Prestin.

Prestin es una proteína critica para la audicion en mamiferos. Está codificado por el gen SLC26A5. Cientificos descubrieron que este gen muestra los mismos cambios en delfines, es posible que los cambios genéticos observados en este, permitan vibraciones más rápidas y, por ello, la mayor frecuencia de audición que se necesita para la ecolocación.

efecto de proteina prestin en delfines

Para que sirve.

Las ondas rebotan en el entorno, por lo que los delfines les ayuda a: - Comunicarse entre ellos - Orientarse - Encontrar una presa

Idealización de la fuerza de la tela de araña en la mente de Stan Lee

Análisis de la proteina prestin

## Proteína prestin
Protein_prestin <- readAAStringSet(file="prestin.fasta")

Nombre de la secuencia.

names(Protein_prestin)

## [1] "XP_004320315.1 prestin [Tursiops truncatus]"

Número de aminoácidos.

width(Protein_prestin)

## [1] 741

Continuación análisis de la proteina prestin

Primeros 20 aminoácidos

subseq(Protein_prestin, start=1, end=20)

## AAStringSet object of length 1:
##     width seq                                               names               
## [1]    20 MDHVEETEILAATQRYYVER                              XP_004320315.1 pr...

Análisis de la proteína completa.

alphabetFrequency(Protein_prestin)

##       A  R  N  D C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T W  Y  V U O B J Z X * -
## [1,] 62 21 24 30 9 25 39 54 11 54 80 36 18 43 38 48 46 3 28 72 0 0 0 0 0 0 0 0
##      + . other
## [1,] 0 0     0

Referencias científicas.

Genes y genomas

1 - Definición de prestin. Link.

2.- proteina prestin https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/XP_004320315.1?report=fasta