Caso de estudio: Relación entre enfermedades crónicas y covid-19

Visualizando datos

Librerías y carpeta de trabajo

setwd('~/estadisticaap')
library(pacman)
p_load("DT","tidyverse","readr","prettydoc")

Leer Datos.csv para Sonora y presentar tabla

datosenfcron <- read.csv("Diagnosticos18.csv")

datossonora <- (datosenfcron [datosenfcron$Estado == "Sonora", ])

datatable(datossonora)
## Warning in instance$preRenderHook(instance): It seems your data is too big
## for client-side DataTables. You may consider server-side processing: https://
## rstudio.github.io/DT/server.html

Gráfico por diagnósticos de enfermedades cronicas en Obregón , Hermosillo, Santa Ana y caborca

`

Diagnostico <- datossonora$Diagnóstico

Jurisdiccion <- datossonora$Jurisdicción

datosgrafico <- data.frame(Diagnostico,Jurisdiccion)

ggplot(datosgrafico, aes(fill=Jurisdiccion, y=Diagnostico)) + 
    geom_bar(position="dodge", stat="count") +
    xlab ("Número de casos") +
    ylab ("Diagnóstico") +
  ggtitle(" Enfermedades crónicas en Sonora, 2018 (CENAPRECE)")

¿Son lugares que tienen más personas reportadas con enfermedades crónicas los lugares que también tienen más personas fallecidas por covid-19?

Sí , porque aquellas personas que tienen alguna enferemdad cronica son mucho más susceptibles a desarrollar complicaciones si contraen COVID-19, lo que aumentaría sus posibilidades de muerte.

¿Por qué razones si la población de Ciudad Obregón es más grande que la santa ana y de caborca, existen más personas con diagnóstico de enfermedades crónicas ?

Aunque la población de Ciudad Obregón es más grande , que la de Santa Ana y de Caborca , el hecho de que en Ciudad Obregón se presenten menos diagnosticos por enferemdades cronicas puede deberse a diversos factores , que van desde la insfrestructura médica de la ciudad , los hábitos en cuanto alimentación y ejercicio que tengan las personas , y la educación de de los habitantes.

Tabla

Contando casos de Caborca

#Caborca 
datossonoracaborca <- (datosenfcron [datosenfcron$Jurisdicción == "CABORCA", ])

datatable(datossonoracaborca)
## Warning in instance$preRenderHook(instance): It seems your data is too big
## for client-side DataTables. You may consider server-side processing: https://
## rstudio.github.io/DT/server.html
count(datossonoracaborca)
##     n
## 1 647

Contando para obregón

#Obregon

datossonoraobregon <- (datosenfcron [datosenfcron$Jurisdicción == "CIUDAD OBREGÓN", ])

datatable(datossonoraobregon)
## Warning in instance$preRenderHook(instance): It seems your data is too big
## for client-side DataTables. You may consider server-side processing: https://
## rstudio.github.io/DT/server.html
count(datossonoraobregon)
##     n
## 1 158

Datos para Hermosillo

datossonorahmllo <- (datosenfcron [datosenfcron$Jurisdicción == "HERMOSILLO", ])

datatable(datossonorahmllo)
## Warning in instance$preRenderHook(instance): It seems your data is too big
## for client-side DataTables. You may consider server-side processing: https://
## rstudio.github.io/DT/server.html
count(datossonorahmllo)
##     n
## 1 738

Datos para Santa Ana

datossonorasa <- (datosenfcron [datosenfcron$Jurisdicción == "SANTA ANA", ])

datatable(datossonorasa)
## Warning in instance$preRenderHook(instance): It seems your data is too big
## for client-side DataTables. You may consider server-side processing: https://
## rstudio.github.io/DT/server.html
count(datossonorasa)
##     n
## 1 593

Tabla general

datossaludsonora <- read.csv("datosdalud.csv",encoding = "UTF-8")

datatable(datossaludsonora)

¿Son los lugares que proporcionalmente tienen más defunciones, los lugares que también tienen más diagnósticos?

No, por que como se observa en el caso de Obregón se tiene que es el lugar donde menos diagnosticos existen en proporcion a su población , pero en cuanto a la proporción de defunciones es mucho mayor que la de los demás municipios.

¿por qué si en cajeme hay menos enfermedades crónicas, proporcionalmente a su población hay más defunciones?

Puede deberse a que muchas de las personas que tienen algún tipo de enefermedad cronica , no hayan sido diagnosticada con el padecimiento , por lo que al no tomar algun tratamiento su mortalidad aumenta de gran manera , por el hecho de que la mayoría de las personas que tienen enfermedades cronicas mueren debido a algún tipo de complicación.

¿Cuánta gente habita en cada ciudad?

Fuente: http://cuentame.inegi.org.mx/monografias/informacion/son/territorio/div_municipal.aspx?tema=me&e=26

017 Caborca 85631 058 Santa Ana 16248 018 Cajeme 433050 030 Hermosillo 884 273

Comparación

Si hacemos una relación de número de personas fallecidas por cada 10000 habitantes, para poder comparar en proporción , con esta forma de comparar, ¿Cuál ciudad tiene proporcionalmente más fallecidos? ¿Las ciudades con más personas diagnosticadas son las que proporcionalmente presentan más fallecidos?

Cajeme , tiene una mayor proporcionalidad de fallecidos por cada diez mil habitantes ,ya que tiene un valor de 14.4 minetras que los demás municipios tienen un valor por debajo de este valor. En el caso de de las ciudades que más diagnosticos no necesariamente son las que tienen más fallecids, ya que como se observa en Cajeme fué el que menos diagnosticos tenía, pero fué que el que proporcionalmente tenía más numero de muertos por cada 10000 habitantes.

Asignación

*Leer datos

library(DT)
datossaludcausa <- read.csv("datosaludparte2.csv", encoding="UTF-8")

datatable(datossaludcausa)

¿Qué características tendría un municipio que tuviera menos defunciones?

R= El número de personas que habitan la localidad, la eduación que reciben las personas a nivel medio y superior,facilidad al acceso a los servicios de salud.

¿Qué variables se correlacionan con el número de defunciones?

No se observa en el analisis algún tipo de relación significaivo entre el hecho de que la proporción de fallecidos este relacionado con la proporcón de personas que sabeen leer y de escribir.

¿Los municipios que tienen más gente escolarizada son los que menos tienen defunciones?

No necesariamente , ya que en el caso de Cajeme se puede observar que su % de personas escolarizadas con respecto a las de Santa Ana es ligeramente mayor (aprox 1%); de igual forma para la cantidad de defunciones por cada 10000 habitantes.

¿Qué otras variables podemos añadir al análisis?

  • Nivel socioeconómico de las personas

  • Número de personas con acceso a los servicios de salud

  • Lugar Residencia

  • Genetica