Getting the data & necessary libraries

library(haven)
df <- read_sav("./Desktop/saldataassignment1.sav")
attach(df)
str(df)
## tibble [1,422 × 48] (S3: tbl_df/tbl/data.frame)
##  $ country: dbl+lbl [1:1422] 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,...
##    ..@ label      : chr "Country from where data were obtained"
##    ..@ format.spss: chr "F8.2"
##    ..@ labels     : Named num [1:3] 1 2 3
##    .. ..- attr(*, "names")= chr [1:3] "usa" "uganda" "india"
##  $ sex    : dbl+lbl [1:1422] 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1,...
##    ..@ label      : chr "Sex"
##    ..@ format.spss: chr "F8.2"
##    ..@ labels     : Named num [1:2] 0 1
##    .. ..- attr(*, "names")= chr [1:2] "Male" "Female"
##  $ age    : num [1:1422] 20 43 21 18 20 21 20 NA 45 44 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal1   : num [1:1422] 3 3 4 4 2 3 4 4 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal2   : num [1:1422] 3 3 4 4 3 3 4 4 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal3   : num [1:1422] 3 2 3 3 3 3 4 4 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal4   : num [1:1422] 3 3 4 4 4 3 3 4 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal5   : num [1:1422] 3 3 3 4 4 3 4 2 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal6   : num [1:1422] 1 3 1 3 2 0 1 3 1 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal7   : num [1:1422] 2 2 2 1 2 1 0 3 1 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal8   : num [1:1422] 4 2 2 4 2 1 0 3 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal9   : num [1:1422] 4 3 2 4 2 2 2 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal10  : num [1:1422] 4 3 3 4 1 3 3 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal11  : num [1:1422] 3 3 3 4 3 3 3 2 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal12  : num [1:1422] 3 3 3 4 4 3 4 2 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal13  : num [1:1422] 2 3 1 1 2 2 3 4 2 1 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal14  : num [1:1422] 3 3 3 2 2 3 3 4 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal15  : num [1:1422] 3 3 3 3 4 3 4 3 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal16  : num [1:1422] 3 2 3 4 2 2 2 4 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal17  : num [1:1422] 3 3 4 4 2 3 3 1 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal18  : num [1:1422] 3 3 2 3 2 3 2 2 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal19  : num [1:1422] 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal20  : num [1:1422] 3 3 3 3 3 3 4 3 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal21  : num [1:1422] 3 3 3 3 2 3 3 3 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal22  : num [1:1422] 2 3 1 3 1 2 1 3 1 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal23  : num [1:1422] 3 3 1 4 1 1 0 2 4 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal24  : num [1:1422] 3 2 2 0 1 1 3 4 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal25  : num [1:1422] 2 3 4 4 3 3 3 2 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal26  : num [1:1422] 3 3 4 4 3 3 4 2 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal27  : num [1:1422] 3 3 3 4 2 2 2 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal28  : num [1:1422] 2 3 3 2 2 3 3 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal29  : num [1:1422] 3 3 3 3 2 3 3 3 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal30  : num [1:1422] 3 3 2 3 2 2 1 2 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal31  : num [1:1422] 3 2 1 4 2 2 0 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal32  : num [1:1422] 3 2 4 4 2 3 3 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal33  : num [1:1422] 3 3 4 4 4 3 4 4 3 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal34  : num [1:1422] 3 3 3 3 4 3 4 4 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal35  : num [1:1422] 3 3 4 4 4 3 4 4 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal36  : num [1:1422] 3 3 3 3 2 2 3 2 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal37  : num [1:1422] 4 3 3 4 3 3 1 4 4 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal38  : num [1:1422] 3 2 3 3 4 3 4 3 2 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal39  : num [1:1422] 2 2 4 4 4 2 4 2 2 3 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ sal40  : num [1:1422] 3 3 2 4 2 3 2 3 4 4 ...
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ esircos: num [1:1422] 17 18 12 22 4 10 1 21 15 20 ...
##   ..- attr(*, "label")= chr "ESI-Revised- Cognitive Orientation Toward Spirituality"
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ esirepd: num [1:1422] 12 13 9 2 3 9 11 15 1 13 ...
##   ..- attr(*, "label")= chr "ESI-Revised- Experiential-Phenomenological Dimension"
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ esirewb: num [1:1422] 18 15 23 22 23 18 20 12 21 21 ...
##   ..- attr(*, "label")= chr "ESI-Revised- Existential Well-Being"
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ esirpar: num [1:1422] 15 13 6 5 8 11 13 18 13 8 ...
##   ..- attr(*, "label")= chr "ESI-Revised- Paranormal Beliefs"
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
##  $ esirrel: num [1:1422] 19 19 11 24 4 11 5 21 19 23 ...
##   ..- attr(*, "label")= chr "ESI-Revised- Religiousness"
##   ..- attr(*, "format.spss")= chr "F8.2"
S <- data.frame(df[4:43])

Descriptive Statistics

summary(df)
##     country           sex              age             sal1      
##  Min.   :1.000   Min.   :0.0000   Min.   :17.00   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.:0.0000   1st Qu.:21.00   1st Qu.:2.000  
##  Median :3.000   Median :1.0000   Median :22.00   Median :3.000  
##  Mean   :2.324   Mean   :0.5353   Mean   :23.49   Mean   :2.823  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:1.0000   3rd Qu.:24.00   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :3.000   Max.   :1.0000   Max.   :56.00   Max.   :4.000  
##                  NA's   :4        NA's   :17                     
##       sal2            sal3            sal4            sal5           sal6      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.00   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.00   1st Qu.:1.000  
##  Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.00   Median :3.000  
##  Mean   :3.098   Mean   :2.844   Mean   :2.949   Mean   :2.98   Mean   :2.284  
##  3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.00   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.00   Max.   :4.000  
##                                                                                
##       sal7           sal8            sal9           sal10           sal11     
##  Min.   :0.00   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.00  
##  1st Qu.:2.00   1st Qu.:2.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.00  
##  Median :2.00   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.00  
##  Mean   :2.21   Mean   :2.653   Mean   :3.115   Mean   :3.201   Mean   :2.88  
##  3rd Qu.:3.00   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.00  
##  Max.   :4.00   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.00  
##                                                                               
##      sal12           sal13           sal14           sal15          sal16      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.00   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:3.000   1st Qu.:0.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.00   1st Qu.:1.000  
##  Median :3.000   Median :1.000   Median :3.000   Median :3.00   Median :2.000  
##  Mean   :2.875   Mean   :1.571   Mean   :2.927   Mean   :2.92   Mean   :2.281  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.00   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.00   Max.   :4.000  
##                                                                                
##      sal17           sal18           sal19           sal20           sal21     
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.00  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.:2.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.00  
##  Median :2.000   Median :2.500   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.00  
##  Mean   :2.385   Mean   :2.405   Mean   :3.404   Mean   :3.214   Mean   :2.78  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.00  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.00  
##                                                                                
##      sal22           sal23           sal24          sal25           sal26      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.00   Min.   :0.000   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.:1.000   1st Qu.:2.00   1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.000  
##  Median :3.000   Median :3.000   Median :3.00   Median :3.000   Median :3.000  
##  Mean   :2.384   Mean   :2.387   Mean   :2.41   Mean   :2.993   Mean   :2.812  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.00   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.00   Max.   :4.000   Max.   :4.000  
##                                                                                
##      sal27           sal28           sal29           sal30      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:1.000   1st Qu.:2.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.000  
##  Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000  
##  Mean   :2.382   Mean   :2.478   Mean   :3.034   Mean   :2.527  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000  
##                                                                 
##      sal31           sal32           sal33           sal34      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.000   1st Qu.:3.000  
##  Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000   Median :3.000  
##  Mean   :2.898   Mean   :2.897   Mean   :3.098   Mean   :2.985  
##  3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000  
##                                                                 
##      sal35           sal36          sal37           sal38           sal39      
##  Min.   :0.000   Min.   :0.00   Min.   :0.000   Min.   :0.000   Min.   :0.000  
##  1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.00   1st Qu.:3.000   1st Qu.:2.000   1st Qu.:2.000  
##  Median :3.000   Median :3.00   Median :4.000   Median :3.000   Median :3.000  
##  Mean   :3.012   Mean   :2.85   Mean   :3.331   Mean   :2.771   Mean   :2.695  
##  3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.00   3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:3.000  
##  Max.   :4.000   Max.   :4.00   Max.   :4.000   Max.   :4.000   Max.   :4.000  
##                                                                                
##      sal40          esircos         esirepd         esirewb     
##  Min.   :0.000   Min.   : 0.00   Min.   : 0.00   Min.   : 0.00  
##  1st Qu.:3.000   1st Qu.:13.00   1st Qu.: 9.00   1st Qu.:13.00  
##  Median :3.000   Median :17.00   Median :12.00   Median :16.00  
##  Mean   :3.115   Mean   :15.83   Mean   :11.52   Mean   :15.46  
##  3rd Qu.:4.000   3rd Qu.:19.00   3rd Qu.:14.00   3rd Qu.:18.00  
##  Max.   :4.000   Max.   :24.00   Max.   :24.00   Max.   :24.00  
##                                                                 
##     esirpar         esirrel     
##  Min.   : 0.00   Min.   : 0.00  
##  1st Qu.: 7.00   1st Qu.:14.00  
##  Median :10.00   Median :18.00  
##  Mean   :10.14   Mean   :16.69  
##  3rd Qu.:13.00   3rd Qu.:20.00  
##  Max.   :24.00   Max.   :24.00  
## 

Correlation test

mcor<-round(cor(S),2)
mcor
##       sal1 sal2  sal3 sal4  sal5 sal6 sal7 sal8 sal9 sal10 sal11 sal12 sal13
## sal1  1.00 0.45  0.17 0.20  0.09 0.19 0.19 0.26 0.23  0.32  0.17  0.18  0.12
## sal2  0.45 1.00  0.21 0.24  0.16 0.20 0.19 0.22 0.25  0.27  0.19  0.22  0.00
## sal3  0.17 0.21  1.00 0.28  0.29 0.08 0.20 0.08 0.08  0.08  0.35  0.29 -0.02
## sal4  0.20 0.24  0.28 1.00  0.27 0.15 0.24 0.14 0.13  0.16  0.30  0.27  0.04
## sal5  0.09 0.16  0.29 0.27  1.00 0.18 0.16 0.07 0.07  0.04  0.42  0.33 -0.05
## sal6  0.19 0.20  0.08 0.15  0.18 1.00 0.30 0.30 0.32  0.18  0.15  0.08  0.03
## sal7  0.19 0.19  0.20 0.24  0.16 0.30 1.00 0.39 0.29  0.24  0.18  0.18  0.03
## sal8  0.26 0.22  0.08 0.14  0.07 0.30 0.39 1.00 0.53  0.39  0.10  0.13  0.03
## sal9  0.23 0.25  0.08 0.13  0.07 0.32 0.29 0.53 1.00  0.59  0.14  0.09  0.08
## sal10 0.32 0.27  0.08 0.16  0.04 0.18 0.24 0.39 0.59  1.00  0.12  0.12  0.16
## sal11 0.17 0.19  0.35 0.30  0.42 0.15 0.18 0.10 0.14  0.12  1.00  0.46 -0.02
## sal12 0.18 0.22  0.29 0.27  0.33 0.08 0.18 0.13 0.09  0.12  0.46  1.00 -0.02
## sal13 0.12 0.00 -0.02 0.04 -0.05 0.03 0.03 0.03 0.08  0.16 -0.02 -0.02  1.00
## sal14 0.10 0.18  0.04 0.07  0.04 0.22 0.11 0.11 0.21  0.18  0.03  0.00 -0.01
## sal15 0.16 0.18  0.25 0.31  0.32 0.16 0.17 0.11 0.09  0.12  0.35  0.36  0.00
## sal16 0.29 0.22  0.03 0.19 -0.01 0.20 0.13 0.28 0.28  0.40  0.10  0.13  0.27
## sal17 0.27 0.28  0.23 0.31  0.27 0.25 0.24 0.20 0.19  0.20  0.33  0.34  0.08
## sal18 0.21 0.19  0.14 0.17  0.18 0.25 0.25 0.20 0.21  0.25  0.21  0.18  0.09
## sal19 0.05 0.13  0.15 0.13  0.21 0.08 0.06 0.07 0.09  0.07  0.20  0.12 -0.08
## sal20 0.11 0.18  0.22 0.28  0.22 0.13 0.14 0.07 0.08  0.11  0.20  0.20  0.03
## sal21 0.18 0.18  0.10 0.13  0.10 0.22 0.07 0.13 0.14  0.20  0.14  0.09  0.03
## sal22 0.28 0.24  0.11 0.15  0.08 0.39 0.28 0.40 0.46  0.45  0.17  0.08  0.12
## sal23 0.22 0.17  0.03 0.11  0.01 0.27 0.19 0.41 0.42  0.34  0.10  0.11  0.05
## sal24 0.22 0.12  0.04 0.10 -0.01 0.19 0.15 0.22 0.26  0.36  0.04  0.01  0.38
## sal25 0.23 0.30  0.16 0.23  0.26 0.23 0.16 0.16 0.16  0.16  0.24  0.24 -0.01
## sal26 0.22 0.18  0.12 0.23  0.17 0.11 0.08 0.08 0.07  0.12  0.20  0.20  0.02
## sal27 0.26 0.24  0.06 0.22  0.00 0.21 0.14 0.25 0.29  0.42  0.15  0.13  0.27
## sal28 0.09 0.10  0.05 0.08  0.08 0.07 0.07 0.11 0.10  0.10  0.10  0.07  0.00
## sal29 0.09 0.18  0.18 0.18  0.17 0.08 0.12 0.03 0.04  0.06  0.14  0.11 -0.01
## sal30 0.23 0.20  0.18 0.26  0.30 0.34 0.34 0.34 0.33  0.29  0.27  0.21  0.08
## sal31 0.31 0.35  0.23 0.25  0.23 0.30 0.34 0.35 0.38  0.33  0.25  0.20  0.04
## sal32 0.41 0.42  0.17 0.26  0.16 0.21 0.18 0.21 0.21  0.23  0.23  0.23  0.03
## sal33 0.19 0.27  0.13 0.29  0.15 0.11 0.13 0.12 0.14  0.22  0.17  0.21  0.02
## sal34 0.14 0.20  0.22 0.34  0.19 0.14 0.21 0.13 0.13  0.14  0.23  0.25  0.01
## sal35 0.15 0.17  0.26 0.44  0.29 0.17 0.21 0.07 0.10  0.09  0.24  0.25  0.05
## sal36 0.17 0.24  0.22 0.20  0.32 0.26 0.21 0.09 0.13  0.13  0.23  0.17 -0.03
## sal37 0.29 0.20  0.08 0.13  0.06 0.18 0.24 0.47 0.57  0.70  0.13  0.13  0.12
## sal38 0.16 0.17  0.36 0.33  0.28 0.18 0.23 0.17 0.14  0.12  0.35  0.28 -0.03
## sal39 0.18 0.21  0.27 0.29  0.29 0.16 0.21 0.12 0.11  0.12  0.39  0.36  0.00
## sal40 0.24 0.22  0.11 0.18  0.17 0.19 0.28 0.34 0.38  0.41  0.21  0.24  0.04
##       sal14 sal15 sal16 sal17 sal18 sal19 sal20 sal21 sal22 sal23 sal24 sal25
## sal1   0.10  0.16  0.29  0.27  0.21  0.05  0.11  0.18  0.28  0.22  0.22  0.23
## sal2   0.18  0.18  0.22  0.28  0.19  0.13  0.18  0.18  0.24  0.17  0.12  0.30
## sal3   0.04  0.25  0.03  0.23  0.14  0.15  0.22  0.10  0.11  0.03  0.04  0.16
## sal4   0.07  0.31  0.19  0.31  0.17  0.13  0.28  0.13  0.15  0.11  0.10  0.23
## sal5   0.04  0.32 -0.01  0.27  0.18  0.21  0.22  0.10  0.08  0.01 -0.01  0.26
## sal6   0.22  0.16  0.20  0.25  0.25  0.08  0.13  0.22  0.39  0.27  0.19  0.23
## sal7   0.11  0.17  0.13  0.24  0.25  0.06  0.14  0.07  0.28  0.19  0.15  0.16
## sal8   0.11  0.11  0.28  0.20  0.20  0.07  0.07  0.13  0.40  0.41  0.22  0.16
## sal9   0.21  0.09  0.28  0.19  0.21  0.09  0.08  0.14  0.46  0.42  0.26  0.16
## sal10  0.18  0.12  0.40  0.20  0.25  0.07  0.11  0.20  0.45  0.34  0.36  0.16
## sal11  0.03  0.35  0.10  0.33  0.21  0.20  0.20  0.14  0.17  0.10  0.04  0.24
## sal12  0.00  0.36  0.13  0.34  0.18  0.12  0.20  0.09  0.08  0.11  0.01  0.24
## sal13 -0.01  0.00  0.27  0.08  0.09 -0.08  0.03  0.03  0.12  0.05  0.38 -0.01
## sal14  1.00  0.16  0.18  0.13  0.16  0.22  0.10  0.24  0.20  0.14  0.13  0.29
## sal15  0.16  1.00  0.14  0.34  0.23  0.17  0.24  0.16  0.18  0.08  0.06  0.27
## sal16  0.18  0.14  1.00  0.26  0.24 -0.04  0.09  0.24  0.34  0.33  0.35  0.18
## sal17  0.13  0.34  0.26  1.00  0.38  0.10  0.22  0.22  0.29  0.20  0.14  0.37
## sal18  0.16  0.23  0.24  0.38  1.00  0.10  0.13  0.20  0.31  0.16  0.17  0.27
## sal19  0.22  0.17 -0.04  0.10  0.10  1.00  0.21  0.10  0.04 -0.02  0.06  0.20
## sal20  0.10  0.24  0.09  0.22  0.13  0.21  1.00  0.22  0.15  0.08  0.04  0.22
## sal21  0.24  0.16  0.24  0.22  0.20  0.10  0.22  1.00  0.30  0.20  0.08  0.24
## sal22  0.20  0.18  0.34  0.29  0.31  0.04  0.15  0.30  1.00  0.40  0.29  0.23
## sal23  0.14  0.08  0.33  0.20  0.16 -0.02  0.08  0.20  0.40  1.00  0.22  0.18
## sal24  0.13  0.06  0.35  0.14  0.17  0.06  0.04  0.08  0.29  0.22  1.00  0.16
## sal25  0.29  0.27  0.18  0.37  0.27  0.20  0.22  0.24  0.23  0.18  0.16  1.00
## sal26  0.13  0.39  0.15  0.24  0.16  0.14  0.18  0.18  0.10  0.09  0.10  0.27
## sal27  0.16  0.17  0.71  0.28  0.28 -0.03  0.11  0.21  0.34  0.33  0.31  0.19
## sal28  0.07  0.09  0.12  0.16  0.14 -0.03  0.10  0.11  0.12  0.13  0.05  0.11
## sal29  0.13  0.17  0.00  0.13  0.09  0.29  0.27  0.09  0.08 -0.04  0.01  0.20
## sal30  0.20  0.27  0.24  0.34  0.38  0.14  0.17  0.21  0.40  0.25  0.22  0.31
## sal31  0.18  0.26  0.15  0.32  0.27  0.16  0.19  0.15  0.35  0.24  0.18  0.33
## sal32  0.17  0.21  0.21  0.31  0.22  0.13  0.24  0.23  0.26  0.20  0.15  0.32
## sal33  0.17  0.27  0.17  0.24  0.17  0.16  0.42  0.23  0.15  0.14  0.03  0.25
## sal34  0.09  0.34  0.15  0.24  0.15  0.11  0.34  0.14  0.16  0.12  0.04  0.18
## sal35  0.07  0.33  0.13  0.28  0.15  0.12  0.37  0.14  0.14  0.08  0.09  0.19
## sal36  0.20  0.29  0.05  0.26  0.37  0.23  0.24  0.26  0.21  0.06  0.07  0.34
## sal37  0.16  0.11  0.37  0.18  0.23  0.07  0.13  0.15  0.41  0.39  0.32  0.18
## sal38  0.06  0.35  0.17  0.34  0.22  0.10  0.23  0.15  0.22  0.16  0.06  0.19
## sal39  0.06  0.30  0.17  0.40  0.23  0.13  0.21  0.12  0.16  0.16  0.08  0.25
## sal40  0.13  0.20  0.26  0.29  0.24  0.10  0.15  0.14  0.29  0.29  0.19  0.28
##       sal26 sal27 sal28 sal29 sal30 sal31 sal32 sal33 sal34 sal35 sal36 sal37
## sal1   0.22  0.26  0.09  0.09  0.23  0.31  0.41  0.19  0.14  0.15  0.17  0.29
## sal2   0.18  0.24  0.10  0.18  0.20  0.35  0.42  0.27  0.20  0.17  0.24  0.20
## sal3   0.12  0.06  0.05  0.18  0.18  0.23  0.17  0.13  0.22  0.26  0.22  0.08
## sal4   0.23  0.22  0.08  0.18  0.26  0.25  0.26  0.29  0.34  0.44  0.20  0.13
## sal5   0.17  0.00  0.08  0.17  0.30  0.23  0.16  0.15  0.19  0.29  0.32  0.06
## sal6   0.11  0.21  0.07  0.08  0.34  0.30  0.21  0.11  0.14  0.17  0.26  0.18
## sal7   0.08  0.14  0.07  0.12  0.34  0.34  0.18  0.13  0.21  0.21  0.21  0.24
## sal8   0.08  0.25  0.11  0.03  0.34  0.35  0.21  0.12  0.13  0.07  0.09  0.47
## sal9   0.07  0.29  0.10  0.04  0.33  0.38  0.21  0.14  0.13  0.10  0.13  0.57
## sal10  0.12  0.42  0.10  0.06  0.29  0.33  0.23  0.22  0.14  0.09  0.13  0.70
## sal11  0.20  0.15  0.10  0.14  0.27  0.25  0.23  0.17  0.23  0.24  0.23  0.13
## sal12  0.20  0.13  0.07  0.11  0.21  0.20  0.23  0.21  0.25  0.25  0.17  0.13
## sal13  0.02  0.27  0.00 -0.01  0.08  0.04  0.03  0.02  0.01  0.05 -0.03  0.12
## sal14  0.13  0.16  0.07  0.13  0.20  0.18  0.17  0.17  0.09  0.07  0.20  0.16
## sal15  0.39  0.17  0.09  0.17  0.27  0.26  0.21  0.27  0.34  0.33  0.29  0.11
## sal16  0.15  0.71  0.12  0.00  0.24  0.15  0.21  0.17  0.15  0.13  0.05  0.37
## sal17  0.24  0.28  0.16  0.13  0.34  0.32  0.31  0.24  0.24  0.28  0.26  0.18
## sal18  0.16  0.28  0.14  0.09  0.38  0.27  0.22  0.17  0.15  0.15  0.37  0.23
## sal19  0.14 -0.03 -0.03  0.29  0.14  0.16  0.13  0.16  0.11  0.12  0.23  0.07
## sal20  0.18  0.11  0.10  0.27  0.17  0.19  0.24  0.42  0.34  0.37  0.24  0.13
## sal21  0.18  0.21  0.11  0.09  0.21  0.15  0.23  0.23  0.14  0.14  0.26  0.15
## sal22  0.10  0.34  0.12  0.08  0.40  0.35  0.26  0.15  0.16  0.14  0.21  0.41
## sal23  0.09  0.33  0.13 -0.04  0.25  0.24  0.20  0.14  0.12  0.08  0.06  0.39
## sal24  0.10  0.31  0.05  0.01  0.22  0.18  0.15  0.03  0.04  0.09  0.07  0.32
## sal25  0.27  0.19  0.11  0.20  0.31  0.33  0.32  0.25  0.18  0.19  0.34  0.18
## sal26  1.00  0.16  0.07  0.12  0.17  0.21  0.24  0.24  0.22  0.19  0.18  0.09
## sal27  0.16  1.00  0.11 -0.02  0.28  0.20  0.21  0.19  0.17  0.13  0.08  0.37
## sal28  0.07  0.11  1.00  0.11  0.11  0.10  0.14  0.12  0.13  0.13  0.13  0.09
## sal29  0.12 -0.02  0.11  1.00  0.20  0.19  0.20  0.25  0.19  0.20  0.26  0.05
## sal30  0.17  0.28  0.11  0.20  1.00  0.44  0.31  0.18  0.22  0.24  0.34  0.31
## sal31  0.21  0.20  0.10  0.19  0.44  1.00  0.39  0.24  0.17  0.18  0.30  0.34
## sal32  0.24  0.21  0.14  0.20  0.31  0.39  1.00  0.35  0.20  0.24  0.25  0.23
## sal33  0.24  0.19  0.12  0.25  0.18  0.24  0.35  1.00  0.45  0.37  0.25  0.23
## sal34  0.22  0.17  0.13  0.19  0.22  0.17  0.20  0.45  1.00  0.47  0.23  0.17
## sal35  0.19  0.13  0.13  0.20  0.24  0.18  0.24  0.37  0.47  1.00  0.29  0.13
## sal36  0.18  0.08  0.13  0.26  0.34  0.30  0.25  0.25  0.23  0.29  1.00  0.11
## sal37  0.09  0.37  0.09  0.05  0.31  0.34  0.23  0.23  0.17  0.13  0.11  1.00
## sal38  0.21  0.17  0.10  0.17  0.29  0.24  0.23  0.29  0.41  0.35  0.24  0.15
## sal39  0.22  0.18  0.12  0.15  0.30  0.27  0.27  0.29  0.28  0.31  0.27  0.12
## sal40  0.18  0.29  0.11  0.08  0.31  0.34  0.24  0.27  0.22  0.21  0.17  0.47
##       sal38 sal39 sal40
## sal1   0.16  0.18  0.24
## sal2   0.17  0.21  0.22
## sal3   0.36  0.27  0.11
## sal4   0.33  0.29  0.18
## sal5   0.28  0.29  0.17
## sal6   0.18  0.16  0.19
## sal7   0.23  0.21  0.28
## sal8   0.17  0.12  0.34
## sal9   0.14  0.11  0.38
## sal10  0.12  0.12  0.41
## sal11  0.35  0.39  0.21
## sal12  0.28  0.36  0.24
## sal13 -0.03  0.00  0.04
## sal14  0.06  0.06  0.13
## sal15  0.35  0.30  0.20
## sal16  0.17  0.17  0.26
## sal17  0.34  0.40  0.29
## sal18  0.22  0.23  0.24
## sal19  0.10  0.13  0.10
## sal20  0.23  0.21  0.15
## sal21  0.15  0.12  0.14
## sal22  0.22  0.16  0.29
## sal23  0.16  0.16  0.29
## sal24  0.06  0.08  0.19
## sal25  0.19  0.25  0.28
## sal26  0.21  0.22  0.18
## sal27  0.17  0.18  0.29
## sal28  0.10  0.12  0.11
## sal29  0.17  0.15  0.08
## sal30  0.29  0.30  0.31
## sal31  0.24  0.27  0.34
## sal32  0.23  0.27  0.24
## sal33  0.29  0.29  0.27
## sal34  0.41  0.28  0.22
## sal35  0.35  0.31  0.21
## sal36  0.24  0.27  0.17
## sal37  0.15  0.12  0.47
## sal38  1.00  0.53  0.22
## sal39  0.53  1.00  0.29
## sal40  0.22  0.29  1.00

model - Principal Component Method of Factor Analysis

The principal() function performs factor analysis with the principal component method as explained above. The rotation is set to none for now as we have not yet done any rotation of the factors. The covar argument is set to TRUE so the function factors the covariance matrix S of the data as we did above.

library(psych)
root.fa.covar <- principal(df[,4:43], nfactors = 2, rotate = 'none', covar = TRUE)
root.fa.covar
## Principal Components Analysis
## Call: principal(r = df[, 4:43], nfactors = 2, rotate = "none", covar = TRUE)
## Standardized loadings (pattern matrix) based upon correlation matrix
##        PC1   PC2    h2   u2 com
## sal1  0.49 -0.15 0.267 0.73 1.2
## sal2  0.51  0.00 0.259 0.74 1.0
## sal3  0.38  0.34 0.262 0.74 2.0
## sal4  0.50  0.27 0.325 0.68 1.6
## sal5  0.40  0.43 0.344 0.66 2.0
## sal6  0.46 -0.14 0.233 0.77 1.2
## sal7  0.47 -0.06 0.222 0.78 1.0
## sal8  0.49 -0.41 0.409 0.59 1.9
## sal9  0.53 -0.48 0.508 0.49 2.0
## sal10 0.55 -0.51 0.563 0.44 2.0
## sal11 0.48  0.34 0.350 0.65 1.8
## sal12 0.45  0.33 0.304 0.70 1.8
## sal13 0.12 -0.28 0.095 0.91 1.4
## sal14 0.32 -0.09 0.110 0.89 1.2
## sal15 0.50  0.35 0.374 0.63 1.8
## sal16 0.48 -0.42 0.403 0.60 2.0
## sal17 0.60  0.14 0.376 0.62 1.1
## sal18 0.50 -0.04 0.253 0.75 1.0
## sal19 0.26  0.25 0.128 0.87 2.0
## sal20 0.42  0.30 0.267 0.73 1.8
## sal21 0.39 -0.03 0.153 0.85 1.0
## sal22 0.57 -0.37 0.460 0.54 1.7
## sal23 0.44 -0.40 0.356 0.64 2.0
## sal24 0.34 -0.40 0.280 0.72 1.9
## sal25 0.53  0.13 0.292 0.71 1.1
## sal26 0.39  0.20 0.191 0.81 1.5
## sal27 0.50 -0.39 0.401 0.60 1.9
## sal28 0.23  0.01 0.054 0.95 1.0
## sal29 0.30  0.30 0.181 0.82 2.0
## sal30 0.62 -0.05 0.383 0.62 1.0
## sal31 0.61 -0.05 0.371 0.63 1.0
## sal32 0.55  0.05 0.308 0.69 1.0
## sal33 0.50  0.22 0.296 0.70 1.4
## sal34 0.48  0.30 0.320 0.68 1.7
## sal35 0.48  0.36 0.363 0.64 1.9
## sal36 0.48  0.27 0.304 0.70 1.6
## sal37 0.55 -0.49 0.540 0.46 2.0
## sal38 0.52  0.31 0.372 0.63 1.6
## sal39 0.52  0.31 0.370 0.63 1.6
## sal40 0.55 -0.18 0.339 0.66 1.2
## 
##                        PC1  PC2
## SS loadings           8.95 3.44
## Proportion Var        0.22 0.09
## Cumulative Var        0.22 0.31
## Proportion Explained  0.72 0.28
## Cumulative Proportion 0.72 1.00
## 
## Mean item complexity =  1.5
## Test of the hypothesis that 2 components are sufficient.
## 
## The root mean square of the residuals (RMSR) is  0.06 
##  with the empirical chi square  7366.57  with prob <  0 
## 
## Fit based upon off diagonal values = 0.93

What factors to extract?

# Determine Number of Factors to Extract
library(nFactors)
## Loading required package: lattice
## 
## Attaching package: 'nFactors'
## The following object is masked from 'package:lattice':
## 
##     parallel
ev <- eigen(cor(S)) # get eigenvalues
ap <- parallel(subject=nrow(S),var=ncol(S),
  rep=100,cent=.05)
nS <- nScree(x=ev$values, aparallel=ap$eigen$qevpea)
plotnScree(nS)