United States Covid 19 Cases, Deaths (Adjusted for CDC Excess Deaths), Inferred Infections
George Robertson
November, 09, 2020
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Excess Deaths for United States
The CDC provides a weekly report on deaths for any cause. The average of daily deaths from 2015 to 2019 is calculated. The daily deaths for any cause is netted against the average giving excess deaths for 2020.
The excess deaths are then used to qualify the reported US Covid 19 deaths. The reported deaths are approximately 60% of the CDC excess deaths.
The excess deaths from the CDC weekly report is “disaggregated”, converted from weekly to daily. This daily excess death is then cumulative summed.
Ratio of cumulative excess deaths to reported deaths
The US reported deaths percentage of US cumulative excess deaths is shown.
CDC excess deaths are used to adjust reported deaths
The reported deaths are adjusted upwards by dividing them by the percentage of reported deaths to excess deaths. The objective is to identify the presence and growth of Covid 19, not to account for the severity or co-morbidty.
Daily Adjusted Deaths
Smoothed daily adjusted deaths will be used below.
Daily new cases and smoothed daily new cases
Daily new cases shown with the smoothed daily new cases overlayed.
Smoothed daily new cases will be used below.
Data is from the NY Times github data repository.
Daily new cases compared to daily deaths
Daily deaths are multiplied by ten in the plot below so as to have similar scale so as to see if there is correlation.
Daily deaths scatter plotted against new case
Daily Deaths Lagged, Daily New Cases
Daily Deaths are lagged by 18 days (the mean of Covid 19 time to death after infection). The lagged daily deaths are multiped by 10X so as to be on similar scale. Daily cases and lagged daily deaths are compared by plot line and then by scatter plot.
Data table
## death dai daism adjdeath daiadj daiadjsm xcess cumx per cas
## 2020-03-02 6 4 4 12 8 11 196 196 0.5 104
## 2020-03-03 10 4 4 20 8 10 196 392 0.5 125
## 2020-03-04 12 2 3 24 4 10 197 589 0.5 161
## 2020-03-05 12 0 3 24 0 9 198 787 0.5 228
## 2020-03-06 15 3 3 30 6 8 197 984 0.5 311
## 2020-03-07 19 4 4 38 8 8 196 1180 0.5 428
## 2020-03-08 22 3 4 44 6 9 192 1373 0.5 547
## 2020-03-09 26 4 5 52 8 11 186 1559 0.5 748
## 2020-03-10 31 5 6 62 10 14 176 1735 0.5 1018
## 2020-03-11 37 6 8 74 12 18 163 1898 0.5 1263
## 2020-03-12 43 6 12 86 12 25 146 2044 0.5 1668
## 2020-03-13 50 7 15 101 14 33 127 2170 0.5 2224
## 2020-03-14 60 10 20 121 20 43 104 2274 0.5 2898
## 2020-03-15 68 8 26 137 16 56 86 2360 0.5 3600
## 2020-03-16 91 23 33 183 46 71 74 2434 0.5 4507
## 2020-03-17 117 26 42 235 52 94 67 2501 0.5 5906
## 2020-03-18 162 45 58 326 90 127 66 2567 0.5 8350
## 2020-03-19 212 50 78 426 100 167 70 2637 0.5 12393
## 2020-03-20 277 65 100 557 131 217 80 2717 0.5 18012
## 2020-03-21 360 83 132 723 167 283 95 2813 0.5 24528
## 2020-03-22 458 98 172 920 197 349 118 2931 0.5 33073
## 2020-03-23 579 121 202 1162 243 422 149 3080 0.5 43505
## 2020-03-24 785 206 250 1575 413 530 186 3266 0.5 53938
## 2020-03-25 1054 269 319 2113 538 662 232 3498 0.5 68572
## 2020-03-26 1353 299 393 2710 597 811 285 3782 0.5 85570
## 2020-03-27 1770 417 482 3541 831 983 345 4127 0.5 102900
## 2020-03-28 2300 530 582 4595 1053 1175 413 4540 0.5 123966
## 2020-03-29 2718 418 695 5423 829 1361 505 5045 0.5 142486
## 2020-03-30 3368 650 791 6708 1285 1541 621 5666 0.5 163955
## 2020-03-31 4304 936 892 8550 1842 1768 761 6427 0.5 188461
## 2020-04-01 5325 1021 1043 10547 1998 2020 925 7352 0.5 215391
## 2020-04-02 6541 1216 1181 12911 2364 2255 1113 8464 0.5 245108
## 2020-04-03 7932 1391 1312 15596 2685 2487 1325 9789 0.5 277426
## 2020-04-04 9488 1556 1445 18574 2978 2698 1561 11351 0.5 312525
## 2020-04-05 10856 1368 1573 21172 2597 2868 1790 13141 0.5 338141
## 2020-04-06 12382 1526 1652 24046 2874 3008 2012 15153 0.5 369057
## 2020-04-07 14616 2234 1716 28210 4164 3173 2228 17381 0.5 399394
## 2020-04-08 16701 2085 1846 32050 3840 3370 2436 19817 0.5 431214
## 2020-04-09 18821 2120 1964 35910 3860 3521 2637 22454 0.5 465913
## 2020-04-10 21084 2263 2037 39981 4072 3617 2831 25284 0.5 499386
## 2020-04-11 23168 2084 2094 43687 3706 3664 3018 28302 0.5 531106
## 2020-04-12 24849 1681 2139 46646 2959 3667 3165 31468 0.5 558249
## 2020-04-13 26613 1764 2138 49722 3077 3666 3272 34740 0.5 584018
## 2020-04-14 29318 2705 2108 54384 4662 3672 3339 38079 0.5 610709
## 2020-04-15 32070 2752 2153 59059 4675 3671 3366 41445 0.5 640742
## 2020-04-16 34419 2349 2172 62997 3937 3649 3353 44799 0.5 672355
## 2020-04-17 36708 2289 2165 66787 3790 3603 3301 48099 0.5 703864
## 2020-04-18 38659 1951 2169 69982 3195 3549 3208 51307 0.6 732262
## 2020-04-19 40179 1520 2191 72450 2467 3485 3125 54432 0.6 757596
## 2020-04-20 42016 1837 2151 75406 2956 3414 3053 57485 0.6 784991
## 2020-04-21 44688 2672 2054 79657 4251 3342 2991 60476 0.6 810505
## 2020-04-22 47059 2371 2027 83380 3724 3267 2939 63415 0.6 839336
## 2020-04-23 49228 2169 2039 86748 3368 3205 2897 66312 0.6 873112
## 2020-04-24 51360 2132 2033 90023 3275 3134 2866 69178 0.6 909853
## 2020-04-25 53327 1967 2019 93013 2990 3055 2845 72024 0.6 944261
## 2020-04-26 54580 1253 2024 94903 1890 3001 2812 74836 0.6 970996
## 2020-04-27 56022 1442 1985 97063 2160 2929 2767 77603 0.6 994193
## 2020-04-28 58416 2394 1863 100616 3553 2838 2709 80312 0.6 1018844
## 2020-04-29 60930 2514 1852 104302 3686 2797 2639 82950 0.6 1045399
## 2020-04-30 63140 2210 1894 107505 3203 2773 2556 85507 0.6 1075756
## 2020-05-01 64902 1762 1880 110034 2529 2707 2462 87968 0.6 1109726
## 2020-05-02 66485 1583 1850 112288 2254 2629 2355 90323 0.6 1139200
## 2020-05-03 67816 1331 1866 114170 1882 2569 2259 92582 0.6 1165340
## 2020-05-04 68905 1089 1826 115701 1531 2515 2174 94756 0.6 1187302
## 2020-05-05 71139 2234 1718 118817 3116 2436 2100 96857 0.6 1211011
## 2020-05-06 73847 2708 1652 122549 3732 2338 2038 98894 0.6 1235517
## 2020-05-07 75805 1958 1618 125218 2669 2255 1986 100881 0.6 1263995
## 2020-05-08 77380 1575 1616 127347 2129 2205 1946 102826 0.6 1291643
## 2020-05-09 78834 1454 1616 129299 1952 2163 1917 104743 0.6 1316511
## 2020-05-10 79766 932 1608 130543 1244 2110 1888 106631 0.6 1336828
## 2020-05-11 80748 982 1589 131848 1305 2065 1860 108491 0.6 1354449
## 2020-05-12 82400 1652 1483 134030 2182 2006 1832 110323 0.6 1376749
## 2020-05-13 84168 1768 1391 136346 2317 1896 1806 112129 0.6 1397894
## 2020-05-14 85906 1738 1354 138605 2259 1792 1780 113908 0.6 1424856
## 2020-05-15 87499 1593 1334 140660 2055 1736 1754 115662 0.6 1451093
## 2020-05-16 88724 1225 1321 142230 1570 1694 1729 117392 0.6 1474752
## 2020-05-17 89568 844 1330 143306 1076 1653 1699 119091 0.6 1493766
## 2020-05-18 90414 846 1302 144381 1075 1612 1663 120754 0.6 1515593
## 2020-05-19 91934 1520 1215 146302 1921 1542 1622 122377 0.6 1536570
## 2020-05-20 93411 1477 1136 148156 1854 1478 1575 123952 0.6 1559640
## 2020-05-21 94722 1311 1117 149791 1635 1431 1523 125475 0.6 1585373
## 2020-05-22 96010 1288 1086 151388 1597 1380 1465 126940 0.6 1609172
## 2020-05-23 97060 1050 1084 152683 1295 1343 1402 128343 0.6 1631440
## 2020-05-24 97680 620 1093 153445 762 1315 1343 129685 0.6 1651471
## 2020-05-25 98190 510 1074 154070 625 1295 1288 130973 0.6 1670571
## 2020-05-26 98937 747 1014 154983 913 1265 1236 132209 0.6 1689467
## 2020-05-27 100422 1485 983 156790 1806 1218 1189 133398 0.6 1708211
## 2020-05-28 101622 1200 959 158240 1451 1177 1145 134543 0.6 1730723
## 2020-05-29 102812 1190 937 159671 1431 1151 1106 135648 0.6 1755271
## 2020-05-30 103775 963 942 160824 1153 1124 1070 136718 0.6 1778668
## 2020-05-31 104379 604 950 161544 720 1097 1039 137757 0.6 1799302
## 2020-06-01 105113 734 941 162417 873 1093 1012 138769 0.6 1821199
## 2020-06-02 106195 1082 939 163699 1282 1111 989 139757 0.6 1841990
## 2020-06-03 107184 989 904 164865 1166 1094 970 140728 0.7 1861977
## 2020-06-04 108192 1008 883 166048 1183 1052 956 141684 0.7 1883593
## 2020-06-05 109304 1112 859 167348 1299 1017 946 142630 0.7 1912302
## 2020-06-06 110032 728 845 168195 847 984 941 143571 0.7 1934818
## 2020-06-07 110422 390 852 168648 453 958 934 144505 0.7 1953434
## 2020-06-08 111144 722 820 169484 836 932 925 145429 0.7 1971641
## 2020-06-09 112174 1030 771 170672 1188 904 914 146343 0.7 1990446
## 2020-06-10 113103 929 754 171739 1067 879 901 147244 0.7 2013298
## 2020-06-11 113980 877 735 172743 1004 854 887 148131 0.7 2036500
## 2020-06-12 114759 779 705 173631 888 823 871 149001 0.7 2061993
## 2020-06-13 115451 692 703 174418 787 796 853 149854 0.7 2087327
## 2020-06-14 115768 317 715 174777 360 781 837 150691 0.7 2106457
## 2020-06-15 116216 448 679 175285 507 760 824 151516 0.7 2126574
## 2020-06-16 116985 769 628 176153 868 735 814 152330 0.7 2151459
## 2020-06-17 117746 761 620 177010 857 717 806 153136 0.7 2177114
## 2020-06-18 118473 727 612 177826 816 771 801 153937 0.7 2205173
## 2020-06-19 119171 698 742 178606 781 824 798 154734 0.7 2236009
## 2020-06-20 119717 546 737 179216 609 809 798 155532 0.7 2268034
## 2020-06-21 119974 257 752 179502 286 798 799 156331 0.7 2294413
## 2020-06-22 120334 360 738 179902 400 792 803 157134 0.7 2324879
## 2020-06-23 121167 833 706 180826 924 806 808 157942 0.7 2359939
## 2020-06-24 121934 767 747 181675 848 819 816 158758 0.7 2396928
## 2020-06-25 124400 2466 741 184383 2708 812 825 159584 0.7 2438101
## 2020-06-26 125033 633 743 185073 691 805 837 160420 0.7 2483629
## 2020-06-27 125544 511 746 185629 556 788 850 161271 0.7 2525928
## 2020-06-28 125815 271 747 185924 294 776 866 162137 0.7 2565436
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