\[ACTIVIDAD...1\]
library(dplyr)##
## Attaching package: 'dplyr'## The following objects are masked from 'package:stats':
##
## filter, lag## The following objects are masked from 'package:base':
##
## intersect, setdiff, setequal, unionset.seed(2099)
biomasa<-round(rnorm(120,5,0.85),2)
flores.r<-rbinom(120,20,0.8)
flores.d<-rpois(120,10.5)
hojas.d<-sample.int(300,120,replace = TRUE)
library(purrr)
plaga<-rbernoulli(120,0.75)
plaga<-ifelse(plaga==FALSE, "Ausente", "Presente")
estatus<-gl(3,40,labels=c("S","PA","MA"))
fertilizacion<-runif(120,0,1.2)
fertilizacion<-ifelse(fertilizacion<0.5,"FO","FI")\[ACTIVIDAD..2\]
tib.c<-data.frame(biomasa,flores.r,flores.d,hojas.d,plaga,estatus,fertilizacion)
tib.c## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.19 16 1 150 Presente S FO
## 2 4.68 19 13 197 Ausente S FI
## 3 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 4 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 5 4.86 17 8 277 Ausente S FI
## 6 4.28 16 19 89 Presente S FI
## 7 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 8 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 9 4.81 17 8 121 Presente S FO
## 10 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 11 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 12 4.33 16 10 57 Ausente S FO
## 13 4.14 12 11 203 Presente S FO
## 14 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 15 4.09 16 13 83 Presente S FO
## 16 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 17 4.20 17 8 237 Presente S FO
## 18 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 19 4.65 15 7 281 Presente S FI
## 20 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 21 4.73 17 8 84 Presente S FO
## 22 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 23 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 24 4.53 20 9 75 Presente S FI
## 25 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 26 3.79 17 6 300 Ausente S FO
## 27 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 28 6.00 16 11 38 Presente S FO
## 29 5.39 18 10 164 Presente S FI
## 30 4.30 18 10 199 Ausente S FO
## 31 4.71 16 12 235 Ausente S FO
## 32 4.97 14 9 26 Presente S FI
## 33 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 34 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 35 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 36 4.90 17 11 227 Presente S FI
## 37 6.09 14 11 222 Presente S FI
## 38 4.06 12 10 59 Ausente S FI
## 39 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 40 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 41 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 42 5.55 16 11 105 Presente PA FI
## 43 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 44 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 45 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 46 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 47 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 48 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 49 4.66 15 9 119 Ausente PA FO
## 50 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 51 4.57 14 6 60 Ausente PA FI
## 52 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 53 4.08 14 13 138 Presente PA FI
## 54 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 55 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 56 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 57 4.68 17 5 3 Presente PA FO
## 58 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 59 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 60 3.28 16 5 33 Presente PA FO
## 61 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 62 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 63 3.90 17 10 58 Presente PA FO
## 64 6.13 15 10 286 Ausente PA FI
## 65 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 66 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 67 4.08 13 13 265 Presente PA FI
## 68 3.72 18 10 72 Presente PA FI
## 69 5.19 17 11 157 Presente PA FI
## 70 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 71 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 72 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 73 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 74 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 75 5.53 15 16 218 Ausente PA FI
## 76 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 77 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 78 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 79 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 80 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 81 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 82 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 83 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 84 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 85 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 86 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 87 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 88 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 89 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 90 5.14 16 8 225 Presente MA FO
## 91 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
## 92 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 93 5.73 16 10 222 Presente MA FO
## 94 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 95 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 96 3.89 16 13 86 Presente MA FI
## 97 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 98 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 99 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 100 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 101 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 102 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 103 4.51 15 13 25 Presente MA FI
## 104 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 105 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 106 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 107 4.80 15 13 264 Presente MA FI
## 108 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 109 4.14 17 12 199 Presente MA FO
## 110 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 111 4.41 17 11 283 Presente MA FI
## 112 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 113 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 114 4.48 16 7 291 Presente MA FO
## 115 5.20 16 10 165 Presente MA FO
## 116 4.96 15 10 236 Presente MA FI
## 117 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 118 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 119 6.71 20 12 129 Presente MA FI
## 120 4.62 18 9 190 Ausente MA FOdim(tib.c)## [1] 120 7str(tib.c)## 'data.frame': 120 obs. of 7 variables:
## $ biomasa : num 5.19 4.68 5.44 3.53 4.86 4.28 5.06 6.37 4.81 5.88 ...
## $ flores.r : int 16 19 20 17 17 16 16 16 17 17 ...
## $ flores.d : int 1 13 10 13 8 19 8 8 8 8 ...
## $ hojas.d : int 150 197 279 118 277 89 253 54 121 37 ...
## $ plaga : chr "Presente" "Ausente" "Presente" "Presente" ...
## $ estatus : Factor w/ 3 levels "S","PA","MA": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
## $ fertilizacion: chr "FO" "FI" "FI" "FI" ...class(tib.c)## [1] "data.frame"names(tib.c)## [1] "biomasa" "flores.r" "flores.d" "hojas.d"
## [5] "plaga" "estatus" "fertilizacion"is.na(tib.c)## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## [1,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
## [2,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
## [3,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
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## [117,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
## [118,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
## [119,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
## [120,] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSEtib.i<-sample_n(tib.c,90)
tib.i[1,4]<-NA
tib.i[65,2]<-NA
tib.i## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.73 16 10 NA Presente MA FO
## 2 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 3 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 4 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 5 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 6 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 7 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 8 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 9 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 10 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 11 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 12 4.33 16 10 57 Ausente S FO
## 13 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 14 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 15 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 16 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 17 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 18 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 19 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 20 4.62 18 9 190 Ausente MA FO
## 21 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 22 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 23 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 24 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 25 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 26 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 27 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 28 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 29 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 30 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 31 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 32 4.09 16 13 83 Presente S FO
## 33 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 34 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 35 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 36 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 37 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 38 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 39 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 40 4.71 16 12 235 Ausente S FO
## 41 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 42 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 43 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 44 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 45 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 46 4.14 12 11 203 Presente S FO
## 47 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 48 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 49 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 50 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 51 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 52 4.53 20 9 75 Presente S FI
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## 54 4.39 14 14 18 Presente PA FI
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## 56 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 57 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 58 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 59 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 60 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 61 4.81 17 8 121 Presente S FO
## 62 4.65 15 7 281 Presente S FI
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## 64 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 65 5.14 NA 8 225 Presente MA FO
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## 67 5.44 20 10 279 Presente S FI
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## 70 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
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## 75 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
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## 78 4.30 18 10 199 Ausente S FO
## 79 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 80 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 81 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 82 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 83 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 84 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 85 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 86 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 87 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 88 4.20 17 8 237 Presente S FO
## 89 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 90 5.83 16 11 141 Presente PA FO\[ACTIVIDAD..3\]
select(tib.c,flores.r)## flores.r
## 1 16
## 2 19
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## 5 17
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## 7 16
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## 64 15
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## 39 13
## 40 10
## 41 6
## 42 11
## 43 7
## 44 14
## 45 10
## 46 14
## 47 7
## 48 11
## 49 9
## 50 13
## 51 6
## 52 12
## 53 13
## 54 15
## 55 7
## 56 6
## 57 5
## 58 13
## 59 12
## 60 5
## 61 9
## 62 8
## 63 10
## 64 10
## 65 12
## 66 14
## 67 13
## 68 10
## 69 11
## 70 8
## 71 14
## 72 13
## 73 11
## 74 5
## 75 16
## 76 12
## 77 14
## 78 14
## 79 11
## 80 9
## 81 12
## 82 9
## 83 11
## 84 8
## 85 10
## 86 7
## 87 10
## 88 11
## 89 12
## 90 8
## 91 4
## 92 9
## 93 10
## 94 8
## 95 13
## 96 13
## 97 19
## 98 15
## 99 9
## 100 14
## 101 7
## 102 10
## 103 13
## 104 12
## 105 12
## 106 11
## 107 13
## 108 10
## 109 12
## 110 7
## 111 11
## 112 12
## 113 4
## 114 7
## 115 10
## 116 10
## 117 6
## 118 11
## 119 12
## 120 9var.estatus<-tib.c %>% group_by(estatus) %>% select(flores.d)## Adding missing grouping variables: `estatus`var.estatus<-var.estatus %>% arrange(desc(flores.d),.by_group = TRUE)
var.estatus## # A tibble: 120 x 2
## # Groups: estatus [3]
## estatus flores.d
## <fct> <int>
## 1 S 19
## 2 S 14
## 3 S 14
## 4 S 13
## 5 S 13
## 6 S 13
## 7 S 13
## 8 S 13
## 9 S 12
## 10 S 12
## # ... with 110 more rowsfloresMA<-tib.c %>% select(starts_with("flores")) %>% filter(estatus== "MA")
floresMA## flores.r flores.d
## 1 17 12
## 2 14 9
## 3 16 11
## 4 16 8
## 5 17 10
## 6 17 7
## 7 14 10
## 8 18 11
## 9 14 12
## 10 16 8
## 11 16 4
## 12 14 9
## 13 16 10
## 14 16 8
## 15 15 13
## 16 16 13
## 17 16 19
## 18 18 15
## 19 14 9
## 20 15 14
## 21 13 7
## 22 17 10
## 23 15 13
## 24 11 12
## 25 17 12
## 26 19 11
## 27 15 13
## 28 14 10
## 29 17 12
## 30 18 7
## 31 17 11
## 32 16 12
## 33 15 4
## 34 16 7
## 35 16 10
## 36 15 10
## 37 15 6
## 38 18 11
## 39 20 12
## 40 18 9bio5<-tib.c %>% filter(biomasa > 5)
bio5## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.19 16 1 150 Presente S FO
## 2 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 3 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 4 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 5 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 6 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 7 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 8 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 9 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 10 6.00 16 11 38 Presente S FO
## 11 5.39 18 10 164 Presente S FI
## 12 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 13 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 14 6.09 14 11 222 Presente S FI
## 15 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 16 5.55 16 11 105 Presente PA FI
## 17 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 18 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 19 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 20 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 21 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 22 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 23 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 24 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 25 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 26 6.13 15 10 286 Ausente PA FI
## 27 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 28 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 29 5.19 17 11 157 Presente PA FI
## 30 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 31 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 32 5.53 15 16 218 Ausente PA FI
## 33 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 34 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 35 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 36 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 37 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 38 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 39 5.14 16 8 225 Presente MA FO
## 40 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 41 5.73 16 10 222 Presente MA FO
## 42 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 43 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 44 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 45 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 46 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 47 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 48 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 49 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 50 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 51 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 52 5.20 16 10 165 Presente MA FO
## 53 6.71 20 12 129 Presente MA FIpa.fo<-tib.c %>% filter(estatus=="PA", fertilizacion=="FO")
pa.fo## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 2 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 3 4.66 15 9 119 Ausente PA FO
## 4 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 5 4.68 17 5 3 Presente PA FO
## 6 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 7 3.28 16 5 33 Presente PA FO
## 8 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 9 3.90 17 10 58 Presente PA FO
## 10 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 11 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 12 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 13 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 14 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 15 4.58 14 9 185 Ausente PA FOpa.fi<-tib.c %>% filter(estatus=="PA"| fertilizacion=="FI")
pa.fi## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 4.68 19 13 197 Ausente S FI
## 2 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 3 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 4 4.86 17 8 277 Ausente S FI
## 5 4.28 16 19 89 Presente S FI
## 6 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 7 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 8 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 9 4.65 15 7 281 Presente S FI
## 10 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 11 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 12 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 13 4.53 20 9 75 Presente S FI
## 14 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 15 5.39 18 10 164 Presente S FI
## 16 4.97 14 9 26 Presente S FI
## 17 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 18 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 19 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 20 4.90 17 11 227 Presente S FI
## 21 6.09 14 11 222 Presente S FI
## 22 4.06 12 10 59 Ausente S FI
## 23 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 24 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 25 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 26 5.55 16 11 105 Presente PA FI
## 27 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 28 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 29 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 30 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 31 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 32 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 33 4.66 15 9 119 Ausente PA FO
## 34 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 35 4.57 14 6 60 Ausente PA FI
## 36 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 37 4.08 14 13 138 Presente PA FI
## 38 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 39 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 40 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 41 4.68 17 5 3 Presente PA FO
## 42 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 43 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 44 3.28 16 5 33 Presente PA FO
## 45 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 46 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 47 3.90 17 10 58 Presente PA FO
## 48 6.13 15 10 286 Ausente PA FI
## 49 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 50 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 51 4.08 13 13 265 Presente PA FI
## 52 3.72 18 10 72 Presente PA FI
## 53 5.19 17 11 157 Presente PA FI
## 54 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 55 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 56 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 57 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 58 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 59 5.53 15 16 218 Ausente PA FI
## 60 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 61 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 62 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 63 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 64 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 65 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 66 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 67 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 68 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 69 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 70 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 71 3.89 16 13 86 Presente MA FI
## 72 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 73 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 74 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 75 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 76 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 77 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 78 4.51 15 13 25 Presente MA FI
## 79 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 80 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 81 4.80 15 13 264 Presente MA FI
## 82 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 83 4.41 17 11 283 Presente MA FI
## 84 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 85 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 86 4.96 15 10 236 Presente MA FI
## 87 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 88 6.71 20 12 129 Presente MA FIflores.des<-tib.c %>% select(flores.d,plaga) %>% filter(flores.d>median(flores.d))
flores.des## flores.d plaga
## 1 13 Ausente
## 2 13 Presente
## 3 19 Presente
## 4 12 Presente
## 5 11 Presente
## 6 13 Presente
## 7 11 Presente
## 8 14 Presente
## 9 14 Presente
## 10 13 Presente
## 11 11 Presente
## 12 12 Ausente
## 13 11 Ausente
## 14 11 Presente
## 15 11 Presente
## 16 13 Presente
## 17 11 Presente
## 18 14 Presente
## 19 14 Presente
## 20 11 Presente
## 21 13 Ausente
## 22 12 Presente
## 23 13 Presente
## 24 15 Ausente
## 25 13 Ausente
## 26 12 Presente
## 27 12 Ausente
## 28 14 Presente
## 29 13 Presente
## 30 11 Presente
## 31 14 Presente
## 32 13 Presente
## 33 11 Ausente
## 34 16 Ausente
## 35 12 Presente
## 36 14 Presente
## 37 14 Presente
## 38 11 Presente
## 39 12 Ausente
## 40 11 Presente
## 41 11 Presente
## 42 12 Presente
## 43 13 Presente
## 44 13 Presente
## 45 19 Presente
## 46 15 Presente
## 47 14 Presente
## 48 13 Presente
## 49 12 Presente
## 50 12 Ausente
## 51 11 Ausente
## 52 13 Presente
## 53 12 Presente
## 54 11 Presente
## 55 12 Ausente
## 56 11 Ausente
## 57 12 Presenteplaga.i<- tib.i %>% select(flores.r,plaga) %>% filter(flores.r>median(flores.r,na.rm = TRUE))
plaga.i## flores.r plaga
## 1 18 Presente
## 2 17 Presente
## 3 17 Presente
## 4 17 Ausente
## 5 17 Presente
## 6 17 Ausente
## 7 18 Presente
## 8 17 Presente
## 9 17 Presente
## 10 18 Ausente
## 11 18 Presente
## 12 17 Presente
## 13 19 Presente
## 14 17 Presente
## 15 17 Presente
## 16 18 Presente
## 17 18 Presente
## 18 17 Ausente
## 19 17 Presente
## 20 17 Presente
## 21 20 Presente
## 22 17 Presente
## 23 20 Presente
## 24 19 Ausente
## 25 17 Presente
## 26 17 Presente
## 27 17 Ausente
## 28 18 Ausente
## 29 17 Ausente
## 30 17 Ausente
## 31 19 Ausente
## 32 19 Presente
## 33 18 Ausente
## 34 18 Presente
## 35 17 Presentemedian(tib.c $flores.r)## [1] 16median(tib.i$flores.r,na.rm = TRUE)## [1] 16\[ACTIVIDAD..4\]
v1<-c(tib.c$flores.r,flores.d)
v2<-c(quantile(tib.c$flores.r,0.25),quantile(tib.c$flores.d,0.75))
tib.c %>% filter((v1[[1]]>v2[[1]]),(v1[[2]]>v2[[2]]))## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.19 16 1 150 Presente S FO
## 2 4.68 19 13 197 Ausente S FI
## 3 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 4 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 5 4.86 17 8 277 Ausente S FI
## 6 4.28 16 19 89 Presente S FI
## 7 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 8 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 9 4.81 17 8 121 Presente S FO
## 10 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 11 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 12 4.33 16 10 57 Ausente S FO
## 13 4.14 12 11 203 Presente S FO
## 14 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 15 4.09 16 13 83 Presente S FO
## 16 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 17 4.20 17 8 237 Presente S FO
## 18 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 19 4.65 15 7 281 Presente S FI
## 20 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 21 4.73 17 8 84 Presente S FO
## 22 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 23 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 24 4.53 20 9 75 Presente S FI
## 25 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 26 3.79 17 6 300 Ausente S FO
## 27 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 28 6.00 16 11 38 Presente S FO
## 29 5.39 18 10 164 Presente S FI
## 30 4.30 18 10 199 Ausente S FO
## 31 4.71 16 12 235 Ausente S FO
## 32 4.97 14 9 26 Presente S FI
## 33 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 34 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 35 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 36 4.90 17 11 227 Presente S FI
## 37 6.09 14 11 222 Presente S FI
## 38 4.06 12 10 59 Ausente S FI
## 39 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 40 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 41 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 42 5.55 16 11 105 Presente PA FI
## 43 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 44 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 45 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 46 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 47 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 48 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 49 4.66 15 9 119 Ausente PA FO
## 50 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 51 4.57 14 6 60 Ausente PA FI
## 52 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 53 4.08 14 13 138 Presente PA FI
## 54 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 55 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 56 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 57 4.68 17 5 3 Presente PA FO
## 58 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 59 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 60 3.28 16 5 33 Presente PA FO
## 61 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 62 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 63 3.90 17 10 58 Presente PA FO
## 64 6.13 15 10 286 Ausente PA FI
## 65 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 66 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 67 4.08 13 13 265 Presente PA FI
## 68 3.72 18 10 72 Presente PA FI
## 69 5.19 17 11 157 Presente PA FI
## 70 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 71 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 72 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 73 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 74 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 75 5.53 15 16 218 Ausente PA FI
## 76 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 77 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 78 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 79 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 80 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 81 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 82 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 83 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 84 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 85 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 86 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 87 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 88 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 89 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 90 5.14 16 8 225 Presente MA FO
## 91 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
## 92 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 93 5.73 16 10 222 Presente MA FO
## 94 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 95 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 96 3.89 16 13 86 Presente MA FI
## 97 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 98 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 99 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 100 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 101 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 102 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 103 4.51 15 13 25 Presente MA FI
## 104 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 105 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 106 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 107 4.80 15 13 264 Presente MA FI
## 108 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 109 4.14 17 12 199 Presente MA FO
## 110 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 111 4.41 17 11 283 Presente MA FI
## 112 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 113 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 114 4.48 16 7 291 Presente MA FO
## 115 5.20 16 10 165 Presente MA FO
## 116 4.96 15 10 236 Presente MA FI
## 117 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 118 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 119 6.71 20 12 129 Presente MA FI
## 120 4.62 18 9 190 Ausente MA FOtib.e<-(mutate(tib.c,biomasa.est=((biomasa-5)/0.85), flores.r.est=((flores.r-min(flores.r))/(max(flores.r)-min(flores.r))),flores.d.est= ((flores.d-min(flores.d))/(max(flores.d)-min(flores.d))),hojas.d.est=( (hojas.d-min(hojas.d))/(max(hojas.d)-min(hojas.d)))))
tib.e<- data.frame("biomasa.estandarizada"=tib.e$biomasa.est,"flores.r.estandarizada"=tib.e$flores.r.est,"flores.d.estandarizada"=tib.e$flores.d.est,"hojas.d.estandarizada"=tib.e$hojas.d.est)
tib.e## biomasa.estandarizada flores.r.estandarizada flores.d.estandarizada
## 1 0.22352941 0.5555556 0.0000000
## 2 -0.37647059 0.8888889 0.6666667
## 3 0.51764706 1.0000000 0.5000000
## 4 -1.72941176 0.6666667 0.6666667
## 5 -0.16470588 0.6666667 0.3888889
## 6 -0.84705882 0.5555556 1.0000000
## 7 0.07058824 0.5555556 0.3888889
## 8 1.61176471 0.5555556 0.3888889
## 9 -0.22352941 0.6666667 0.3888889
## 10 1.03529412 0.6666667 0.3888889
## 11 0.64705882 0.4444444 0.6111111
## 12 -0.78823529 0.5555556 0.5000000
## 13 -1.01176471 0.1111111 0.5555556
## 14 -1.24705882 0.6666667 0.3888889
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## 16 0.16470588 0.3333333 0.5000000
## 17 -0.94117647 0.6666667 0.3888889
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## 19 -0.41176471 0.4444444 0.3333333
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## 22 1.02352941 0.8888889 0.7222222
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## 26 -1.42352941 0.6666667 0.2777778
## 27 -1.78823529 0.4444444 0.3888889
## 28 1.17647059 0.5555556 0.5555556
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## 33 -0.14117647 0.5555556 0.5555556
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## 52 1.24705882 0.5555556 0.6111111
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## 54 0.27058824 0.5555556 0.7777778
## 55 1.58823529 0.6666667 0.3333333
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## 61 0.98823529 0.8888889 0.4444444
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## 120 -0.44705882 0.7777778 0.4444444
## hojas.d.estandarizada
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## 16 0.496644295
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## 20 0.429530201
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## 118 0.268456376
## 119 0.426174497
## 120 0.630872483tib.c<-mutate(tib.c,division.flores=(flores.r/flores.d))
tib.c## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.19 16 1 150 Presente S FO
## 2 4.68 19 13 197 Ausente S FI
## 3 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 4 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 5 4.86 17 8 277 Ausente S FI
## 6 4.28 16 19 89 Presente S FI
## 7 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 8 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 9 4.81 17 8 121 Presente S FO
## 10 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 11 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 12 4.33 16 10 57 Ausente S FO
## 13 4.14 12 11 203 Presente S FO
## 14 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 15 4.09 16 13 83 Presente S FO
## 16 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 17 4.20 17 8 237 Presente S FO
## 18 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 19 4.65 15 7 281 Presente S FI
## 20 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 21 4.73 17 8 84 Presente S FO
## 22 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 23 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 24 4.53 20 9 75 Presente S FI
## 25 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 26 3.79 17 6 300 Ausente S FO
## 27 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 28 6.00 16 11 38 Presente S FO
## 29 5.39 18 10 164 Presente S FI
## 30 4.30 18 10 199 Ausente S FO
## 31 4.71 16 12 235 Ausente S FO
## 32 4.97 14 9 26 Presente S FI
## 33 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 34 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 35 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 36 4.90 17 11 227 Presente S FI
## 37 6.09 14 11 222 Presente S FI
## 38 4.06 12 10 59 Ausente S FI
## 39 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 40 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 41 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 42 5.55 16 11 105 Presente PA FI
## 43 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 44 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 45 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 46 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 47 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 48 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 49 4.66 15 9 119 Ausente PA FO
## 50 5.74 15 13 250 Ausente PA FO
## 51 4.57 14 6 60 Ausente PA FI
## 52 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 53 4.08 14 13 138 Presente PA FI
## 54 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 55 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 56 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 57 4.68 17 5 3 Presente PA FO
## 58 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 59 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 60 3.28 16 5 33 Presente PA FO
## 61 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
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## 63 3.90 17 10 58 Presente PA FO
## 64 6.13 15 10 286 Ausente PA FI
## 65 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 66 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 67 4.08 13 13 265 Presente PA FI
## 68 3.72 18 10 72 Presente PA FI
## 69 5.19 17 11 157 Presente PA FI
## 70 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 71 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 72 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 73 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 74 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 75 5.53 15 16 218 Ausente PA FI
## 76 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 77 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 78 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 79 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 80 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 81 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 82 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 83 5.78 16 11 169 Presente MA FI
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## 85 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 86 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 87 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 88 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 89 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 90 5.14 16 8 225 Presente MA FO
## 91 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
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## 94 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 95 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 96 3.89 16 13 86 Presente MA FI
## 97 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 98 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 99 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 100 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 101 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 102 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 103 4.51 15 13 25 Presente MA FI
## 104 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 105 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 106 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 107 4.80 15 13 264 Presente MA FI
## 108 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 109 4.14 17 12 199 Presente MA FO
## 110 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 111 4.41 17 11 283 Presente MA FI
## 112 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 113 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 114 4.48 16 7 291 Presente MA FO
## 115 5.20 16 10 165 Presente MA FO
## 116 4.96 15 10 236 Presente MA FI
## 117 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 118 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 119 6.71 20 12 129 Presente MA FI
## 120 4.62 18 9 190 Ausente MA FO
## division.flores
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## 3 2.0000000
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## 7 2.0000000
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## 9 2.1250000
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## 12 1.6000000
## 13 1.0909091
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## 17 2.1250000
## 18 1.1818182
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## 30 1.8000000
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## 40 1.1000000
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## 48 1.3636364
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## 65 1.4166667
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## 119 1.6666667
## 120 2.0000000tib.c %>% select(division.flores, plaga) %>% mutate( rangomin = min_rank(division.flores)) %>% arrange(desc(rangomin))## division.flores plaga rangomin
## 1 16.0000000 Presente 120
## 2 4.0000000 Ausente 119
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## 5 3.2000000 Ausente 114
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## 10 2.5714286 Presente 110
## 11 2.5714286 Presente 110
## 12 2.5000000 Presente 109
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## 14 2.4285714 Presente 106
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## 22 2.1250000 Presente 94
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## 28 2.1111111 Ausente 93
## 29 2.0000000 Presente 85
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## 43 1.8000000 Presente 78
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## 51 1.6363636 Ausente 70
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## 69 1.4615385 Presente 52
## 70 1.4545455 Presente 47
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## 81 1.4000000 Presente 39
## 82 1.4000000 Presente 39
## 83 1.3636364 Presente 38
## 84 1.3571429 Presente 37
## 85 1.3333333 Ausente 34
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## 87 1.3333333 Ausente 34
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## 89 1.3076923 Presente 32
## 90 1.2727273 Presente 31
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## 93 1.2307692 Presente 28
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## 95 1.2142857 Presente 26
## 96 1.2000000 Ausente 24
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## 100 1.1538462 Ausente 18
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## 104 1.1428571 Presente 16
## 105 1.1428571 Presente 16
## 106 1.1000000 Ausente 15
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## 115 1.0000000 Presente 6
## 116 0.9375000 Ausente 5
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## 118 0.9166667 Presente 3
## 119 0.8421053 Presente 1
## 120 0.8421053 Presente 1tib.e<-rename(tib.e,flor.r=flores.r.estandarizada,flor.d=flores.d.estandarizada)
rename_with(tib.e,toupper)## BIOMASA.ESTANDARIZADA FLOR.R FLOR.D HOJAS.D.ESTANDARIZADA
## 1 0.22352941 0.5555556 0.0000000 0.496644295
## 2 -0.37647059 0.8888889 0.6666667 0.654362416
## 3 0.51764706 1.0000000 0.5000000 0.929530201
## 4 -1.72941176 0.6666667 0.6666667 0.389261745
## 5 -0.16470588 0.6666667 0.3888889 0.922818792
## 6 -0.84705882 0.5555556 1.0000000 0.291946309
## 7 0.07058824 0.5555556 0.3888889 0.842281879
## 8 1.61176471 0.5555556 0.3888889 0.174496644
## 9 -0.22352941 0.6666667 0.3888889 0.399328859
## 10 1.03529412 0.6666667 0.3888889 0.117449664
## 11 0.64705882 0.4444444 0.6111111 0.000000000
## 12 -0.78823529 0.5555556 0.5000000 0.184563758
## 13 -1.01176471 0.1111111 0.5555556 0.674496644
## 14 -1.24705882 0.6666667 0.3888889 0.221476510
## 15 -1.07058824 0.5555556 0.6666667 0.271812081
## 16 0.16470588 0.3333333 0.5000000 0.496644295
## 17 -0.94117647 0.6666667 0.3888889 0.788590604
## 18 -1.25882353 0.2222222 0.5555556 0.100671141
## 19 -0.41176471 0.4444444 0.3333333 0.936241611
## 20 -0.75294118 0.5555556 0.2222222 0.429530201
## 21 -0.31764706 0.6666667 0.3888889 0.275167785
## 22 1.02352941 0.8888889 0.7222222 0.872483221
## 23 -1.68235294 0.6666667 0.7222222 0.255033557
## 24 -0.55294118 1.0000000 0.4444444 0.244966443
## 25 0.57647059 0.3333333 0.6666667 0.802013423
## 26 -1.42352941 0.6666667 0.2777778 1.000000000
## 27 -1.78823529 0.4444444 0.3888889 0.852348993
## 28 1.17647059 0.5555556 0.5555556 0.120805369
## 29 0.45882353 0.7777778 0.5000000 0.543624161
## 30 -0.82352941 0.7777778 0.5000000 0.661073826
## 31 -0.34117647 0.5555556 0.6111111 0.781879195
## 32 -0.03529412 0.3333333 0.4444444 0.080536913
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## 34 1.98823529 0.6666667 0.3333333 0.620805369
## 35 2.09411765 0.7777778 0.3333333 0.744966443
## 36 -0.11764706 0.6666667 0.5555556 0.755033557
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## 38 -1.10588235 0.1111111 0.5000000 0.191275168
## 39 0.36470588 0.8888889 0.6666667 0.617449664
## 40 -0.49411765 0.0000000 0.5000000 0.023489933
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## 50 0.87058824 0.4444444 0.6666667 0.832214765
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## 53 -1.08235294 0.3333333 0.6666667 0.456375839
## 54 0.27058824 0.5555556 0.7777778 0.120805369
## 55 1.58823529 0.6666667 0.3333333 0.097315436
## 56 -0.64705882 0.0000000 0.2777778 0.365771812
## 57 -0.37647059 0.6666667 0.2222222 0.003355705
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## 60 -2.02352941 0.5555556 0.2222222 0.104026846
## 61 0.98823529 0.8888889 0.4444444 0.197986577
## 62 -0.03529412 0.6666667 0.3888889 0.624161074
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## 65 1.02352941 0.6666667 0.6111111 0.500000000
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## 76 -2.20000000 0.7777778 0.6111111 0.395973154
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## 79 0.97647059 0.5555556 0.5555556 0.466442953
## 80 -0.49411765 0.3333333 0.4444444 0.614093960
## 81 -0.65882353 0.6666667 0.6111111 0.718120805
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## 92 1.05882353 0.3333333 0.4444444 0.929530201
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## 97 1.47058824 0.5555556 1.0000000 0.795302013
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## 103 -0.57647059 0.4444444 0.6666667 0.077181208
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## 107 -0.23529412 0.4444444 0.6666667 0.879194631
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## 109 -1.01176471 0.6666667 0.6111111 0.661073826
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## 113 -0.88235294 0.4444444 0.1666667 0.953020134
## 114 -0.61176471 0.5555556 0.3333333 0.969798658
## 115 0.23529412 0.5555556 0.5000000 0.546979866
## 116 -0.04705882 0.4444444 0.5000000 0.785234899
## 117 -0.57647059 0.4444444 0.2777778 0.432885906
## 118 -0.21176471 0.7777778 0.5555556 0.268456376
## 119 2.01176471 1.0000000 0.6111111 0.426174497
## 120 -0.44705882 0.7777778 0.4444444 0.630872483tib.e<-rename_with(tib.e, ∼tolower(gsub(".","_", .x,fixed=TRUE)))
tib.e## biomasa_estandarizada flor_r flor_d hojas_d_estandarizada
## 1 0.22352941 0.5555556 0.0000000 0.496644295
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## 3 0.51764706 1.0000000 0.5000000 0.929530201
## 4 -1.72941176 0.6666667 0.6666667 0.389261745
## 5 -0.16470588 0.6666667 0.3888889 0.922818792
## 6 -0.84705882 0.5555556 1.0000000 0.291946309
## 7 0.07058824 0.5555556 0.3888889 0.842281879
## 8 1.61176471 0.5555556 0.3888889 0.174496644
## 9 -0.22352941 0.6666667 0.3888889 0.399328859
## 10 1.03529412 0.6666667 0.3888889 0.117449664
## 11 0.64705882 0.4444444 0.6111111 0.000000000
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## 14 -1.24705882 0.6666667 0.3888889 0.221476510
## 15 -1.07058824 0.5555556 0.6666667 0.271812081
## 16 0.16470588 0.3333333 0.5000000 0.496644295
## 17 -0.94117647 0.6666667 0.3888889 0.788590604
## 18 -1.25882353 0.2222222 0.5555556 0.100671141
## 19 -0.41176471 0.4444444 0.3333333 0.936241611
## 20 -0.75294118 0.5555556 0.2222222 0.429530201
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## 22 1.02352941 0.8888889 0.7222222 0.872483221
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## 26 -1.42352941 0.6666667 0.2777778 1.000000000
## 27 -1.78823529 0.4444444 0.3888889 0.852348993
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## 29 0.45882353 0.7777778 0.5000000 0.543624161
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## 35 2.09411765 0.7777778 0.3333333 0.744966443
## 36 -0.11764706 0.6666667 0.5555556 0.755033557
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## 47 0.44705882 0.3333333 0.3333333 0.523489933
## 48 -0.04705882 0.4444444 0.5555556 0.691275168
## 49 -0.40000000 0.4444444 0.4444444 0.392617450
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## 51 -0.50588235 0.3333333 0.2777778 0.194630872
## 52 1.24705882 0.5555556 0.6111111 0.442953020
## 53 -1.08235294 0.3333333 0.6666667 0.456375839
## 54 0.27058824 0.5555556 0.7777778 0.120805369
## 55 1.58823529 0.6666667 0.3333333 0.097315436
## 56 -0.64705882 0.0000000 0.2777778 0.365771812
## 57 -0.37647059 0.6666667 0.2222222 0.003355705
## 58 0.21176471 0.1111111 0.6666667 0.117449664
## 59 -0.71764706 0.6666667 0.6111111 0.375838926
## 60 -2.02352941 0.5555556 0.2222222 0.104026846
## 61 0.98823529 0.8888889 0.4444444 0.197986577
## 62 -0.03529412 0.6666667 0.3888889 0.624161074
## 63 -1.29411765 0.6666667 0.5000000 0.187919463
## 64 1.32941176 0.4444444 0.5000000 0.953020134
## 65 1.02352941 0.6666667 0.6111111 0.500000000
## 66 0.61176471 0.3333333 0.7222222 0.634228188
## 67 -1.08235294 0.2222222 0.6666667 0.882550336
## 68 -1.50588235 0.7777778 0.5000000 0.234899329
## 69 0.22352941 0.6666667 0.5555556 0.520134228
## 70 0.10588235 0.4444444 0.3888889 0.798657718
## 71 0.97647059 0.5555556 0.7222222 0.439597315
## 72 -0.72941176 0.6666667 0.6666667 0.563758389
## 73 -1.52941176 0.6666667 0.5555556 0.214765101
## 74 -0.44705882 0.5555556 0.2222222 0.731543624
## 75 0.62352941 0.4444444 0.8333333 0.724832215
## 76 -2.20000000 0.7777778 0.6111111 0.395973154
## 77 -1.20000000 0.5555556 0.7222222 0.661073826
## 78 1.37647059 0.4444444 0.7222222 0.265100671
## 79 0.97647059 0.5555556 0.5555556 0.466442953
## 80 -0.49411765 0.3333333 0.4444444 0.614093960
## 81 -0.65882353 0.6666667 0.6111111 0.718120805
## 82 0.44705882 0.3333333 0.4444444 0.067114094
## 83 0.91764706 0.5555556 0.5555556 0.560402685
## 84 -0.84705882 0.5555556 0.3888889 0.818791946
## 85 -0.55294118 0.6666667 0.5000000 0.073825503
## 86 -0.63529412 0.6666667 0.3333333 0.798657718
## 87 0.48235294 0.3333333 0.5000000 0.892617450
## 88 -0.51764706 0.7777778 0.5555556 0.963087248
## 89 1.27058824 0.3333333 0.6111111 0.040268456
## 90 0.16470588 0.5555556 0.3888889 0.748322148
## 91 -0.67058824 0.5555556 0.1666667 0.892617450
## 92 1.05882353 0.3333333 0.4444444 0.929530201
## 93 0.85882353 0.5555556 0.5000000 0.738255034
## 94 -0.51764706 0.5555556 0.3888889 0.714765101
## 95 1.81176471 0.4444444 0.6666667 0.704697987
## 96 -1.30588235 0.5555556 0.6666667 0.281879195
## 97 1.47058824 0.5555556 1.0000000 0.795302013
## 98 1.23529412 0.7777778 0.7777778 0.567114094
## 99 0.17647059 0.3333333 0.4444444 0.496644295
## 100 -0.78823529 0.4444444 0.7222222 0.731543624
## 101 1.11764706 0.2222222 0.3333333 0.805369128
## 102 -0.65882353 0.6666667 0.5000000 0.426174497
## 103 -0.57647059 0.4444444 0.6666667 0.077181208
## 104 0.28235294 0.0000000 0.6111111 0.671140940
## 105 0.05882353 0.6666667 0.6111111 0.704697987
## 106 0.03529412 0.8888889 0.5555556 0.993288591
## 107 -0.23529412 0.4444444 0.6666667 0.879194631
## 108 -0.29411765 0.3333333 0.5000000 0.053691275
## 109 -1.01176471 0.6666667 0.6111111 0.661073826
## 110 0.40000000 0.7777778 0.3333333 0.026845638
## 111 -0.69411765 0.6666667 0.5555556 0.942953020
## 112 0.35294118 0.5555556 0.6111111 0.949664430
## 113 -0.88235294 0.4444444 0.1666667 0.953020134
## 114 -0.61176471 0.5555556 0.3333333 0.969798658
## 115 0.23529412 0.5555556 0.5000000 0.546979866
## 116 -0.04705882 0.4444444 0.5000000 0.785234899
## 117 -0.57647059 0.4444444 0.2777778 0.432885906
## 118 -0.21176471 0.7777778 0.5555556 0.268456376
## 119 2.01176471 1.0000000 0.6111111 0.426174497
## 120 -0.44705882 0.7777778 0.4444444 0.630872483\[ACTIVIDAD..5\]
tib.i %>% select(biomasa) %>% summarise(mean(biomasa),kount=n())## mean(biomasa) kount
## 1 4.992889 90tib.i %>%select(biomasa,fertilizacion)%>% group_by(fertilizacion) %>% summarise(media=mean(biomasa), kount=n()) ## # A tibble: 2 x 3
## fertilizacion media kount
## <chr> <dbl> <int>
## 1 FI 4.98 52
## 2 FO 5.01 38tib.i %>% select(biomasa,fertilizacion)%>% group_by(fertilizacion)%>% summarise(cuantil_0.1=quantile(biomasa,0.1),cuantil_0.2=quantile(biomasa,0.2),cuantil_0.3=quantile(biomasa,0.3),cuantil_0.4=quantile(biomasa,0.4),cuantil_0.5=quantile(biomasa,0.5))## # A tibble: 2 x 6
## fertilizacion cuantil_0.1 cuantil_0.2 cuantil_0.3 cuantil_0.4 cuantil_0.5
## <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 FI 3.97 4.38 4.44 4.57 4.92
## 2 FO 4.18 4.44 4.55 4.73 5tib.i %>% select(biomasa,fertilizacion,plaga)%>%group_by(fertilizacion,plaga) %>% summarise(media=mean(biomasa),mediana=median(biomasa),maximo=max(biomasa),minimo=min(biomasa),desviacion.tipica=sd(biomasa),media.truncada=mean(biomasa,trim = 0.1), varianza=var(biomasa))## `summarise()` has grouped output by 'fertilizacion'. You can override using the `.groups` argument.## # A tibble: 4 x 9
## # Groups: fertilizacion [2]
## fertilizacion plaga media mediana maximo minimo desviacion.tipica
## <chr> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 FI Ausente 5.20 5.1 6.69 4.36 0.668
## 2 FI Presente 4.92 4.64 6.78 3.13 0.903
## 3 FO Ausente 4.81 4.62 6.37 3.7 0.754
## 4 FO Presente 5.09 5.14 6.17 3.98 0.643
## # ... with 2 more variables: media.truncada <dbl>, varianza <dbl>tib.i %>% select(biomasa,fertilizacion,plaga,estatus)%>%group_by(fertilizacion,plaga,estatus="S") %>% summarise(media=mean(biomasa),mediana=median(biomasa),maximo=max(biomasa),minimo=min(biomasa),desviacion.tipica=sd(biomasa),media.truncada=mean(biomasa,trim = 0.1), varianza=var(biomasa))## `summarise()` has grouped output by 'fertilizacion', 'plaga'. You can override using the `.groups` argument.## # A tibble: 4 x 10
## # Groups: fertilizacion, plaga [4]
## fertilizacion plaga estatus media mediana maximo minimo desviacion.tipica
## <chr> <chr> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 FI Ausente S 5.20 5.1 6.69 4.36 0.668
## 2 FI Presente S 4.92 4.64 6.78 3.13 0.903
## 3 FO Ausente S 4.81 4.62 6.37 3.7 0.754
## 4 FO Presente S 5.09 5.14 6.17 3.98 0.643
## # ... with 2 more variables: media.truncada <dbl>, varianza <dbl>#eliminando los faltantes
#sin.faltantes<- tib.i %>% drop_na(tib.i)%>% select(biomasa,fertilizacion,plaga,estatus)%>%group_by(fertilizacion,plaga,estatus="S") %>% summarise(media=mean(biomasa),mediana=median(biomasa),maximo=max(biomasa),minimo=min(biomasa),desviacion.tipica=sd(biomasa),media.truncada=mean(biomasa,trim = 0.1), varianza=var(biomasa))
#profe me aparece que no se encuentra la funcion drop_na, no se por qué pasa
#continuacion
tib.i %>% filter(estatus %in% c("PA","MA")) %>% arrange(estatus)## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 2 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 3 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 4 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 5 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 6 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 7 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 8 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 9 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 10 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 11 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 12 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 13 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 14 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 15 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 16 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 17 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 18 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 19 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 20 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 21 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 22 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 23 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 24 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 25 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 26 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 27 5.83 16 11 141 Presente PA FO
## 28 5.73 16 10 NA Presente MA FO
## 29 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 30 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 31 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 32 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 33 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 34 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 35 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 36 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 37 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 38 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 39 4.62 18 9 190 Ausente MA FO
## 40 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 41 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 42 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 43 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 44 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 45 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 46 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 47 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 48 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 49 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 50 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 51 4.48 16 7 291 Presente MA FO
## 52 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 53 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 54 5.14 NA 8 225 Presente MA FO
## 55 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 56 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 57 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
## 58 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 59 5.30 16 12 285 Ausente MA FItib.i %>% filter(complete.cases(tib.i))## biomasa flores.r flores.d hojas.d plaga estatus fertilizacion
## 1 5.15 14 9 150 Ausente MA FI
## 2 5.34 18 7 10 Presente MA FO
## 3 4.39 17 12 114 Presente PA FI
## 4 4.25 15 4 286 Presente MA FI
## 5 3.93 13 11 32 Presente S FI
## 6 4.38 17 13 170 Presente PA FI
## 7 6.08 14 12 14 Presente MA FO
## 8 4.33 15 14 220 Presente MA FI
## 9 5.05 17 12 212 Ausente MA FI
## 10 4.46 17 7 240 Presente MA FO
## 11 4.33 16 10 57 Ausente S FO
## 12 5.90 14 9 279 Presente MA FO
## 13 3.70 17 11 66 Ausente PA FO
## 14 4.58 14 9 185 Ausente PA FO
## 15 6.78 18 7 224 Presente S FI
## 16 4.75 14 10 18 Presente MA FI
## 17 3.57 17 14 78 Presente S FI
## 18 4.44 17 10 129 Presente MA FI
## 19 4.62 18 9 190 Ausente MA FO
## 20 5.55 15 12 2 Presente S FI
## 21 5.40 18 7 59 Presente PA FI
## 22 5.41 14 10 268 Presente MA FO
## 23 4.58 11 10 9 Ausente S FI
## 24 4.28 16 8 246 Presente MA FI
## 25 4.55 17 14 258 Presente PA FO
## 26 5.87 19 14 262 Presente S FI
## 27 5.38 14 7 158 Presente PA FI
## 28 3.53 17 13 118 Presente S FI
## 29 3.94 17 8 68 Presente S FI
## 30 6.37 16 8 54 Ausente S FO
## 31 4.09 16 13 83 Presente S FO
## 32 5.24 11 12 202 Presente MA FO
## 33 5.95 13 7 242 Presente MA FI
## 34 6.54 15 13 212 Presente MA FI
## 35 5.49 14 13 241 Presente S FO
## 36 6.06 16 12 134 Presente PA FI
## 37 5.03 16 10 43 Presente PA FO
## 38 6.05 18 15 171 Presente MA FI
## 39 4.71 16 12 235 Ausente S FO
## 40 4.56 18 11 289 Presente MA FI
## 41 4.44 17 12 216 Ausente MA FI
## 42 4.53 17 10 24 Presente MA FO
## 43 6.35 17 7 31 Presente PA FI
## 44 4.36 16 5 130 Ausente S FI
## 45 4.14 12 11 203 Presente S FO
## 46 6.25 16 19 239 Presente MA FI
## 47 4.88 16 11 260 Ausente S FI
## 48 5.06 16 8 253 Presente S FO
## 49 5.78 16 11 169 Presente MA FI
## 50 5.23 16 15 38 Ausente PA FI
## 51 4.53 20 9 75 Presente S FI
## 52 6.17 15 14 81 Presente PA FO
## 53 4.39 14 14 18 Presente PA FI
## 54 4.48 16 7 291 Presente MA FO
## 55 5.83 16 14 133 Presente PA FI
## 56 4.56 16 8 215 Presente MA FI
## 57 4.96 15 11 208 Presente PA FI
## 58 5.38 14 9 22 Presente MA FO
## 59 3.48 15 8 256 Presente S FI
## 60 4.81 17 8 121 Presente S FO
## 61 4.65 15 7 281 Presente S FI
## 62 4.39 13 6 10 Presente PA FI
## 63 5.18 12 13 37 Ausente PA FO
## 64 5.09 15 8 240 Presente PA FI
## 65 5.44 20 10 279 Presente S FI
## 66 4.51 15 6 131 Presente MA FI
## 67 4.45 11 6 111 Presente PA FI
## 68 5.03 19 11 298 Ausente MA FI
## 69 6.00 16 11 38 Presente S FO
## 70 4.97 17 8 188 Presente PA FO
## 71 4.73 17 8 84 Presente S FO
## 72 4.62 16 5 220 Presente PA FI
## 73 4.43 16 4 268 Ausente MA FO
## 74 5.87 17 12 151 Ausente PA FI
## 75 4.97 14 9 26 Presente S FI
## 76 4.30 18 10 199 Ausente S FO
## 77 6.69 17 7 187 Ausente S FI
## 78 5.88 17 8 37 Ausente S FO
## 79 5.52 14 14 191 Presente PA FO
## 80 5.84 19 9 61 Ausente PA FI
## 81 5.31 19 13 186 Presente S FI
## 82 3.98 16 14 199 Presente PA FO
## 83 4.82 18 11 82 Ausente MA FO
## 84 3.13 18 12 120 Presente PA FI
## 85 5.30 16 12 285 Ausente MA FI
## 86 4.20 17 8 237 Presente S FO
## 87 5.14 14 10 150 Presente S FO
## 88 5.83 16 11 141 Presente PA FOtib.c %>% mutate (flores.r=NULL, flores.d= NULL)## biomasa hojas.d plaga estatus fertilizacion division.flores
## 1 5.19 150 Presente S FO 16.0000000
## 2 4.68 197 Ausente S FI 1.4615385
## 3 5.44 279 Presente S FI 2.0000000
## 4 3.53 118 Presente S FI 1.3076923
## 5 4.86 277 Ausente S FI 2.1250000
## 6 4.28 89 Presente S FI 0.8421053
## 7 5.06 253 Presente S FO 2.0000000
## 8 6.37 54 Ausente S FO 2.0000000
## 9 4.81 121 Presente S FO 2.1250000
## 10 5.88 37 Ausente S FO 2.1250000
## 11 5.55 2 Presente S FI 1.2500000
## 12 4.33 57 Ausente S FO 1.6000000
## 13 4.14 203 Presente S FO 1.0909091
## 14 3.94 68 Presente S FI 2.1250000
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## 16 5.14 150 Presente S FO 1.4000000
## 17 4.20 237 Presente S FO 2.1250000
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## 120 9 190 2.0000000tib.c %>% select(flores.d, flores.r, everything())## flores.d flores.r biomasa hojas.d plaga estatus fertilizacion
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## 15 13 16 4.09 83 Presente S FO
## 16 10 14 5.14 150 Presente S FO
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## 19 7 15 4.65 281 Presente S FI
## 20 5 16 4.36 130 Ausente S FI
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## 30 10 18 4.30 199 Ausente S FO
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## 40 10 11 4.58 9 Ausente S FI
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## 45 10 16 5.03 43 Presente PA FO
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## 50 13 15 5.74 250 Ausente PA FO
## 51 6 14 4.57 60 Ausente PA FI
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