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Detecção de pontos de mudança na curva de novos casos de covid-19

Magno T F Severino

KSS - Santander

17/11/2021

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Casos diários reportados no Brasil (2020)

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Média móvel de casos semanais reportados no Brasil (2020)

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Média móvel de casos semanais reportados no Brasil (2020)

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Média móvel de casos semanais reportados no Brasil (2020)

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Média móvel de casos semanais reportados no Brasil (2020)

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Regressão usando splines

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Definição

Problema de regressão não paramétrica da forma

yi=f(xi)+ϵi,i=1,...,n,

  • xiR;
  • f é uma função suave desconhecida em [a,b];
  • f(xi)=E(yi|xi);
  • ϵi são iid com E(ϵi)=0.
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Definição

Para estimar f, defina uma partição de [a,b] em intervalos [a,t1),[t1,t2),...,[tK,b] e um modelo de regressão spline de ordem m=p+1,

f(x)=β0+pj=1βjxj+Kk=1βp+k(xtk)p+,

  • p,KZ+,
  • \boldsymbol{\beta} = [\beta_0,...,\beta_{p+K}]',
  • (u)_{+}^{p} = u^{p}\mathbb{1}(u \geq 0),
  • t_1 <...<t_{K}.
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Método

Soma de quadrados de resíduos penalizada

\begin{equation} PSS_{\lambda}(\boldsymbol{\theta};\boldsymbol{y}) = \sum_{i=1}^{n}[y_i - f(x_i)]^2 + \lambda (K+1), \end{equation}

  • \boldsymbol{y} = [y_1,...,y_n]',
  • f é a função spline,
  • \lambda>0 é a constante de penalização.

O estimador \boldsymbol{\hat{\theta}} é obtido por \begin{equation} \boldsymbol{\hat{\theta}} = \arg \min_{\boldsymbol{\theta}} PSS_{\lambda}(\boldsymbol{\theta};\boldsymbol{y}). \end{equation}

  • \boldsymbol{\theta} = [\boldsymbol{\beta}, K, t_1,...,t_K]'.
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www.ime.usp.br/~gpeca

Inicio da pandemia em São Paulo/SP

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Inicio da pandemia em São Paulo/SP

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Taxa de duplicação em São Paulo/SP

Período Taxa de mortalidade acumulada Taxa de duplicação
15/03 - 30/03 8,8% 3,6 dias
31/03 - 23/04 8,2% 66,8 dias
24/04 - 29/04 8,7% 6,3 dias
30/04 - 20/05 8% 38,2 dias
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Suiça

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Suíça

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Suíça

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Splines cúbicos

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Suiça

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Como aplicar esse método em outuros contextos?

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Referências

  • Sousa, Alex Rodrigo dos S., Magno TF Severino, and Florencia G. Leonardi. "Model selection criteria for regression models with splines and the automatic localization of knots." arXiv preprint arXiv:2006.02649 (2020);

  • Hastie, Trevor, Robert Tibshirani, and Jerome Friedman. The elements of statistical learning: data mining, inference, and prediction. Springer Science & Business Media, 2009;

  • opendata.ecdc.europa.eu/covid19/;

  • Brasil.io;

  • www.worldometers.info/coronavirus/.

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Casos diários reportados no Brasil (2020)

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