Análisis de datos sobre la epidemia COVID-19 en Chile

Incorpora datos oficiales de Chile hasta las 21 hrs. del dia 30 abr. 2020

Grupo DataCovid - Departamento de Salud Pública UC

Grupo DataCovid - Departamento de Salud Pública UC

Autores

• Paula Margozzini, Médico Especialista en Salud Pública, Magister en Salud Pública

• Alvaro Passi-Solar, Magister en Epidemiología, PhD(c) Epidemiology & Public Health UCL

• Paola Viviani, PhD en Bioestadística

• Luis Villarroel, PhD. en Bioestadística

• Jaime Cerda, Médico Especialista en Salud Pública, Magister en Epidemiología

• Oslando Padilla, Bioestadístico

• Paula Bedregal, Médico Especialista en Salud Pública, PhD. en Psicología

• Sandra Cortés, PhD. en Salud Pública

Grupo de Colaboradores

• Cristina Vidal, Médico residente

• Catalina Poblete, Médico residente

Citar como

Paula Margozzini, Alvaro Passi-Solar, Paola Viviani, Luis Villarroel, Jaime Cerda, Oslando Padilla, Paula Bedregal, Sandra Cortés. (2020). “Análisis de datos DataCovidDSP UC.” Retrieved 2 de mayo de 2020, 2020, from https://rpubs.com/DataCovid/UC_DSP

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Información internacional: Organización Mundial de la Salud (OMS)

https://who.sprinklr.com/

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Fuentes oficiales de información de Chile

• Ministerio de Salud

• Gobierno de Chile, Plan nacional Coronavirus

• Ministerio de Ciencia, Tecnología, Conocimiento e Innovación (casos por región entre el 2 y el 26 de marzo)

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Figura 1: Casos confirmados COVID-19 (test PCR +): casos diarios nuevos y acumulados según cambios en definición de caso sospechoso. Chile 02 mar.-30 abr. 2020

Actualizaciones de definición de caso sospechoso para vigilancia epidemiológica ante brote de COVID-19:

• Ordinario B51 Nº 656 (02/03/2020)

• Ordinario B51 Nº748 (06/03/2020)

• Ordinario B51 N°895 (18/03/2020)

• Ordinario B51 N°933 (23/03/2020)

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Figura 2: Tasa acumulada (x 100.000 habitantes) de casos confirmados con PCR COVID-19 según región. Chile 02 mar.-30 abr. 2020

Ver animación de la progresión de la epidemia regional en el tiempo

Actualizaciones de definición de caso sospechoso para vigilancia epidemiológica ante brote de COVID-19:

• Ordinario B51 Nº 656 (02/03/2020)

• Ordinario B51 Nº748 (06/03/2020)

• Ordinario B51 N°895 (18/03/2020)

• Ordinario B51 N°933 (23/03/2020)

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Figura 3: Tasa acumulada de casos confirmados COVID-19 (x 100.000 habitantes) según fecha, edad y sexo. Chile 23 mar.-27 abr. 2020

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Figura 4: Comparación entre la distribución (%) acumulada de casos confirmados COVID-19 y la distribución poblacional chilena según región. Chile 03 mar-30 abr. 2020 (n=17008)

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Figura 5: Distribución (%) acumulada de casos confirmados COVID-19 según fecha, edad y sexo. Chile 23 mar.-27 abr. 2020

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Figura 6: Mediana de edad de casos acumulados confirmados con PCR COVID-19 según fecha. Chile 10 mar.-27 abr. 2020

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Figura 7: Distribución (%) diaria de casos acumulados confirmados con PCR COVID-19 en activos, recuperados y fallecidos. Chile 31 mar.-30 abr. 2020

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Figura 8: Distribución (%) de casos confirmados COVID-19 según factor de exposición y fecha. Chile 27 mar.-14 abr. 2020

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Figura 9: Distribución (%) de casos confirmados COVID-19 según sintomatología reportada y fecha. Chile 27 mar.-11 abr. 2020

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Figura 10: N° diario de exámenes PCR COVID-19 notificados (nuevos y acumulados). Chile 23 mar.-30 abr. 2020

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Figura 11: N° de exámenes PCR COVID-19 diarios acumulados según tipo de laboratorio. Chile 27 mar.-30 abr. 2020

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Figura 12: Distribución (%) de la notificación de exámenes PCR COVID-19 acumulados según fecha y laboratorio. Chile 26 mar-30 abr. 2020

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Figura 13: Distribución (%) de exámenes PCR COVID-19 nuevos según laboratorio y día. Chile 26 mar-30 abr. 2020

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Figura 14: Positividad (%) del total de exámenes PCR COVID-19. Chile 23 mar.-30 abr. 2020

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Figura 15: Positividad (%) de exámenes nuevos PCR COVID-19 notificados por región y semana. Chile 06 abr.-26 abr. 2020

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Figura 16: Promedio de exámenes nuevos diarios PCR COVID-19 (x 100.000 habitantes) según región y semana. Chile 19 abr.-25 abr. 2020

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Figura 17: N° diario de casos confirmados acumulados hospitalizados por COVID-19. Chile 23 mar.-27 abr. 2020

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Figura 18: Distribución (%) acumulada de casos confirmados COVID-19 hospitalizados según fecha, edad y sexo. Chile 23 mar.-20 abr. 2020

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Figura 19: Tasa acumulada de casos confirmados COVID-19 hospitalizados (x 100.000 habitantes) según fecha, edad y sexo. Chile 23 mar.-20 abr. 2020

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Figura 20: Comparación entre las distribuciones (%) de casos acumulados confirmados COVID-19 hospitalizados en UCI y de casos confirmados según región. Chile 30 abr. 2020 (n=428)

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Figura 21: Distribución (%) por gravedad de pacientes hospitalizados por COVID-19. Chile 15 abr.-30 abr. 2020

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Figura 22: Número de camas UCI ocupadas diariamente por casos confirmados COVID-19 según fecha y región. Chile 28 mar.-30 abr. 2020

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Figura 23: Camas UCI ocupadas (x 100.000 habitantes) con pacientes COVID-19 según día y región. Chile 28 mar.-30 abr. 2020

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Figura 24: Número acumulado de pacientes COVID -19 fallecidos según fecha. Chile 06 mar.-30 abr. 2020

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Figura 25: Número acumulado de pacientes COVID-19 fallecidos según región y fecha. Chile 29 mar.-30 abr. 2020

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Figura 26: Tasa acumulada de mortalidad por COVID-19 (x 100.000 habitantes) según región y fecha. Chile 29 mar.-30 abr. 2020

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Figura 27: Distribución (%) acumulada de fallecidos por COVID-19 según edad y fecha. Chile 08 abr.-30 abr. 2020

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Figura 28: Tasa acumulada de mortalidad por COVID-19 (x 100.000 habitantes) según edad y fecha. Chile 08 abr.-30 abr. 2020

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Figura 29: Letalidad (%), calculada con desfase temporal de 0, 7 y 14 días, acumulada diaria de casos confirmados con PCR COVID-19. Chile 16 mar.-30 abr. 2020

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Figura 30: Evolución del Número reproductivo (Rt) de la epidemia COVID-19 por región. Chile 02 mar.-30 abr. 2020

Línea roja horizontal: Rt=1

Etiquetas: valores de Rt últimos 3 días

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Comparación internacional de países seleccionados

INDICADORES DE LOS SISTEMAS DE SALUD DISPONIBLES AL INICIO DE LA PANDEMIA COVID-19

País	Población total aprox	Población % ≥65 años (2018)	Mortalidad estandarizada x edad ECNT x100.000 (2016; OMS)	Prevalencia % IMC≥25 estandarizada x edad en ≥18 y años (OMS, 2016)	Número muertos último año disponible (2016, OECD)	Camas agudas x1.000 Hab	Médicos x1.000 Hab	Camas críticas x100.000 Hab
México	125328000	7.2	457.8	64.9	671194	1.4	2.4	3.3
Chile	19458000	11.2	379.6	63.1	104000	2	2.1	7.1
Corea del Sur	51470000	13.5	266.7	30.3	280827	7.1	2.3	10.6
China (Hubei)	58000000	9	542.4	32.3	9883469	6,51 (Wuhan)	2,55 (Hubei)	3,6 (todo China)
Reino Unido	66650000	18.2	342.4	63.7	597204	2.9	2.5	10.5
Italia	60360000	22.6	306.4	58.5	646048	2.6	3.2	8.6
España	46940000	19.2	297.4	61.6	410611	2.4	3	9.7
EEUU	327352000	15.8	417.9	67.9	2744248	2.4	2.6	25.8

• Datos camas, médicos, población y población 65 y más OECD (Dato más cercano 2017-2020)

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Comparación internacional de indicadores sobre la epidemia COVID-19 en países seleccionados al 28 de abril 2020

País	Primer caso notificado	Población total aprox	Número de test diagnósticos reportados (cerca 28 abril)	Tasa de testeo x1.000 (al 28 de abril)	Confirmados comunicados 28 de abril	Tasa de COVID confirmados acumulados x1.000	Días desde inicio pandemia (27/04/20)	Número de casos acumulados por días de observación	Muertos COVID 28 de abril	Tasa mortalidad x100.000	Tasa letalidad casos confirmados x100	Muertos acumulados /días observacion
Mexico	27-02-2020	125328000	62489	0.5	15529	0.1	60	258.8	1434	1.1	9.2	23.9
Chile	03-03-2020	19458000	166165	8.5	14365	0.7	55	261.2	207	1.1	1.4	3.8
Corea del Sur	08-01-2020	51470000	608514	11.8	10752	0.2	110	97.7	244	0.5	2.3	2.2
China (Hubei)	08-12-2019	58000000	s.dato	s.dato	68128	1.2	141	483.2	4512	7.8	6.6	32.0
Reino Unido	28-02-2020	66650000	763387	11.5	158354	2.4	59	2684.0	21745	32.6	13.7	368.6
Italia	31-01-2020	60360000	1274871	21.1	201505	3.3	87	2316.1	27359	45.3	13.6	314.5
España	31-01-2020	46940000	1035522	22.1	232128	4.9	87	2668.1	23822	50.7	10.3	273.8
EEUU	21-01-2020	327352000	5628374	17.2	1002498	3.1	97	10335.0	57266	17.5	5.7	590.4

Fuentes: Ourworldindata, Oxford University; COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU) *Dato español de número de test reportados, corresponde a 23/04. No se dispone de datos actualizados

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Medidas de Salud Pública implementadas en Chile para el control y mitigación de la epidemia COVID-19 durante el año 2020

• Diagnóstico, notificación y aislamiento obligatorio de casos positivos.
  
• Cuarentena individual obligatoria de contactos de casos positivos (incluye viajeros del extranjero).
• Vigilancia epidemiológica que retroalimenta las medidas de un plan nacional.
• Lavado de manos, higiene respiratoria y distancia social mayor a 1 metro con énfasis en proteger a población de alto riesgo.
• Medidas regulatorias nacionales para: favorecer teletrabajo, proteger trabajadores de mayor edad, restringir transporte nacional/internacional, cambiar modalidad de educación escolar y universitaria a online, no permitir aglomeraciones y eventos públicos o privados, obligatoriedad de uso de mascarilla en transporte u aglomeración.
• Medidas restrictivas locales o nacionales progresivas: aduana sanitaria, cordón sanitario, cuarentenas comunitarias totales mandatadas, cuarentena obligatoria para mayores de 80 años, restricción de visitas a población institucionalizada en hospitales, hogares y cárceles, prohibición de funcionamiento de comercio y trabajo no esencial, toques de queda.
• Aumento de la capacidad diagnóstica y hospitalaria del sistema de salud. Manejo centralizado de asignación de camas UCI y ventilación mecánica.
• Medidas económicas y de apoyo a población vulnerable para mitigar efectos no deseados de las intervenciones sanitarias.

Fuente: adaptado de información oficial disponible en gob.cl

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1. Comentario epidemiológico: Situación Rt, curso de epidemia

• Chile se encuentra cursando su novena semana de epidemia.

• A nivel nacional (en promedio), ha bajado su número reproductivo (Rt) significativamente, acercándose al valor 1 en la semana 8, sin embargo, comienza a subir nuevamente asociado al cambio de estrategia de testeo.

• Esto traduce que el conjunto de medidas implementadas han provocado contención y un importante enlentecimiento de la transmisión. En particular Rt a nivel nacional está muy influido por la situación en la RM.

• La epidemia muestra gran heterogeneidad y asincronía en el tiempo en el país, con diferentes situaciones y velocidades cambiantes en las diversas regiones. lo que sugiere que los Rt tanto nacional como regionales pueden volver a subir.

• En 9 de las 15 regiones se observa Rt inferior a 1.

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2. Comentario epidemiológico: Descripción de los casos confirmados

Hasta la fecha, el riesgo de tener PCR + es mayor en:

• El grupo de 30-44 años,seguido del grupo de 45-59 años.

• Hombres que en Mujeres (levemente mayor)

• Residir en Magallanes, Ñuble, Metropolitana, Araucanía y Arica y Parinacota (orden decreciente).

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3. Comentario epidemiológico: Descripción clínica casos confirmados

• Los síntomas más frecuentes en casos confirmados son: fiebre, cefalea, mialgia, tos y dificultad respiratoria.

• El reporte de fiebre tiende a disminuir en el transcurso de la epidemia de 60 a 40% lo que puede ser consistente con estrategia de aumento de oferta de testeo.

• Del total de casos confirmados acumulados hasta la fecha se ha hospitalizado el 12%. 42% hospitalizados en cama básica y 41% en UTI y UCI.

• Presentan más riesgo de hospitalización los hombres y la población mayor de 30 años.

• En niños, niñas y adolescentes el riesgo es similar para hombres y mujeres.

• Se ha recuperado 53% de los casos confirmados acumulados hasta la fecha.

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4. Comentario epidemiológico: Descripción de las personas fallecidas

• Respecto del total de la población chilena, la tasa de mortalidad acumulada actual es de 1.2 x100.000 habitantes. Mayor mortalidad se observó en Magallanes, seguido de Araucanía y Ñuble.

• Del total de casos confirmados acumulados la letalidad hasta la fecha es de 1,4%. Sin embargo al corregir datos la letalidad aumenta a 2,5% (desfase 14 días inicio síntomas).

• Se requiere ajustar por edad y sexo para hacer, adecuadamente, comparaciones entre regiones.

• Probabilidad de morir de personas mayores de 70 es 60 veces mayor que la de menores de 40 años.

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5. Comentario epidemiológico: Uso de servicios de diagnóstico con test R-PCR

• La tasa de testeo poblacional con PCR es alta en el contexto latinoamericano y similar a algunos países de OECD que cursan misma semana de evolución de la epidemia.
  

• Se evidencia aumento de la capacidad de testeo (desde 1 a 65 laboratorios), lo que ha mejorado la tasa de testeo, sin embargo existe heterogeneidad geográfica y preocupan tasas descendentes en Arica y Parinacota, Valparaíso y Magallanes.

• La positividad del exámenes, a nivel nacional, se estabilizó en un nivel relativamente bajo antes del cambio de estrategia de testeo. Posteriormente se eleva a 9%. La mayor positividad se encuentra en Magallanes, Arica y Parinacota y Antofagasta.

• Se requiere vigilar estos indicadores en población de alto riesgo y vulnerabilidad social.

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6. Comentario epidemiológico: Demanda potencial de servicios

• De persistir este curso lento y contenido, la demanda de hospitalización, en particular de UCI/UTI y ventilación mecánica por Covid puede estabilizarse. Sin embargo, la ocurrencia de brotes en población de mayor edad y comorbilidad puede hacer elevar esta demanda. Se sugiere vigilar casos nuevos de hospitalización (incidencia) por semana epidemiológica y estrato de edad.

• La demanda regional puede ser mitigada en ese escenario con la estrategia de administración centralizada de un sistema integrado de camas.

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7. Comentario epidemiológico: Proyecciones

• Las proyecciones futuras con base a la información actual deben ser cautelosas dado el nivel de incertidumbre en los parámetros a utilizar en el modelamiento y las permanentes nuevas evidencias científicas en una enfermedad nueva.

• Con la información actual, de mantenerse este curso, la estimación del tamaño de la infección comunitaria total a un año de iniciada la epidemia en Chile será bajo, muy lejano a los niveles de inmunidad de rebaño, esto hará persistir la potencialidad de nuevos brotes cada vez que ingresen casos importados.

• Se prevé una epidemia de curso largo con endemia estable a nivel nacional pero brotes sucesivos regionales/áreas geográficas delimitadas hasta la aparición de un tratamiento preventivo o vacuna.

• Se prevé que la mortalidad y letalidad pueden aumentar en la medida que se contagie población de mayor riesgo (bajo nivel socioeconómico, mayor edad, mayor comorbilidad), sin embargo, pudiera reducirse en la medida que se encuentren terapias para los casos más graves, lo que es posible dados los avances en estudios en Chile y en el mundo.

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8. Comentario epidemiológico: Comparación con el curso de la epidemia COVID-19 con países seleccionados

• Al comparar diversos indicadores, con otros países del mundo, Chile muestra un comportamiento nacional más parecido al curso de Corea del Sur.

• Tasa de testeo más baja que algunos países europeos y Corea del Sur, pero mucho mayor que México y otros países latinoamericanos.

• Tasa de confirmados se acerca a lo reportado por Wuhan primera fase, y es superior a Corea del Sur.

• La letalidad es la menor de los países comparados, pero la mortalidad es superior a Corea del Sur.

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9. Sugerencias a tomadores de decisión: ideas de mejoras simples en la entrega de información

• Concordamos en que comunicar la información georeferenciada de casos tiene dificultades legales por el resguardo de la confidencialidad y protección de pacientes y comunidades.

• Concordamos en que la entrega de información muy desagregada diaria a nivel comunal (con edad, sexo, nivel socioeconómico o afiliación previsional) generan inestabilidad en los datos lo que puede ser mal interpretado por la opinión pública generando alarma o falsa seguridad según sean los cambios.

• Sin embargo, confiamos en que todas estas variables de información más detallada a nivel local (al menos semanal), estén siendo incorporadas en la toma de decisiones por parte de la autoridad sanitaria.

• Se sugiere agregar data no confidencial y sencilla de incluir en reportes que podría iluminar la descripción general del curso de la epidemia hacia la opinión pública:

• Tasas nacionales y regionales de incidencia actual en mayores de 70 años por semana epidemiológica (monitoreo de una subpoblación de alto riesgo)

• Reportar por separado la positividad de exámenes realizados según laboratorio (publico, privado, ISP).

• Seguimiento de nuevos fallecidos e incidencia de hospitalización por semana epidemiológica en el subgrupo de 70 años o más.

• Descripticón de fallecidos según comorbilidad y sexo.

• Para comprender el estado del Sistema de Servicios de Salud: incluir el monitoreo de al menos un indicador no Covid (una condición sensible a la atención en APS, Hospital (camas ocupadas no COVID), urgencia (consultas no COVID).

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10. Sugerencias a tomadores de decisión: Enfrentamiento epidemiológico de la pandemia en Chile

1. Continuar con esfuerzos dirigidos a estrategias poblacionales (promoción de distancia social en toda la población) y de alto riesgo individual (testeo/aislamiento en casos positivos/contactos).

2. Mejorar la focalización de testeo y vigilancia específica:

• En poblaciones con mayor riesgo biomédico (vigilar incidencia en mayores de 70 años y población inscrita en APS pública con multimorbilidad),
• En poblaciones con vulnerabilidad social (población Institucionalizada y sus trabajadores).

3. Ampliar definición de caso sospechoso a sintomaticos leves y asintomaticos contactos estrechos de casos positivos y trabajadores de alto riesgo.

4. Realizar primera ola de estudios serológicos de inmunidad IgG:

• En muestras aleatorias de población: comenzar con población de escolares (para resolver nivel de infección y potencial transmisibilidad), población institucionalizada y su personal,

• Luego, población general en hogares estratificada por edad y sexo como línea de base. Esto último debiese también ser repetido en la próxima Encuesta Nacional de Salud.

5. Fortalecer vigilancia de salud pública en tiempo real de indicadores de salud No Covid (ACSC) e identificar áreas de mejora para contar en un futuro próximo con reforzamiento de esta función esencial.

6. Definición técnica de indicadores sanitarios que regularán las decisiones dinámicas sobre retorno a actividades presenciales y las medidas de seguridad que serán requisito para autorizarlas.

7. Fortalecer estrategia comunicacional nacional y local que promueva:

• Mayor demanda de test PCR particularmente en usuarios sector público de salud.

• Aislamiento centralizado en poblaciones cuya vulnerabilidad social no permite aislamiento seguro en hogar.

• Estimular la continuidad de la atención de salud de enfermos crónicos y su autocuidado.

8. Potenciar el impulso de Innovación digital, colaboración intersectorial y compromiso comunitario generado por la epidemia, para:

• Impulsar una mayor coordinación en el mundo de la salud en el trabajo (trabajadores y empleadores, mutuales).

• Impulsar un trabajo más colaborativo y coordinado con el mundo de las organizaciones sociales, en particular aquellas con bases territoriales, que pueden colaborar en las diversas estrategias de mitigación de la pandemia a nivel local.

• Impulsar la relevancia del cuidado integrados de enfermos crónicos estratificados por multimorbilidad, en particular, preparar dispositivos de atención coordinada para la etapa posterior a al epidemia.

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11. Sugerencias a personal de salud y prestadores de salud

Potentes medidas de Salud Pública están en manos de personal y prestadores de salud…

1. Detección de casos positivos y su aislamiento.

2. Aislamiento de contactos.

3. Licencias médicas a trabajadores que son casos positivos o contactos.

4. Realizar los registros que alimentan la VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA: esencial para la construcción de indicadores fidedignos que permiten ir tomando decisiones restrictivas progresivas a la población general (lo progresivo permite evaluar adherencia poblacional efectiva y equilibrar el impacto en las cadenas de distribución y abastecimiento).

5. Abogacía: muy importante estar alineados con el Plan Nacional y directrices institucionales.

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12. Sugerencias a población general

• Lavado de manos.

• Distancia social (1.5 metros).

• Usar codo o pañuelo al toser o estornudar.

• Uso de mascarilla (en transporte público o privado o en lugares cerrados con 10 personas o más).

• Respetar las cuarentenas, cordones y aduanas sanitarias y toques de queda.

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12. Sugerencias a población general

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