Florida Covid 19 Cases, Deaths (Adjusted for CDC Excess Deaths), Inferred Infections
George Robertson
November, 09, 2020
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Excess Deaths for Florida
The CDC provides a weekly report on deaths for any cause. The average of daily deaths from 2015 to 2019 is calculated. The daily deaths for any cause is netted against the average giving excess deaths for 2020.
The excess deaths are then used to qualify the reported FL Covid 19 deaths. The reported deaths are approximately 60% of the CDC excess deaths.
The excess deaths from the CDC weekly report is “disaggregated”, converted from weekly to daily. This daily excess death is then cumulative summed.
Ratio of cumulative excess deaths to reported deaths
The FL reported deaths percentage of FL cumulative excess deaths is shown.
CDC excess deaths are used to adjust reported deaths
The reported deaths are adjusted upwards by dividing them by the percentage of reported deaths to excess deaths. The objective is to identify the presence and growth of Covid 19, not to account for the severity or co-morbidty.
Daily Adjusted Deaths
Smoothed daily adjusted deaths will be used below.
Daily new cases and smoothed daily new cases
Daily new cases shown with the smoothed daily new cases overlayed.
Smoothed daily new cases will be used below.
Data is from the NY Times github data repository.
Daily new cases compared to daily deaths
Daily deaths are multiplied by ten in the plot below so as to have similar scale so as to see if there is correlation.
Daily deaths scatter plotted against new case
Daily Deaths Lagged, Daily New Cases
Daily Deaths are lagged by 18 days (the mean of Covid 19 time to death after infection). The lagged daily deaths are multiped by 10X so as to be on similar scale. Daily cases and lagged daily deaths are compared by plot line and then by scatter plot.
Data table
## death dai daism adjdeath daiadj daiadjsm xcess cumx per cas
## 2020-03-02 0 0 0.2 0 0 0.5 26 26 0.6 2
## 2020-03-03 0 0 0.2 0 0 0.4 26 52 0.6 3
## 2020-03-04 0 0 0.2 0 0 0.4 26 78 0.6 3
## 2020-03-05 0 0 0.2 0 0 0.4 26 105 0.6 4
## 2020-03-06 2 2 0.2 4 4 0.3 26 131 0.6 7
## 2020-03-07 2 0 0.2 4 0 0.4 26 157 0.6 12
## 2020-03-08 2 0 0.2 4 0 0.4 26 183 0.6 13
## 2020-03-09 2 0 0.2 4 0 0.5 25 208 0.6 14
## 2020-03-10 2 0 0.3 4 0 0.6 24 232 0.6 23
## 2020-03-11 2 0 0.5 4 0 0.8 23 254 0.6 26
## 2020-03-12 2 0 0.5 4 0 1.0 21 275 0.6 46
## 2020-03-13 2 0 0.5 4 0 1.0 19 294 0.6 70
## 2020-03-14 3 1 0.5 5 2 1.0 16 310 0.6 70
## 2020-03-15 3 0 0.7 5 0 1.3 14 324 0.6 109
## 2020-03-16 4 1 0.8 7 2 1.7 12 336 0.6 141
## 2020-03-17 6 2 1.2 11 4 2.2 10 346 0.6 210
## 2020-03-18 7 1 1.4 13 2 2.5 8 353 0.6 326
## 2020-03-19 8 1 1.6 14 2 3.1 6 359 0.6 434
## 2020-03-20 9 1 2.1 16 2 4.6 4 363 0.6 564
## 2020-03-21 11 2 3.3 20 4 6.2 2 365 0.6 764
## 2020-03-22 13 2 4.1 23 4 7.1 2 367 0.6 1000
## 2020-03-23 18 5 4.3 32 9 8.1 2 369 0.6 1222
## 2020-03-24 20 2 5.1 36 4 9.5 2 371 0.6 1467
## 2020-03-25 23 3 6.0 42 5 11.1 2 373 0.6 1971
## 2020-03-26 29 6 7.1 52 11 14.7 5 378 0.6 2478
## 2020-03-27 46 17 10.4 83 31 19.0 7 385 0.6 3198
## 2020-03-28 56 10 12.2 101 18 22.0 11 396 0.6 4038
## 2020-03-29 60 4 13.9 108 7 25.0 14 410 0.6 4943
## 2020-03-30 72 12 15.5 130 22 28.4 17 426 0.6 5695
## 2020-03-31 85 13 17.9 153 23 32.7 19 445 0.6 6742
## 2020-04-01 100 15 20.9 180 27 36.8 21 466 0.6 7769
## 2020-04-02 144 44 22.5 259 79 41.0 22 489 0.6 9000
## 2020-04-03 169 25 24.9 304 45 45.6 24 512 0.6 10260
## 2020-04-04 194 25 27.8 349 45 48.6 24 536 0.6 11537
## 2020-04-05 220 26 29.6 396 47 50.4 26 562 0.6 12342
## 2020-04-06 253 33 29.8 455 59 52.7 27 589 0.6 13621
## 2020-04-07 295 42 31.8 530 75 58.1 29 618 0.6 14739
## 2020-04-08 322 27 36.2 578 48 63.6 32 650 0.6 15690
## 2020-04-09 370 48 36.1 664 86 65.9 34 684 0.6 16819
## 2020-04-10 418 48 38.3 749 85 68.5 38 722 0.6 17960
## 2020-04-11 445 27 40.8 797 48 70.3 41 763 0.6 18978
## 2020-04-12 460 15 40.5 824 27 70.1 44 807 0.6 19855
## 2020-04-13 498 38 40.0 891 67 71.0 45 852 0.6 21011
## 2020-04-14 570 72 40.5 1019 127 72.0 45 897 0.6 21620
## 2020-04-15 613 43 41.8 1095 76 74.1 43 940 0.6 22526
## 2020-04-16 667 54 42.8 1190 95 76.8 41 981 0.6 23332
## 2020-04-17 725 58 43.7 1292 102 78.1 37 1018 0.6 24745
## 2020-04-18 747 22 46.2 1331 39 77.6 32 1050 0.6 25484
## 2020-04-19 773 26 45.7 1376 46 76.7 29 1079 0.6 26306
## 2020-04-20 822 49 44.2 1462 86 75.3 28 1107 0.6 27050
## 2020-04-21 866 44 39.8 1539 77 74.4 29 1135 0.6 27861
## 2020-04-22 926 60 42.8 1644 105 75.1 31 1167 0.6 28301
## 2020-04-23 986 60 42.2 1749 105 75.0 36 1203 0.6 29640
## 2020-04-24 1045 59 41.7 1851 103 73.9 43 1246 0.6 30525
## 2020-04-25 1054 9 43.5 1867 16 74.8 52 1298 0.6 30831
## 2020-04-26 1073 19 45.4 1900 33 75.7 58 1356 0.6 31520
## 2020-04-27 1087 14 42.8 1924 24 73.2 62 1417 0.6 32130
## 2020-04-28 1170 83 40.9 2068 144 73.0 63 1481 0.6 32838
## 2020-04-29 1216 46 41.8 2148 80 75.1 62 1543 0.6 33185
## 2020-04-30 1267 51 42.5 2236 88 75.5 59 1601 0.6 33683
## 2020-05-01 1313 46 42.6 2315 79 76.0 53 1654 0.6 34720
## 2020-05-02 1363 50 47.2 2401 86 78.7 44 1699 0.6 35455
## 2020-05-03 1378 15 49.3 2427 26 80.1 38 1737 0.6 36070
## 2020-05-04 1398 20 48.7 2461 34 79.3 34 1771 0.6 36889
## 2020-05-05 1470 72 43.4 2584 123 76.8 32 1803 0.6 37431
## 2020-05-06 1538 68 43.2 2701 116 74.4 32 1835 0.6 37994
## 2020-05-07 1599 61 43.0 2805 104 74.2 35 1870 0.6 38820
## 2020-05-08 1668 69 43.2 2922 117 73.6 39 1909 0.6 39191
## 2020-05-09 1714 46 42.5 3000 78 73.1 46 1955 0.6 39993
## 2020-05-10 1720 6 45.0 3010 10 72.5 50 2005 0.6 40588
## 2020-05-11 1734 14 44.2 3034 24 72.3 53 2058 0.6 40974
## 2020-05-12 1778 44 40.5 3109 75 71.4 55 2113 0.6 41915
## 2020-05-13 1826 48 39.5 3190 81 68.8 54 2167 0.6 42394
## 2020-05-14 1874 48 38.2 3271 81 66.4 52 2220 0.6 43202
## 2020-05-15 1916 42 36.5 3342 71 64.1 48 2268 0.6 44130
## 2020-05-16 1963 47 36.5 3421 79 62.4 43 2311 0.6 44803
## 2020-05-17 1972 9 39.4 3436 15 62.1 39 2350 0.6 45580
## 2020-05-18 1996 24 38.6 3476 40 62.0 36 2386 0.6 46434
## 2020-05-19 2051 55 36.4 3569 92 59.8 36 2422 0.6 46936
## 2020-05-20 2095 44 33.2 3642 74 58.2 37 2459 0.6 47463
## 2020-05-21 2143 48 34.2 3723 80 58.7 39 2498 0.6 48667
## 2020-05-22 2189 46 34.4 3799 77 58.8 43 2541 0.6 49443
## 2020-05-23 2232 43 34.5 3871 72 58.3 49 2590 0.6 50119
## 2020-05-24 2236 4 36.5 3878 7 57.2 53 2643 0.6 50859
## 2020-05-25 2251 15 34.9 3903 25 56.0 56 2699 0.6 51738
## 2020-05-26 2258 7 31.4 3914 12 55.9 56 2755 0.6 52247
## 2020-05-27 2318 60 33.4 4014 100 56.2 56 2811 0.6 52626
## 2020-05-28 2363 45 32.5 4089 75 55.3 53 2864 0.6 53277
## 2020-05-29 2412 49 32.1 4170 81 55.2 49 2913 0.6 54489
## 2020-05-30 2446 34 32.8 4226 56 54.6 43 2956 0.6 55416
## 2020-05-31 2450 4 34.7 4233 7 54.2 39 2996 0.6 56155
## 2020-06-01 2459 9 34.5 4248 15 54.4 36 3032 0.6 56822
## 2020-06-02 2529 70 34.8 4363 116 56.9 35 3066 0.6 57439
## 2020-06-03 2565 36 34.3 4423 59 58.2 35 3101 0.6 58756
## 2020-06-04 2606 41 33.6 4490 67 56.8 36 3137 0.6 60175
## 2020-06-05 2659 53 33.5 4577 87 55.6 39 3176 0.6 61480
## 2020-06-06 2687 28 33.1 4623 46 55.2 43 3219 0.6 62750
## 2020-06-07 2699 12 36.5 4643 20 56.1 46 3266 0.6 63930
## 2020-06-08 2711 12 36.2 4662 20 56.1 49 3314 0.6 64896
## 2020-06-09 2764 53 31.4 4749 87 55.0 50 3365 0.6 65992
## 2020-06-10 2800 36 32.8 4808 59 53.4 51 3415 0.6 67363
## 2020-06-11 2847 47 31.6 4885 77 52.8 50 3466 0.6 69061
## 2020-06-12 2876 29 30.8 4932 47 52.3 49 3515 0.6 70963
## 2020-06-13 2924 48 32.0 5010 78 52.3 47 3562 0.6 73544
## 2020-06-14 2930 6 34.2 5020 10 53.3 46 3608 0.6 75560
## 2020-06-15 2937 7 34.5 5031 11 53.5 46 3654 0.6 77318
## 2020-06-16 2992 55 31.4 5120 89 54.1 47 3701 0.6 80101
## 2020-06-17 3017 25 33.6 5161 41 55.2 49 3749 0.6 82711
## 2020-06-18 3060 43 33.3 5231 70 55.4 51 3801 0.6 85918
## 2020-06-19 3103 43 34.6 5300 70 55.9 55 3856 0.6 89740
## 2020-06-20 3143 40 33.9 5365 65 55.0 60 3916 0.6 93789
## 2020-06-21 3160 17 35.3 5392 27 54.9 65 3981 0.6 97283
## 2020-06-22 3172 12 37.0 5411 19 57.4 69 4050 0.6 100209
## 2020-06-23 3237 65 34.9 5516 105 58.7 72 4122 0.6 103495
## 2020-06-24 3280 43 37.5 5585 69 59.9 75 4197 0.6 109006
## 2020-06-25 3326 46 37.6 5659 74 62.3 78 4275 0.6 114010
## 2020-06-26 3365 39 39.5 5721 62 65.0 80 4354 0.6 122952
## 2020-06-27 3389 24 41.5 5760 38 65.0 81 4435 0.6 132537
## 2020-06-28 3418 29 41.6 5806 46 64.3 83 4518 0.6 141067
## 2020-06-29 3446 28 42.9 5851 45 67.0 85 4604 0.6 146333
## 2020-06-30 3504 58 41.5 5943 93 68.7 88 4692 0.6 152426
## 2020-07-01 3549 45 43.1 6015 72 68.8 92 4784 0.6 158989
## 2020-07-02 3616 67 43.2 6122 106 73.1 96 4879 0.6 169098
## 2020-07-03 3683 67 49.5 6228 106 80.1 100 4979 0.6 178586
## 2020-07-04 3701 18 54.8 6256 28 87.0 105 5084 0.6 190044
## 2020-07-05 3730 29 59.8 6302 46 91.8 110 5194 0.6 200103
## 2020-07-06 3777 47 61.2 6376 74 93.0 116 5309 0.6 206439
## 2020-07-07 3840 63 59.4 6476 99 97.3 122 5431 0.6 213786
## 2020-07-08 3888 48 66.1 6551 76 104.9 128 5559 0.6 223775
## 2020-07-09 4008 120 69.5 6740 188 113.3 135 5693 0.6 232710
## 2020-07-10 4101 93 76.4 6885 145 121.2 142 5835 0.6 244143
## 2020-07-11 4196 95 84.8 7033 148 128.3 149 5984 0.6 254503
## 2020-07-12 4241 45 89.5 7103 70 135.2 157 6142 0.6 269803
## 2020-07-13 4276 35 92.6 7157 54 140.5 166 6307 0.6 282427
## 2020-07-14 4408 132 94.7 7362 204 146.4 175 6482 0.6 291621
## 2020-07-15 4520 112 101.3 7534 173 154.8 184 6665 0.6 301802
## 2020-07-16 4676 156 102.8 7774 239 162.0 194 6859 0.6 315767
## 2020-07-17 4804 128 108.9 7969 196 166.5 204 7063 0.6 327233
## 2020-07-18 4894 90 112.0 8106 137 169.7 215 7278 0.6 337561
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## 2020-03-15 32 63 53242 8198 0.0024 21299325 2020-03-15
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