Índice
1. Introducción
2. Descarga de datos
3. Descompresión de datos
4. Referencias

1. Introducción

El siguiente código contiene la rutina para descargar información desde la infraestructura de datos espaciales del Instituto Alexander von Humboldt (GeoNetwork), para su incorporación en el flujo de trabajo de la plataforma BioTablero.

En primer lugar se debe instalar las librerí knitr. Knirt se requiere para la generación de informes dinámicos en R.
#install.packages("knitr")
require("knitr")
## Loading required package: knitr

2. Descarga de datos

La descarga de datos se realiza con la función download.file, esta función necesita mínimo dos argumentos para ser ejecutada. El primer argumento, url, es la dirección de descarga del producto. El segundo argumento, desfile, es la ruta (dirección y carpeta) dentro del sistema de archivos computador donde el usuario desea descargar el archivo .zip proveniente de GeoNetwork. Tanto la dirección url como en la ruta de salida desfile son argumentos tipo caracter. A continuación definimos estos parametros, los cuales deben ser especificados por cada usuario.
url = "http://geonetwork.humboldt.org.co/geonetwork/srv/api/records/e29b399c-24ee-4c16-b19c-be2eb1ce0aae/attachments/LHFI.zip"
destfile = "D:/LHFI.zip"
Como ejemplo para esta rutina se ha seleccionado el índice de huella espacial humana (IHEH) (Ayram et al., 2020) que permite medir el grado de transformación espaciotemporal del país, e identificar aquellas áreas más transformadas. El IHEH corresponde al grado o magnitud de la influencia acumulada de las actividades antrópicas sobre los paisajes y ecosistemas.
download.file(url = url, destfile = destfile) #Recuerde cambiar en este espacio con la ruta donde desea guardar el achivo descargado en su ordenador

3. Descompresión de datos

Una vez descargado el archivo, se realiza su descomprensión LHFI.zip. La descompresión se realiza con la función unzip de la librería utils instalada al principio de esta rutina. La función requiere de dos argumentos mínimos: zipfile, en donde se señala la ruta y el nombre en donde se encuentra el archivo .zip a descomprimir, y exdir, que va a hacer referencia a la dirección del ordenador en la cual queremos descomprimir el archivo .zip.
unzip(zipfile = destfile, exdir = "D:/") #Recuerde verificar tanto la ruta del archivo, como la dirección donde desea descomprimir la información.  

4. Referencias

Ayram, C., Etter, A., Díaz, J., Rodríguez, S., Ramírez, W., & Crozo, G. (2020). Spatiotemporal evaluation of the human footprint in Colombia: Four decades of anthropic impact in highly biodiverse ecosystems. Ecological Indicators, 117(April), 106630. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106630