Caso de estudio de la 2da unidad de probabilidad y estadística: Enfermedades crónicas y su relación con los fallecimientos por COVID-19
- Importar bibliotecas:
library(pacman)
p_load("base64enc", "htmltools", "mime", "xfun", "prettydoc","readr", "knitr","DT","dplyr", "ggplot2","plotly", "gganimate","gifski","scales")¿Que tan probable es que un municipio con alta cantidad de diagnósticos por enfermedades crónicas también sea un municipio con tasas elevadas de mortalidad por COVID-19?
Dado que los pacientes con enfermedades crónicas tienen mayor probabilidad de desarrollar complicaciones si se contagian.
Enfermedades crónicas en Sonora
Fuente de los datos Obtenida de: https://datos.gob.mx/busca/dataset/expediente-clinico-electronico-unemes-enfermedades-cronicas--2018
URL de datos CSV crudos: http://www.cenaprece.salud.gob.mx/descargas/Excel/Diagnosticos18.csv
Expediente Clínico Electrónico UNEMES (unidades de especialidades médicas) Enfermedades Crónicas 2018
El Centro Nacional de Programas Preventivos y Control de Enfermedades (CENAPRECE), es el órgano desconcentrado de la Secretaría de Salud responsable de conducir e implementar los programas sustantivos para la prevención y control de enfermedades, para reducir la morbilidad y mortalidad en la población mexicana.
Importar Datos:
## [1] "data.frame"## Estado Jurisdiccion Uneme CLUES Cve.Persona Genero
## 1 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5910 Mujer
## 2 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5953 Mujer
## 3 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6045 Mujer
## 4 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6091 Mujer
## 5 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6138 Mujer
## 6 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5706 Hombre
## Cve.Diagn.f3.stico Diagnostico Fecha.Diagnostico
## 1 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 2 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 3 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 4 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 5 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 6 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018Formatear datos
Visualización
ggplot(SonoraS, aes(fill=Jurisdiccion, y=Diagnostico)) +
geom_bar(position="dodge", stat="count") +
xlab ("Número de casos") +
ylab ("Diagnóstico") +
ggtitle(" Enfermedades crónicas en Sonora, 2018 (CENAPRECE)") 
Ahora que se tienen los datos, podemos estimar la cantidad de personas diagnísticadas por jurisdicción (Ciudad):
## [1] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [5] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [9] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [13] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [17] HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO
## [21] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [25] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [29] CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA CABORCA
## [33] CIUDAD OBREGON HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA
## [37] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [41] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [45] SANTA ANA SANTA ANA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [49] CIUDAD OBREGON HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [53] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [57] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [61] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA
## [65] SANTA ANA CABORCA SANTA ANA CABORCA
## [69] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [73] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [77] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [81] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [85] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [89] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [93] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [97] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [101] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [105] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [109] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [113] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [117] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [121] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [125] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [129] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [133] CABORCA CIUDAD OBREGON HERMOSILLO HERMOSILLO
## [137] SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [141] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [145] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [149] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [153] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [157] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [161] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [165] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [169] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [173] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [177] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [181] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [185] HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO SANTA ANA
## [189] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [193] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [197] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [201] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [205] CABORCA CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON
## [209] CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [213] CIUDAD OBREGON SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [217] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [221] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [225] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [229] SANTA ANA SANTA ANA CIUDAD OBREGON HERMOSILLO
## [233] CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA HERMOSILLO
## [237] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [241] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [245] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA
## [249] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [253] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [257] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [261] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [265] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [269] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [273] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [277] CABORCA CABORCA HERMOSILLO SANTA ANA
## [281] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [285] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [289] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [293] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [297] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [301] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [305] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [309] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [313] SANTA ANA CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [317] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [321] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [325] SANTA ANA SANTA ANA CIUDAD OBREGON CABORCA
## [329] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [333] CABORCA CIUDAD OBREGON HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
## [337] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [341] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [345] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [349] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [353] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [357] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [361] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [365] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [369] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [373] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [377] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [381] SANTA ANA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [385] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO
## [389] SANTA ANA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [393] HERMOSILLO CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [397] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
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## [405] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
## [409] CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA CABORCA
## [413] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [417] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [421] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [425] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA HERMOSILLO
## [429] HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [433] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [437] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO
## [441] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [445] CABORCA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [449] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [453] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CIUDAD OBREGON
## [457] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
## [461] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON HERMOSILLO HERMOSILLO
## [465] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [469] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [473] HERMOSILLO CIUDAD OBREGON SANTA ANA SANTA ANA
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## [485] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
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## [505] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA SANTA ANA
## [509] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CIUDAD OBREGON
## [513] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [517] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON HERMOSILLO
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## [525] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [529] SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [533] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [537] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [541] HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
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## [549] SANTA ANA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [553] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [557] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [561] HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [565] HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
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## [577] HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [581] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [585] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO
## [589] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [593] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CABORCA
## [597] CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON HERMOSILLO
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## [605] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [613] SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [669] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [697] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA
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## [733] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
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## [757] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [761] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [765] SANTA ANA HERMOSILLO CABORCA HERMOSILLO
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## [777] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
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## [837] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
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## [849] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [853] CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
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## [861] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [865] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [925] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [929] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [953] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1133] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1137] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1141] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1153] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [1177] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1221] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1225] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1233] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1245] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1273] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1277] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1281] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1285] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1289] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [1293] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1297] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1305] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1309] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1313] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1317] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1321] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1325] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [1329] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1333] CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [1337] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1341] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1345] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1349] HERMOSILLO CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1353] CIUDAD OBREGON SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [1357] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1361] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1365] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [1369] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1377] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1381] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1385] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1389] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [1397] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1401] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1405] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1409] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA SANTA ANA
## [1413] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1417] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1421] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1425] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1429] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1433] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1437] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1441] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1445] HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1449] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1453] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1457] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1461] HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA
## [1465] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1469] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1473] HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON HERMOSILLO
## [1477] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1481] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1485] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1489] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1493] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
## [1497] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [1501] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1505] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1509] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [1513] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1517] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1521] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1525] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1529] CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA
## [1533] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1537] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1541] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1545] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1549] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
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## [1557] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1561] SANTA ANA CABORCA HERMOSILLO SANTA ANA
## [1565] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1569] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1573] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1577] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [1581] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1585] HERMOSILLO CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1589] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1593] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1597] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1617] HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
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## [1733] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1753] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## 91 Levels: \xc1LVARO OBREG\xd3N ACAPULCO ACU\xd1A ... ZACATECASPreguntas ¿Por qué razones si la población de Ciudad Obregón es más grande que la santa ana y de caborca, existen más personas con diagnóstico de enfermedades crónicas ?
La razón por lo que pasa esto es por el estilo de vida de cada ciudad, por ejemplo en Santa Ana y de Caborca por el simple hecho de que estén cerca de la frontera estadunidense implica mucho sobre su estilo de vida ya que las personas de Ciudad Obregón suele comer mas sano que la de dichas ciudades, ya que la mayoría de los ciudadanos de ciudad obregón suelen ser de medios rurales
¿Cuánta gente habita en cada ciudad? Fuente: http://cuentame.inegi.org.mx/monografias/informacion/son/territorio/div_municipal.aspx?tema=me&e=26
En Hermosillo habitan 884 273 personas
En Cajeme habitan 433 050 personas
En Caborca habitan 85 631 personas
En Santa Ana habitan 16 248 personas
Defunciones por COVID-19 en Sonora
Importar Datos
Defunciones en Caborca: 95
Defunciones en Cajeme: 625
Defunciones en Hermosillo: 1010
Defunciones en Santa Ana: 113
En una escala dividiendo la población total por 10,000 queda de esta manera: Así dando una relación más clara
Defunciones en Caborca: 12
Defunciones en Cajeme: 15
Defunciones en Hermosillo: 12
Defunciones en Santa Ana: 70
¿Cuál ciudad tiene proporcionalmente más fallecidos? Proporcionalmente hablando la ciudad de Santa Ana tiene mas fallecidos
¿Las ciudades con más personas diagnosticadas son las que proporcionalmente presentan más fallecidos? Hermosillo cuenta con más fallecidos por covid-19. Sin embargo, Santa Ana proporcionalmente cuenta con mas fallecidos
Fallecidos: https://datos.covid-19.conacyt.mx/#DownZCSV
Conclusion
La ciudad de Hermosillo tiene mas defunciones por CoviD-19, siendo la ciudad con mayor poblacion. Cajeme también tiene una cantidad considerable . La ciudad que más destacaba en enfermedades crónicas es Caborca, sin embargo no tiene la misma relación en defunciones por covid.