 0.3329
## 35 NbTaxonsI2M2Contributifs 33.0000
## 36 IndiceShannonI2M2 0.6218
## 37 AverageScorePerTaxonI2M2 0.4203
## 38 PolyvoltinismeI2M2 0.2852
## 39 OvovivipariteI2M2 0.1799
## 40 RichesseI2M2 0.4702
## 41 Ind Invert Multimetrique 0.3779
## 42 NbTaxonsI2M2Contributifs 39.0000
## COMMENTAIRE
## 1
## 2
## 3
## 4
## 5
## 6
## 7 Les taxons suivants, representant 4% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3206, 1054.
## 8
## 9
## 10
## 11
## 12
## 13
## 14
## 15
## 16
## 17
## 18
## 19
## 20
## 21 Les taxons suivants, representant 3% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3206.
## 22
## 23
## 24
## 25
## 26
## 27
## 28 Les taxons suivants, representant 3% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3206.
## 29
## 30
## 31
## 32
## 33
## 34
## 35
## 36
## 37
## 38
## 39
## 40
## 41
## 42calcule_SEEE_ODinvertebres(donnees)## CODE_STATION DATE CODE_OPERATION MATIERES_ORGANIQUES
## 1 04207400 17/07/2015 04207400*2015-07-17 0.1905
## 2 04207400 21/07/2016 04207400*2016-07-21 0.1405
## 3 04207400 26/09/2017 04207400*2017-09-26 0.4582
## 4 04207400 28/08/2018 04207400*2018-08-28 0.2922
## 5 04207400 10/07/2019 04207400*2019-07-10 0.1713
## 6 04207400 05/08/2020 04207400*2020-08-05 0.1875
## MATIERES_PHOSPHOREES MATIERES_AZOTEES NITRATES HAP PESTICIDES RIPISYLVE
## 1 0.1745 0.1205 0.9405 0.7877 0.8492 0.6393
## 2 0.1230 0.0752 0.9446 0.7786 0.8452 0.6746
## 3 0.2546 0.1585 0.7769 0.6492 0.7224 0.6523
## 4 0.5023 0.2000 0.7631 0.7818 0.8463 0.6458
## 5 0.1325 0.0688 0.9401 0.7741 0.8197 0.6670
## 6 0.1121 0.0435 0.9588 0.7235 0.8613 0.5817
## VOIES_COMMUNICATION URBANISATION_100M RISQUE_COLMATAGE
## 1 0.1655 0.6878 0.7864
## 2 0.0951 0.7023 0.8088
## 3 0.2303 0.5395 0.6673
## 4 0.2439 0.6175 0.6958
## 5 0.1397 0.6491 0.8058
## 6 0.1196 0.5740 0.8794
## INSTABILITE_HYDROLOGIQUE ANTHROPISATION_BV TAILLE_1 TAILLE_2 TAILLE_3
## 1 0.6076 0.9650 0.2454086 0.2759851 0.2586478
## 2 0.5630 0.9818 0.2458245 0.2910303 0.2296083
## 3 0.5743 0.7782 0.2766916 0.2652162 0.2173221
## 4 0.5096 0.9259 0.2614469 0.2931914 0.2689816
## 5 0.5147 0.9714 0.2406192 0.3165472 0.2259241
## 6 0.4511 0.9683 0.2256936 0.2715248 0.2663027
## TAILLE_4 TAILLE_5 LONGEVITE_1 LONGEVITE_2 VOLTINISME_1 VOLTINISME_2
## 1 0.1587743 0.06118413 0.5586731 0.4413269 0.05304692 0.5629382
## 2 0.1717077 0.06182922 0.5738180 0.4261820 0.04471775 0.5026940
## 3 0.1810024 0.05976770 0.5638885 0.4361115 0.04939984 0.5825135
## 4 0.1244716 0.05190852 0.6052995 0.3947005 0.03758749 0.5964475
## 5 0.1584273 0.05848214 0.5833296 0.4154902 0.04626838 0.5502225
## 6 0.1878567 0.04862216 0.5661688 0.4338312 0.03865574 0.5669017
## VOLTINISME_3 STADE_AQUATIQUE_1 STADE_AQUATIQUE_2 STADE_AQUATIQUE_3
## 1 0.3840149 0.3569375 0.3183942 0.1096252
## 2 0.4525883 0.3470730 0.3360227 0.1123101
## 3 0.3680867 0.3524996 0.3408225 0.1018670
## 4 0.3659650 0.3635044 0.3218093 0.1022483
## 5 0.4031157 0.3633005 0.3332008 0.1122001
## 6 0.3944425 0.3486247 0.3339675 0.1222251
## STADE_AQUATIQUE_4 REPRODUCTION_1 REPRODUCTION_2 REPRODUCTION_3 REPRODUCTION_4
## 1 0.2150431 0.2671023 0.015863394 0.05468578 0.5141985
## 2 0.2045943 0.2833844 0.019141675 0.08169454 0.4783821
## 3 0.2048109 0.2502988 0.005470645 0.03174417 0.5366915
## 4 0.2124380 0.2699273 0.018455302 0.04960748 0.5175259
## 5 0.1912986 0.2559569 0.024070403 0.07078267 0.5174642
## 6 0.1951827 0.2538449 0.014606109 0.06754530 0.5031067
## REPRODUCTION_5 REPRODUCTION_6 REPRODUCTION_7 DISPERSION_1 DISPERSION_2
## 1 0.05208435 0.07270446 0.02336121 0.4563719 0.2437696
## 2 0.05615768 0.05715658 0.02408308 0.4605399 0.2520750
## 3 0.03627797 0.12602637 0.01349054 0.4236183 0.2636259
## 4 0.04851096 0.08331696 0.01265614 0.4533789 0.2337495
## 5 0.05046172 0.06445237 0.01681170 0.4454782 0.2432994
## 6 0.04723092 0.08801420 0.02565191 0.4302389 0.2550956
## DISPERSION_3 DISPERSION_4 RESISTANCE_1 RESISTANCE_2 RESISTANCE_3 RESISTANCE_4
## 1 0.1111281 0.1887304 0.05859629 0.09349920 0.1644160 0.6727769
## 2 0.1229563 0.1644288 0.08624399 0.08863476 0.1686518 0.6495114
## 3 0.1034187 0.2093371 0.04462082 0.10401401 0.1865702 0.6580325
## 4 0.1222226 0.1906490 0.06267349 0.09756272 0.2482969 0.5914669
## 5 0.1229447 0.1882776 0.07351611 0.10602866 0.2003391 0.6095163
## 6 0.1163510 0.1983145 0.06414134 0.09424297 0.1741194 0.6611946
## RESPIRATION_1 RESPIRATION_2 RESPIRATION_3 LOCOMOTION_1 LOCOMOTION_2
## 1 0.4406343 0.4414773 0.11788841 0.02708106 0.12435463
## 2 0.4539548 0.4495740 0.09647118 0.02345999 0.13947775
## 3 0.4089047 0.4263430 0.16475225 0.03201537 0.11202301
## 4 0.4199835 0.4654843 0.11453215 0.02961061 0.09347311
## 5 0.4523069 0.4551213 0.09257179 0.02417977 0.11311836
## 6 0.4366991 0.4532547 0.11004616 0.02440146 0.12296340
## LOCOMOTION_3 LOCOMOTION_4 LOCOMOTION_5 LOCOMOTION_6 NOURRITURE_1 NOURRITURE_2
## 1 0.5263504 0.08961485 0.10657356 0.1260255 0.1799764 0.1344069
## 2 0.5057367 0.08091670 0.11027197 0.1401369 0.1985832 0.1429717
## 3 0.5445480 0.09558448 0.09376166 0.1220675 0.1759603 0.1151251
## 4 0.5341372 0.10118161 0.10719141 0.1344060 0.1835699 0.1342523
## 5 0.5233378 0.08545169 0.10645588 0.1474565 0.1983297 0.1351534
## 6 0.5237867 0.07794649 0.09354857 0.1573534 0.1851914 0.1222513
## NOURRITURE_3 NOURRITURE_4 NOURRITURE_5 NOURRITURE_6 NOURRITURE_7
## 1 0.3152273 0.10257898 0.03311648 0.07714059 0.1575533
## 2 0.3115846 0.09325836 0.04002712 0.07731253 0.1362625
## 3 0.3444093 0.10375206 0.03598465 0.05761206 0.1671566
## 4 0.3317198 0.11008384 0.03234972 0.06209433 0.1459301
## 5 0.3335553 0.10512321 0.03596132 0.06793601 0.1239410
## 6 0.3243989 0.09100702 0.03300878 0.08446217 0.1596805
## ALIMENTATION_1 ALIMENTATION_2 ALIMENTATION_3 ALIMENTATION_4 ALIMENTATION_5
## 1 0.09545942 0.2789388 0.3007315 0.1158832 0.03030398
## 2 0.11387853 0.2790914 0.3006947 0.1096611 0.04067529
## 3 0.08670539 0.2764762 0.3333308 0.0934428 0.04405115
## 4 0.08285303 0.2597130 0.3284824 0.1490781 0.04546444
## 5 0.11512994 0.2679524 0.3237232 0.1161246 0.02813357
## 6 0.08811861 0.2626358 0.3009559 0.1387299 0.03808170
## ALIMENTATION_6 ALIMENTATION_7 TRANSVERSAL_1 TRANSVERSAL_2 TRANSVERSAL_3
## 1 0.1551110 0.02357213 0.2686021 0.3793734 0.10485881
## 2 0.1334963 0.02250271 0.2710367 0.3862494 0.09489424
## 3 0.1552882 0.01070541 0.2572079 0.3735664 0.10986347
## 4 0.1163568 0.01805231 0.2507858 0.3619670 0.12205999
## 5 0.1343420 0.01459425 0.2773424 0.3749440 0.09890842
## 6 0.1589090 0.01256908 0.2790819 0.3732839 0.09836907
## TRANSVERSAL_4 TRANSVERSAL_5 TRANSVERSAL_6 LONGITUDINAL_1 LONGITUDINAL_2
## 1 0.03905878 0.06148393 0.1466229 0.08342727 0.1454353
## 2 0.03190124 0.06767864 0.1482398 0.08247889 0.1438329
## 3 0.05375890 0.06091548 0.1446879 0.07246445 0.1437305
## 4 0.04194768 0.06768142 0.1555581 0.07537902 0.1403826
## 5 0.03429046 0.06930254 0.1452122 0.08327190 0.1518935
## 6 0.03381631 0.05553372 0.1599151 0.07285715 0.1396774
## LONGITUDINAL_3 LONGITUDINAL_4 LONGITUDINAL_5 LONGITUDINAL_6 LONGITUDINAL_7
## 1 0.1566784 0.1543800 0.1452361 0.1393246 0.05911956
## 2 0.1550192 0.1559365 0.1394152 0.1366288 0.06424914
## 3 0.1547060 0.1632168 0.1458324 0.1347320 0.05536398
## 4 0.1600797 0.1692240 0.1498753 0.1270520 0.04869246
## 5 0.1597993 0.1678263 0.1412085 0.1276044 0.05392080
## 6 0.1563753 0.1646316 0.1474425 0.1416193 0.06158760
## LONGITUDINAL_8 ALTITUDE_1 ALTITUDE_2 ALTITUDE_3 SUBSTRAT_1 SUBSTRAT_2
## 1 0.1163989 0.6808151 0.2238167 0.09536821 0.2219957 0.1409724
## 2 0.1224394 0.6852662 0.2244741 0.09025963 0.2239317 0.1427391
## 3 0.1299539 0.7012874 0.2047057 0.09400692 0.2142789 0.1473499
## 4 0.1293148 0.7027665 0.2170842 0.08014929 0.2140727 0.1423085
## 5 0.1144751 0.6939747 0.2213346 0.08469066 0.2284594 0.1454825
## 6 0.1158092 0.6916853 0.2088491 0.09946555 0.2441583 0.1385056
## SUBSTRAT_3 SUBSTRAT_4 SUBSTRAT_5 SUBSTRAT_6 SUBSTRAT_7 SUBSTRAT_8 SUBSTRAT_9
## 1 0.09666289 0.05024465 0.2136399 0.04566583 0.09670243 0.06906700 0.06504928
## 2 0.09501919 0.04732580 0.2181656 0.04386285 0.08823609 0.07604899 0.06467072
## 3 0.10506741 0.05082739 0.2060918 0.04369787 0.07612398 0.07907076 0.07749205
## 4 0.10070687 0.05106557 0.2282318 0.04874406 0.07527708 0.06485616 0.07473732
## 5 0.09615849 0.04847182 0.2139803 0.04237858 0.08768859 0.07332637 0.06405385
## 6 0.09819164 0.04597375 0.2083756 0.04217159 0.08904628 0.07257193 0.06100522
## COURANT_1 COURANT_2 COURANT_3 COURANT_4 TROPHIE_1 TROPHIE_2 TROPHIE_3
## 1 0.1834127 0.3702327 0.3057075 0.1406471 0.3610438 0.4364861 0.2024702
## 2 0.1761970 0.3835585 0.2996097 0.1406348 0.3677703 0.4354362 0.1967935
## 3 0.1844327 0.3774494 0.2996096 0.1385083 0.3567734 0.4326829 0.2105437
## 4 0.2102382 0.3439579 0.3026330 0.1431708 0.3253670 0.4595323 0.2151007
## 5 0.1695831 0.3663836 0.3103453 0.1536880 0.3542282 0.4522984 0.1918998
## 6 0.1718006 0.3804994 0.3047668 0.1429333 0.3602348 0.4481824 0.1915828
## SALINITE_1 SALINITE_2 TEMPERATURE_1 TEMPERATURE_2 TEMPERATURE_3 SAPROBIE_1
## 1 0.8082459 0.1917541 0.1359648 0.11665467 0.7473805 0.06948245
## 2 0.8167021 0.1832979 0.1493267 0.16002382 0.6906495 0.07473601
## 3 0.8241121 0.1758879 0.1332277 0.11391040 0.7528619 0.06056552
## 4 0.8055816 0.1944184 0.1184731 0.07675551 0.8047714 0.05976762
## 5 0.8319575 0.1680425 0.1524714 0.12780268 0.7181523 0.07818313
## 6 0.8248901 0.1751099 0.1412418 0.13964058 0.7191176 0.06971291
## SAPROBIE_2 SAPROBIE_3 SAPROBIE_4 SAPROBIE_5 PH_1 PH_2 PH_3
## 1 0.2556367 0.4163987 0.2161107 0.03165986 0.03091599 0.05346881 0.1205918
## 2 0.2739278 0.4118816 0.1942255 0.03131301 0.03164344 0.05243005 0.1196230
## 3 0.2711901 0.4253132 0.2134711 0.02946015 0.02783327 0.04565553 0.1152059
## 4 0.2339074 0.4324176 0.2393372 0.03457020 0.02924533 0.05166105 0.1100118
## 5 0.2612354 0.4231547 0.2057512 0.03167550 0.03118056 0.04996211 0.1144753
## 6 0.2643570 0.4316386 0.2078576 0.02643391 0.02980235 0.05067497 0.1140038
## PH_4 PH_5 PH_6 CSI_TAILLE CSI_LONGEVITE CSI_VOLTINISME
## 1 0.1891452 0.2208012 0.3743654 0.5308553 0.5435675 0.5899303
## 2 0.1805878 0.2177582 0.3840415 0.5403389 0.5959383 0.5505935
## 3 0.1869859 0.2299889 0.3943305 0.5664105 0.5684203 0.5952641
## 4 0.1824188 0.2230768 0.4035862 0.5161330 0.5007798 0.5658603
## 5 0.1889294 0.2291776 0.3862750 0.5338263 0.5787271 0.5543004
## 6 0.1860921 0.2380914 0.3813353 0.5565919 0.6091961 0.5915092
## CSI_STADE_AQUATIQUE CSI_REPRODUCTION CSI_DISPERSION CSI_RESISTANCE
## 1 0.1907792 0.8089988 0.2370109 0.7547399
## 2 0.1949068 0.7839181 0.2421071 0.7305159
## 3 0.2093951 0.8452869 0.2436136 0.7719665
## 4 0.2033005 0.8284447 0.2231922 0.7302386
## 5 0.1939137 0.7924792 0.2189284 0.7154068
## 6 0.1919079 0.8234373 0.2310430 0.7759767
## CSI_RESPIRATION CSI_LOCOMOTION CSI_NOURRITURE CSI_ALIMENTATION
## 1 0.5826634 0.4013110 0.3384334 0.5964342
## 2 0.6053526 0.3924876 0.3102993 0.5828076
## 3 0.5990895 0.4314680 0.3892335 0.6371436
## 4 0.5473983 0.4235656 0.3668062 0.5979280
## 5 0.5717176 0.4155624 0.3348636 0.5781182
## 6 0.5962127 0.4223793 0.3608966 0.6225953
## CSI_TRANSVERSAL CSI_LONGITUDINAL CSI_ALTITUDE CSI_SUBSTRAT CSI_COURANT
## 1 0.1989661 0.08216072 0.4022452 0.1062462 0.1704529
## 2 0.1941724 0.08551511 0.4190974 0.1034287 0.1821683
## 3 0.1975455 0.09456779 0.4280199 0.1071783 0.1684702
## 4 0.1804846 0.07676560 0.4545197 0.1171697 0.1390151
## 5 0.1901212 0.08010796 0.4349407 0.1068139 0.1631159
## 6 0.2011677 0.08866688 0.4301967 0.1115638 0.1886804
## CSI_TROPHIE CSI_SALINITE CSI_TEMPERATURE CSI_SAPROBIE CSI_PH
## 1 0.2056864 0.5012128 0.5893888 0.2175640 0.1685415
## 2 0.1991406 0.5171048 0.5639223 0.2111304 0.1799132
## 3 0.2218885 0.5421463 0.5946491 0.2349381 0.1857097
## 4 0.2041291 0.5104510 0.6001726 0.2225595 0.1988110
## 5 0.2028929 0.5617418 0.5572190 0.2106601 0.1800504
## 6 0.1979936 0.5317047 0.5817684 0.2159219 0.1742764
## SIMILARITE_TAILLE SIMILARITE_LONGEVITE SIMILARITE_VOLTINISME
## 1 0.4194402 0.6812595 0.6723124
## 2 0.4003211 0.6898635 0.6951894
## 3 0.4166604 0.6771868 0.6862157
## 4 0.4225846 0.7298250 0.7616178
## 5 0.4404026 0.6822285 0.7055431
## 6 0.4196454 0.6670221 0.6957514
## SIMILARITE_STADE_AQUATIQUE SIMILARITE_REPRODUCTION SIMILARITE_DISPERSION
## 1 0.7296890 0.4362484 0.7246412
## 2 0.7248048 0.3946331 0.7283848
## 3 0.7124608 0.4006926 0.7168491
## 4 0.7240644 0.3868687 0.7644237
## 5 0.7420417 0.4254014 0.7513002
## 6 0.7482956 0.4005142 0.7209887
## SIMILARITE_RESISTANCE SIMILARITE_RESPIRATION SIMILARITE_LOCOMOTION
## 1 0.5865116 0.5402492 0.6281176
## 2 0.5713610 0.5351032 0.6245878
## 3 0.5875131 0.5256428 0.6392819
## 4 0.5438224 0.5417297 0.5999296
## 5 0.5648501 0.5970421 0.6465641
## 6 0.5254795 0.5454456 0.6222988
## SIMILARITE_NOURRITURE SIMILARITE_ALIMENTATION SIMILARITE_TRANSVERSAL
## 1 0.4391528 0.3193092 0.7153268
## 2 0.4461986 0.3025488 0.7558697
## 3 0.4489992 0.2958986 0.7108477
## 4 0.4535202 0.3145475 0.7375062
## 5 0.4963946 0.3464156 0.7619557
## 6 0.4439346 0.3142788 0.7520378
## SIMILARITE_LONGITUDINAL SIMILARITE_ALTITUDE SIMILARITE_SUBSTRAT
## 1 0.7290396 0.8929613 0.6956628
## 2 0.7362745 0.8908652 0.7253102
## 3 0.7208575 0.8829209 0.6561702
## 4 0.7499711 0.8856398 0.6981587
## 5 0.7499958 0.8870170 0.7225110
## 6 0.7287176 0.8828324 0.7141210
## SIMILARITE_COURANT SIMILARITE_TROPHIE SIMILARITE_SALINITE
## 1 0.7598167 0.7674629 0.9486549
## 2 0.7856559 0.7918111 0.9468258
## 3 0.7565634 0.7582573 0.9402650
## 4 0.7826460 0.7743850 0.9391610
## 5 0.7679508 0.8177616 0.9429580
## 6 0.7799747 0.7894965 0.9495543
## SIMILARITE_TEMPERATURE SIMILARITE_SAPROBIE SIMILARITE_PH RAO_TAILLE
## 1 0.8061375 0.7951419 0.8901177 0.2938695
## 2 0.7821295 0.8056763 0.8810731 0.3058167
## 3 0.8294430 0.7939999 0.8955312 0.3062467
## 4 0.9219455 0.8193534 0.8783234 0.1681609
## 5 0.7830996 0.8154251 0.8852635 0.3482908
## 6 0.7999527 0.8264801 0.8884483 0.3754591
## RAO_LONGEVITE RAO_VOLTINISME RAO_STADE_AQUATIQUE RAO_REPRODUCTION
## 1 0.2764343 0.11937364 0.13103765 0.3888801
## 2 0.3582168 0.12087973 0.13817723 0.3776912
## 3 0.2035087 0.26600033 0.09223602 0.4947759
## 4 0.1060185 0.09722635 0.08200459 0.2388733
## 5 0.2909645 0.15977708 0.10561204 0.4296482
## 6 0.3806469 0.18059589 0.10509581 0.4823413
## RAO_DISPERSION RAO_RESISTANCE RAO_RESPIRATION RAO_LOCOMOTION RAO_NOURRITURE
## 1 0.09026407 0.3986734 0.2750478 0.15380935 0.15777637
## 2 0.09795500 0.2383092 0.2900482 0.12243758 0.12481749
## 3 0.08931566 0.4834047 0.1978884 0.12181432 0.20643307
## 4 0.04483353 0.3647381 0.0919757 0.07269674 0.09558045
## 5 0.10505363 0.3729130 0.2988654 0.17704679 0.18471058
## 6 0.09504942 0.2270618 0.2420514 0.16809961 0.13243422
## RAO_ALIMENTATION RAO_TRANSVERSAL RAO_LONGITUDINAL RAO_ALTITUDE RAO_SUBSTRAT
## 1 0.2770461 0.03259915 0.05054705 0.09025933 0.03243465
## 2 0.2821268 0.04792415 0.05214668 0.07923308 0.02587137
## 3 0.2358330 0.04475676 0.09886314 0.07040571 0.04821933
## 4 0.1082384 0.01953365 0.05112543 0.07200745 0.02696382
## 5 0.3231174 0.03651922 0.05197696 0.08078400 0.03751771
## 6 0.4021068 0.06522253 0.08240577 0.08903294 0.03872601
## RAO_COURANT RAO_TROPHIE RAO_SALINITE RAO_TEMPERATURE RAO_SAPROBIE RAO_PH
## 1 0.03319393 0.09983000 0.08002402 0.05676217 0.04305245 0.13899222
## 2 0.08144480 0.07232216 0.04302804 0.14679655 0.04072630 0.08085276
## 3 0.05742206 0.15230872 0.13959082 0.08450678 0.09822392 0.13107527
## 4 0.02179404 0.09618940 0.07879568 0.03054701 0.04489697 0.13240451
## 5 0.03560313 0.09617351 0.08179181 0.06170710 0.04768851 0.11270311
## 6 0.15919013 0.07994624 0.06125586 0.23663777 0.05430158 0.07016248
## SPEAR_S SPEAR_Q SPEAR_SENSIBILITE_MAX SPEAR_SENSIBILITE_MOY_S
## 1 0.2857143 0.2243723 0.16 -0.5873069
## 2 0.3500000 0.2656940 0.16 -0.5672666
## 3 0.3235294 0.2545825 0.16 -0.7023128
## 4 0.3529412 0.2387960 0.16 -0.6882548
## 5 0.3939394 0.3073868 0.16 -0.6769898
## 6 0.3783784 0.2757634 0.16 -0.5948318
## SPEAR_SENSIBILITE_MOY_Q GROUPE_BIO_a_S GROUPE_BIO_b_S GROUPE_BIO_c_S
## 1 -0.7187670 0.02380952 0.1666667 0.09523810
## 2 -0.6293763 0.02500000 0.1250000 0.07500000
## 3 -0.7305265 0.00000000 0.1470588 0.02941176
## 4 -0.8158895 0.00000000 0.1176471 0.02941176
## 5 -0.6733741 0.00000000 0.1515152 0.03030303
## 6 -0.6581538 0.00000000 0.1351351 0.08108108
## GROUPE_BIO_d_S GROUPE_BIO_e_S GROUPE_BIO_f_S GROUPE_BIO_g_S GROUPE_BIO_h_S
## 1 0.04761905 0.4047619 0.07142857 0.04761905 0.02380952
## 2 0.07500000 0.4250000 0.10000000 0.05000000 0.02500000
## 3 0.11764706 0.4705882 0.02941176 0.08823529 0.02941176
## 4 0.05882353 0.4705882 0.08823529 0.11764706 0.02941176
## 5 0.06060606 0.5151515 0.09090909 0.03030303 0.03030303
## 6 0.08108108 0.4864865 0.08108108 0.05405405 0.02702703
## GROUPE_BIO_a_Q GROUPE_BIO_b_Q GROUPE_BIO_c_Q GROUPE_BIO_d_Q GROUPE_BIO_e_Q
## 1 4.472872e-05 0.26788031 0.0003131010 0.0005814734 0.5642528
## 2 1.625488e-04 0.30819246 0.0004876463 0.0004876463 0.5380364
## 3 0.000000e+00 0.09761388 0.0062364425 0.0132863341 0.7960954
## 4 0.000000e+00 0.10937628 0.0001643520 0.0045196812 0.8582464
## 5 0.000000e+00 0.24764616 0.0004379242 0.0024085833 0.5036129
## 6 0.000000e+00 0.33631157 0.0022909507 0.0027491409 0.5608247
## GROUPE_BIO_f_Q GROUPE_BIO_g_Q GROUPE_BIO_h_Q GROUPE_ECO_A_S GROUPE_ECO_B_S
## 1 0.0007603882 0.0008945744 0.16209688 0 0.07142857
## 2 0.0056892068 0.0004876463 0.14174252 0 0.10000000
## 3 0.0010845987 0.0081344902 0.06534707 0 0.08823529
## 4 0.0010682883 0.0007395842 0.02309146 0 0.08823529
## 5 0.0166411211 0.0008758485 0.22071382 0 0.09090909
## 6 0.0048109966 0.0098510882 0.07835052 0 0.08108108
## GROUPE_ECO_C_S GROUPE_ECO_D_S GROUPE_ECO_E_S GROUPE_ECO_F_S GROUPE_ECO_G_S
## 1 0.1666667 0.2142857 0.09523810 0.14285714 0.00000000
## 2 0.1750000 0.2500000 0.07500000 0.07500000 0.00000000
## 3 0.1470588 0.2352941 0.11764706 0.17647059 0.02941176
## 4 0.2058824 0.2058824 0.05882353 0.20588235 0.00000000
## 5 0.1818182 0.2727273 0.09090909 0.09090909 0.00000000
## 6 0.1891892 0.2702703 0.10810811 0.16216216 0.00000000
## GROUPE_ECO_A_Q GROUPE_ECO_B_Q GROUPE_ECO_C_Q GROUPE_ECO_D_Q GROUPE_ECO_E_Q
## 1 0 0.02169343 0.2976696 0.21000134 0.2968198
## 2 0 0.01853056 0.2460988 0.36573472 0.2158648
## 3 0 0.23047722 0.1521150 0.07022777 0.4541757
## 4 0 0.03574657 0.1372340 0.06417947 0.7124661
## 5 0 0.03941318 0.3431136 0.14692358 0.2239982
## 6 0 0.04398625 0.3725086 0.16540664 0.3179840
## GROUPE_ECO_F_Q GROUPE_ECO_G_Q GROUPE_BIOECO_a_S GROUPE_BIOECO_b_S
## 1 0.003086282 0.0000000000 0.04761905 0.2619048
## 2 0.001950585 0.0000000000 0.05000000 0.2250000
## 3 0.011659436 0.0002711497 0.05882353 0.2352941
## 4 0.018160901 0.0000000000 0.05882353 0.2058824
## 5 0.005693015 0.0000000000 0.06060606 0.2424242
## 6 0.007560137 0.0000000000 0.05405405 0.2162162
## GROUPE_BIOECO_d_S GROUPE_BIOECO_e_S GROUPE_BIOECO_g_S GROUPE_BIOECO_z_S
## 1 0.11904762 0.00000000 0.2380952 0.1428571
## 2 0.10000000 0.00000000 0.2500000 0.1250000
## 3 0.17647059 0.00000000 0.2352941 0.1470588
## 4 0.14705882 0.02941176 0.2647059 0.1176471
## 5 0.09090909 0.00000000 0.2424242 0.1515152
## 6 0.16216216 0.00000000 0.2702703 0.1351351
## GROUPE_BIOECO_a_Q GROUPE_BIOECO_b_Q GROUPE_BIOECO_d_Q GROUPE_BIOECO_e_Q
## 1 0.0024600796 0.3188710 0.0016549627 0.000000000
## 2 0.0030884265 0.2594278 0.0008127438 0.000000000
## 3 0.0187093275 0.3652386 0.0268438178 0.000000000
## 4 0.0008217602 0.1714192 0.0051770893 0.000164352
## 5 0.0096343333 0.3612875 0.0032844318 0.000000000
## 6 0.0077892325 0.4066438 0.0132875143 0.000000000
## GROUPE_BIOECO_g_Q GROUPE_BIOECO_z_Q GROUPE_BIO_SHANNON GROUPE_ECO_SHANNON
## 1 0.01127164 0.4596771 1.4278970 1.658975
## 2 0.01674252 0.3603706 1.4645577 1.630143
## 3 0.02006508 0.5140998 1.0424182 1.765604
## 4 0.02604980 0.7319418 0.7195182 1.272774
## 5 0.03547186 0.4440552 1.6112201 1.645831
## 6 0.02084765 0.3915235 1.4307004 1.737213
## GROUPE_BIOECO_SHANNON
## 1 1.1507957
## 2 1.1685108
## 3 1.3848469
## 4 0.9525689
## 5 1.3132230
## 6 1.3113565Script du SEEE pour le calcul de l’IBG-DCE
calcule_SEEE_IBG_DCE(donnees)## CODE_OPERATION CODE_STATION DATE CODE_PAR
## 1 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 8051
## 2 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 6035
## 3 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 6034
## 4 04207400*2015-07-17 04207400 17/07/2015 5910
## 5 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 8051
## 6 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 6035
## 7 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 6034
## 8 04207400*2016-07-21 04207400 21/07/2016 5910
## 9 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 8051
## 10 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 6035
## 11 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 6034
## 12 04207400*2017-09-26 04207400 26/09/2017 5910
## 13 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 8051
## 14 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 6035
## 15 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 6034
## 16 04207400*2018-08-28 04207400 28/08/2018 5910
## 17 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 8051
## 18 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 6035
## 19 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 6034
## 20 04207400*2019-07-10 04207400 10/07/2019 5910
## 21 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 8051
## 22 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 6035
## 23 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 6034
## 24 04207400*2020-08-05 04207400 05/08/2020 5910
## LIB_PAR RESULTAT
## 1 NbTaxonsMPCEcontributifs 37
## 2 MPCE GFI phases A+B 4
## 3 MPCE Variete phases A+B 30
## 4 MPCE phases A+B 12
## 5 NbTaxonsMPCEcontributifs 41
## 6 MPCE GFI phases A+B 6
## 7 MPCE Variete phases A+B 34
## 8 MPCE phases A+B 15
## 9 NbTaxonsMPCEcontributifs 35
## 10 MPCE GFI phases A+B 7
## 11 MPCE Variete phases A+B 28
## 12 MPCE phases A+B 14
## 13 NbTaxonsMPCEcontributifs 33
## 14 MPCE GFI phases A+B 7
## 15 MPCE Variete phases A+B 26
## 16 MPCE phases A+B 14
## 17 NbTaxonsMPCEcontributifs 31
## 18 MPCE GFI phases A+B 7
## 19 MPCE Variete phases A+B 27
## 20 MPCE phases A+B 14
## 21 NbTaxonsMPCEcontributifs 37
## 22 MPCE GFI phases A+B 7
## 23 MPCE Variete phases A+B 28
## 24 MPCE phases A+B 14
## COMMENTAIRES
## 1
## 2
## 3
## 4 Les taxons suivant, representant 5% du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 1054, 3206.
## 5
## 6
## 7
## 8
## 9
## 10
## 11
## 12 Les taxons suivant, representant 3% du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3206.
## 13
## 14
## 15
## 16 Les taxons suivant, representant 3% du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3206.
## 17
## 18
## 19
## 20
## 21
## 22
## 23
## 24Liste des opérations avec IBG Grand cours d’eau (IBG-GCE)
station_etudiee<-"04216000"
stations_op<-import_hubeau_indices_hbio(liste_stations = station_etudiee, indice="inv")
stations_op<-stations_op%>%subset(CdParametre=="6951")On importe les listes faunistiques depuis HubEau et on ne retient que les données qui correspondent à une date où l’IBG-GCE est calculé.
donnees<-import_hubeau_liste_hbio(liste_stations = c(station_etudiee), indice="inv")
donnees<-donnees%>%subset(date_prelevement%in%stations_op$DatePrel)On met en forme les listes conformément au format d’entrée du script du SEEE MGCE.
donnees$CODE_OPERATION <-
paste0(donnees$code_station_hydrobio, "*", donnees$date_prelevement)
donnees$CODE_STATION <- donnees$code_station_hydrobio
donnees$DATE <- format(donnees$date_prelevement, "%d/%m/%Y")
donnees$TYPO_NATIONALE <- "G12-A"
donnees$CODE_PHASE <- donnees$code_lot
donnees$CODE_TAXON <- donnees$code_appel_taxon
donnees$RESULTAT <- donnees$resultat_taxon
donnees$CODE_REMARQUE <- donnees$code_type_resultat
donnees <-
donnees %>% select(
CODE_OPERATION,
CODE_STATION,
DATE,
TYPO_NATIONALE,
CODE_PHASE,
CODE_TAXON,
RESULTAT,
CODE_REMARQUE
)On regroupe les codes lots conformément à la nomenclature 480 du SANDRE qui prévoit que ces codes valent A, B ou C.
donnees$CODE_PHASE<-substr(donnees$CODE_PHASE,1,1)
donnees<-donnees%>%group_by(CODE_OPERATION, CODE_PHASE, CODE_TAXON, CODE_REMARQUE, CODE_STATION, DATE, TYPO_NATIONALE)%>%dplyr::summarise(RESULTAT=sum(RESULTAT, na.rm=T))## `summarise()` has grouped output by 'CODE_OPERATION', 'CODE_PHASE',
## 'CODE_TAXON', 'CODE_REMARQUE', 'CODE_STATION', 'DATE'. You can override using
## the `.groups` argument.Appel de l’API du SEEE pour le calcul de l’IBG-GCE
calcule_SEEE_MGCE(donnees)## CODE_OPERATION CODE_STATION DATE CODE_PAR
## 1 04216000*2010-08-26 04216000 26/08/2010 8130
## 2 04216000*2010-08-26 04216000 26/08/2010 6959
## 3 04216000*2010-08-26 04216000 26/08/2010 6955
## 4 04216000*2010-08-26 04216000 26/08/2010 6951
## 5 04216000*2011-09-01 04216000 01/09/2011 8130
## 6 04216000*2011-09-01 04216000 01/09/2011 6959
## 7 04216000*2011-09-01 04216000 01/09/2011 6955
## 8 04216000*2011-09-01 04216000 01/09/2011 6951
## 9 04216000*2012-06-29 04216000 29/06/2012 8130
## 10 04216000*2012-06-29 04216000 29/06/2012 6959
## 11 04216000*2012-06-29 04216000 29/06/2012 6955
## 12 04216000*2012-06-29 04216000 29/06/2012 6951
## 13 04216000*2013-07-12 04216000 12/07/2013 8130
## 14 04216000*2013-07-12 04216000 12/07/2013 6959
## 15 04216000*2013-07-12 04216000 12/07/2013 6955
## 16 04216000*2013-07-12 04216000 12/07/2013 6951
## 17 04216000*2014-05-28 04216000 28/05/2014 8130
## 18 04216000*2014-05-28 04216000 28/05/2014 6959
## 19 04216000*2014-05-28 04216000 28/05/2014 6955
## 20 04216000*2014-05-28 04216000 28/05/2014 6951
## 21 04216000*2015-07-07 04216000 07/07/2015 8130
## 22 04216000*2015-07-07 04216000 07/07/2015 6959
## 23 04216000*2015-07-07 04216000 07/07/2015 6955
## 24 04216000*2015-07-07 04216000 07/07/2015 6951
## 25 04216000*2018-08-08 04216000 08/08/2018 8130
## 26 04216000*2018-08-08 04216000 08/08/2018 6959
## 27 04216000*2018-08-08 04216000 08/08/2018 6955
## 28 04216000*2018-08-08 04216000 08/08/2018 6951
## 29 04216000*2019-08-06 04216000 06/08/2019 8130
## 30 04216000*2019-08-06 04216000 06/08/2019 6959
## 31 04216000*2019-08-06 04216000 06/08/2019 6955
## 32 04216000*2019-08-06 04216000 06/08/2019 6951
## 33 04216000*2020-08-04 04216000 04/08/2020 8130
## 34 04216000*2020-08-04 04216000 04/08/2020 6959
## 35 04216000*2020-08-04 04216000 04/08/2020 6955
## 36 04216000*2020-08-04 04216000 04/08/2020 6951
## LIB_PAR RESULTAT
## 1 NbTaxonsMGCEcontributifs 26
## 2 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 3 MGCE Variete 12 prelevements 23
## 4 MGCE 12 prelevements 8
## 5 NbTaxonsMGCEcontributifs 38
## 6 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 7 MGCE Variete 12 prelevements 33
## 8 MGCE 12 prelevements 11
## 9 NbTaxonsMGCEcontributifs 27
## 10 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 11 MGCE Variete 12 prelevements 24
## 12 MGCE 12 prelevements 8
## 13 NbTaxonsMGCEcontributifs 37
## 14 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 15 MGCE Variete 12 prelevements 32
## 16 MGCE 12 prelevements 10
## 17 NbTaxonsMGCEcontributifs 30
## 18 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 19 MGCE Variete 12 prelevements 30
## 20 MGCE 12 prelevements 10
## 21 NbTaxonsMGCEcontributifs 24
## 22 MGCE GFI 12 prelevements 5
## 23 MGCE Variete 12 prelevements 23
## 24 MGCE 12 prelevements 11
## 25 NbTaxonsMGCEcontributifs 26
## 26 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 27 MGCE Variete 12 prelevements 24
## 28 MGCE 12 prelevements 8
## 29 NbTaxonsMGCEcontributifs 23
## 30 MGCE GFI 12 prelevements 2
## 31 MGCE Variete 12 prelevements 22
## 32 MGCE 12 prelevements 8
## 33 NbTaxonsMGCEcontributifs 36
## 34 MGCE GFI 12 prelevements 6
## 35 MGCE Variete 12 prelevements 33
## 36 MGCE 12 prelevements 15
## COMMENTAIRES
## 1
## 2
## 3
## 4 Les taxons suivant, representant 7% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 4202.
## 5
## 6
## 7
## 8 Les taxons suivant, representant 10% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 3170, 3206, 4202.
## 9
## 10
## 11
## 12 Les taxons suivant, representant 13% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 1075, 3127, 3170, 4202.
## 13
## 14
## 15
## 16 Les taxons suivant, representant 12% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 3170, 3206, 4202, 9785.
## 17
## 18
## 19
## 20 Les taxons suivant, representant 14% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 1054, 3127, 3206, 4202, 3170.
## 21
## 22
## 23
## 24 Les taxons suivant, representant 14% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 3170, 4202, 3206.
## 25
## 26
## 27
## 28 Les taxons suivant, representant 4% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127.
## 29
## 30
## 31
## 32 Les taxons suivant, representant 8% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 4202.
## 33
## 34
## 35
## 36 Les taxons suivant, representant 8% des taxons du prelevement, n'ont pas ete pris en compte dans le calcul : 3127, 4202, 5238.