Cantidad de especies por familia

Usé un archivo con la lista de especies de plantas de Puerto Rico, extraído del sitio “Plantas de la Isla de Puerto Rico” (Gann GD, Trejo-Torres JC, Stocking CG (2015-2019) Plantas de la Isla de Puerto Rico / Plants of the Island of Puerto Rico. The Institute for Regional Conservation. Delray Beach, Florida, USA. https://regionalconservation.org/ircs/database/site/IntroPR.asp)

# datos del master
library(readxl)
familias <- read_excel("spppipr.xlsx", sheet = "Sheet1")

Tabla x familia

Cantidad de especies, de mayor a menor, por familia. (NOTA: hay familias de helechos, licopodiofitas y gimnospermas)

library(dplyr)
table(familias$familia) %>% 
        as.data.frame() %>% 
        arrange(desc(Freq))

Géneros por familia

Cantidad de géneros por familia. Incluye familias de monilofitas y gimnospermas.

library(dplyr)
generos <- familias %>%
  group_by(familia) %>%
  summarise(cantidad_gen = n_distinct(genero))
arrange(generos, desc(cantidad_gen))

Cantidad de especies por género en cada familia

library(tidyr)
especies <- familias %>% 
  group_by(familia) %>%
  count(genero)
arrange(especies, desc(n))