library(readr)
## Warning: package 'readr' was built under R version 3.6.3
library(readr)
#Mariela Camacho Chaparro - 164956 - ingenieria quimica 
# ESTADISTICA APLICADA
#ANALISIS DE DATOS COVID-19

#INTRODUCCION: con base a la informacion proporcionada se realizo el analis de 5 paises los caules en este caso son: (Belgium, Argentina, Bangladesh, Mexico y China) esto con el fin de encontrar el numero de ersonas contagiadas en cada uno de ellos asi como tambien el numero de recuperados y decesos 
#objetivo: el principal objetivo es que mediante esta aplicacion y una serie de datos determinar el numero de personas contagiadas

#Declaración de URL
url_conf <- "https://raw.githubusercontent.com/CSSEGISandData/COVID-19/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series/time_series_covid19_confirmed_global.csv"
url_decesos <-"https://raw.githubusercontent.com/CSSEGISandData/COVID-19/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series/time_series_covid19_deaths_global.csv"
url_recuperados <-"https://raw.githubusercontent.com/CSSEGISandData/COVID-19/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series/time_series_covid19_recovered_global.csv"

#Variables en marcos de datos (data frames)
datos_conf <- read.csv(url_conf)
datos_decesos <- read.csv(url_decesos)
datos_recuperados <- read.csv(url_recuperados)

#EDA Exploratory Data Analysis
class(datos_conf)
## [1] "data.frame"
dim(datos_conf)
## [1] 264  95
head(datos_conf)
##   Province.State      Country.Region      Lat     Long X1.22.20 X1.23.20
## 1                        Afghanistan  33.0000  65.0000        0        0
## 2                            Albania  41.1533  20.1683        0        0
## 3                            Algeria  28.0339   1.6596        0        0
## 4                            Andorra  42.5063   1.5218        0        0
## 5                             Angola -11.2027  17.8739        0        0
## 6                Antigua and Barbuda  17.0608 -61.7964        0        0
##   X1.24.20 X1.25.20 X1.26.20 X1.27.20 X1.28.20 X1.29.20 X1.30.20 X1.31.20
## 1        0        0        0        0        0        0        0        0
## 2        0        0        0        0        0        0        0        0
## 3        0        0        0        0        0        0        0        0
## 4        0        0        0        0        0        0        0        0
## 5        0        0        0        0        0        0        0        0
## 6        0        0        0        0        0        0        0        0
##   X2.1.20 X2.2.20 X2.3.20 X2.4.20 X2.5.20 X2.6.20 X2.7.20 X2.8.20 X2.9.20
## 1       0       0       0       0       0       0       0       0       0
## 2       0       0       0       0       0       0       0       0       0
## 3       0       0       0       0       0       0       0       0       0
## 4       0       0       0       0       0       0       0       0       0
## 5       0       0       0       0       0       0       0       0       0
## 6       0       0       0       0       0       0       0       0       0
##   X2.10.20 X2.11.20 X2.12.20 X2.13.20 X2.14.20 X2.15.20 X2.16.20 X2.17.20
## 1        0        0        0        0        0        0        0        0
## 2        0        0        0        0        0        0        0        0
## 3        0        0        0        0        0        0        0        0
## 4        0        0        0        0        0        0        0        0
## 5        0        0        0        0        0        0        0        0
## 6        0        0        0        0        0        0        0        0
##   X2.18.20 X2.19.20 X2.20.20 X2.21.20 X2.22.20 X2.23.20 X2.24.20 X2.25.20
## 1        0        0        0        0        0        0        1        1
## 2        0        0        0        0        0        0        0        0
## 3        0        0        0        0        0        0        0        1
## 4        0        0        0        0        0        0        0        0
## 5        0        0        0        0        0        0        0        0
## 6        0        0        0        0        0        0        0        0
##   X2.26.20 X2.27.20 X2.28.20 X2.29.20 X3.1.20 X3.2.20 X3.3.20 X3.4.20 X3.5.20
## 1        1        1        1        1       1       1       1       1       1
## 2        0        0        0        0       0       0       0       0       0
## 3        1        1        1        1       1       3       5      12      12
## 4        0        0        0        0       0       1       1       1       1
## 5        0        0        0        0       0       0       0       0       0
## 6        0        0        0        0       0       0       0       0       0
##   X3.6.20 X3.7.20 X3.8.20 X3.9.20 X3.10.20 X3.11.20 X3.12.20 X3.13.20 X3.14.20
## 1       1       1       4       4        5        7        7        7       11
## 2       0       0       0       2       10       12       23       33       38
## 3      17      17      19      20       20       20       24       26       37
## 4       1       1       1       1        1        1        1        1        1
## 5       0       0       0       0        0        0        0        0        0
## 6       0       0       0       0        0        0        0        1        1
##   X3.15.20 X3.16.20 X3.17.20 X3.18.20 X3.19.20 X3.20.20 X3.21.20 X3.22.20
## 1       16       21       22       22       22       24       24       40
## 2       42       51       55       59       64       70       76       89
## 3       48       54       60       74       87       90      139      201
## 4        1        2       39       39       53       75       88      113
## 5        0        0        0        0        0        1        2        2
## 6        1        1        1        1        1        1        1        1
##   X3.23.20 X3.24.20 X3.25.20 X3.26.20 X3.27.20 X3.28.20 X3.29.20 X3.30.20
## 1       40       74       84       94      110      110      120      170
## 2      104      123      146      174      186      197      212      223
## 3      230      264      302      367      409      454      511      584
## 4      133      164      188      224      267      308      334      370
## 5        3        3        3        4        4        5        7        7
## 6        3        3        3        7        7        7        7        7
##   X3.31.20 X4.1.20 X4.2.20 X4.3.20 X4.4.20 X4.5.20 X4.6.20 X4.7.20 X4.8.20
## 1      174     237     273     281     299     349     367     423     444
## 2      243     259     277     304     333     361     377     383     400
## 3      716     847     986    1171    1251    1320    1423    1468    1572
## 4      376     390     428     439     466     501     525     545     564
## 5        7       8       8       8      10      14      16      17      19
## 6        7       7       9      15      15      15      15      19      19
##   X4.9.20 X4.10.20 X4.11.20 X4.12.20 X4.13.20 X4.14.20 X4.15.20 X4.16.20
## 1     484      521      555      607      665      714      784      840
## 2     409      416      433      446      467      475      494      518
## 3    1666     1761     1825     1914     1983     2070     2160     2268
## 4     583      601      601      638      646      659      673      673
## 5      19       19       19       19       19       19       19       19
## 6      19       19       21       21       23       23       23       23
##   X4.17.20 X4.18.20 X4.19.20 X4.20.20 X4.21.20
## 1      906      933      996     1026     1092
## 2      539      548      562      584      609
## 3     2418     2534     2629     2718     2811
## 4      696      704      713      717      717
## 5       19       24       24       24       24
## 6       23       23       23       23       23
names(datos_conf)
##  [1] "Province.State" "Country.Region" "Lat"            "Long"          
##  [5] "X1.22.20"       "X1.23.20"       "X1.24.20"       "X1.25.20"      
##  [9] "X1.26.20"       "X1.27.20"       "X1.28.20"       "X1.29.20"      
## [13] "X1.30.20"       "X1.31.20"       "X2.1.20"        "X2.2.20"       
## [17] "X2.3.20"        "X2.4.20"        "X2.5.20"        "X2.6.20"       
## [21] "X2.7.20"        "X2.8.20"        "X2.9.20"        "X2.10.20"      
## [25] "X2.11.20"       "X2.12.20"       "X2.13.20"       "X2.14.20"      
## [29] "X2.15.20"       "X2.16.20"       "X2.17.20"       "X2.18.20"      
## [33] "X2.19.20"       "X2.20.20"       "X2.21.20"       "X2.22.20"      
## [37] "X2.23.20"       "X2.24.20"       "X2.25.20"       "X2.26.20"      
## [41] "X2.27.20"       "X2.28.20"       "X2.29.20"       "X3.1.20"       
## [45] "X3.2.20"        "X3.3.20"        "X3.4.20"        "X3.5.20"       
## [49] "X3.6.20"        "X3.7.20"        "X3.8.20"        "X3.9.20"       
## [53] "X3.10.20"       "X3.11.20"       "X3.12.20"       "X3.13.20"      
## [57] "X3.14.20"       "X3.15.20"       "X3.16.20"       "X3.17.20"      
## [61] "X3.18.20"       "X3.19.20"       "X3.20.20"       "X3.21.20"      
## [65] "X3.22.20"       "X3.23.20"       "X3.24.20"       "X3.25.20"      
## [69] "X3.26.20"       "X3.27.20"       "X3.28.20"       "X3.29.20"      
## [73] "X3.30.20"       "X3.31.20"       "X4.1.20"        "X4.2.20"       
## [77] "X4.3.20"        "X4.4.20"        "X4.5.20"        "X4.6.20"       
## [81] "X4.7.20"        "X4.8.20"        "X4.9.20"        "X4.10.20"      
## [85] "X4.11.20"       "X4.12.20"       "X4.13.20"       "X4.14.20"      
## [89] "X4.15.20"       "X4.16.20"       "X4.17.20"       "X4.18.20"      
## [93] "X4.19.20"       "X4.20.20"       "X4.21.20"
#Extracción de datos de países
# a continuacion se presentan los 5 paises, mostrando cada uno sus tres resultados
#PAÍS 1: BELGIUM / BÉLGICA
conf_belgium <-t(datos_conf[datos_conf$Country.Region=="Belgium" ,])
cat("Confirmados Belgium", conf_belgium[nrow(conf_belgium)], "\n")
## Confirmados Belgium 40956
decesos_belgium <-t(datos_decesos[datos_decesos$Country.Region=="Belgium" ,])
cat("Decesos Belgium", decesos_belgium[nrow(decesos_belgium)], "\n")
## Decesos Belgium 5998
recuperados_belgium <-t(datos_recuperados[datos_recuperados$Country.Region=="Belgium" ,])
cat("Recuperados Belgium", recuperados_belgium[nrow(recuperados_belgium)], "\n")
## Recuperados Belgium 9002
#PAÍS 2: ARGENTINA 
conf_Argentina<-t(datos_conf[datos_conf$Country.Region=="Argentina" ,])
cat("Confirmados ARGENTINA", conf_Argentina[nrow(conf_Argentina)], "\n")
## Confirmados ARGENTINA 3031
decesos_Argentina <-t(datos_decesos[datos_decesos$Country.Region=="Argentina" ,])
cat("Decesos Argentina", decesos_Argentina[nrow(decesos_Argentina)], "\n")
## Decesos Argentina 147
recuperados_Argentina <-t(datos_recuperados[datos_recuperados$Country.Region=="Argentina" ,])
cat("Recuperados Argentina", recuperados_Argentina[nrow(recuperados_Argentina)], "\n")
## Recuperados Argentina 840
#PAÍS 3: BANGLADESH
conf_Bangladesh<-t(datos_conf[datos_conf$Country.Region=="Bangladesh" ,])
cat("Confirmados Bangladesh", conf_Bangladesh[nrow(conf_Bangladesh)], "\n")
## Confirmados Bangladesh 3382
decesos_Bangladesh<-t(datos_decesos[datos_decesos$Country.Region=="Bangladesh" ,])
cat("Decesos Bangladesh", decesos_Bangladesh[nrow(decesos_Bangladesh)], "\n")
## Decesos Bangladesh 110
recuperados_Bangladesh<-t(datos_recuperados[datos_recuperados$Country.Region=="Bangladesh" ,])
cat("Recuperados Bangladesh", recuperados_Bangladesh[nrow(recuperados_Bangladesh)], "\n")
## Recuperados Bangladesh 87
#PAÍS 4: MEXICO / MÉXICO
conf_mexico<-t(datos_conf[datos_conf$Country.Region=="Mexico" ,])
cat("Confirmados México", conf_mexico[nrow(conf_mexico)], "\n")
## Confirmados México 8772
decesos_mexico<-t(datos_decesos[datos_decesos$Country.Region=="Mexico" ,])
cat("Decesos México", decesos_mexico[nrow(decesos_mexico)], "\n")
## Decesos México 712
recuperados_mexico<-t(datos_recuperados[datos_recuperados$Country.Region=="Mexico" ,])
cat("Recuperados México", recuperados_mexico[nrow(recuperados_mexico)], "\n")
## Recuperados México 2627
#PAÍS 5: BEIJING / CHINA
conf_China <-t(datos_conf[datos_conf$Country.Region=="China" ,])
cat("Confirmados China", conf_China[nrow(conf_China)], "\n")
## Confirmados China   991
decesos_China <-t(datos_decesos[datos_decesos$Country.Region=="China" ,])
cat("Decesos China", decesos_China[nrow(decesos_China)], "\n")
## Decesos China    6
recuperados_China <-t(datos_recuperados[datos_recuperados$Country.Region=="China" ,])
cat("Recuperados China", recuperados_China[nrow(recuperados_China)], "\n")
## Recuperados China   984