# 17 de setiembre de 2013

library(survey)
## Attaching package: 'survey'
## 
## The following object(s) are masked from 'package:graphics':
## 
## dotchart
options(OutDec = ",")


# load('~/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')

# load('C:/Users/usuario/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')

# load('~/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')
load("~/Dropbox/odontologia/maestria licet/setiembre2013/datos_licet_12092013.RData")

library(car)
## Loading required package: MASS Loading required package: nnet



modelomulti_ero.logit3 <- svyglm(erodentina.rec ~ Sexo + Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec + 
    Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + Yogurt.rec + 
    AlterGastrica.rec, design = diseniopost1, family = quasibinomial())
summary(modelomulti_ero.logit3)
## 
## Call:
## svyglm(formula = erodentina.rec ~ Sexo + Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec + 
##     Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + 
##     Yogurt.rec + AlterGastrica.rec, design = diseniopost1, family = quasibinomial())
## 
## Survey design:
## postStratify(disenio1, ~categor.rec + Sexo, tabla.pob)
## 
## Coefficients:
##                                                     Estimate Std. Error
## (Intercept)                                           -5,214      1,411
## SexoM                                                  1,327      0,476
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec2-HIGH SCHOOL          -0,554      0,373
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec3-COLLEGE-UNIVERSITY   -0,144      0,583
## Tipo.de.Escuela2-Privada                               0,969      0,696
## IGS.rec2-De 45 a 60                                    1,202      1,276
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                           1,817      1,125
## RefrCola.rec2-Todos los dias                           0,334      0,504
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                    0,909      0,740
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias               0,325      0,317
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia          1,837      0,759
## Yogurt.rec2-Todos los dias                            -1,719      0,708
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                         -1,468      0,770
## AlterGastrica.rec2-Yes                               -15,644      0,444
##                                                     t value Pr(>|t|)    
## (Intercept)                                           -3,70   0,0010 ** 
## SexoM                                                  2,79   0,0098 ** 
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec2-HIGH SCHOOL          -1,48   0,1498    
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec3-COLLEGE-UNIVERSITY   -0,25   0,8075    
## Tipo.de.Escuela2-Privada                               1,39   0,1754    
## IGS.rec2-De 45 a 60                                    0,94   0,3551    
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                           1,62   0,1182    
## RefrCola.rec2-Todos los dias                           0,66   0,5134    
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                    1,23   0,2305    
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias               1,03   0,3147    
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia          2,42   0,0228 *  
## Yogurt.rec2-Todos los dias                            -2,43   0,0224 *  
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                         -1,91   0,0676 .  
## AlterGastrica.rec2-Yes                               -35,22   <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0,001 '**' 0,01 '*' 0,05 '.' 0,1 ' ' 1 
## 
## (Dispersion parameter for quasibinomial family taken to be 0,7922)
## 
## Number of Fisher Scoring iterations: 17

confint(modelomulti_ero.logit3)
##                                                        2,5 %    97,5 %
## (Intercept)                                          -7,9788  -2,44937
## SexoM                                                 0,3933   2,26021
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec2-HIGH SCHOOL         -1,2847   0,17744
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec3-COLLEGE-UNIVERSITY  -1,2860   0,99896
## Tipo.de.Escuela2-Privada                             -0,3945   2,33300
## IGS.rec2-De 45 a 60                                  -1,2999   3,70306
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                         -0,3871   4,02147
## RefrCola.rec2-Todos los dias                         -0,6545   1,32297
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                  -0,5418   2,35889
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias             -0,2959   0,94492
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia         0,3494   3,32458
## Yogurt.rec2-Todos los dias                           -3,1059  -0,33160
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                        -2,9762   0,04071
## AlterGastrica.rec2-Yes                              -16,5142 -14,77328
reporte <- data.frame(modelomulti_ero.logit3$coefficients, exp(modelomulti_ero.logit3$coefficients))
colnames(reporte) <- c("coef", "exp_coef")
reporte
##                                                         coef  exp_coef
## (Intercept)                                          -5,2141 5,439e-03
## SexoM                                                 1,3268 3,769e+00
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec2-HIGH SCHOOL         -0,5537 5,748e-01
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec3-COLLEGE-UNIVERSITY  -0,1435 8,663e-01
## Tipo.de.Escuela2-Privada                              0,9693 2,636e+00
## IGS.rec2-De 45 a 60                                   1,2016 3,325e+00
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                          1,8172 6,155e+00
## RefrCola.rec2-Todos los dias                          0,3342 1,397e+00
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                   0,9085 2,481e+00
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias              0,3245 1,383e+00
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia         1,8370 6,278e+00
## Yogurt.rec2-Todos los dias                           -1,7188 1,793e-01
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                        -1,4678 2,304e-01
## AlterGastrica.rec2-Yes                              -15,6437 1,607e-07
modelomulti_ero.logit3
## Stratified 1 - level Cluster Sampling design (with replacement)
## With (44) clusters.
## postStratify(disenio1, ~categor.rec + Sexo, tabla.pob)
## 
## Call:  svyglm(formula = erodentina.rec ~ Sexo + Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec + 
##     Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + 
##     Yogurt.rec + AlterGastrica.rec, design = diseniopost1, family = quasibinomial())
## 
## Coefficients:
##                                         (Intercept)  
##                                              -5,214  
##                                               SexoM  
##                                               1,327  
##        Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec2-HIGH SCHOOL  
##                                              -0,554  
## Nive.Educativo.de.la.Madre2.rec3-COLLEGE-UNIVERSITY  
##                                              -0,144  
##                            Tipo.de.Escuela2-Privada  
##                                               0,969  
##                                 IGS.rec2-De 45 a 60  
##                                               1,202  
##                        IGS.rec3 -Menos o igual a 45  
##                                               1,817  
##                        RefrCola.rec2-Todos los dias  
##                                               0,334  
##                 RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia  
##                                               0,909  
##            Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias  
##                                               0,325  
##       Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia  
##                                               1,837  
##                          Yogurt.rec2-Todos los dias  
##                                              -1,719  
##                       Yogurt.rec3-Nunca o raramente  
##                                              -1,468  
##                              AlterGastrica.rec2-Yes  
##                                             -15,644  
## 
## Degrees of Freedom: 1013 Total (i.e. Null);  26 Residual
##   (140 observations deleted due to missingness)
## Null Deviance:       370 
## Residual Deviance: 322   AIC: NA