New Jersey Covid 19 Cases, Deaths (Adjusted for CDC Excess Deaths), Inferred Infections
George Robertson
November, 09, 2020
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Excess Deaths for New Jersey
The CDC provides a weekly report on deaths for any cause. The average of daily deaths from 2015 to 2019 is calculated. The daily deaths for any cause is netted against the average giving excess deaths for 2020.
The excess deaths are then used to qualify the reported NJ Covid 19 deaths. The reported deaths are approximately 60% of the CDC excess deaths.
The excess deaths from the CDC weekly report is “disaggregated”, converted from weekly to daily. This daily excess death is then cumulative summed.
Ratio of cumulative excess deaths to reported deaths
The NJ reported deaths percentage of NJ cumulative excess deaths is shown.
CDC excess deaths are used to adjust reported deaths
The reported deaths are adjusted upwards by dividing them by the percentage of reported deaths to excess deaths. The objective is to identify the presence and growth of Covid 19, not to account for the severity or co-morbidty.
Daily Adjusted Deaths
Smoothed daily adjusted deaths will be used below.
Daily new cases and smoothed daily new cases
Daily new cases shown with the smoothed daily new cases overlayed.
Smoothed daily new cases will be used below.
Data is from the NY Times github data repository.
Daily new cases compared to daily deaths
Daily deaths are multiplied by ten in the plot below so as to have similar scale so as to see if there is correlation.
Daily deaths scatter plotted against new case
Daily Deaths Lagged, Daily New Cases
Daily Deaths are lagged by 18 days (the mean of Covid 19 time to death after infection). The lagged daily deaths are multiped by 10X so as to be on similar scale. Daily cases and lagged daily deaths are compared by plot line and then by scatter plot.
Data table
## death dai daism adjdeath daiadj daiadjsm xcess cumx per cas
## 2020-03-04 0 0 0.23 0 0.0 0.4 2 2 0.6 1
## 2020-03-05 0 0 0.15 0 0.0 0.4 2 2 0.6 2
## 2020-03-06 0 0 0.09 0 0.0 0.3 2 2 0.6 4
## 2020-03-07 0 0 0.07 0 0.0 0.2 2 2 0.6 4
## 2020-03-08 0 0 0.08 0 0.0 0.2 2 2 0.6 6
## 2020-03-09 0 0 0.13 0 0.0 0.2 2 2 0.6 11
## 2020-03-10 1 1 0.23 2 1.5 0.3 2 2 0.6 15
## 2020-03-11 1 0 0.23 2 0.0 0.4 2 2 0.6 23
## 2020-03-12 1 0 0.38 2 0.0 0.8 2 2 0.6 29
## 2020-03-13 1 0 0.69 2 0.0 1.1 2 2 0.6 50
## 2020-03-14 2 1 0.85 3 1.5 1.5 2 2 0.6 75
## 2020-03-15 2 0 1.23 3 0.0 2.0 2 2 0.6 98
## 2020-03-16 3 1 1.54 5 1.5 2.6 2 2 0.6 176
## 2020-03-17 3 0 2.00 5 0.0 3.9 2 2 0.6 268
## 2020-03-18 5 2 3.31 8 3.1 5.7 2 2 0.6 427
## 2020-03-19 9 4 4.69 14 6.2 7.8 2 2 0.6 735
## 2020-03-20 11 2 6.23 17 3.1 10.4 2 2 0.6 896
## 2020-03-21 16 5 8.15 25 7.7 13.5 2 2 0.6 1336
## 2020-03-22 20 4 10.62 31 6.2 16.4 5 8 0.6 1914
## 2020-03-23 27 7 12.15 42 10.8 19.5 8 16 0.6 2844
## 2020-03-24 44 17 15.08 68 26.3 25.3 12 28 0.6 3675
## 2020-03-25 62 18 20.15 96 27.8 33.7 18 46 0.6 4402
## 2020-03-26 82 20 26.62 127 30.9 48.2 24 70 0.6 6876
## 2020-03-27 108 26 40.62 167 40.1 63.6 31 101 0.6 8825
## 2020-03-28 140 32 48.54 216 49.3 79.8 40 141 0.6 11124
## 2020-03-29 161 21 63.62 248 32.3 93.7 52 192 0.6 13386
## 2020-03-30 199 38 68.46 307 58.4 101.5 67 259 0.6 16636
## 2020-03-31 267 68 73.92 411 104.2 116.8 85 344 0.6 18696
## 2020-04-01 355 88 90.00 545 134.4 141.1 107 451 0.7 22255
## 2020-04-02 539 184 109.38 825 279.5 163.3 132 582 0.7 25590
## 2020-04-03 647 108 122.46 988 163.0 182.8 160 742 0.7 29895
## 2020-04-04 847 200 137.85 1288 300.0 204.2 191 933 0.7 34124
## 2020-04-05 917 70 155.54 1392 104.4 222.5 223 1156 0.7 37505
## 2020-04-06 1005 88 165.46 1523 130.8 232.3 255 1411 0.7 41090
## 2020-04-07 1232 227 167.38 1858 335.2 249.1 287 1699 0.7 44416
## 2020-04-08 1504 272 188.46 2256 397.5 275.7 320 2019 0.7 47437
## 2020-04-09 1700 196 201.31 2540 283.7 295.5 353 2371 0.7 51027
## 2020-04-10 1932 232 220.85 2872 332.9 312.4 386 2757 0.7 54588
## 2020-04-11 2183 251 230.23 3229 356.6 322.0 419 3176 0.7 58151
## 2020-04-12 2350 167 242.54 3464 235.2 324.5 447 3623 0.7 61850
## 2020-04-13 2443 93 245.92 3595 130.3 330.4 469 4092 0.7 64584
## 2020-04-14 2805 362 241.92 4097 502.6 339.2 486 4578 0.7 68824
## 2020-04-15 3156 351 249.92 4578 480.4 344.3 498 5076 0.7 71030
## 2020-04-16 3518 362 258.69 5066 488.4 347.7 504 5580 0.7 75317
## 2020-04-17 3840 322 264.31 5495 428.6 350.4 504 6084 0.7 78467
## 2020-04-18 4070 230 264.15 5797 302.8 347.6 499 6583 0.7 81420
## 2020-04-19 4202 132 270.23 5970 172.6 340.5 493 7076 0.7 85301
## 2020-04-20 4377 175 268.85 6197 227.4 335.3 484 7560 0.7 88806
## 2020-04-21 4753 376 249.15 6681 483.4 334.5 474 8034 0.7 92387
## 2020-04-22 5063 310 252.77 7074 393.3 330.4 462 8496 0.7 95865
## 2020-04-23 5368 305 250.15 7457 382.4 329.0 449 8945 0.7 99989
## 2020-04-24 5617 249 260.62 7766 308.9 328.2 433 9378 0.7 102196
## 2020-04-25 5863 246 266.77 8068 302.3 323.2 416 9794 0.7 105523
## 2020-04-26 5938 75 272.31 8159 91.6 319.8 399 10194 0.7 109038
## 2020-04-27 6044 106 268.77 8289 129.0 312.3 382 10576 0.7 111188
## 2020-04-28 6442 398 242.85 8768 479.9 302.0 366 10942 0.7 113856
## 2020-04-29 6770 328 244.69 9159 390.2 296.2 349 11291 0.7 116264
## 2020-04-30 7228 458 244.69 9696 536.9 290.6 333 11624 0.7 118652
## 2020-05-01 7538 310 244.92 10054 358.3 281.7 316 11940 0.7 121190
## 2020-05-02 7742 204 237.62 10287 233.6 272.2 300 12240 0.8 123717
## 2020-05-03 7871 129 244.46 10434 146.8 269.8 284 12525 0.8 126744
## 2020-05-04 7910 39 247.00 10478 44.2 269.5 269 12794 0.8 128269
## 2020-05-05 8244 334 220.62 10855 376.4 257.4 255 13048 0.8 130593
## 2020-05-06 8549 305 210.62 11195 339.7 241.3 240 13289 0.8 131890
## 2020-05-07 8801 252 190.31 11472 277.9 224.8 227 13515 0.8 133635
## 2020-05-08 8952 151 185.23 11638 165.3 209.3 214 13729 0.8 135454
## 2020-05-09 9116 164 184.31 11816 178.5 199.5 201 13930 0.8 137085
## 2020-05-10 9255 139 182.92 11967 150.5 194.0 190 14120 0.8 138532
## 2020-05-11 9310 55 188.15 12026 59.3 194.1 180 14300 0.8 139945
## 2020-05-12 9508 198 168.54 12239 212.7 187.6 171 14471 0.8 140743
## 2020-05-13 9702 194 156.69 12446 206.9 173.5 164 14634 0.8 141560
## 2020-05-14 9946 244 149.69 12704 258.3 160.9 158 14792 0.8 142704
## 2020-05-15 10138 192 145.46 12906 201.7 153.7 153 14945 0.8 143905
## 2020-05-16 10249 111 143.77 13022 116.0 150.1 150 15095 0.8 145089
## 2020-05-17 10356 107 140.46 13133 111.4 143.7 145 15240 0.8 146334
## 2020-05-18 10435 79 140.23 13215 82.0 138.5 140 15380 0.8 148039
## 2020-05-19 10586 151 125.85 13371 156.0 130.9 134 15514 0.8 149013
## 2020-05-20 10747 161 114.54 13537 165.5 122.9 128 15642 0.8 150399
## 2020-05-21 10843 96 107.15 13635 98.2 113.8 120 15762 0.8 151472
## 2020-05-22 10985 142 97.15 13779 144.7 104.2 112 15874 0.8 152719
## 2020-05-23 11081 96 98.62 13877 97.4 101.2 103 15977 0.8 153104
## 2020-05-24 11133 52 98.31 13930 52.6 99.0 95 16071 0.8 154154
## 2020-05-25 11144 11 97.15 13941 11.1 95.2 87 16159 0.8 155092
## 2020-05-26 11191 47 87.31 13988 47.5 89.2 81 16240 0.8 155764
## 2020-05-27 11339 148 78.69 14137 149.0 83.4 76 16316 0.8 156628
## 2020-05-28 11401 62 79.77 14199 62.2 81.0 72 16388 0.8 157815
## 2020-05-29 11531 130 75.77 14329 130.0 78.3 68 16456 0.8 158844
## 2020-05-30 11634 103 74.46 14432 102.6 74.4 66 16522 0.8 159608
## 2020-05-31 11698 64 74.85 14495 63.6 73.5 63 16585 0.8 160445
## 2020-06-01 11721 23 79.38 14518 22.8 74.9 60 16646 0.8 160918
## 2020-06-02 11770 49 78.69 14567 48.5 77.3 57 16703 0.8 161545
## 2020-06-03 11880 110 74.15 14675 108.6 75.9 54 16757 0.8 162068
## 2020-06-04 11970 90 75.08 14764 88.6 73.2 50 16807 0.8 162530
## 2020-06-05 12049 79 70.15 14842 77.5 70.2 46 16853 0.8 163336
## 2020-06-06 12106 57 65.77 14897 55.8 66.9 42 16895 0.8 163893
## 2020-06-07 12176 70 68.54 14966 68.4 65.7 38 16933 0.8 164164
## 2020-06-08 12214 38 69.54 15003 37.1 65.6 35 16968 0.8 164497
## 2020-06-09 12303 89 69.69 15089 86.6 66.5 32 17001 0.8 164796
## 2020-06-10 12377 74 65.15 15161 71.8 64.1 30 17030 0.8 165346
## 2020-06-11 12443 66 61.46 15225 63.9 59.6 28 17058 0.8 165816
## 2020-06-12 12489 46 57.77 15270 44.5 55.9 27 17085 0.8 166164
## 2020-06-13 12589 100 56.08 15366 96.4 53.1 26 17111 0.8 166605
## 2020-06-14 12625 36 52.38 15401 34.6 49.8 24 17135 0.8 166881
## 2020-06-15 12676 51 50.46 15450 49.0 47.3 23 17158 0.8 167103
## 2020-06-16 12727 51 45.54 15499 48.9 45.6 21 17179 0.8 167426
## 2020-06-17 12769 42 44.00 15539 40.2 43.4 19 17199 0.8 167703
## 2020-06-18 12800 31 42.46 15568 29.6 101.8 17 17216 0.8 168107
## 2020-06-19 12835 35 183.31 15602 33.4 161.0 15 17231 0.8 168496
## 2020-06-20 12857 22 178.85 15623 21.0 158.4 12 17243 0.8 168834
## 2020-06-21 12870 13 178.69 15635 12.4 155.6 10 17253 0.8 169142
## 2020-06-22 12895 25 176.85 15659 23.8 154.0 9 17262 0.8 169415
## 2020-06-23 12949 54 174.23 15710 51.4 152.4 8 17271 0.8 169734
## 2020-06-24 12995 46 174.31 15754 43.7 152.0 8 17279 0.8 169892
## 2020-06-25 14872 1877 175.23 17482 1728.0 151.8 9 17288 0.9 172050
## 2020-06-26 14914 42 174.77 17520 37.5 152.2 10 17298 0.9 172438
## 2020-06-27 14948 34 177.46 17550 30.3 152.9 12 17310 0.9 172727
## 2020-06-28 14975 27 178.38 17574 24.0 153.2 14 17324 0.9 173036
## 2020-06-29 14992 17 178.15 17589 15.1 153.1 15 17339 0.9 173126
## 2020-06-30 15035 43 175.38 17627 38.2 152.7 15 17354 0.9 173521
## 2020-07-01 15078 43 175.85 17665 38.2 155.4 15 17370 0.9 173782
## 2020-07-02 15107 29 42.38 17691 25.7 97.3 15 17385 0.9 174212
## 2020-07-03 15164 57 41.08 17742 50.5 36.0 14 17399 0.9 174598
## 2020-07-04 15189 25 40.85 17764 22.1 36.0 13 17412 0.9 174889
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