Covid-19
Pedro Ivo Camacho A. Salvador
12/03/2020
Site permanente para atualização dos dados para o Brasil
Juntando com o do WordBank
Resultados por Continentes.
## Response [https://opendata.ecdc.europa.eu/covid19/casedistribution/csv/]
## Date: 2022-11-18 18:13
## Status: 200
## Content-Type: application/octet-stream
## Size: 4.31 MB
## <ON DISK> C:\Users\profe\AppData\Local\Temp\RtmpqWVlOb\file62b43339164f.csv
A primeira questão é que o número de casos em valor absoluto, pouco ou nada se refere ao verdadeiro poder destrutivo do contágio em cada país. Afinal, o número da população importa para termos uma ideia da importância relativa de cada pessoa para aquele país, e sua probabilidade de contágio.
Apenas em termos ilustrativos, os dois mapas abaixo representam em termos absolutos e termos relativos o imapcto da COVID19
Evolução da COVID19 pelo mundo
## Carregando pacotes exigidos: sp## ### Welcome to rworldmap ##### For a short introduction type : vignette('rworldmap')## 135 codes from your data successfully matched countries in the map
## 79 codes from your data failed to match with a country code in the map
## 108 codes from the map weren't represented in your data
Agora em termos relativos
## 135 codes from your data successfully matched countries in the map
## 79 codes from your data failed to match with a country code in the map
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A taxa de crescimento deve obedecer o mesmo padrão do exercício anterior. Qual o percentual da população que está de fato afetada por este virus.
São duas bases de dados. A primeira da ECDC fonte da União Europeia.
## 135 codes from your data successfully matched countries in the map
## 79 codes from your data failed to match with a country code in the map
## 108 codes from the map weren't represented in your data
Fazendo uma contrapartida
Paper Covid
## [1] "Argentina vs Brasil" "1498160" "40766"
## [4] NA "6901952" "181402"
## [7] NA
## [,1] [,2] [,3]
## 2020-02-26 1 0 211049519
## 2020-03-01 1 0 211049519
## 2020-03-05 1 0 211049519
## 2020-03-06 5 0 211049519
## 2020-03-07 5 0 211049519
## 2020-03-09 12 0 211049519
## 2020-03-11 9 0 211049519
## 2020-03-12 18 0 211049519
## 2020-03-13 25 0 211049519
## 2020-03-14 21 0 211049519
## 2020-03-15 23 0 211049519
## 2020-03-16 79 0 211049519
## 2020-03-17 34 0 211049519
## 2020-03-18 57 1 211049519
## 2020-03-19 137 3 211049519
## 2020-03-20 193 2 211049519
## 2020-03-21 283 5 211049519
## 2020-03-22 224 7 211049519
## 2020-03-23 418 7 211049519
## 2020-03-24 345 9 211049519
## 2020-03-25 310 12 211049519
## 2020-03-26 232 11 211049519
## 2020-03-27 482 20 211049519
## 2020-03-28 502 15 211049519
## 2020-03-29 487 22 211049519
## 2020-03-30 352 22 211049519
## 2020-03-31 323 23 211049519
## 2020-04-01 1138 42 211049519
## 2020-04-02 1119 40 211049519
## 2020-04-03 1074 58 211049519
## 2020-04-04 1146 60 211049519
## 2020-04-05 1222 73 211049519
## 2020-04-06 852 54 211049519
## 2020-04-07 926 67 211049519
## 2020-04-08 1661 114 211049519
## 2020-04-09 2210 133 211049519
## 2020-04-10 1930 141 211049519
## 2020-04-11 1781 115 211049519
## 2020-04-12 1089 68 211049519
## 2020-04-13 1442 99 211049519
## 2020-04-14 1261 105 211049519
## 2020-04-15 1832 204 211049519
## 2020-04-16 3058 204 211049519
## 2020-04-17 2105 188 211049519
## 2020-04-18 3257 217 211049519
## 2020-04-19 2917 206 211049519
## 2020-04-20 2055 115 211049519
## 2020-04-21 1927 113 211049519
## 2020-04-22 2498 166 211049519
## 2020-04-23 2678 165 211049519
## 2020-04-24 3735 407 211049519
## 2020-04-25 3503 357 211049519
## 2020-04-26 5514 346 211049519
## 2020-04-27 3379 189 211049519
## 2020-04-28 4613 338 211049519
## 2020-04-29 5385 474 211049519
## 2020-04-30 6276 449 211049519
## 2020-05-01 7218 435 211049519
## 2020-05-02 6209 428 211049519
## 2020-05-03 4970 421 211049519
## 2020-05-04 4588 275 211049519
## 2020-05-05 6633 296 211049519
## 2020-05-06 6935 600 211049519
## 2020-05-07 10503 615 211049519
## 2020-05-08 9888 610 211049519
## 2020-05-09 10222 751 211049519
## 2020-05-10 10611 730 211049519
## 2020-05-11 6760 496 211049519
## 2020-05-12 5632 396 211049519
## 2020-05-13 9258 881 211049519
## 2020-05-14 11385 749 211049519
## 2020-05-15 13944 844 211049519
## 2020-05-16 15305 824 211049519
## 2020-05-17 14919 816 211049519
## 2020-05-18 7938 485 211049519
## 2020-05-19 13140 674 211049519
## 2020-05-20 17408 1179 211049519
## 2020-05-21 19951 888 211049519
## 2020-05-22 18508 1188 211049519
## 2020-05-23 20803 1001 211049519
## 2020-05-24 16508 965 211049519
## 2020-05-25 15813 653 211049519
## 2020-05-26 11687 807 211049519
## 2020-05-27 16324 1039 211049519
## 2020-05-28 20599 1086 211049519
## 2020-05-29 26417 1156 211049519
## 2020-05-30 26928 1124 211049519
## 2020-05-31 33274 956 211049519
## 2020-06-01 16409 480 211049519
## 2020-06-02 11598 623 211049519
## 2020-06-03 28936 1262 211049519
## 2020-06-04 28633 1349 211049519
## 2020-06-05 30916 1473 211049519
## 2020-06-06 30830 1005 211049519
## 2020-06-07 27075 904 211049519
## 2020-06-08 18921 525 211049519
## 2020-06-09 15654 679 211049519
## 2020-06-10 32091 1272 211049519
## 2020-06-11 32913 1274 211049519
## 2020-06-12 30412 1239 211049519
## 2020-06-13 25982 909 211049519
## 2020-06-14 21704 892 211049519
## 2020-06-15 17110 612 211049519
## 2020-06-16 20647 627 211049519
## 2020-06-17 34918 1282 211049519
## 2020-06-18 32188 1269 211049519
## 2020-06-19 22765 1238 211049519
## 2020-06-20 54771 1206 211049519
## 2020-06-21 34666 1022 211049519
## 2020-06-22 17459 641 211049519
## 2020-06-23 21432 654 211049519
## 2020-06-24 39436 1374 211049519
## 2020-06-25 42725 1185 211049519
## 2020-06-26 39483 1141 211049519
## 2020-06-27 46860 990 211049519
## 2020-06-28 38693 1109 211049519
## 2020-06-29 30476 552 211049519
## 2020-06-30 24052 692 211049519
## 2020-07-01 33846 1280 211049519
## 2020-07-02 46712 1038 211049519
## 2020-07-03 48105 1252 211049519
## 2020-07-04 42223 1290 211049519
## 2020-07-05 37923 1091 211049519
## 2020-07-06 26051 602 211049519
## 2020-07-07 20229 620 211049519
## 2020-07-08 45305 1254 211049519
## 2020-07-09 44571 1223 211049519
## 2020-07-10 42619 1220 211049519
## 2020-07-11 45048 1214 211049519
## 2020-07-12 39023 1071 211049519
## 2020-07-13 24831 631 211049519
## 2020-07-14 20286 733 211049519
## 2020-07-15 41857 1300 211049519
## 2020-07-16 39924 1233 211049519
## 2020-07-17 45403 1322 211049519
## 2020-07-18 34177 1163 211049519
## 2020-07-19 28532 921 211049519
## 2020-07-20 23529 716 211049519
## 2020-07-21 20257 632 211049519
## 2020-07-22 41008 1367 211049519
## 2020-07-23 67860 1284 211049519
## 2020-07-24 59961 1311 211049519
## 2020-07-25 55891 1156 211049519
## 2020-07-26 51147 1211 211049519
## 2020-07-27 24578 555 211049519
## 2020-07-28 23284 614 211049519
## 2020-07-29 40816 921 211049519
## 2020-07-30 69074 1595 211049519
## 2020-07-31 57837 1129 211049519
## 2020-08-01 52383 1212 211049519
## 2020-08-02 45392 1088 211049519
## 2020-08-03 25800 541 211049519
## 2020-08-04 16641 561 211049519
## 2020-08-05 51603 1154 211049519
## 2020-08-06 57152 1437 211049519
## 2020-08-07 53139 1237 211049519
## 2020-08-08 50230 1079 211049519
## 2020-08-09 49970 905 211049519
## 2020-08-10 23010 572 211049519
## 2020-08-11 22048 703 211049519
## 2020-08-12 52160 1274 211049519
## 2020-08-13 55155 1175 211049519
## 2020-08-14 60091 1262 211049519
## 2020-08-15 50644 1060 211049519
## 2020-08-16 41576 709 211049519
## 2020-08-17 23101 620 211049519
## 2020-08-18 19373 684 211049519
## 2020-08-19 47784 1352 211049519
## 2020-08-20 49298 1212 211049519
## 2020-08-21 45323 1204 211049519
## 2020-08-22 30355 1054 211049519
## 2020-08-23 50032 892 211049519
## 2020-08-24 23421 494 211049519
## 2020-08-25 17078 565 211049519
## 2020-08-26 47134 1271 211049519
## 2020-08-27 47161 1085 211049519
## 2020-08-28 44235 984 211049519
## 2020-08-29 43412 855 211049519
## 2020-08-30 41350 958 211049519
## 2020-08-31 16158 366 211049519
## 2020-09-01 45961 553 211049519
## 2020-09-02 42659 1215 211049519
## 2020-09-03 46934 1184 211049519
## 2020-09-04 43773 834 211049519
## 2020-09-05 51194 907 211049519
## 2020-09-06 30168 682 211049519
## 2020-09-07 14521 447 211049519
## 2020-09-08 10273 310 211049519
## 2020-09-09 14279 504 211049519
## 2020-09-10 35816 1075 211049519
## 2020-09-11 40557 983 211049519
## 2020-09-12 43718 874 211049519
## 2020-09-13 33523 814 211049519
## 2020-09-14 14768 415 211049519
## 2020-09-15 15155 381 211049519
## 2020-09-16 36653 1113 211049519
## 2020-09-17 36820 987 211049519
## 2020-09-18 36303 829 211049519
## 2020-09-19 39797 858 211049519
## 2020-09-20 33057 739 211049519
## 2020-09-21 16389 363 211049519
## 2020-09-22 13439 377 211049519
## 2020-09-23 33536 836 211049519
## 2020-09-24 33281 869 211049519
## 2020-09-25 32817 831 211049519
## 2020-09-26 31911 729 211049519
## 2020-09-27 28378 869 211049519
## 2020-09-28 14318 335 211049519
## 2020-09-29 13155 317 211049519
## 2020-09-30 32058 863 211049519
## 2020-10-01 33413 1031 211049519
## 2020-10-02 36157 728 211049519
## 2020-10-03 33431 708 211049519
## 2020-10-04 26310 599 211049519
## 2020-10-05 8456 365 211049519
## 2020-10-06 11946 323 211049519
## 2020-10-07 41906 819 211049519
## 2020-10-08 31553 734 211049519
## 2020-10-09 27750 729 211049519
## 2020-10-10 27444 682 211049519
## 2020-10-11 26749 559 211049519
## 2020-10-12 12345 290 211049519
## 2020-10-13 8426 201 211049519
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## 2020-10-02 14001 3351 44780675
## 2020-10-03 14687 311 44780675
## 2020-10-04 11129 196 44780675
## 2020-10-05 7668 223 44780675
## 2020-10-06 11242 450 44780675
## 2020-10-07 14740 359 44780675
## 2020-10-08 16447 399 44780675
## 2020-10-09 15454 484 44780675
## 2020-10-10 15099 515 44780675
## 2020-10-11 12428 356 44780675
## 2020-10-12 10310 287 44780675
## 2020-10-13 9524 318 44780675
## 2020-10-14 13305 386 44780675
## 2020-10-15 14932 349 44780675
## 2020-10-16 17096 421 44780675
## 2020-10-17 16546 381 44780675
## 2020-10-18 13510 384 44780675
## 2020-10-19 10561 160 44780675
## 2020-10-20 12982 449 44780675
## 2020-10-21 16337 384 44780675
## 2020-10-22 18326 419 44780675
## 2020-10-23 16325 438 44780675
## 2020-10-24 15718 381 44780675
## 2020-10-25 11968 275 44780675
## 2020-10-26 9253 283 44780675
## 2020-10-27 11712 405 44780675
## 2020-10-28 14308 429 44780675
## 2020-10-29 13924 341 44780675
## 2020-10-30 12691 371 44780675
## 2020-10-31 13955 350 44780675
## 2020-11-01 9745 210 44780675
## 2020-11-02 6609 138 44780675
## 2020-11-03 9598 483 44780675
## 2020-11-04 12145 429 44780675
## 2020-11-05 10652 468 44780675
## 2020-11-06 11100 246 44780675
## 2020-11-07 11786 370 44780675
## 2020-11-08 8037 212 44780675
## 2020-11-09 5331 212 44780675
## 2020-11-10 8317 347 44780675
## 2020-11-11 11976 276 44780675
## 2020-11-12 10880 348 44780675
## 2020-11-13 11162 251 44780675
## 2020-11-14 11859 263 44780675
## 2020-11-15 8468 262 44780675
## 2020-11-16 5645 129 44780675
## 2020-11-17 7895 291 44780675
## 2020-11-18 10621 379 44780675
## 2020-11-19 10332 241 44780675
## 2020-11-20 10110 185 44780675
## 2020-11-21 9592 258 44780675
## 2020-11-22 7143 112 44780675
## 2020-11-23 4181 100 44780675
## 2020-11-24 3998 120 44780675
## 2020-11-25 7434 310 44780675
## 2020-11-26 8593 269 44780675
## 2020-11-27 9043 240 44780675
## 2020-11-28 7846 262 44780675
## 2020-11-29 6098 106 44780675
## 2020-11-30 5432 164 44780675
## 2020-12-01 5724 257 44780675
## 2020-12-02 8037 198 44780675
## 2020-12-03 7535 228 44780675
## 2020-12-04 7625 149 44780675
## 2020-12-05 6899 207 44780675
## 2020-12-06 5201 120 44780675
## 2020-12-07 3278 138 44780675
## 2020-12-08 3216 118 44780675
## 2020-12-09 3610 121 44780675
## 2020-12-10 5303 213 44780675
## 2020-12-11 6994 209 44780675
## 2020-12-12 7112 175 44780675
## 2020-12-13 5274 62 44780675
## 2020-12-14 3558 98 44780675## Registered S3 method overwritten by 'quantmod':
## method from
## as.zoo.data.frame zoo
## [,1] [,2] [,3]
## 2020-12-13 64.14307 1.0023268 308368.2
## 2020-12-14 31.88889 0.4076518 308368.2
Colocando no modelo
Resultados
Para os países com o pior nível.
## [1] "United States" "India" "Brazil"
## [4] "Russian Federation" "France" "United Kingdom"
## [7] "Italy" "Argentina" "Colombia"
## [10] "Germany"
Para o Brasil temos a seguinte configuração
## [1] "United States" "India" "Brazil" "Russia"
## [5] "France" "United Kingdom" "Italy" "Argentina"
## [9] "Colombia" "Germany"## [1] "United States" "Brazil" "India" "Mexico"
## [5] "Italy" "United Kingdom" "France" "Iran"
## [9] "Russia" "Argentina"
Para o Ceará temos a seguinte configuração
library(readxl)
ceara <- read_excel("COVID-19_CEARA.xlsx")
SIR <- function(time, state, parameters) {
par <- as.list(c(state, parameters))
with(par, {
dS <- -beta/N * I * S
dI <- beta/N * I * S - gamma * I
dR <- gamma * I
list(c(dS, dI, dR))
})
}
Infected <- as.numeric(ceara$Confirmados)
Day <- 1:(length(Infected))
N <- ceara$Pop
old <- par(mfrow = c(1, 2))
plot(Day, Infected, type ="b")
plot(Day, Infected, log = "y")## Warning in sprintf(ngettext(n, "%d y value <= 0 omitted from logarithmic
## plot", : one argument not used by format ''## Warning in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log):abline(lm(log10(Infected+exp(1)) ~ Day))
title(paste("Casos Confirmados no Ceará"), outer = TRUE, line = -2)
Analisando o comportamento desde o primeiro contágio
Atualizando o modelo de contágio e mortes
Plotando a letalidade média
Agora analisando a partir dos primeiros 100 contágios
Simulando efeitos de quarentena no Brasil
## [1] "United States" "India" "Brazil" "Russia"
## [5] "France" "United Kingdom" "Italy" "Argentina"
## [9] "Colombia" "Germany"
Mapas
Situação Nacional e agora a situação dos Estados
Casos
Casos
Mortes
Casos
Quarentena por estados, simulando os resultado para cada ente-federativo. Simulando os resultados para pico de contágio e etc.
#Análise Econométrica
Pela abordagem proposta por não funcionou
Política e Bolsonaro
Se for citar este estudo utilize a seguinte referência. Salvador (2020)
Salvador, Pedro Ivo Camacho Alves. 2020. “Análise Quantitativa
Da Covid19.” rPUBS 1: 1. https://rpubs.com/pedrosalvador/584906.