# 14 de setiembre de 2013

library(survey)
## Attaching package: 'survey'
## 
## The following object(s) are masked from 'package:graphics':
## 
## dotchart
options(OutDec = ",")


# load('~/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')

# load('C:/Users/usuario/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')

# load('~/Dropbox/odontologia/maestria
# licet/julio_2013/datos_licet_25072013.RData')
load("~/Dropbox/odontologia/maestria licet/setiembre2013/datos_licet_12092013.RData")

library(car)
## Loading required package: MASS Loading required package: nnet



modelomulti_ero.logit2 <- svyglm(erodentina.rec ~ Sexo + Nivel.Educativo.de.la.Madre1 + 
    Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + Yogurt.rec + 
    AlterGastrica.rec + bedeportediario.rec, design = diseniopost1, family = quasibinomial())
summary(modelomulti_ero.logit2)
## 
## Call:
## svyglm(formula = erodentina.rec ~ Sexo + Nivel.Educativo.de.la.Madre1 + 
##     Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + 
##     Yogurt.rec + AlterGastrica.rec + bedeportediario.rec, design = diseniopost1, 
##     family = quasibinomial())
## 
## Survey design:
## postStratify(disenio1, ~categor.rec + Sexo, tabla.pob)
## 
## Coefficients:
##                                                  Estimate Std. Error
## (Intercept)                                        -4,466      1,645
## SexoM                                               1,081      0,459
## Nivel.Educativo.de.la.Madre12-Elementary School    -1,104      0,586
## Nivel.Educativo.de.la.Madre13-High School          -1,289      0,695
## Nivel.Educativo.de.la.Madre14-College-University   -1,147      0,876
## Tipo.de.Escuela2-Privada                            0,802      0,635
## IGS.rec2-De 45 a 60                                 1,232      1,445
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                        1,941      1,234
## RefrCola.rec2-Todos los dias                        0,460      0,855
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                 1,070      1,023
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias            0,280      0,503
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia       1,489      0,966
## Yogurt.rec2-Todos los dias                         -1,615      0,793
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                      -1,596      0,766
## AlterGastrica.rec2-Yes                            -15,633      0,449
## bedeportediario.rec2-Gatorade                       0,496      0,851
## bedeportediario.rec3-other                         -1,394      1,218
##                                                  t value Pr(>|t|)    
## (Intercept)                                        -2,71    0,014 *  
## SexoM                                               2,35    0,030 *  
## Nivel.Educativo.de.la.Madre12-Elementary School    -1,88    0,076 .  
## Nivel.Educativo.de.la.Madre13-High School          -1,86    0,080 .  
## Nivel.Educativo.de.la.Madre14-College-University   -1,31    0,207    
## Tipo.de.Escuela2-Privada                            1,26    0,223    
## IGS.rec2-De 45 a 60                                 0,85    0,405    
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                        1,57    0,133    
## RefrCola.rec2-Todos los dias                        0,54    0,597    
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                 1,05    0,310    
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias            0,56    0,584    
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia       1,54    0,141    
## Yogurt.rec2-Todos los dias                         -2,04    0,057 .  
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                      -2,08    0,052 .  
## AlterGastrica.rec2-Yes                            -34,79   <2e-16 ***
## bedeportediario.rec2-Gatorade                       0,58    0,567    
## bedeportediario.rec3-other                         -1,14    0,267    
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0,001 '**' 0,01 '*' 0,05 '.' 0,1 ' ' 1 
## 
## (Dispersion parameter for quasibinomial family taken to be 0,7175)
## 
## Number of Fisher Scoring iterations: 17

confint(modelomulti_ero.logit2)
##                                                     2,5 %    97,5 %
## (Intercept)                                       -7,6899  -1,24149
## SexoM                                              0,1812   1,98015
## Nivel.Educativo.de.la.Madre12-Elementary School   -2,2530   0,04577
## Nivel.Educativo.de.la.Madre13-High School         -2,6509   0,07292
## Nivel.Educativo.de.la.Madre14-College-University  -2,8649   0,57062
## Tipo.de.Escuela2-Privada                          -0,4433   2,04721
## IGS.rec2-De 45 a 60                               -1,6001   4,06429
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                      -0,4778   4,36006
## RefrCola.rec2-Todos los dias                      -1,2167   2,13634
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia               -0,9364   3,07564
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias          -0,7054   1,26589
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia     -0,4048   3,38253
## Yogurt.rec2-Todos los dias                        -3,1698  -0,06065
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                     -3,0979  -0,09438
## AlterGastrica.rec2-Yes                           -16,5139 -14,75230
## bedeportediario.rec2-Gatorade                     -1,1724   2,16527
## bedeportediario.rec3-other                        -3,7803   0,99327
reporte <- data.frame(modelomulti_ero.logit2$coefficients, exp(modelomulti_ero.logit2$coefficients))
colnames(reporte) <- c("coef", "exp_coef")
reporte
##                                                      coef  exp_coef
## (Intercept)                                       -4,4657 1,150e-02
## SexoM                                              1,0807 2,947e+00
## Nivel.Educativo.de.la.Madre12-Elementary School   -1,1036 3,317e-01
## Nivel.Educativo.de.la.Madre13-High School         -1,2890 2,755e-01
## Nivel.Educativo.de.la.Madre14-College-University  -1,1471 3,175e-01
## Tipo.de.Escuela2-Privada                           0,8020 2,230e+00
## IGS.rec2-De 45 a 60                                1,2321 3,428e+00
## IGS.rec3 -Menos o igual a 45                       1,9411 6,967e+00
## RefrCola.rec2-Todos los dias                       0,4598 1,584e+00
## RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia                1,0696 2,914e+00
## Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias           0,2802 1,323e+00
## Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia      1,4889 4,432e+00
## Yogurt.rec2-Todos los dias                        -1,6152 1,988e-01
## Yogurt.rec3-Nunca o raramente                     -1,5961 2,027e-01
## AlterGastrica.rec2-Yes                           -15,6331 1,624e-07
## bedeportediario.rec2-Gatorade                      0,4964 1,643e+00
## bedeportediario.rec3-other                        -1,3935 2,482e-01
modelomulti_ero.logit2
## Stratified 1 - level Cluster Sampling design (with replacement)
## With (44) clusters.
## postStratify(disenio1, ~categor.rec + Sexo, tabla.pob)
## 
## Call:  svyglm(formula = erodentina.rec ~ Sexo + Nivel.Educativo.de.la.Madre1 + 
##     Tipo.de.Escuela + IGS.rec + RefrCola.rec + Bebidas_energizantes.rec + 
##     Yogurt.rec + AlterGastrica.rec + bedeportediario.rec, design = diseniopost1, 
##     family = quasibinomial())
## 
## Coefficients:
##                                      (Intercept)  
##                                           -4,466  
##                                            SexoM  
##                                            1,081  
##  Nivel.Educativo.de.la.Madre12-Elementary School  
##                                           -1,104  
##        Nivel.Educativo.de.la.Madre13-High School  
##                                           -1,289  
## Nivel.Educativo.de.la.Madre14-College-University  
##                                           -1,147  
##                         Tipo.de.Escuela2-Privada  
##                                            0,802  
##                              IGS.rec2-De 45 a 60  
##                                            1,232  
##                     IGS.rec3 -Menos o igual a 45  
##                                            1,941  
##                     RefrCola.rec2-Todos los dias  
##                                            0,460  
##              RefrCola.rec3-Mas de 3 veces al dia  
##                                            1,070  
##         Bebidas_energizantes.rec2-Todos los dias  
##                                            0,280  
##    Bebidas_energizantes.recMas de 3 veces al dia  
##                                            1,489  
##                       Yogurt.rec2-Todos los dias  
##                                           -1,615  
##                    Yogurt.rec3-Nunca o raramente  
##                                           -1,596  
##                           AlterGastrica.rec2-Yes  
##                                          -15,633  
##                    bedeportediario.rec2-Gatorade  
##                                            0,496  
##                       bedeportediario.rec3-other  
##                                           -1,394  
## 
## Degrees of Freedom: 876 Total (i.e. Null);  18 Residual
##   (277 observations deleted due to missingness)
## Null Deviance:       321 
## Residual Deviance: 274   AIC: NA