Caso de estudio de la 2da unidad de probabilidad y estadística: Enfermedades crónicas y su relación con los fallecimientos por COVID-19
enfermedades.jpg
- Importar bibliotecas:
setwd("~/PYE1112ITSON")
library(pacman)
p_load("base64enc", "htmltools", "mime", "xfun", "prettydoc","readr", "knitr","DT","dplyr", "ggplot2","plotly", "gganimate","gifski","scales")¿Que tanp probable es que un munucipio con alta cantidad de diagnósticos por enfermedades crónicas también sea un municipio con tasas elevadas de mortalidad por COVID-19?
Dado que los pacientes con enfermedades crónicas tienen mayor probabilidad de desarrollar complicaciones si se contagian.
Enfermedades crónicas en Sonora
Fuente de los datos Obtenida de: https://datos.gob.mx/busca/dataset/expediente-clinico-electronico-unemes-enfermedades-cronicas--2018
URL de datos CSV crudos: http://www.cenaprece.salud.gob.mx/descargas/Excel/Diagnosticos18.csv
Expediente Clínico Electrónico UNEMES (unidades de especialidades médicas) Enfermedades Crónicas 2018
- El Centro Nacional de Programas Preventivos y Control de Enfermedades (CENAPRECE), es el órgano desconcentrado de la Secretaría de Salud responsable de conducir e implementar los programas sustantivos para la prevención y control de enfermedades, para reducir la morbilidad y mortalidad en la población mexicana.
Importar datos
## [1] "data.frame"## Estado Jurisdiccion Uneme CLUES Cve.Persona Genero
## 1 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5910 Mujer
## 2 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5953 Mujer
## 3 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6045 Mujer
## 4 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6091 Mujer
## 5 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN6138 Mujer
## 6 Guanajuato IRAPUATO UNEME EC IRAPUATO GTSSA017250 GuIRUN5706 Hombre
## Cve.Diagn.f3.stico Diagnostico Fecha.Diagnostico
## 1 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 2 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 3 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 4 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 5 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018
## 6 E78.2 Dislipidemias 02/01/2018Formatear datos
Visualización
# Grouped
ggplot(SonoraS, aes(fill=Jurisdiccion, y=Diagnostico)) +
geom_bar(position="dodge", stat="count") +
xlab ("Número de casos") +
ylab ("Diagnóstico") +
ggtitle(" Enfermedades crónicas en Sonora, 2018 (CENAPRECE)") 
Ahora que se tienen los datos, podemos estimar la cantidad de personas diagnísticadas por jurisdicción (Ciudad):
## [1] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [5] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [9] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [13] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [17] HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO
## [21] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [25] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [29] CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA CABORCA
## [33] CIUDAD OBREGON HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA
## [37] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [41] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [45] SANTA ANA SANTA ANA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [49] CIUDAD OBREGON HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [53] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [57] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [61] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA
## [65] SANTA ANA CABORCA SANTA ANA CABORCA
## [69] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [73] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [77] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [81] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [85] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [89] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [93] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [97] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [101] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [105] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [109] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [113] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [117] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [121] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [125] SANTA ANA CABORCA CABORCA CABORCA
## [129] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [133] CABORCA CIUDAD OBREGON HERMOSILLO HERMOSILLO
## [137] SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [141] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [145] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [149] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [153] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [157] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [161] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [165] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [169] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [173] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [177] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [181] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [185] HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO SANTA ANA
## [189] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [193] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [197] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [201] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [205] CABORCA CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON
## [209] CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [213] CIUDAD OBREGON SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [217] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [233] CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA HERMOSILLO
## [237] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [241] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [245] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA
## [249] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [253] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [257] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [261] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA CABORCA
## [265] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [269] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [273] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [277] CABORCA CABORCA HERMOSILLO SANTA ANA
## [281] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [285] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [289] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
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## [297] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [301] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [305] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [309] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [313] SANTA ANA CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [317] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [321] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [329] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [333] CABORCA CIUDAD OBREGON HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
## [337] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [341] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [345] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [349] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [353] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [357] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [361] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [365] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [369] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [373] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [377] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [381] SANTA ANA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [385] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO
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## [393] HERMOSILLO CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
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## [413] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [421] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
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## [429] HERMOSILLO SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [433] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [441] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## [457] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON
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## [517] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON HERMOSILLO
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## [533] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
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## [541] HERMOSILLO HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
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## [589] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [757] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [761] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [849] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1133] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1137] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [1233] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1317] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
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## [1325] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
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## [1333] CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [1337] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1345] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1349] HERMOSILLO CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1357] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1361] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1365] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [1369] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1377] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1381] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1385] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1389] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
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## [1397] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1401] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1405] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1409] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA SANTA ANA
## [1413] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1417] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1421] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1425] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1429] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1433] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1437] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1441] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1445] HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1449] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1453] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1457] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1461] HERMOSILLO HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA
## [1465] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1469] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1477] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1497] CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [1501] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1505] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1509] HERMOSILLO CABORCA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [1513] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1517] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1521] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1525] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1529] CABORCA CABORCA CIUDAD OBREGON CABORCA
## [1533] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1537] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1541] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1545] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## [1549] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1553] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1557] CABORCA CABORCA SANTA ANA SANTA ANA
## [1561] SANTA ANA CABORCA HERMOSILLO SANTA ANA
## [1565] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1569] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1573] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1577] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
## [1581] CABORCA CABORCA CABORCA CABORCA
## [1585] HERMOSILLO CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1589] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1593] SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1597] SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1601] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
## [1605] CABORCA CABORCA CABORCA SANTA ANA
## [1609] SANTA ANA SANTA ANA CABORCA CABORCA
## [1613] CABORCA SANTA ANA SANTA ANA HERMOSILLO
## [1617] HERMOSILLO CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA
## [1621] CABORCA CABORCA CABORCA HERMOSILLO
## [1625] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1629] HERMOSILLO SANTA ANA SANTA ANA SANTA ANA
## [1633] SANTA ANA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1637] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1641] CABORCA CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1645] HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA CABORCA
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## [1653] SANTA ANA CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON CIUDAD OBREGON
## [1657] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
## [1661] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1681] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1701] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1733] CABORCA HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO
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## [1769] CIUDAD OBREGON CABORCA CABORCA CABORCA
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## [1801] HERMOSILLO HERMOSILLO HERMOSILLO CABORCA
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## [2133] HERMOSILLO CABORCA CABORCA CABORCA
## 91 Levels: \xc1LVARO OBREG\xd3N ACAPULCO ACU\xd1A ... ZACATECASAhora que se tienen los datos, podemos estimar la cantidad de personas diagnísticadas por jurisdicción (ciudad)
¿Por qué razones si la población de Ciudad Obregón es más grande que la Santa Ana y de Caborca, existen más personas con diagnóstico de enfermedades crónicas?
Esto podria ser que las ciudades al estar mas al norte del estado tomaron costumbres del pais vecino las cuales podrian ser el sedentarismo y comer comida chatarra pero tambien en mexico somos el primer lugar en obecidad puede ser a la falta de educacion en el ambito de la salud.
¿Cuánta gente habita en cada ciudad?
Fuente: http://cuentame.inegi.org.mx/monografias/informacion/son/territorio/div_municipal.aspx?tema=me&e=26
Clave Municipio Población
018 Cajeme: 433050
017 Caborca: 85631
058 Santa Ana: 16248
030 Hermosillo: 884273
Fallecidos por COVID-19: https://datos.covid-19.conacyt.mx/#DownZCSV
Total de defunciones en Caborca: 95
Total de defunciones en Cajeme: 625
Total de defunciones en Hermosillo: 1010
Total de defunciones en Santa Ana: 113
Si hacemos una relación de número de personas fallecidas por cada 10,000 habitantes, para poder comparar en proporción, tenemos que por cada 10,000 habitantes:
Defunciones en Caborca*: 12
Defunciones en Cajeme*: 15
Defunciones en Hermosillo*: 12
Defunciones en Santa Ana*: 70
Para el cálculo de los datos anteriores, se dividió el número de fallecidos por COVID-19 en cada municipio, entre su población total dividida entre diez mil.
Con esta forma de comparar, ¿Cuál ciudad tiene proporcionalmente más fallecidos?
Santa Ana
¿Las ciudades con más personas diagnosticadas son las que proporcionalmente presentan más fallecidos?
No, ya que en la capital cuenta con indice mas elevado de enfermedades cornicas y en otros municipios no pero en la capital no hay tantos fallecimientos como en los otros municipios eesto podria deberse a que en ese sector el nivel medico es mucho mas alto y estan mas equipados para ciertas situaciones.