Visualització yellow

Idisba-Unitat Bioinformàtica

2020-06-26

Yellow

KEGG

Barplot i dotplot

Visualitza la puntuació de l’enrequiment amb el p-valor i el reconte de gens

Xarxa de gens

Xarxa conectant els gens entre diferents procesos biologics (GO o KEGG)

Heatmap

Simplifica la xarxa de gens/processos biològics.

Mapa de funcions

Mostra les funcions organitzades en una xarxa conectades pels gens comuns,

UpSet Plot

Visualització de la associació entre gens i conjunts de gens i resalta el solapaments que hi ha.

KEGG

Visualització de les vies KEGG resaltant els gens que hi participen

GO

Barplot i dotplot

Visualitza la puntuació de l’enrequiment amb el p-valor i el reconte de gens

Xarxa de gens

Xarxa conectant els gens entre diferents procesos biologics (GO o KEGG)

Heatmap

Simplifica la xarxa de gens/processos biològics.

Mapa de funcions

Mostra les funcions organitzades en una xarxa conectades pels gens comuns,

UpSet Plot

Visualització de la associació entre gens i conjunts de gens i resalta el solapaments que hi ha.

Molecular function

## $dag
## A graphNEL graph with directed edges
## Number of Nodes = 32 
## Number of Edges = 45 
## 
## $complete.dag
## [1] "A graph with 32 nodes."

Biological proces

## $dag
## A graphNEL graph with directed edges
## Number of Nodes = 47 
## Number of Edges = 81 
## 
## $complete.dag
## [1] "A graph with 47 nodes."