ConectaR 2021

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Análisis y visualización de datos del fenotipo de las semillas y germinación de un set de accesiones de la colección mundial de frijol mediante Rstudio
Joselin Piedra, Ester Vargas, Andrés Monge, Guillermo Solano, William Solano, Luis Guillermo Santos, Peter Wenzl, Luis Barboza-Barquero luisorlando.barboza@ucr.ac.cr http://www.cigras.ucr.ac.cr

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Objetivo

Caracterizar la germinación y propiedades de semillas de 1200 accesiones del banco mundial de frijol del CIAT que estuvieron almacenadas por 30 años a -20°C en el CATIE

Origen de las muestras

Fenotipo

Humedad semilla (%)

Correlaciones

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Características evaluadas y algunos de los paquetes utilizados

-Análisis de imágenes: área, color, e imbibición

-Métodos convencionales: germinación ( plántulas normales, anormales, muertas), tetrazolio, humedad, actividad de agua, clorofila

-Algunos paquetes utilizados en RStudio: stringr (unir bases de datos), plotly (visualización de datos), easynls (ajuste de modelos), PerformanceAnalytics, ggcorrplot (análisis de correlación), FactoMineR (análisis de componentes principales)

Trabajo futuro

-Identificar accesiones con alta viabilidad y conocer atributos que confieren esta respuesta

-Determinar si alguno de los métodos permite identificar rápidamente la viabilidad de una semilla

-Conocer si existe alguna relación entre el origen de las semillas y su respuesta al almacenamiento

Agradecimientos

Comité organizador ConectaR. CIAT-CATIE-CIGRAS. VI-UCR Proyecto C0609. Este poster se hizo siguiendo el post de Wei Yang https://wytham.rbind.io/post/making-a-poster-in-r/