Comparatives p value 0.1. KEGG

Plataforma Genòmica i Bioinformàtica

2021-02-12

Reunió 29/01/2021

Patró de gens p value 0.1

dieta
coding
coding+non coding
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
compare ups down total_1 ups_2 down_2 total_2 ups down total_1 ups_2 down_2 total_2
SUP vs DEF 54 264 318 1 7 8 1160 675 1835 23 30 53
WT- SUP vs DEF 262 670 932 8 58 66 1066 301 1367 9 1 10
DF1- SUP vs DEF 98 130 228 NA NA NA 2733 1234 3967 97 268 365
mDf1-SUP vs DEF 105 576 681 2 75 77 2386 854 3240 46 18 64
mWt- SUP vs DEF 223 684 907 2 1 3 1410 511 1921 25 17 42
NORMAL- SUP vs DEF 67 264 331 NA NA NA 1390 1121 2511 44 259 303
mWt and WT- SUP vs DEF 225 114 339 5 1 6 1074 427 1501 22 12 34
DF1 and RSA- SUP vs DEF 153 165 318 7 3 10 1295 530 1825 73 13 86
mDf1 and WT- SUP vs DEF 822 1305 2127 8 212 220 1410 511 1921 25 17 42
mWt and DF1- SUP vs DEF 296 908 1204 2 5 7 3995 2190 6185 310 727 1037
mDf1 and DF1- SUP vs DEF 84 118 202 NA NA NA 2781 1108 3889 59 36 95
DF1 and NORMAL- SUP vs DEF 164 183 347 2 1 3 863 557 1420 11 15 26
mWt and DF1 and RSA-SUP vs DEF 455 1139 1594 13 22 35 1077 367 1444 11 4 15
mDf1 and DF1 and RSA- SUP vs DEF 344 661 1005 9 43 52 2681 1154 3835 131 55 186
mWt and WT and NORMAL- SUP vs DEF 225 114 339 5 1 6 1853 1482 3335 73 181 254
mDf1 and WT and NORMAL- SUP vs DEF 822 1305 2127 8 212 220 1295 530 1825 73 13 86
mWt and DF1 and NORMAL- SUP vs DEF 321 575 896 6 3 9 3995 2190 6185 310 727 1037
mDf1 and DF1 and NORMAL- SUP vs DEF 287 222 509 7 5 12 1691 613 2304 71 15 86
fenotip
coding
coding+non coding
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
compare ups down total_1 ups_2 down_2 total_2 ups down total_1 ups_2 down_2 total_2
RSA vs NORMAL 154 636 790 2 9 11 1924 1664 3588 10 100 110
SUP-RSA vs NORMAL 184 135 319 2 3 5 2097 1561 3658 39 235 274
DEF- RSA vs NORMAL 411 973 1384 1 54 55 976 593 1569 20 7 27
DF1- RSA vs NORMAL 28 269 297 NA NA NA 1958 1476 3434 21 277 298
mWt- RSA vs NORMAL 287 849 1136 NA NA NA 647 1497 2144 9 9 18
mDf1- RSA vs NORMAL 382 947 1329 1 91 92 2493 1455 3948 69 233 302
DF1 and DEF- RSA vs NORMAL 77 202 279 1 0 1 523 466 989 9 6 15
DF1 and SUP- RSA vs NORMAL 175 302 477 3 6 9 1272 1215 2487 39 43 82
mWt and DEF- RSA vs NORMAL 234 380 614 5 22 27 1220 793 2013 35 98 133
mWt and DF1- RSA vs NORMAL 51 247 298 NA NA NA 435 731 1166 30 30 60
mWt and SUP- RSA vs NORMAL 542 1029 1571 3 85 88 2485 1488 3973 115 360 475
mDf1 and DEF- RSA vs NORMAL 576 821 1397 1 74 75 2344 1187 3531 81 174 255
mDf1 and DF1- RSA vs NORMAL 464 1038 1502 NA NA NA 2683 1475 4158 69 250 319
mDf1 and SUP- RSA vs NORMAL 369 911 1280 5 78 83 2392 1661 4053 88 248 336
mWt and DF1 and DEF- RSA vs NORMAL 73 76 149 2 1 3 198 297 495 7 8 15
mWt and DF1 and SUP- RSA vs NORMAL 169 541 710 4 19 23 896 1123 2019 79 163 242
mDf1 and DF1 and DEF- RSA vs NORMAL 424 572 996 1 38 39 1677 916 2593 43 86 129
mDf1 and DF1 and SUP- RSA vs NORMAL 746 1667 2413 5 192 197 3588 2636 6224 165 707 872
genotip
coding
coding+non coding
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
FC 1.2; pval=0.1
FC 2; pval=0.1
compare ups down total_1 ups_2 down_2 total_2 ups down total_1 ups_2 down_2 total_2
DF1 vs WT 296 516 812 1 13 14 2706 991 3697 12 108 120
DEF- DF1 vs WT 626 913 1539 6 94 100 3036 1475 4511 105 374 479
mWt- DF1 vs WT 1016 912 1928 15 138 153 3773 1308 5081 425 443 868
SUP- DF1 vs WT 187 174 361 1 1 2 1875 598 2473 11 8 19
mDf1- DF1 vs WT 64 156 220 1 5 6 834 775 1609 10 13 23
NORMAL- DF1 vs WT 260 239 499 1 9 10 2264 673 2937 15 62 77
mWt and DEF- DF1 vs WT 774 689 1463 20 154 174 2550 1210 3760 444 461 905
mWt and SUP- DF1 vs WT 1147 1063 2210 14 95 109 4482 1373 5855 502 424 926
mDf1 and DEF- DF1 vs WT 242 547 789 3 38 41 1930 1179 3109 71 166 237
mDf1 and SUP- DF1 vs WT 149 265 414 3 3 6 759 1743 2502 22 23 45
DEF and NORMAL-DF1 vs WT 426 424 850 3 38 41 2316 890 3206 85 165 250
mWt and NORMAL- DF1 vs WT 960 691 1651 15 82 97 3825 1071 4896 375 346 721
SUP and NORMAL- DF1 vs WT 263 208 471 3 3 6 1928 886 2814 20 26 46
mDf1 and NORMAL- DF1 vs WT 91 77 168 3 2 5 513 879 1392 7 33 40
mWt and SUP and NORMA- DF1 vs WT 1045 749 1794 16 62 78 2385 1023 3408 486 383 869
mWt and DEF and NORMAL- DF1 vs WT 728 596 1324 18 115 133 4370 1078 5448 477 320 797
mDf1 and DEF and NORMAL- DF1 vs WT 169 260 429 4 11 15 1242 818 2060 52 28 80
mDf1 and SUP and NORMAL- DF1 vs WT 985 584 1569 108 6 114 1624 2807 4431 321 56 377

KEGG

COMPARATIVA dieta

COMPARATIVA fenotip

COMPARATIVA genotip

Número de GOs compartits entre les diferents comparatives

KEGG per KEGG

Com es comporten els gens involucrats ens els KEGG comuns entre comparatives

[1] 1

Comportaments gens dieta

GOs comuns a un màxim de 4

mmu03010

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04530

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04924

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05171

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05203

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05418

Taula amb tots els gens comparativa

GOs comuns a un màxim de 3

mmu01522

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04070

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04360

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04927

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04928

Taula amb tots els gens comparativa

GOs comuns a un màxim de 2

mmu01040

mmu03050

mmu04270

mmu04611

mmu04614

mmu04966

mmu05231

[1] 2

Comportaments gens fenotip

GOs comuns a un màxim de 6

mmu00071

Taula amb tots els gens comparativa

mmu00280

Taula amb tots els gens comparativa

mmu00630

Taula amb tots els gens comparativa

mmu01210

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04020

Taula amb tots els gens comparativa

GOs comuns a un màxim de 3

mmu00601

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04142

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04144

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04520

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04962

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05203

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05214

Taula amb tots els gens comparativa

mmu05215

Taula amb tots els gens comparativa

GOs comuns a un màxim de 2

mmu04014

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04360

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04725

Taula amb tots els gens comparativa

mmu04730

mmu04916

Taula amb tots els gens comparativa