Florida Covid 19 Cases, Deaths (Adjusted for CDC Excess Deaths), Inferred Infections
George Robertson
November, 07, 2020
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Excess Deaths for Florida
The CDC provides a weekly report on deaths for any cause. The average of daily deaths from 2015 to 2019 is calculated. The daily deaths for any cause is netted against the average giving excess deaths for 2020.
The excess deaths are then used to qualify the reported FL Covid 19 deaths. The reported deaths are approximately 60% of the CDC excess deaths.
The excess deaths from the CDC weekly report is “disaggregated”, converted from weekly to daily. This daily excess death is then cumulative summed.
Ratio of cumulative excess deaths to reported deaths
The FL reported deaths percentage of FL cumulative excess deaths is shown.
CDC excess deaths are used to adjust reported deaths
The reported deaths are adjusted upwards by dividing them by the percentage of reported deaths to excess deaths. The objective is to identify the presence and growth of Covid 19, not to account for the severity or co-morbidty.
Daily Adjusted Deaths
Smoothed daily adjusted deaths will be used below.
Daily new cases and smoothed daily new cases
Daily new cases shown with the smoothed daily new cases overlayed.
Smoothed daily new cases will be used below.
Data is from the NY Times github data repository.
Daily new cases compared to daily deaths
Daily deaths are multiplied by ten in the plot below so as to have similar scale so as to see if there is correlation.
Daily deaths scatter plotted against new case
Daily Deaths Lagged, Daily New Cases
Daily Deaths are lagged by 18 days (the mean of Covid 19 time to death after infection). The lagged daily deaths are multiped by 10X so as to be on similar scale. Daily cases and lagged daily deaths are compared by plot line and then by scatter plot.
Data table
## death dai daism adjdeath daiadj daiadjsm xcess cumx per cas
## 2020-03-02 0 0 0.2 0 0 0.4 NA NA 0.7 2
## 2020-03-03 0 0 0.2 0 0 0.3 NA NA 0.7 3
## 2020-03-04 0 0 0.2 0 0 0.3 NA NA 0.7 3
## 2020-03-05 0 0 0.2 0 0 0.3 NA NA 0.7 4
## 2020-03-06 2 2 0.2 3 3 0.3 NA NA 0.7 7
## 2020-03-07 2 0 0.2 3 0 0.3 26 26 0.7 12
## 2020-03-08 2 0 0.2 3 0 0.3 26 52 0.7 13
## 2020-03-09 2 0 0.2 3 0 0.4 25 77 0.7 14
## 2020-03-10 2 0 0.3 3 0 0.5 24 101 0.7 23
## 2020-03-11 2 0 0.5 3 0 0.7 23 123 0.7 26
## 2020-03-12 2 0 0.5 3 0 0.8 21 144 0.7 46
## 2020-03-13 2 0 0.5 3 0 0.8 19 163 0.7 70
## 2020-03-14 3 1 0.5 5 2 0.9 16 179 0.7 70
## 2020-03-15 3 0 0.7 5 0 1.1 14 193 0.7 109
## 2020-03-16 4 1 0.8 6 2 1.5 12 205 0.7 141
## 2020-03-17 6 2 1.2 9 3 1.8 10 215 0.7 210
## 2020-03-18 7 1 1.4 11 2 2.1 8 222 0.7 326
## 2020-03-19 8 1 1.6 12 2 2.6 6 228 0.7 434
## 2020-03-20 9 1 2.1 14 2 3.8 4 232 0.7 564
## 2020-03-21 11 2 3.3 17 3 5.2 2 234 0.7 764
## 2020-03-22 13 2 4.1 20 3 5.9 1 235 0.7 1000
## 2020-03-23 18 5 4.3 27 8 6.7 1 237 0.7 1222
## 2020-03-24 20 2 5.1 30 3 7.9 2 238 0.7 1467
## 2020-03-25 23 3 6.0 35 5 9.3 3 241 0.7 1971
## 2020-03-26 29 6 7.1 44 9 12.3 5 246 0.7 2478
## 2020-03-27 46 17 10.4 69 26 15.9 7 253 0.7 3198
## 2020-03-28 56 10 12.2 84 15 18.4 11 264 0.7 4038
## 2020-03-29 60 4 13.9 90 6 21.0 14 278 0.7 4943
## 2020-03-30 72 12 15.5 108 18 23.8 17 294 0.7 5695
## 2020-03-31 85 13 17.9 128 20 27.4 19 313 0.7 6742
## 2020-04-01 100 15 20.9 151 23 30.9 21 334 0.7 7769
## 2020-04-02 144 44 22.5 217 66 34.4 22 356 0.7 9000
## 2020-04-03 169 25 24.9 255 38 38.3 24 380 0.7 10260
## 2020-04-04 194 25 27.8 292 38 40.9 24 404 0.7 11537
## 2020-04-05 220 26 29.6 331 39 42.4 26 430 0.7 12342
## 2020-04-06 253 33 29.8 381 50 44.4 27 457 0.7 13621
## 2020-04-07 295 42 31.8 444 63 48.9 29 486 0.7 14739
## 2020-04-08 322 27 36.2 485 41 53.6 32 518 0.7 15690
## 2020-04-09 370 48 36.1 557 72 55.6 34 552 0.7 16819
## 2020-04-10 418 48 38.3 629 72 57.9 38 590 0.7 17960
## 2020-04-11 445 27 40.8 670 41 59.5 41 631 0.7 18978
## 2020-04-12 460 15 40.5 692 23 59.4 44 675 0.7 19855
## 2020-04-13 498 38 40.0 749 57 60.2 45 720 0.7 21011
## 2020-04-14 570 72 40.5 858 108 61.2 45 765 0.7 21620
## 2020-04-15 613 43 41.8 922 65 63.1 43 808 0.7 22526
## 2020-04-16 667 54 42.8 1003 81 65.5 41 849 0.7 23332
## 2020-04-17 725 58 43.7 1090 87 66.7 37 886 0.7 24745
## 2020-04-18 747 22 46.2 1124 33 66.3 32 918 0.7 25484
## 2020-04-19 773 26 45.7 1163 39 65.5 29 947 0.7 26306
## 2020-04-20 822 49 44.2 1236 74 64.4 28 975 0.7 27050
## 2020-04-21 866 44 39.8 1302 66 63.7 29 1003 0.7 27861
## 2020-04-22 926 60 42.8 1392 90 64.5 31 1035 0.7 28301
## 2020-04-23 986 60 42.2 1482 90 64.5 36 1071 0.7 29640
## 2020-04-24 1045 59 41.7 1571 88 63.6 43 1114 0.7 30525
## 2020-04-25 1054 9 43.5 1584 13 64.5 52 1166 0.7 30831
## 2020-04-26 1073 19 45.4 1613 28 65.4 58 1224 0.7 31520
## 2020-04-27 1087 14 42.8 1634 21 63.2 62 1285 0.7 32130
## 2020-04-28 1170 83 40.9 1758 124 63.2 63 1348 0.7 32838
## 2020-04-29 1216 46 41.8 1827 69 65.1 62 1411 0.7 33185
## 2020-04-30 1267 51 42.5 1903 76 65.5 59 1469 0.7 33683
## 2020-05-01 1313 46 42.6 1972 69 66.1 53 1522 0.7 34720
## 2020-05-02 1363 50 47.2 2047 75 68.6 44 1566 0.7 35455
## 2020-05-03 1378 15 49.3 2070 22 69.9 38 1605 0.7 36070
## 2020-05-04 1398 20 48.7 2100 30 69.2 34 1639 0.7 36889
## 2020-05-05 1470 72 43.4 2207 108 67.1 32 1671 0.7 37431
## 2020-05-06 1538 68 43.2 2309 102 65.1 32 1703 0.7 37994
## 2020-05-07 1599 61 43.0 2400 91 65.0 35 1738 0.7 38820
## 2020-05-08 1668 69 43.2 2504 103 64.6 39 1777 0.7 39191
## 2020-05-09 1714 46 42.5 2572 69 64.3 46 1823 0.7 39993
## 2020-05-10 1720 6 45.0 2581 9 63.8 50 1873 0.7 40588
## 2020-05-11 1734 14 44.2 2602 21 63.7 53 1926 0.7 40974
## 2020-05-12 1778 44 40.5 2668 66 63.0 55 1981 0.7 41915
## 2020-05-13 1826 48 39.5 2740 72 60.7 54 2035 0.7 42394
## 2020-05-14 1874 48 38.2 2812 72 58.8 52 2088 0.7 43202
## 2020-05-15 1916 42 36.5 2874 63 56.8 48 2136 0.7 44130
## 2020-05-16 1963 47 36.5 2944 70 55.4 43 2179 0.7 44803
## 2020-05-17 1972 9 39.4 2958 13 55.1 39 2218 0.7 45580
## 2020-05-18 1996 24 38.6 2994 36 55.1 36 2254 0.7 46434
## 2020-05-19 2051 55 36.4 3076 82 53.2 36 2290 0.7 46936
## 2020-05-20 2095 44 33.2 3142 66 51.8 37 2327 0.7 47463
## 2020-05-21 2143 48 34.2 3213 72 52.3 39 2366 0.7 48667
## 2020-05-22 2189 46 34.4 3282 69 52.5 43 2409 0.7 49443
## 2020-05-23 2232 43 34.5 3346 64 52.2 49 2458 0.7 50119
## 2020-05-24 2236 4 36.5 3352 6 51.2 53 2511 0.7 50859
## 2020-05-25 2251 15 34.9 3374 22 50.1 56 2567 0.7 51738
## 2020-05-26 2258 7 31.4 3385 10 50.1 56 2623 0.7 52247
## 2020-05-27 2318 60 33.4 3474 89 50.5 56 2679 0.7 52626
## 2020-05-28 2363 45 32.5 3541 67 49.7 53 2732 0.7 53277
## 2020-05-29 2412 49 32.1 3614 73 49.7 49 2781 0.7 54489
## 2020-05-30 2446 34 32.8 3665 51 49.2 43 2824 0.7 55416
## 2020-05-31 2450 4 34.7 3671 6 48.9 39 2863 0.7 56155
## 2020-06-01 2459 9 34.5 3684 13 49.1 36 2900 0.7 56822
## 2020-06-02 2529 70 34.8 3789 104 51.4 35 2934 0.7 57439
## 2020-06-03 2565 36 34.3 3842 54 52.6 35 2969 0.7 58756
## 2020-06-04 2606 41 33.6 3903 61 51.4 36 3005 0.7 60175
## 2020-06-05 2659 53 33.5 3982 79 50.4 39 3044 0.7 61480
## 2020-06-06 2687 28 33.1 4024 42 50.1 43 3087 0.7 62750
## 2020-06-07 2699 12 36.5 4042 18 50.9 46 3133 0.7 63930
## 2020-06-08 2711 12 36.2 4060 18 50.9 49 3182 0.7 64896
## 2020-06-09 2764 53 31.4 4139 79 50.0 50 3232 0.7 65992
## 2020-06-10 2800 36 32.8 4192 54 48.6 51 3283 0.7 67363
## 2020-06-11 2847 47 31.6 4262 70 48.1 50 3334 0.7 69061
## 2020-06-12 2876 29 30.8 4305 43 47.7 49 3383 0.7 70963
## 2020-06-13 2924 48 32.0 4377 71 47.8 47 3430 0.7 73544
## 2020-06-14 2930 6 34.2 4386 9 48.7 46 3476 0.7 75560
## 2020-06-15 2937 7 34.5 4396 10 49.0 46 3522 0.7 77318
## 2020-06-16 2992 55 31.4 4478 82 49.6 47 3569 0.7 80101
## 2020-06-17 3017 25 33.6 4515 37 50.6 49 3617 0.7 82711
## 2020-06-18 3060 43 33.3 4579 64 50.9 51 3669 0.7 85918
## 2020-06-19 3103 43 34.6 4643 64 51.4 55 3724 0.7 89740
## 2020-06-20 3143 40 33.9 4702 59 50.6 60 3784 0.7 93789
## 2020-06-21 3160 17 35.3 4727 25 50.6 65 3849 0.7 97283
## 2020-06-22 3172 12 37.0 4745 18 52.9 69 3918 0.7 100209
## 2020-06-23 3237 65 34.9 4842 97 54.2 72 3990 0.7 103495
## 2020-06-24 3280 43 37.5 4906 64 55.4 75 4065 0.7 109006
## 2020-06-25 3326 46 37.6 4974 68 57.7 78 4142 0.7 114010
## 2020-06-26 3365 39 39.5 5032 58 60.2 80 4222 0.7 122952
## 2020-06-27 3389 24 41.5 5067 36 60.3 81 4303 0.7 132537
## 2020-06-28 3418 29 41.6 5111 43 59.8 83 4386 0.7 141067
## 2020-06-29 3446 28 42.9 5152 42 62.3 85 4471 0.7 146333
## 2020-06-30 3504 58 41.5 5238 86 64.0 88 4560 0.7 152426
## 2020-07-01 3549 45 43.1 5305 67 64.1 92 4651 0.7 158989
## 2020-07-02 3616 67 43.2 5404 99 68.3 96 4747 0.7 169098
## 2020-07-03 3683 67 49.5 5504 99 75.1 100 4847 0.7 178586
## 2020-07-04 3701 18 54.8 5530 27 81.7 105 4952 0.7 190044
## 2020-07-05 3730 29 59.8 5573 43 86.2 110 5062 0.7 200103
## 2020-07-06 3777 47 61.2 5643 70 87.4 116 5177 0.7 206439
## 2020-07-07 3840 63 59.4 5736 93 91.7 122 5299 0.7 213786
## 2020-07-08 3888 48 66.1 5807 71 99.1 128 5427 0.7 223775
## 2020-07-09 4008 120 69.5 5985 178 107.3 135 5561 0.7 232710
## 2020-07-10 4101 93 76.4 6123 138 115.2 142 5703 0.7 244143
## 2020-07-11 4196 95 84.8 6263 141 122.2 149 5852 0.7 254503
## 2020-07-12 4241 45 89.5 6330 67 129.0 157 6009 0.7 269803
## 2020-07-13 4276 35 92.6 6381 52 134.3 166 6175 0.7 282427
## 2020-07-14 4408 132 94.7 6576 195 140.3 175 6350 0.7 291621
## 2020-07-15 4520 112 101.3 6742 165 148.8 184 6533 0.7 301802
## 2020-07-16 4676 156 102.8 6972 230 156.3 194 6727 0.7 315767
## 2020-07-17 4804 128 108.9 7161 189 161.2 204 6931 0.7 327233
## 2020-07-18 4894 90 112.0 7294 133 164.8 215 7146 0.7 337561
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## 2020-04-13 21299325 13223 389243 394461 1156 976 2020-04-13 0.01827
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## 2020-05-26 21299325 9561 864584 875333 509 774 2020-05-26 0.04059
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## 2020-05-28 21299325 9794 884119 879199 651 754 2020-05-28 0.04151
## 2020-05-29 21299325 9919 894038 895555 1212 807 2020-05-29 0.04197
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## 2020-06-11 21299325 12452 1037386 1030415 1698 1715 2020-06-11 0.04871
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## 2020-06-13 21299325 12828 1063013 1060973 2581 2041 2020-06-13 0.04991
## 2020-06-14 21299325 13661 1076674 1080843 2016 2279 2020-06-14 0.05055
## 2020-06-15 21299325 15011 1091685 1100708 1758 2508 2020-06-15 0.05125
## 2020-06-16 21299325 16330 1108015 1106044 2783 2672 2020-06-16 0.05202
## 2020-06-17 21299325 17247 1125263 1114639 2610 2803 2020-06-17 0.05283
## 2020-06-18 21299325 17488 1142751 1128568 3207 3020 2020-06-18 0.05365
## 2020-06-19 21299325 18340 1161091 1147233 3822 3271 2020-06-19 0.05451
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## 2020-06-21 21299325 21464 1202378 1196983 3494 4275 2020-06-21 0.05645
## 2020-06-22 21299325 23039 1225417 1224507 2926 4841 2020-06-22 0.05753
## 2020-06-23 21299325 24436 1249852 1252611 3286 5191 2020-06-23 0.05868
## 2020-06-24 21299325 25802 1275654 1265920 5511 5422 2020-06-24 0.05989
## 2020-06-25 21299325 26861 1302515 1276269 5004 5657 2020-06-25 0.06115
## 2020-06-26 21299325 28054 1330569 1315286 8942 6023 2020-06-26 0.06247
## 2020-06-27 21299325 29750 1360319 1348374 9585 6525 2020-06-27 0.06387
## 2020-06-28 21299325 31252 1391572 1394433 8530 7131 2020-06-28 0.06533
## 2020-06-29 21299325 32235 1423807 1432202 5266 7768 2020-06-29 0.06685
## 2020-06-30 21299325 32967 1456774 1458745 6093 8085 2020-06-30 0.06840
## 2020-07-01 21299325 33597 1490371 1484394 6563 8217 2020-07-01 0.06997
## 2020-07-02 21299325 34367 1524739 1510917 10109 8358 2020-07-02 0.07159
## 2020-07-03 21299325 35360 1560099 1550387 9488 8375 2020-07-03 0.07325
## 2020-07-04 21299325 36996 1597095 1591305 11458 8469 2020-07-04 0.07498
## 2020-07-05 21299325 39077 1636172 1642198 10059 8802 2020-07-05 0.07682
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## 2020-07-07 21299325 43671 1721257 1718317 7347 10034 2020-07-07 0.08081
## 2020-07-08 21299325 44322 1765579 1740931 9989 10248 2020-07-08 0.08289
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## 2020-09-09 21299325 27497 4092274 4100035 2056 2672 2020-09-09 0.19213
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## 2020-10-04 21299325 18937 4716906 4730399 1868 2332 2020-10-04 0.22146
## 2020-10-05 21299325 18067 4734973 4750886 1415 2398 2020-10-05 0.22231
## 2020-10-06 21299325 17380 4752353 4772489 2251 2476 2020-10-06 0.22312
## 2020-10-07 21299325 16695 4769048 4775856 2582 2463 2020-10-07 0.22391
## 2020-10-08 21299325 16381 4785429 4781465 3306 2476 2020-10-08 0.22468
## 2020-10-09 21299325 16006 4801435 4797170 2908 2509 2020-10-09 0.22543
## 2020-10-10 21299325 14990 4816426 4815674 0 2599 2020-10-10 0.22613
## 2020-10-11 21299325 14075 4830501 4837256 5570 2774 2020-10-11 0.22679
## 2020-10-12 21299325 13692 4844193 4857430 1533 2896 2020-10-12 0.22743
## 2020-10-13 21299325 13050 4857243 4868915 2725 2871 2020-10-13 0.22805
## 2020-10-14 21299325 12409 4869652 4876757 2883 2850 2020-10-14 0.22863
## 2020-10-15 21299325 11768 4881420 4889359 3356 2833 2020-10-15 0.22918
## 2020-10-16 21299325 11126 4892546 4905038 3449 3033 2020-10-16 0.22970
## 2020-10-17 21299325 10485 4903031 4913996 4044 3186 2020-10-17 0.23020
## 2020-10-18 21299325 9844 4912875 4924911 2539 3230 2020-10-18 0.23066
## 2020-10-19 21299325 9202 4922077 4939742 1707 3338 2020-10-19 0.23109
## 2020-10-20 21299325 8561 4930638 4952571 3662 3344 2020-10-20 0.23149
## 2020-10-21 21299325 7920 4938558 4965399 2144 3404 2020-10-21 0.23186
## 2020-10-22 21299325 7279 4945836 4978228 5558 3471 2020-10-22 0.23221
## 2020-10-23 21299325 6637 4952474 4991056 3689 3505 2020-10-23 0.23252
## 2020-10-24 21299325 5996 4958470 5003884 4471 3639 2020-10-24 0.23280
## 2020-10-25 21299325 5355 4963825 5016713 2385 3792 2020-10-25 0.23305
## 2020-10-26 21299325 4714 4968539 5029541 3377 3868 2020-10-26 0.23327
## 2020-10-27 21299325 4073 4972611 5042370 4298 4023 2020-10-27 0.23346
## 2020-10-28 21299325 3431 4976043 5055198 4115 4089 2020-10-28 0.23362
## 2020-10-29 21299325 2790 4978833 5068027 4198 4081 2020-10-29 0.23376
## 2020-10-30 21299325 2149 4980981 5080855 5592 4186 2020-10-30 0.23386
## 2020-10-31 21299325 1508 4982489 5093683 2331 4380 2020-10-31 0.23393
## 2020-11-01 21299325 866 4983356 5106512 4865 4573 2020-11-01 0.23397
## 2020-11-02 21299325 225 4983581 5119340 4651 4767 2020-11-02 0.23398
## 2020-11-03 21299325 -416 4983165 5132169 4637 4961 2020-11-03 0.23396
## 2020-11-04 21299325 -1057 4982107 5144997 4423 5154 2020-11-04 0.23391
## 2020-11-05 21299325 -1698 4980409 5157826 6257 5348 2020-11-05 0.23383
## 2020-11-06 21299325 -2340 4978069 5170654 5245 5541 2020-11-06 0.23372