1 Partea generală

2 Partea specială

2.1 Introducere

2.1.1 Obiective

2.2 Material și metode

2.2.1 Analiza statistică a datelor

Pentru variabilele calitative, am folosit pie-uri sau bar-chart-uri și am calculat frecvențele absolute și relative ale categoriilor formate. Pentru a descrie relațiile dintre variabilele calitative am folosit testele Fisher și Odds-Ratio (OR) cu IC95% sau Chi² și Cramer V. Am prezentat grafic rezultatele sub forma unor bar-chart-uri.

Pentru a studia relațiile dintre variabilele cantitative și cele binare, am folosit testul Mann-Whitney (MW). Am prezentat valorile p generate de aceste teste precum și mediile ±DS ale grupurilor și diferența mediilor cu IC95% asociat. Pentru a descrie relațiile dintre variabilele calitative am folosit testul Chi² sau Fisher și indicatorii Cramer V și Odds-Ratio (OR) cu IC95%. Am prezentat grafic rezultatele sub forma unor bar-chart-uri.

Pentru a studia relațiile dintre variabilele cantitative am folosit coeficientul de corelație Spearman (R), cu valoarea p asociata și am prezentat grafic relațiile sub forma unor scatter-plot-uri pe care am adăugat linia de regresie.

Am folosit WPS Office 2019 pentru managementul bazei de date. Pentru toate analizele statistice și graficele ulterioare am folosit R version 4.0.0 (2020-04-24) [1]. Am considerat p < 0.05 ca fiind semnificativ statistic și p < 0.1 ca prezentând doar o tendință spre semnificativitate statistică.

2.3 Rezultate

-distributia pe: - varsta materna (21-46 ani)-din 5 in 5 ani; -greutate: <60kg, 60-70kg, >70kg; -varsta gestationala la care s-a efectuat NIPT: -t1:1-13 SA si t2: 14-28 SA; -fractie fetala (%); -? in functie de testele facute: DT, TT, DT+TT, NIPT, Amniocenteza;

2.3.1 Distribuții

Tabel 1: Descrierea eșantionului.

Variabila

Detalii

Total

N=

324

Vârsta maternă (ani)

M (min:max)

34 (21:46)

μ ±DS

33.74 ±4.53

Vârsta maternă

<35 ani

183 (56.5%)

≥35 ani

141 (43.5%)

Greutate maternă (kg)

M (min:max)

60 (34:91)

μ ±DS

61.38 ±9.57

Greutate maternă

<60kg

129 (39.8%)

60-70kg

95 (29.3%)

>70kg

100 (30.9%)

Vârsta gestațională (săptămâni)

M (min:max)

12.71 (10:21)

μ ±DS

13.26 ±2.21

Vârsta gestațională

T1

77 (23.8%)

T2

43 (13.3%)

(date nedisponibile)

204 (63.0%)

Fracția de ADN fetal

M (min:max)

9.62 (0:31.3)

μ ±DS

9.97 ±3.93

NIPT

risc crescut

3 (0.9%)

risc scăzut

313 (96.6%)

neconcludent

8 (2.5%)

Sex

F

168 (51.9%)

M

143 (44.1%)

neconcludent

10 (3.1%)

(date nedisponibile)

3 (0.9%)

DT

risc crescut

14 (4.3%)

risc scăzut

71 (21.9%)

(date nedisponibile)

239 (73.8%)

TT

risc crescut

1 (0.3%)

risc scăzut

13 (4.0%)

(date nedisponibile)

310 (95.7%)

DT+TT

risc crescut

15 (4.6%)

risc scăzut

79 (24.4%)

(date nedisponibile)

230 (71.0%)

Amniocenteză

sdr. Down

4 (1.2%)

fară anomalii cromozomiale

5 (1.5%)

(date nedisponibile)

315 (97.2%)

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max);

Tabel 2: Descrierea eșantionului.

Variabila

Detalii

Total

N=

324

Vârsta maternă (ani)

M (min:max)

34 (21:46)

μ ±DS

33.74 ±4.53

Vârsta maternă

<35 ani

183 (56.5%)

≥35 ani

141 (43.5%)

Greutate maternă (kg)

M (min:max)

60 (34:91)

μ ±DS

61.38 ±9.57

Greutate maternă

<60kg

129 (39.8%)

60-70kg

95 (29.3%)

>70kg

100 (30.9%)

Vârsta gestațională (săptămâni)

M (min:max)

12.71 (10:21)

μ ±DS

13.26 ±2.21

Vârsta gestațională

T1

77 (64.2%)

T2

43 (35.8%)

Fracția de ADN fetal

M (min:max)

9.62 (0:31.3)

μ ±DS

9.97 ±3.93

NIPT

risc crescut

3 (0.9%)

risc scăzut

313 (96.6%)

neconcludent

8 (2.5%)

Sex

F

168 (52.3%)

M

143 (44.5%)

neconcludent

10 (3.1%)

DT

risc crescut

14 (16.5%)

risc scăzut

71 (83.5%)

TT

risc crescut

1 (7.1%)

risc scăzut

13 (92.9%)

DT+TT

risc crescut

15 (16.0%)

risc scăzut

79 (84.0%)

Amniocenteză

sdr. Down

4 (44.4%)

fară anomalii cromozomiale

5 (55.6%)

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max);

2.3.2 Corel1

varsta materna, greutate, varsta gestationala, sex fetal -> fractia de ADN fetal;

Subset

N

Mean ±SD

Med (min:max)

Geometric mean, SD

Fracția de ADN fetal (Shapiro-Wilk normality test: p<0.001)

(total)

324 (100.0%)

9.973 ±3.93

9.62 (0.00:31.3)

8.76, 2.13

Sex (Kruskal-Wallis rank sum test: p<0.001)

F

168 (52.3%)

10.348 ±3.64

9.77 (3.58:31.3)

9.87, 1.41

M

143 (44.5%)

9.985 ±3.80

9.63 (0.00:25.7)

9.04, 1.90

neconcludent

10 (3.1%)

2.431 ±2.99

1.00 (0.00:8.1)

0.67, 7.65

Vârsta maternă (ani) (Spearman's rank correlation rho: R=0.030, p=0.598)

(total)

319 (98.5%)

33.737 ±4.53

34.00 (21.00:46.0)

33.53, 1.15

Vârsta maternă (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.494)

<35 ani

183 (56.5%)

9.740 ±3.45

9.63 (0.00:20.7)

8.76, 1.97

≥35 ani

141 (43.5%)

10.275 ±4.47

9.59 (0.00:31.3)

8.76, 2.33

Greutate maternă (kg) (Spearman's rank correlation rho: R=-0.634, p<0.001)

(total)

260 (80.2%)

61.385 ±9.57

60.00 (34.00:91.0)

60.78, 1.16

Greutate maternă (Kruskal-Wallis rank sum test: p<0.001)

<60kg

129 (39.8%)

11.681 ±4.43

11.52 (0.00:31.3)

9.98, 2.42

60-70kg

95 (29.3%)

8.509 ±2.81

8.53 (0.00:17.6)

7.67, 2.03

>70kg

100 (30.9%)

9.161 ±3.30

8.95 (0.00:17.3)

8.40, 1.78

Vârsta gestațională (săptămâni) (Spearman's rank correlation rho: R=-0.160, p=0.082)

(total)

120 (37.0%)

13.260 ±2.21

12.71 (10.00:21.0)

13.19, 1.17

Vârsta gestațională (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.355)

T1

77 (64.2%)

10.560 ±4.11

10.20 (0.00:31.3)

9.61, 1.87

T2

43 (35.8%)

10.080 ±4.20

9.21 (3.58:25.3)

9.42, 1.50

NIPT neconcludent (0) -> VG; G materna;

Variabila

Detalii

risc crescut

risc scăzut

neconcludent

Total

Teste statistice

NIPT

3 (0.9%)

313 (96.6%)

8 (2.5%)

324

Vârsta maternă (ani)

M (min:max)

37 (35:38)

34 (21:46)

32 (26:42)

34 (21:46)

KW: p=0.335

μ ±DS

36.67 ±1.53

33.73 ±4.51

32.75 ±5.68

33.74 ±4.53

Vârsta maternă

<35 ani

0

178 (56.9%)

5 (62.5%)

183 (56.5%)

V=0.11 (p=0.133)

≥35 ani

3 (100%)

135 (43.1%)

3 (37.5%)

141 (43.5%)

Greutate maternă (kg)

M (min:max)

69.5 (58:81)

59.5 (34:91)

62 (58:73)

60 (34:91)

KW: p=0.248

μ ±DS

69.50 ±16.3

61.23 ±9.6

64.25 ±6.69

61.38 ±9.57

Greutate maternă

<60kg

1 (33.3%)

125 (39.9%)

3 (37.5%)

129 (39.8%)

V=0.06 (p=0.654)

60-70kg

0

92 (29.4%)

3 (37.5%)

95 (29.3%)

>70kg

2 (66.7%)

96 (30.7%)

2 (25.0%)

100 (30.9%)

Vârsta gestațională (săptămâni)

M (min:max)

12.57 (10:21)

13.71 (13.71:13.71)

12.71 (10:21)

MW: p=0.729

μ ±DS

13.26 ±2.22

13.71 ±NA

13.26 ±2.21

Vârsta gestațională

T1

0 (NA)

76 (63.9%)

1 (100%)

77 (64.2%)

V=0.07 (p=0.453)

T2

0 (NA)

43 (36.1%)

0

43 (35.8%)

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; Welch = Test T Welch (fără presupunerea de varianțe egale); OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramér V (p calculat prin testul Chi²);

Variabila

Detalii

neconcludent

concludent

Total

Teste statistice

NIPT

8 (2.5%)

316 (97.5%)

324

Vârsta maternă (ani)

M (min:max)

32 (26:42)

34 (21:46)

34 (21:46)

MW: p=0.515

μ ±DS

32.75 ±5.68

33.76 ±4.5

33.74 ±4.53

Vârsta maternă

<35 ani

5 (62.5%)

178 (56.3%)

183 (56.5%)

OR=1.29 [0.30, 5.50] (p>0.999)

≥35 ani

3 (37.5%)

138 (43.7%)

141 (43.5%)

Greutate maternă (kg)

M (min:max)

62 (58:73)

59.5 (34:91)

60 (34:91)

MW: p=0.181

μ ±DS

64.25 ±6.69

61.29 ±9.65

61.38 ±9.57

Greutate maternă

<60kg

3 (37.5%)

126 (39.9%)

129 (39.8%)

V=0.03 (p=0.865)

60-70kg

3 (37.5%)

92 (29.1%)

95 (29.3%)

>70kg

2 (25.0%)

98 (31.0%)

100 (30.9%)

Vârsta gestațională (săptămâni)

M (min:max)

13.71 (13.71:13.71)

12.57 (10:21)

12.71 (10:21)

MW: p=0.729

μ ±DS

13.71 ±NA

13.26 ±2.22

13.26 ±2.21

Vârsta gestațională

T1

1 (100%)

76 (63.9%)

77 (64.2%)

OR=1.71 [0.07, 42.79] (p>0.999)

T2

0

43 (36.1%)

43 (35.8%)

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; Welch = Test T Welch (fără presupunerea de varianțe egale); OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramér V (p calculat prin testul Chi²);

2.3.3 Amnio 1

VM>35 ani si S. Down ( Amnio=2);

-Cum este fractia de ADN fetal la cei cu S. Down (amnio=2) in comparatie cu cea a celor care nu au patologie cromozomiala (amnio=1);

vs. Vârsta maternă

Amniocenteză

≥35 ani

<35 ani

(total)

sdr. Down

4 (100% / 66.7%)

0

4 (44.4%)

fară anomalii cromozomiale

2 (40.0% / 33.3%)

3 (60.0% / 100%)

5 (55.6%)

(total)

141 (43.5%)

183 (56.5%)

9 (100%)

OR=12.60 [0.45, 356.37], phi=0.63 (p=0.167)

Variabila

Detalii

sdr. Down

fară anomalii cromozomiale

Total

Teste statistice

Amniocenteză

4 (44.4%)

5 (55.6%)

9

Vârsta maternă

≥35 ani

4 (100%)

2 (40.0%)

6 (66.7%)

OR=12.60 [0.45, 356.37] (p=0.167)

<35 ani

0

3 (60.0%)

3 (33.3%)

Vârsta maternă (ani)

M (min:max)

36 (35:38)

34 (28:36)

34 (21:46)

MW: p=0.104

μ ±DS

36.25 ±1.5

33.40 ±3.13

33.74 ±4.53

Fracția de ADN fetal

M (min:max)

8.75 (3.58:11.77)

11.52 (7.78:25.32)

9.62 (0:31.3)

MW: p=0.286

μ ±DS

8.21 ±3.51

13.12 ±7.18

9.97 ±3.93

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; Welch = Test T Welch (fără presupunerea de varianțe egale); OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramér V (p calculat prin testul Chi²);

2.3.4 Amnio 2

-NIPT->Amniocenteza; -DT->Amniocenteza; -TT->Amniocenteza; -DT+TT-> Amniocenteza;

Variabila

Detalii

sdr. Down

fară anomalii cromozomiale

Total

Teste statistice

Amniocenteză

4 (44.4%)

5 (55.6%)

9

DT

risc crescut

1 (25.0%)

4 (100%)

5 (62.5%)

OR=0.05 [0.00, 1.56] (p=0.143)

risc scăzut

3 (75.0%)

0

3 (37.5%)

TT

risc crescut

0 (NA)

1 (100%)

1 (100%)

OR=0.33 [0.00, 52.56] (p>0.999)

risc scăzut

0 (NA)

0

0

DT+TT

risc crescut

1 (25.0%)

5 (100%)

6 (66.7%)

OR=0.04 [0.00, 1.25] (p=0.048)

risc scăzut

3 (75.0%)

0

3 (33.3%)

NIPT

risc crescut

3 (75.0%)

0

3 (33.3%)

V=0.79 (p=0.018)

risc scăzut

1 (25.0%)

5 (100%)

6 (66.7%)

neconcludent

0

0

0

NIPT

neconcludent

0

0

0

OR=1.22 [0.02, 74.72] (p>0.999)

concludent

4 (100%)

5 (100%)

9 (100%)

μ ±DS = Media (deviația standard); M (min:max) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; Welch = Test T Welch (fără presupunerea de varianțe egale); OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramér V (p calculat prin testul Chi²);

2.3.5 Speciale 1

-Cate paciente cu risc crescut la DT/TT (=2) au renuntat sa faca amnio pt ca NIPT a estimat un risc scazut (=1);

Toate pacientele cu DT/TT: risc crescut (n=15/94) au NIPT: risc scazut. Dintre acestea, 6 au facut amniocenteza, dintre care 1 a avut un copil cu s. Down.

2.4 Discuții

2.5 Concluzie

3 Bibliografie

  1. R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL https://www.R-project.org/.

.