Introduction

The purpose of this analysis is to assess fixed effects in a small data set

Prelminary data analysis

Loading dataset with scores

Groupe.A Groupe.B Groupe.C Groupe.D Groupe.E Ambiance.Jour.1 Plasisir.montage Plaisir.rencontre.nvle.personnes Proche.sophie RÃ.pond.attente plaisir.ravitaillement Plaisir.rencontre Proche.Julien Reconnu Participer.global X80..Inscrit_prochain Groupe
0 0 0 1 1 7 7 7 5 1 7 8 7 8 8 2 11
0 0 0 1 1 10 9 10 7 2 10 10 8 10 10 3 11
1 0 1 0 0 5 5 6 4 0 5 7 4 7 6 0 10100
1 1 1 0 0 8 8 8 8 1 8 9 8 9 9 3 11100
1 1 0 1 1 9 10 9 7 2 10 9 7 10 10 3 11011
0 0 0 1 1 7 7 7 7 0 6 6 5 7 7 2 11
1 1 1 0 0 9 9 9 8 1 10 10 9 10 9 3 11100
1 1 1 0 0 9 9 9 5 2 10 10 4 10 10 3 11100
0 1 0 1 0 8 7 9 3 0 7 8 3 7 8 1 1010
0 0 0 0 0 10 10 10 7 1 8 8 3 8 8 2 0

Descriptive statistics

##     Groupe.A      Groupe.B      Groupe.C      Groupe.D      Groupe.E  
##  Min.   :0.0   Min.   :0.0   Min.   :0.0   Min.   :0.0   Min.   :0.0  
##  1st Qu.:0.0   1st Qu.:0.0   1st Qu.:0.0   1st Qu.:0.0   1st Qu.:0.0  
##  Median :0.5   Median :0.5   Median :0.0   Median :0.5   Median :0.0  
##  Mean   :0.5   Mean   :0.5   Mean   :0.4   Mean   :0.5   Mean   :0.4  
##  3rd Qu.:1.0   3rd Qu.:1.0   3rd Qu.:1.0   3rd Qu.:1.0   3rd Qu.:1.0  
##  Max.   :1.0   Max.   :1.0   Max.   :1.0   Max.   :1.0   Max.   :1.0  
##  Ambiance.Jour.1 Plasisir.montage Plaisir.rencontre.nvle.personnes
##  Min.   : 5.00   Min.   : 5.0     Min.   : 6.00                   
##  1st Qu.: 7.25   1st Qu.: 7.0     1st Qu.: 7.25                   
##  Median : 8.50   Median : 8.5     Median : 9.00                   
##  Mean   : 8.20   Mean   : 8.1     Mean   : 8.40                   
##  3rd Qu.: 9.00   3rd Qu.: 9.0     3rd Qu.: 9.00                   
##  Max.   :10.00   Max.   :10.0     Max.   :10.00                   
##  Proche.sophie RÃ.pond.attente plaisir.ravitaillement Plaisir.rencontre
##  Min.   :3.0   Min.   :0.00    Min.   : 5.0           Min.   : 6.00    
##  1st Qu.:5.0   1st Qu.:0.25    1st Qu.: 7.0           1st Qu.: 8.00    
##  Median :7.0   Median :1.00    Median : 8.0           Median : 8.50    
##  Mean   :6.1   Mean   :1.00    Mean   : 8.1           Mean   : 8.50    
##  3rd Qu.:7.0   3rd Qu.:1.75    3rd Qu.:10.0           3rd Qu.: 9.75    
##  Max.   :8.0   Max.   :2.00    Max.   :10.0           Max.   :10.00    
##  Proche.Julien     Reconnu      Participer.global X80..Inscrit_prochain
##  Min.   :3.00   Min.   : 7.00   Min.   : 6.00     Min.   :0.0          
##  1st Qu.:4.00   1st Qu.: 7.25   1st Qu.: 8.00     1st Qu.:2.0          
##  Median :6.00   Median : 8.50   Median : 8.50     Median :2.5          
##  Mean   :5.80   Mean   : 8.60   Mean   : 8.50     Mean   :2.2          
##  3rd Qu.:7.75   3rd Qu.:10.00   3rd Qu.: 9.75     3rd Qu.:3.0          
##  Max.   :9.00   Max.   :10.00   Max.   :10.00     Max.   :3.0          
##      Groupe     
##  Min.   :    0  
##  1st Qu.:   11  
##  Median : 5555  
##  Mean   : 5545  
##  3rd Qu.:11078  
##  Max.   :11100

The overall boxplot shows that different groups lead to different intentions to attend the event the following year.

Nonetheless, the individual charts show that no variable has a significant effect per se.

Linear regressions

Diagnostics on the baseline

## 
## Call:
## lm(formula = X80..Inscrit_prochain ~ Groupe.A + Groupe.B + Groupe.C + 
##     Groupe.D + Groupe.E, data = scores)
## 
## Residuals:
##          1          2          3          4          5          6          7 
## -3.333e-01  6.667e-01  2.914e-16 -3.747e-16 -2.637e-16 -3.333e-01  1.249e-16 
##          8          9         10 
##  1.249e-16  3.331e-16 -2.498e-16 
## 
## Coefficients:
##             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)   
## (Intercept)   2.0000     0.4082   4.899  0.00805 **
## Groupe.A     -2.3333     0.6667  -3.500  0.02490 * 
## Groupe.B      3.0000     0.4714   6.364  0.00313 **
## Groupe.C      0.3333     0.6667   0.500  0.64333   
## Groupe.D     -4.0000     0.7454  -5.367  0.00582 **
## Groupe.E      4.3333     0.6667   6.500  0.00289 **
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.4082 on 4 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.9306, Adjusted R-squared:  0.8438 
## F-statistic: 10.72 on 5 and 4 DF,  p-value: 0.01965

## Error in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log) : 
##   'x' and 'y' lengths differ

## Error in summary(m1)$coef[2, 3] : indice hors limites

## Groupe.A Groupe.B Groupe.C Groupe.D Groupe.E 
## 6.666667 3.333333 6.400000 8.333333 6.400000

## named integer(0)

Checking Groupe as a factor

## 
## Call:
## lm(formula = scale(X80..Inscrit_prochain) ~ as.factor(Groupe), 
##     data = scores)
## 
## Residuals:
##          1          2          3          4          5          6          7 
## -3.227e-01  6.455e-01  8.327e-17  2.498e-16  0.000e+00 -3.227e-01 -1.110e-16 
##          8          9         10 
## -1.110e-16 -1.665e-16  1.388e-16 
## attr(,"scaled:center")
## [1] 2.2
## attr(,"scaled:scale")
## [1] 1.033
## 
## Coefficients:
##                        Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)  
## (Intercept)             -0.1936     0.3953  -0.490   0.6499  
## as.factor(Groupe)11      0.3227     0.4564   0.707   0.5185  
## as.factor(Groupe)1010   -0.9682     0.5590  -1.732   0.1583  
## as.factor(Groupe)10100  -1.9365     0.5590  -3.464   0.0257 *
## as.factor(Groupe)11011   0.9682     0.5590   1.732   0.1583  
## as.factor(Groupe)11100   0.9682     0.4564   2.121   0.1012  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.3953 on 4 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.9306, Adjusted R-squared:  0.8438 
## F-statistic: 10.72 on 5 and 4 DF,  p-value: 0.01965

Using normalized coefficients

## 
## Call:
## lm(formula = scale(X80..Inscrit_prochain) ~ scale(Groupe.A) + 
##     scale(Groupe.B) + scale(Groupe.C) + scale(Groupe.D) + scale(Groupe.E), 
##     data = scores)
## 
## Residuals:
##          1          2          3          4          5          6          7 
## -3.227e-01  6.455e-01 -5.274e-16  8.327e-17 -1.388e-16 -3.227e-01  3.053e-16 
##          8          9         10 
##  3.053e-16 -3.331e-16  5.551e-17 
## attr(,"scaled:center")
## [1] 2.2
## attr(,"scaled:scale")
## [1] 1.033
## 
## Coefficients:
##                   Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)   
## (Intercept)     -2.633e-16  1.250e-01   0.000  1.00000   
## scale(Groupe.A) -1.191e+00  3.402e-01  -3.500  0.02490 * 
## scale(Groupe.B)  1.531e+00  2.406e-01   6.364  0.00313 **
## scale(Groupe.C)  1.667e-01  3.333e-01   0.500  0.64333   
## scale(Groupe.D) -2.041e+00  3.804e-01  -5.367  0.00582 **
## scale(Groupe.E)  2.167e+00  3.333e-01   6.500  0.00289 **
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.3953 on 4 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.9306, Adjusted R-squared:  0.8437 
## F-statistic: 10.72 on 5 and 4 DF,  p-value: 0.01965

Assessing moderating effects

## 
## Call:
## lm(formula = scale(X80..Inscrit_prochain) ~ scale(Groupe.A) * 
##     scale(Groupe.B) * scale(Groupe.C) * scale(Groupe.D) * scale(Groupe.E), 
##     data = scores)
## 
## Residuals:
##          1          2          3          4          5          6          7 
## -3.227e-01  6.455e-01 -5.274e-16  8.327e-17 -1.388e-16 -3.227e-01  3.053e-16 
##          8          9         10 
##  3.053e-16 -3.331e-16  5.551e-17 
## attr(,"scaled:center")
## [1] 2.2
## attr(,"scaled:scale")
## [1] 1.033
## 
## Coefficients: (26 not defined because of singularities)
##                                                                                   Estimate
## (Intercept)                                                                     -2.633e-16
## scale(Groupe.A)                                                                 -1.191e+00
## scale(Groupe.B)                                                                  1.531e+00
## scale(Groupe.C)                                                                  1.667e-01
## scale(Groupe.D)                                                                 -2.041e+00
## scale(Groupe.E)                                                                  2.167e+00
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)         NA
##                                                                                 Std. Error
## (Intercept)                                                                      1.250e-01
## scale(Groupe.A)                                                                  3.402e-01
## scale(Groupe.B)                                                                  2.406e-01
## scale(Groupe.C)                                                                  3.333e-01
## scale(Groupe.D)                                                                  3.804e-01
## scale(Groupe.E)                                                                  3.333e-01
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                         NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)         NA
##                                                                                 t value
## (Intercept)                                                                       0.000
## scale(Groupe.A)                                                                  -3.500
## scale(Groupe.B)                                                                   6.364
## scale(Groupe.C)                                                                   0.500
## scale(Groupe.D)                                                                  -5.367
## scale(Groupe.E)                                                                   6.500
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B)                                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C)                                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D)                                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                                      NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.E)                                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                                      NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                                      NA
## scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                      NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                      NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)      NA
##                                                                                 Pr(>|t|)
## (Intercept)                                                                      1.00000
## scale(Groupe.A)                                                                  0.02490
## scale(Groupe.B)                                                                  0.00313
## scale(Groupe.C)                                                                  0.64333
## scale(Groupe.D)                                                                  0.00582
## scale(Groupe.E)                                                                  0.00289
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B)                                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C)                                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D)                                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                                       NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.E)                                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                                       NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                                       NA
## scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                       NA
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                       NA
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)       NA
##                                                                                   
## (Intercept)                                                                       
## scale(Groupe.A)                                                                 * 
## scale(Groupe.B)                                                                 **
## scale(Groupe.C)                                                                   
## scale(Groupe.D)                                                                 **
## scale(Groupe.E)                                                                 **
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B)                                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C)                                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D)                                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                                   
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.E)                                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                                   
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                                   
## scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D)                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.E)                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                   
## scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)                   
## scale(Groupe.A):scale(Groupe.B):scale(Groupe.C):scale(Groupe.D):scale(Groupe.E)   
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.3953 on 4 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.9306, Adjusted R-squared:  0.8437 
## F-statistic: 10.72 on 5 and 4 DF,  p-value: 0.01965

Removing C and all moderating effects

## 
## Call:
## lm(formula = scale(X80..Inscrit_prochain) ~ scale(Groupe.A) + 
##     scale(Groupe.B) + scale(Groupe.D) + scale(Groupe.E), data = scores)
## 
## Residuals:
##          1          2          3          4          5          6          7 
## -2.824e-01  6.858e-01 -5.135e-16  4.034e-02 -1.210e-01 -2.824e-01  4.034e-02 
##          8          9         10 
##  4.034e-02 -2.498e-16 -1.210e-01 
## attr(,"scaled:center")
## [1] 2.2
## attr(,"scaled:scale")
## [1] 1.033
## 
## Coefficients:
##                   Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
## (Intercept)     -2.545e-16  1.152e-01   0.000 1.000000    
## scale(Groupe.A) -1.084e+00  2.448e-01  -4.429 0.006835 ** 
## scale(Groupe.B)  1.510e+00  2.183e-01   6.916 0.000969 ***
## scale(Groupe.D) -2.084e+00  3.418e-01  -6.096 0.001719 ** 
## scale(Groupe.E)  2.125e+00  2.976e-01   7.141 0.000836 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.3644 on 5 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.9262, Adjusted R-squared:  0.8672 
## F-statistic: 15.69 on 4 and 5 DF,  p-value: 0.004903

## Error in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log) : 
##   'x' and 'y' lengths differ

##                 Test stat Pr(>|Test stat|)
## scale(Groupe.A)                           
## scale(Groupe.B)                           
## scale(Groupe.D)                           
## scale(Groupe.E)                           
## Tukey test           -0.5           0.6171

## scale(Groupe.A) scale(Groupe.B) scale(Groupe.D) scale(Groupe.E) 
##        4.062500        3.229167        7.916667        6.000000

## named integer(0)
## named integer(0)

Linear predictions

Predicting all the data sample by using the different groupes (except C)

## Confusion Matrix and Statistics
## 
##    
##     2 3 0 1
##   2 3 0 0 0
##   3 1 4 0 0
##   0 0 0 1 0
##   1 0 0 0 1
## 
## Overall Statistics
##                                          
##                Accuracy : 0.9            
##                  95% CI : (0.555, 0.9975)
##     No Information Rate : 0.4            
##     P-Value [Acc > NIR] : 0.001678       
##                                          
##                   Kappa : 0.8485         
##                                          
##  Mcnemar's Test P-Value : NA             
## 
## Statistics by Class:
## 
##                      Class: 2 Class: 3 Class: 0 Class: 1
## Sensitivity            0.7500   1.0000      1.0      1.0
## Specificity            1.0000   0.8333      1.0      1.0
## Pos Pred Value         1.0000   0.8000      1.0      1.0
## Neg Pred Value         0.8571   1.0000      1.0      1.0
## Precision              1.0000   0.8000      1.0      1.0
## Recall                 0.7500   1.0000      1.0      1.0
## F1                     0.8571   0.8889      1.0      1.0
## Prevalence             0.4000   0.4000      0.1      0.1
## Detection Rate         0.3000   0.4000      0.1      0.1
## Detection Prevalence   0.3000   0.5000      0.1      0.1
## Balanced Accuracy      0.8750   0.9167      1.0      1.0

Predictive performance of using “Groupe” as a factor

## Confusion Matrix and Statistics
## 
##    
##     2 3 0 1
##   2 3 0 0 0
##   3 1 4 0 0
##   0 0 0 1 0
##   1 0 0 0 1
## 
## Overall Statistics
##                                          
##                Accuracy : 0.9            
##                  95% CI : (0.555, 0.9975)
##     No Information Rate : 0.4            
##     P-Value [Acc > NIR] : 0.001678       
##                                          
##                   Kappa : 0.8485         
##                                          
##  Mcnemar's Test P-Value : NA             
## 
## Statistics by Class:
## 
##                      Class: 2 Class: 3 Class: 0 Class: 1
## Sensitivity            0.7500   1.0000      1.0      1.0
## Specificity            1.0000   0.8333      1.0      1.0
## Pos Pred Value         1.0000   0.8000      1.0      1.0
## Neg Pred Value         0.8571   1.0000      1.0      1.0
## Precision              1.0000   0.8000      1.0      1.0
## Recall                 0.7500   1.0000      1.0      1.0
## F1                     0.8571   0.8889      1.0      1.0
## Prevalence             0.4000   0.4000      0.1      0.1
## Detection Rate         0.3000   0.4000      0.1      0.1
## Detection Prevalence   0.3000   0.5000      0.1      0.1
## Balanced Accuracy      0.8750   0.9167      1.0      1.0

Using 60% of the sample for training and 40% as testing sample

## Confusion Matrix and Statistics
## 
##    
##     0 2 3 4
##   0 0 0 0 1
##   2 0 1 1 0
##   3 0 0 1 0
##   4 0 0 0 0
## 
## Overall Statistics
##                                           
##                Accuracy : 0.5             
##                  95% CI : (0.0676, 0.9324)
##     No Information Rate : 0.5             
##     P-Value [Acc > NIR] : 0.6875          
##                                           
##                   Kappa : 0.3333          
##                                           
##  Mcnemar's Test P-Value : NA              
## 
## Statistics by Class:
## 
##                      Class: 0 Class: 2 Class: 3 Class: 4
## Sensitivity                NA   1.0000   0.5000     0.00
## Specificity              0.75   0.6667   1.0000     1.00
## Pos Pred Value             NA   0.5000   1.0000      NaN
## Neg Pred Value             NA   1.0000   0.6667     0.75
## Precision                0.00   0.5000   1.0000       NA
## Recall                     NA   1.0000   0.5000     0.00
## F1                         NA   0.6667   0.6667       NA
## Prevalence               0.00   0.2500   0.5000     0.25
## Detection Rate           0.00   0.2500   0.2500     0.00
## Detection Prevalence     0.25   0.5000   0.2500     0.00
## Balanced Accuracy          NA   0.8333   0.7500     0.50

Accuracy after 100 iterations

## [1] 0.5224719

The median is 0.5.

Adding C

## Confusion Matrix and Statistics
## 
##    
##     0 2 3 4
##   0 0 0 0 1
##   2 0 0 2 0
##   3 0 0 1 0
##   4 0 0 0 0
## 
## Overall Statistics
##                                           
##                Accuracy : 0.25            
##                  95% CI : (0.0063, 0.8059)
##     No Information Rate : 0.75            
##     P-Value [Acc > NIR] : 0.9961          
##                                           
##                   Kappa : 0.0769          
##                                           
##  Mcnemar's Test P-Value : NA              
## 
## Statistics by Class:
## 
##                      Class: 0 Class: 2 Class: 3 Class: 4
## Sensitivity                NA       NA   0.3333     0.00
## Specificity              0.75      0.5   1.0000     1.00
## Pos Pred Value             NA       NA   1.0000      NaN
## Neg Pred Value             NA       NA   0.3333     0.75
## Precision                0.00      0.0   1.0000       NA
## Recall                     NA       NA   0.3333     0.00
## F1                         NA       NA   0.5000       NA
## Prevalence               0.00      0.0   0.7500     0.25
## Detection Rate           0.00      0.0   0.2500     0.00
## Detection Prevalence     0.25      0.5   0.2500     0.00
## Balanced Accuracy          NA       NA   0.6667     0.50

Accuracy after 100 iterations

## [1] 0.5196629

The median is 0.5.