##   sist pl rep 1 7 14 21 30 35 44     64
## 1    e  1   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0075
## 2    e  2   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0000
## 3    e  3   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0000
## 4    e  4   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0000
## 5    e  5   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0000
## 6    e  6   1 0 0  0  0  0  0  0 0.0000
## [1] 1  7  14 21 30 35 44 64
## Levels: 1 7 14 21 30 35 44 64
##    sist pl rep      1      7     14     21     30     35     44     64
## 1     e  1   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0075
## 2     e  2   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 3     e  3   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 4     e  4   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 5     e  5   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 6     e  6   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 7     e  7   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 8     e  8   1 0.0000 0.0550 0.0550 0.0550 0.0500 0.0500 0.0625 0.0625
## 9     e  9   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 2.5100
## 10    e 10   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3750
## 11    e 11   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0575 2.3575
## 12    e 12   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 13    e 13   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0500
## 14    e 14   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0250
## 15    e 15   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 16    e 16   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 17    e 17   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0150
## 18    e 18   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 19    e 19   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2000 0.0125 0.1000
## 20    e 20   1 0.0000 0.0650 0.0650 0.0750 0.0750 0.0750 0.0750 0.0750
## 21    e 21   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0125 0.0125
## 22    e 22   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 23    e 23   2 0.0000 0.0175 0.0200 0.0200 0.0300 0.0600 1.3150 2.0250
## 24    e 24   2 0.0000 0.1250 0.1250 0.1250 0.1250 0.1250 0.1250 0.7500
## 25    e 25   2 0.0000 0.0550 0.0550 0.0750 0.0750 0.1250 0.1250 0.9750
## 26    e 26   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 27    e 27   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0250
## 28    e 28   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0250
## 29    e 29   2 0.0000 0.8750 0.8750 0.8750 1.3750 1.3750 1.3750 1.3750
## 30    e 30   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 31    e 31   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0175 0.0175
## 32    e 32   2 0.0000 0.0175 0.0175 0.0250 0.0300 0.0375 0.4600 1.2500
## 33    e 33   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 34    e 34   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0125 0.0250 0.0350 0.0575 0.6250
## 35    e 35   2 0.4000 0.9900 1.3325 1.5250 1.5250 1.5250 1.6575 1.7000
## 36    e 36   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0050 0.0450 0.4250
## 37    e 37   2 0.0500 0.0500 0.0675 0.0750 0.1000 0.2500 0.8000 2.0100
## 38    e 38   2 0.0750 0.0975 0.1275 0.2500 0.2750 0.3250 0.3250 0.3250
## 39    e 39   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 40    e 40   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1025 0.2500
## 41    e 41   3 0.0750 0.0600 0.1000 0.2125 0.2625 0.6500 0.6700 0.6700
## 42    e 42   3 0.0000 0.0350 0.0475 0.0475 0.0475 0.0575 0.0550 0.0550
## 43    e 43   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0025 0.0025 0.0025 0.0025
## 44    e 44   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.7500
## 45    e 45   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0750 0.6050
## 46    e 46   3 0.0000 0.0225 0.0225 0.0250 0.0250 0.0100 0.3150 0.3150
## 47    e 47   3 0.0000 0.0450 0.0575 0.0625 0.0625 0.0625 0.0750 0.1200
## 48    e 48   3 0.0125 0.0125 0.0125 0.0125 0.0125 0.0125 0.0125 0.0125
## 49    e 49   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2625 2.2500
## 50    e 50   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0300 0.0325
## 51    e 51   3 0.0500 0.0600 0.0600 0.0650 0.0750 0.0750 0.0750 0.0750
## 52    e 52   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 53    e 53   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 54    e 54   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 55    e 55   3 0.0450 0.0550 0.0575 0.0625 0.0625 0.0625 0.0725 0.1750
## 56    e 56   3 0.0350 0.0375 0.0550 0.0550 0.0550 0.1000 0.1000 0.1000
## 57    e 57   3 0.0050 0.0100 0.0100 0.0100 0.0100 0.1825 0.1600 0.1250
## 58    e 58   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1000 0.1000 1.4125 3.7500
## 59    e 59   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0525 0.5000
## 60    e 60   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0075 0.0075
## 61    y  1   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3400 0.3750 1.3750
## 62    y  2   1 0.0000 0.0025 0.0250 0.0125 0.0175 0.6250 0.6450 4.6250
## 63    y  3   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.5000
## 64    y  4   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0750 0.1000 0.1025 0.6725 3.3750
## 65    y  5   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.6250
## 66    y  6   1 0.0000 0.0200 0.0325 0.0625 0.0750 0.1000 1.4275 3.8750
## 67    y  7   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0425
## 68    y  8   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0250 0.0350 0.2750 0.4550 3.6250
## 69    y  9   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 7.1250
## 70    y 10   1 0.0000 0.0000 0.0250 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 6.7500
## 71    y 11   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 3.0000
## 72    y 12   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 2.3750
## 73    y 13   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.9000
## 74    y 14   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.7000
## 75    y 15   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.6000 1.9050 9.0000
## 76    y 16   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1000
## 77    y 17   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 78    y 18   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3750 0.3900 1.2750
## 79    y 19   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2500
## 80    y 20   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 81    y 21   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.4225 0.5000
## 82    y 22   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 83    y 23   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.6375 0.2500
## 84    y 24   2 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.9225 3.2500
## 85    y 25   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3750
## 86    y 26   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2500
## 87    y 27   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2750
## 88    y 28   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.2025
## 89    y 29   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3250
## 90    y 30   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.3250
## 91    y 31   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3750 0.4325 2.8750
## 92    y 32   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.7500 0.7925 4.1250
## 93    y 33   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
## 94    y 34   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1400 4.2500
## 95    y 35   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.4250
## 96    y 36   3 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.5000
##   sist pl rep dias sm
## 1    e  1   1    1  0
## 2    e  2   1    1  0
## 3    e  3   1    1  0
## 4    e  4   1    1  0
## 5    e  5   1    1  0
## 6    e  6   1    1  0
##     sist pl rep dias    sm
## 763    y 31   3   64 2.875
## 764    y 32   3   64 4.125
## 765    y 33   3   64 0.000
## 766    y 34   3   64 4.250
## 767    y 35   3   64 0.425
## 768    y 36   3   64 0.500
## 'data.frame':    768 obs. of  5 variables:
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ pl  : int  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
##  $ rep : int  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ dias: num  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ sm  : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...

Exploração » progresso da severidade de mildio Agregação por repetição

Grafico AUC por rep

##   sist rep       auc
## 1    e   1  3.229687
## 2    e   2 13.127105
## 3    e   3  8.443625
## 4    y   1 37.381354
## 5    y   2 19.258229
## 6    y   3 15.790227
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
## sist       1 378.09  378.09  4.7572 0.09463 .
## Residuals  4 317.91   79.48                  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

##   sist rep    1    3    5    8   11   14   18   21   24   27   32   35   39   43   46   50   54 57
## 1    e   1 0.00 0.06 0.06 0.19 0.39 0.42 0.50 0.50 0.53 0.53 0.56 0.67 0.67 0.67 0.78 0.94 0.94  1
## 2    e   2 0.08 0.19 0.19 0.56 0.75 0.78 0.86 0.89 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.94 0.94 0.97 1.00  1
## 3    e   3 0.14 0.20 0.20 0.40 0.63 0.86 0.89 0.89 0.89 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 1.00  1
## 4    y   1 0.25 0.25 0.38 0.56 0.63 0.75 0.75 0.75 0.75 0.81 0.88 0.88 0.94 1.00 1.00 1.00 1.00  1
## 5    y   2 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.25 0.25 0.31 0.38 0.44 0.50 0.63 0.63 0.75 0.88 0.94 1.00  1
## 6    y   3 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.19 0.25 0.31 0.31 0.44 0.44 0.44 0.56 0.69 0.94 1.00 1.00  1
##   sist rep dias   im
## 1    e   1    1 0.00
## 2    e   2    1 0.08
## 3    e   3    1 0.14
## 4    y   1    1 0.25
## 5    y   2    1 0.00
## 6    y   3    1 0.00
##     sist rep dias im
## 103    e   1   57  1
## 104    e   2   57  1
## 105    e   3   57  1
## 106    y   1   57  1
## 107    y   2   57  1
## 108    y   3   57  1
## 'data.frame':    108 obs. of  4 variables:
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 ...
##  $ rep : int  1 2 3 1 2 3 1 2 3 1 ...
##  $ dias: num  1 1 1 1 1 1 3 3 3 3 ...
##  $ im  : num  0 0.08 0.14 0.25 0 0 0.06 0.19 0.2 0.25 ...

Grafico por repetição AUC por rep

##   sist rep    auc
## 1    e   1 31.330
## 2    e   2 45.755
## 3    e   3 45.505
## 4    y   1 44.620
## 5    y   2 26.950
## 6    y   3 25.795
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## sist       1 106.05 106.050  1.1816 0.3381
## Residuals  4 359.01  89.751

##   sist pl rep     1     8    14    21    27    37    44    51
## 1    e  1   1 0.003 0.003 0.010 0.010 0.010 1.000 1.625 2.167
## 2    e  2   1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.005 0.355 1.028
## 3    e  3   1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.533 1.533 1.533
## 4    e  4   1 0.000 0.000 0.010 0.010 0.383 3.650 8.550 8.550
## 5    e  5   1 0.000 0.125 0.125 0.125 0.125 1.313 1.313 1.313
## 6    e  6   1 0.000 0.028 0.078 0.253 0.775 0.775 3.000 3.000
##    sist pl rep     1     8    14    21    27    37    44     51
## 1     e  1   1 0.003 0.003 0.010 0.010 0.010 1.000 1.625  2.167
## 2     e  2   1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.005 0.355  1.028
## 3     e  3   1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.533 1.533  1.533
## 4     e  4   1 0.000 0.000 0.010 0.010 0.383 3.650 8.550  8.550
## 5     e  5   1 0.000 0.125 0.125 0.125 0.125 1.313 1.313  1.313
## 6     e  6   1 0.000 0.028 0.078 0.253 0.775 0.775 3.000  3.000
## 7     e  7   1 0.000 0.000 0.003 0.018 0.553 4.053 4.053  7.000
## 8     e  8   1 0.000 0.000 0.003 0.030 0.080 1.555 3.550  4.000
## 9     e  9   1 0.000 0.075 0.250 0.310 0.310 3.008 4.667  4.667
## 10    e 10   1 0.000 0.060 0.060 0.065 0.065 0.150 0.150  0.150
## 11    e 11   1 0.000 0.003 0.003 0.005 0.053 7.667 7.667  7.667
## 12    e 12   1 0.000 0.003 0.010 0.073 0.513 0.513 3.503  3.503
## 13    e 13   1 0.000 0.000 0.013 0.178 0.228 0.228 0.228  0.228
## 14    e 14   1 0.000 0.003 0.005 0.005 0.078 0.255 0.555  0.555
## 15    e 15   1 0.000 0.000 0.300 0.550 1.225 8.000 9.500  9.500
## 16    e 16   1 0.000 0.003 0.013 0.013 0.055 0.538 0.538  4.000
## 17    e 17   1 0.000 0.000 0.000 0.010 0.013 0.128 0.510  0.510
## 18    e 18   1 0.000 0.010 0.035 0.055 0.083 0.083 0.153  1.467
## 19    e 19   1 0.000 0.003 0.008 0.015 0.015 0.153 0.153  0.200
## 20    e 20   1 0.000 0.055 0.110 0.110 0.885 0.885 2.000  2.000
## 21    e 21   2 0.000 0.513 1.353 1.353 1.353 1.353 1.353  3.000
## 22    e 22   2 0.005 0.125 0.253 0.505 1.053 9.505 9.505  9.505
## 23    e 23   2 0.000 0.005 0.073 0.073 0.073 0.133 0.133  0.133
## 24    e 24   2 0.000 0.008 0.058 0.058 0.058 0.103 0.105  0.105
## 25    e 25   2 0.000 0.005 0.010 0.028 0.130 1.325 3.667  5.733
## 26    e 26   2 0.000 0.003 0.003 0.003 0.003 0.003 0.003  0.003
## 27    e 27   2 0.000 0.010 0.010 0.010 0.010 0.020 0.200  0.200
## 28    e 28   2 0.000 0.008 0.018 0.028 0.085 0.378 0.378  0.378
## 29    e 29   2 0.000 0.000 0.008 0.013 0.013 1.500 8.050 12.400
## 30    e 30   2 0.000 0.753 1.260 1.350 1.400 1.400 4.500  4.500
## 31    e 31   2 0.000 0.003 0.005 0.008 0.030 2.500 2.500  2.500
## 32    e 32   2 0.000 0.000 0.003 0.005 0.013 0.103 0.137  0.137
## 33    e 33   2 0.000 0.000 0.005 0.043 0.153 1.850 2.375  2.375
## 34    e 34   2 0.000 0.005 0.020 0.020 0.113 0.113 0.113  0.113
## 35    e 35   2 0.003 0.053 0.153 0.153 0.153 2.125 2.800  6.333
## 36    e 36   2 0.003 0.050 0.050 0.078 0.080 0.080 0.200  0.200
## 37    e 37   2 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008 0.008 0.200  0.200
## 38    e 38   2 0.000 0.000 0.008 0.050 0.053 1.000 1.000  1.000
## 39    e 39   2 0.000 0.008 0.015 0.058 0.058 0.878 0.878  0.878
## 40    e 40   2 0.000 0.130 0.130 0.130 0.130 0.150 0.150  0.200
## 41    e 41   3 0.000 0.110 0.308 0.583 1.525 3.755 3.755  5.005
## 42    e 42   3 0.000 0.155 0.313 0.313 0.638 5.000 5.000  5.000
## 43    e 43   3 0.000 0.005 0.010 0.055 0.225 0.225 1.303  6.500
## 44    e 44   3 0.000 0.050 0.063 0.128 0.128 0.133 0.275  0.275
## 45    e 45   3 0.000 0.000 0.000 0.013 0.255 1.667 1.667  1.667
## 46    e 46   3 0.000 0.015 0.015 0.058 0.228 1.750 4.250 10.000
## 47    e 47   3 0.005 0.005 0.005 0.008 0.008 0.008 0.140  0.140
## 48    e 48   3 0.000 0.010 0.208 0.228 0.233 1.508 1.508  1.508
## 49    e 49   3 0.000 0.000 0.015 0.080 0.203 1.667 2.600  4.500
## 50    e 50   3 0.000 0.260 0.508 0.558 0.558 0.558 0.558  0.558
## 51    e 51   3 0.003 0.005 0.013 0.013 0.080 0.253 5.000  5.000
## 52    e 52   3 0.003 0.005 0.008 0.010 0.010 0.010 0.153  0.200
## 53    e 53   3 0.003 0.013 0.013 0.013 0.013 0.013 0.013  0.013
## 54    e 54   3 0.000 0.008 0.010 0.010 0.050 0.050 0.050  0.050
## 55    e 55   3 0.000 0.003 0.008 0.053 0.053 0.525 1.600  1.600
## 56    e 56   3 0.000 0.003 0.003 0.005 0.010 0.275 2.000  2.000
## 57    e 57   3 0.000 0.000 0.003 0.005 0.038 0.417 0.417  0.417
## 58    e 58   3 0.000 0.010 0.023 0.105 0.105 1.400 1.400  1.400
## 59    e 59   3 0.000 0.050 0.050 0.053 0.103 0.200 0.200  0.200
## 60    e 60   3 0.000 0.000 0.328 0.580 1.005 4.250 4.250  4.250
## 61    y  1   1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000  0.000
## 62    y  2   1    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA     NA
## 63    y  3   1    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA     NA
## 64    y  4   1 0.000 0.003 0.008 0.008 0.008 0.008 0.008  0.008
## 65    y  5   1 0.000 0.000 0.023 0.065 0.150 0.667 0.667  0.667
## 66    y  6   1 0.000 0.000 0.003 0.003 0.005 0.100 0.100  0.100
## 67    y  7   1 0.000 0.000 0.003 0.003 0.053 0.150 0.150  0.150
## 68    y  8   1 0.000 0.008 0.020 0.060 0.455 2.367 2.600  2.600
## 69    y  9   1 0.000 0.000 0.005 0.030 0.085 0.085 0.200  0.200
## 70    y 10   1 0.000 0.000 0.033 0.068 0.103 1.250 1.250  1.250
## 71    y 11   1 0.000 0.000 0.975 1.125 2.875 2.875 3.400  3.400
## 72    y 12   1 0.000 0.005 0.005 0.005 0.010 0.020 0.255  0.255
## 73    y 13   2 0.000 0.000 0.035 0.213 0.243 0.243 2.075  2.075
## 74    y 14   2 0.000 0.000 0.013 0.213 0.213 0.213 0.213  0.213
## 75    y 15   2 0.013 0.013 0.015 0.023 0.023 0.100 0.100  0.100
## 76    y 16   2 0.000 0.015 0.753 0.778 0.905 1.000 1.000  1.000
## 77    y 17   2 0.000 0.000 0.003 0.005 0.010 0.010 0.010  0.010
## 78    y 18   2 0.003 0.005 0.008 0.058 0.063 0.400 0.400  0.400
## 79    y 19   2 0.000 0.018 0.068 0.088 0.400 1.625 1.625  1.625
## 80    y 20   2 0.000 0.000 0.000 0.005 0.033 0.033 0.200  0.200
## 81    y 21   2 0.000 0.000 0.130 0.393 0.455 0.455 0.455  0.455
## 82    y 22   2 0.000 0.005 0.130 0.578 1.100 7.500 7.500  7.500
## 83    y 23   2 0.000 0.183 0.780 1.403 1.653 1.653 1.653  1.653
## 84    y 24   2 0.000 0.000 0.008 0.043 0.275 0.275 0.325  0.325
## 85    y 25   3 0.008 0.010 0.025 0.085 0.085 1.833 3.667  5.000
## 86    y 26   3 0.000 0.003 0.008 0.010 0.130 0.130 4.333  4.333
## 87    y 27   3 0.000 0.003 0.003 0.013 0.173 1.813 2.467  2.467
## 88    y 28   3 0.000 0.000 0.015 0.015 0.015 0.140 1.100  1.100
## 89    y 29   3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128 0.128 1.000  1.000
## 90    y 30   3 0.000 0.005 0.125 0.130 0.258 0.388 1.803  1.803
## 91    y 31   3 0.000 0.003 0.008 0.015 0.138 0.138 3.000  3.000
## 92    y 32   3 0.000 0.000 0.008 0.018 0.043 0.043 1.500  1.500
## 93    y 33   3 0.000 0.003 0.003 0.008 0.013 0.020 0.020  0.020
## 94    y 34   3 0.000 0.003 0.003 0.003 0.003 0.003 0.003  0.003
## 95    y 35   3 0.000 0.000 0.003 0.005 0.255 0.255 0.255  0.255
## 96    y 36   3 0.000 0.005 0.005 0.328 0.378 1.000 1.000  1.000
##   sist pl rep dias    sf
## 1    e  1   1    1 0.003
## 2    e  2   1    1 0.000
## 3    e  3   1    1 0.000
## 4    e  4   1    1 0.000
## 5    e  5   1    1 0.000
## 6    e  6   1    1 0.000
##     sist pl rep dias    sf
## 763    y 31   3   64 3.000
## 764    y 32   3   64 1.500
## 765    y 33   3   64 0.020
## 766    y 34   3   64 0.003
## 767    y 35   3   64 0.255
## 768    y 36   3   64 1.000

Exploração » progresso da severidade de ferrugem

AUC por rep

##   sist rep      auc
## 1    e   1 85.92815
## 2    e   2 66.33835
## 3    e   3 63.58515
## 4    y   1 30.88620
## 5    y   2 46.57371
## 6    y   3 47.18829
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df  Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)  
## sist       1 1386.34  1386.3  11.859 0.0262 *
## Residuals  4  467.59   116.9                 
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Grafico

##   sist rep          1          4          7         11         14         17        20        24 26
## 1    e   1 0.00000000 0.00000000 0.06451613 0.09677419 0.09677419 0.09090909 0.1515152 0.5151515  1
## 2    e   2 0.03030303 0.09090909 0.03030303 0.12121212 0.15151515 0.15151515 0.4242424 0.7878788  1
## 3    e   3 0.03225806 0.09677419 0.09677419 0.09677419 0.22580645 0.25806452 0.5161290 0.7096774  1
## 4    y   1 0.00000000 0.14285714 0.28571429 0.35714286 0.42857143 0.64285714 0.6428571 0.9214286  1
## 5    y   2 0.00000000 0.18750000 0.37500000 0.37500000 0.56250000 0.87500000 1.0000000 1.0000000  1
## 6    y   3 0.00000000 0.06250000 0.12500000 0.18750000 0.37500000 0.37500000 0.7500000 0.8125000  1
##   sist rep dias        i.f
## 1    e   1    1 0.00000000
## 2    e   2    1 0.03030303
## 3    e   3    1 0.03225806
## 4    y   1    1 0.00000000
## 5    y   2    1 0.00000000
## 6    y   3    1 0.00000000
##    sist rep dias i.f
## 49    e   1   26   1
## 50    e   2   26   1
## 51    e   3   26   1
## 52    y   1   26   1
## 53    y   2   26   1
## 54    y   3   26   1
## 'data.frame':    54 obs. of  4 variables:
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 ...
##  $ rep : int  1 2 3 1 2 3 1 2 3 1 ...
##  $ dias: num  1 1 1 1 1 1 4 4 4 4 ...
##  $ i.f : num  0 0.0303 0.0323 0 0 ...

AUC por rep

##   sist rep       auc
## 1    e   1  4.203324
## 2    e   2  6.606061
## 3    e   3  7.403226
## 4    y   1 11.907143
## 5    y   2 15.000000
## 6    y   3  9.593750
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
## sist       1 55.744  55.744  11.003 0.02946 *
## Residuals  4 20.264   5.066                  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Grafico

##   sist pl rep      1      8     14     21     27       37     44       51
## 1    e  1   1 0.0025 0.0025 0.0100 0.0100 0.0100 1.000000 1.6250 2.166667
## 2    e  2   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.005000 0.3550 1.027500
## 3    e  3   1 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.533333 0.9000       NA
## 4    e  4   1 0.0000 0.0000 0.0100 0.0100 0.3825 3.650000 8.5500 3.900000
## 5    e  5   1 0.0000 0.1250 0.0575 0.0075 0.1050 1.312500 0.3775 0.020000
## 6    e  6   1 0.0000 0.0275 0.0775 0.2525 0.0775 0.755000 3.0000 2.000000
##   sist pl rep dias    sfd
## 1    e  1   1    1 0.0025
## 2    e  2   1    1 0.0000
## 3    e  3   1    1 0.0000
## 4    e  4   1    1 0.0000
## 5    e  5   1    1 0.0000
## 6    e  6   1    1 0.0000
##     sist pl rep dias sfd
## 721    e 49   3   64 4.5
## 724    e 52   3   64 0.2
## 727    e 55   3   64 0.0
## 728    e 56   3   64 0.2
## 752    y 20   2   64 0.0
## 757    y 25   3   64 5.0

Exploração » progresso da severidade de ferrugem

AUC por rep

##   sist rep      auc
## 1    e   1 75.34630
## 2    e   2 70.73821
## 3    e   3 78.63582
## 4    y   1 16.86898
## 5    y   2 24.81851
## 6    y   3 85.65483
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## sist       1 1580.4 1580.41  2.2077 0.2115
## Residuals  4 2863.4  715.85

Grafico

##   sist pl rep dis   21   28   35   43   50   56   63   69   77   85   90   99  108  125  146  152
## 1    e  1   1 mil 0.20 0.35 0.65 0.65 0.71 0.91 0.83 0.71 0.69 0.70 0.95 0.59 0.67 0.59 0.70 0.75
## 2    e  2   1 mil 0.20 0.40 0.63 0.65 0.77 0.91 0.86 0.76 0.71 0.70 0.95 0.65 0.73 0.67 0.73 0.80
## 3    e  3   1 mil 0.20 0.46 0.64 0.65 0.75 0.90 0.85 0.76 0.71 0.72 0.95 0.67 0.74 0.69 0.72 0.77
## 4    e  4   1 mil 0.19 0.48 0.65 0.65 0.77 0.90 0.89 0.77 0.73 0.72 0.95 0.71 0.75 0.74 0.74 0.79
## 5    e  5   1 mil 0.19 0.51 0.64 0.65 0.76 0.91 0.89 0.79 0.76 0.82 0.95 0.74 0.79 0.78 0.78 0.81
## 6    e  6   1 mil 0.19 0.53 0.64 0.65 0.79 0.90 0.90 0.82 0.78 0.80 0.95 0.78 0.83 0.81 0.79 0.83
##    161  173 191 198
## 1 0.71 0.29  NA  NA
## 2 0.89 0.39  NA  NA
## 3 0.89 0.41  NA  NA
## 4 0.90 0.43  NA  NA
## 5 0.92 0.45  NA  NA
## 6 0.92 0.49  NA  NA
## 'data.frame':    3633 obs. of  6 variables:
##  $ dis : Factor w/ 2 levels "fer","mil": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ rep : int  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ pl  : int  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
##  $ dap : Factor w/ 20 levels "21","28","35",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ iaf : num  0.2 0.2 0.2 0.19 0.19 0.19 0.19 0.19 0.19 0.19 ...
##   dis sist rep pl dap  iaf
## 1 mil    e   1  1  21 0.20
## 2 mil    e   1  2  21 0.20
## 3 mil    e   1  3  21 0.20
## 4 mil    e   1  4  21 0.19
## 5 mil    e   1  5  21 0.19
## 6 mil    e   1  6  21 0.19

Exploração por planta

AUC por rep

##   dis sist rep dap       iaf      id
## 1 fer    e   1  21 0.2250000 fer_e_1
## 2 mil    e   1  21 0.1895000 mil_e_1
## 3 fer    y   1  21 0.1200000 fer_y_1
## 4 mil    y   1  21 0.1558333 mil_y_1
## 5 fer    e   2  21 0.2400000 fer_e_2
## 6 mil    e   2  21 0.1940000 mil_e_2
##    dis sist rep      auc
## 1  fer    e   1 114.6855
## 2  fer    e   2 115.0588
## 3  fer    e   3 110.8643
## 4  fer    y   1 139.4749
## 5  fer    y   2 140.4767
## 6  fer    y   3 135.9104
## 7  mil    e   1 119.7912
## 8  mil    e   2 121.3730
## 9  mil    e   3 114.4288
## 10 mil    y   1 126.3850
## 11 mil    y   2 121.4913
## 12 mil    y   3 118.9979
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## sist       1 943.85  943.85  169.31 0.0002013 ***
## Residuals  4  22.30    5.57                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## sist       1 21.211  21.211    1.55 0.2811
## Residuals  4 54.738  13.685

Grafico final

##   sist pl rep dis 20 24 27 30 34 37 41 45 48 51 55 58 63 69 77 82 90 99 108 115 123 146 154 162 167
## 1    e  1   1 mil  0  0  2  3  4  7  7 10 10 10 13 13 13 13 13 13 12 12  12  12  12  11  10  10  10
## 2    e  2   1 mil  0  1  2  4  5  8  9 11 12 13 12 12 11 12 12 12 12 12  12  12  12  12  12  12  12
## 3    e  3   1 mil  0  1  2  3  4  5  6  7  9  9 10 11 12 12 12 12 12 12  12  12  13  12  12  12  12
## 4    e  4   1 mil  0  1  3  4  5  7  8 10 11  9  9  9  9  9  9  9  9  9   9   9   9   9   9   8   8
## 5    e  5   1 mil  0  2  3  4  6  7  8  9 10  9  9  9  9  9  9  9  8  8   8   8   9   9   9   9   9
## 6    e  6   1 mil  0  2  3  5  6  8 10 11 12 11 11  9 11 10 10 10 10 10  10  10  10   9   8   8   8
##   173 190 198
## 1   9   6   5
## 2  12  11   7
## 3  12  11   8
## 4   8   6   5
## 5   9   7   5
## 6   8   7   6
## 'data.frame':    5357 obs. of  6 variables:
##  $ dis : Factor w/ 2 levels "fer","mil": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ rep : int  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ pl  : int  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
##  $ dap : Factor w/ 28 levels "20","24","27",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ fol : int  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
##   dis sist rep pl dap fol
## 1 mil    e   1  1  20   0
## 2 mil    e   1  2  20   0
## 3 mil    e   1  3  20   0
## 4 mil    e   1  4  20   0
## 5 mil    e   1  5  20   0
## 6 mil    e   1  6  20   0
## 'data.frame':    5357 obs. of  6 variables:
##  $ dis : Factor w/ 2 levels "fer","mil": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
##  $ sist: Factor w/ 2 levels "e","y": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ rep : num  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
##  $ pl  : num  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
##  $ dap : num  20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ...
##  $ fol : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
##   dis sist rep pl dap fol
## 1 mil    e   1  1  20   0
## 2 mil    e   1  2  20   0
## 3 mil    e   1  3  20   0
## 4 mil    e   1  4  20   0
## 5 mil    e   1  5  20   0
## 6 mil    e   1  6  20   0

Exploração por planta

AUC por rep

##   dis sist rep dap      fol      id
## 1 fer    e   1  20 1.000000 fer_e_1
## 2 mil    e   1  20 0.000000 mil_e_1
## 3 fer    y   1  20 1.583333 fer_y_1
## 4 mil    y   1  20 1.333333 mil_y_1
## 5 fer    e   2  20 1.400000 fer_e_2
## 6 mil    e   2  20 0.000000 mil_e_2
##  [1] "1" "2" "3" "1" "2" "3" "1" "2" "3" "1" "2" "3"
##    dis sist rep      auc
## 1  fer    e   1 1484.900
## 2  fer    e   2 1526.600
## 3  fer    e   3 1486.650
## 4  fer    y   1 1686.689
## 5  fer    y   2 1730.208
## 6  fer    y   3 1725.375
## 7  mil    e   1 1434.050
## 8  mil    e   2 1319.600
## 9  mil    e   3 1392.600
## 10 mil    y   1 1551.167
## 11 mil    y   2 1601.125
## 12 mil    y   3 1568.583
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
## sist       1  69149   69149   122.9 0.0003766 ***
## Residuals  4   2251     563                      
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## Analysis of Variance Table
## 
## Response: auc
##           Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
## sist       1  55032   55032  27.512 0.006318 **
## Residuals  4   8001    2000                    
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Grafico final