Análisis de casos

La serie de casos se hace hace partir de los 5 casos, para facilitar la comparación desde un punto de vista común. La serie de datos total tiene un patrón en 4 fases, las dos primeras de ascenso prácticamente exponencial (días 0 a 10, y 10 a 14), una también exponencial con menor tasa (14-20) y la actual, cun patrón de desaceleración constante que simila a una progresión lineal.

Sin embargo, sin observamos las curvas por regiones, podemos ver que el patrón exponencial se mantiene para Antofagasta, Arica y Parinacota, Coquimbo, Magallanes, Metropolitana, O’Higgins, Tarapacá y Valparaíso.

## `geom_smooth()` using method = 'loess' and formula 'y ~ x'

## `geom_smooth()` using method = 'loess' and formula 'y ~ x'

Si observamos la proporción de casos nuevos por región, observamos que Arica y Parinacota se encuentra en una fase de expansión muy brusca. En todas las otras regiones se encuentra el patrón esperado de disminución diaria de casos por día al menos en los últimos 3 días, con diversos niveles de avance.

En el gráfico FSDG, donde se observa la diferencia diaria en tasas, lo ideal que los valores se encuentran bajo 1, ya que indica que la tasa disminuye a un ritmo acelerado. Como se puede ver, las regiones con mayor tiempo con casos como la Metropolitana, Araucanía o Biobío tienden a una estabilización de la desaceleración de sus tasas, lo mismo que se observa a nivel total.

Predicción para serie total

A partir del análisis del resultado del algoritmo de la última semana, para la predicción total se recorta la serie a partir de lo 50 casos. La predicción del modelo T+AR(1) es bastante optimista con respecto a los otros dos modelos, prediciendo 6847 para 7 días más, vs 18339 del ARIMA(1,1,0).

Casos nuevos: tendencia + AR(1) : total
  dia casos li ls
25 36 5438 5300 5682
26 37 5720 5443 6236
27 38 5995 5576 6803
28 39 6240 5693 7317
29 40 6467 5800 7797
30 41 6668 5895 8223
31 42 6847 5979 8605
Exponencial : total
  dia casos li ls
25 36 10190 4586 22642
26 37 12198 5448 27312
27 38 14602 6469 32961
28 39 17479 7677 39798
29 40 20924 9107 48077
30 41 25047 10797 58104
31 42 29983 12796 70253
ARIMA(1,1,0) con deriva : total
  dia casos li ls
25 36 5951 4448 7961
26 37 7114 4410 11474
27 38 8575 4580 16054
28 39 10362 4888 21969
29 40 12532 5308 29590
30 41 15159 5833 39397
31 42 18339 6467 52004

Predicciones para serie total usando predicción por regiones.

Otro modelo posible de análisis es usar la suma de las predicciones parciales por región. No he calculado los intervalos de confianza, porque para que sean adecuados debería considerar la covarianza entre las series de las distintas regiones.

El modelo T+AR(1) en 7 días predice 6932 vs 6847 de la serie total, lo que indica la convergencia de los modelos de análisis.

dia tipo casos
1 observado 1
2 observado 3
3 observado 4
4 observado 5
5 observado 7
6 observado 10
7 observado 13
8 observado 17
9 observado 23
10 observado 33
11 observado 43
12 observado 61
13 observado 75
14 observado 156
15 observado 201
16 observado 342
17 observado 434
18 observado 537
19 observado 632
20 observado 746
21 observado 922
22 observado 1142
23 observado 1306
24 observado 1610
25 observado 1909
26 observado 2139
27 observado 2449
28 observado 2738
29 observado 3031
30 observado 3404
31 observado 3737
32 observado 4161
33 observado 4471
34 observado 4815
35 observado 5116
36 General: Exponencial 8569
37 General: Exponencial 10100
38 General: Exponencial 11923
39 General: Exponencial 14102
40 General: Exponencial 16716
41 General: Exponencial 19866
42 General: Exponencial 23682
36 General: ARIMA(1,1,0)+drift 5864
37 General: ARIMA(1,1,0)+drift 6843
38 General: ARIMA(1,1,0)+drift 8130
39 General: ARIMA(1,1,0)+drift 9725
40 General: ARIMA(1,1,0)+drift 11741
41 General: ARIMA(1,1,0)+drift 14233
42 General: ARIMA(1,1,0)+drift 17384
36 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 5422
37 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 5702
38 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 5974
39 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 6232
40 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 6478
41 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 6711
42 Casos nuevo: Tendencia + AR(1) 6932

Predicción por regiones

Hemos modificado el algoritmo para iniciar desde 3 casos en cada Región . Esto permite hacer que las predicciones se acerquen entre sí, siendo optimistas en T+AR(1), siendo bastante pesimistas para Aysén y Arica y Parinacota.

Las tablas por regiones se incluye en el Anexo I

Decesos

Si observamos la serie de decesos por Región, podemos observar que presentan un patrón muy particular, dependiendo de la zona. Destaca el número creciente y rápido de decesos en la Araucanía, así como el estancamiento de la Metropolitana en la primera etapa, para un aumento similar a la araucanía tras el segundo caso.

Fuentes de información: Principalmente, se utilizó el reporte diario del MINSAL, usando Wayback machine para recopilar la información ya no disponible.

Anexo I: Predicciones por región

Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Arica.y.Parinacota
  dia casos li ls
14 36 111.2 70.62 245.5
15 37 196.5 92.45 578.4
16 38 469.6 159.2 1696
17 39 1118 315.6 4383
18 40 3179 810.8 12960
19 41 9527 2334 39413
20 42 32145 7760 133695
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Tarapacá
  dia casos li ls
16 36 24.84 23.77 27.38
17 37 26.68 24.52 31.91
18 38 28.44 25.23 36.27
19 39 30.13 25.92 40.45
20 40 31.73 26.56 44.41
21 41 33.23 27.17 48.12
22 42 34.63 27.73 51.56
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Antofagasta
  dia casos li ls
20 36 74.54 70.02 99.18
21 37 77.36 70.48 116.5
22 38 80.88 71.04 138.4
23 39 83.97 71.54 157.7
24 40 87.04 72.03 176.9
25 41 89.93 72.49 195
26 42 92.67 72.93 212.1
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Atacama
  dia casos li ls
8 36 6.96 6.59 7.58
9 37 8.04 7.14 9.67
10 38 9.19 7.68 12.11
11 39 10.56 8.28 15.25
12 40 12.15 8.94 19.08
13 41 14.21 9.77 24.19
14 42 16.83 10.8 30.84
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Coquimbo
  dia casos li ls
20 36 54.09 52.37 63.72
21 37 55.84 52.68 73.72
22 38 57.48 52.97 83.02
23 39 58.96 53.23 91.46
24 40 60.3 53.46 99.06
25 41 61.48 53.67 105.8
26 42 62.52 53.85 111.7
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Valparaíso
  dia casos li ls
21 36 218.4 215.6 226.3
22 37 224.5 217.5 245.7
23 38 228 218.5 257.2
24 39 231 219.4 267.2
25 40 233 220.1 274
26 41 234.5 220.5 278.9
27 42 235.5 220.8 282.1
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Metropolitana
  dia casos li ls
29 29 2442 2389 2567
30 30 2524 2424 2759
31 31 2594 2454 2924
32 32 2653 2479 3064
33 33 2703 2500 3181
34 34 2744 2517 3277
35 35 2777 2531 3354
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : O’Higgins
  dia casos li ls
20 36 43.24 42.37 46.12
21 37 44.23 42.67 49.45
22 38 45.04 42.91 52.17
23 39 45.69 43.1 54.33
24 40 46.19 43.25 56.02
25 41 46.57 43.37 57.3
26 42 46.86 43.45 58.25
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Maule
  dia casos li ls
29 29 110.6 108.5 120.6
30 30 114.3 109.2 140.6
31 31 118.5 110 163.6
32 32 123 110.8 187.7
33 33 127.4 111.6 212
34 34 131.8 112.4 236.1
35 35 136.2 113.2 259.9
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Ñuble
  dia casos li ls
25 36 563.8 531.1 714.9
26 37 609.4 540.6 932.6
27 38 656.4 550.4 1157
28 39 705.1 560.6 1391
29 40 755.3 571.1 1631
30 41 806.7 581.8 1877
31 42 859.1 592.8 2128
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Biobío
  dia casos li ls
26 29 424.9 415.5 450.4
27 30 437.9 420.3 485.8
28 31 448.4 424.1 514.2
29 32 456.6 427.1 536.6
30 33 462.9 429.5 553.8
31 34 467.6 431.2 566.6
32 35 471.1 432.5 576
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Araucanía
  dia casos li ls
21 36 643.4 629 670
22 37 669 642.8 717.5
23 38 689.6 653.9 755.5
24 39 705.6 662.6 785.3
25 40 717.8 669.2 807.8
26 41 726.7 674 824.3
27 42 733.1 677.5 836.1
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Los.Ríos
  dia casos li ls
17 36 113.3 110.9 118.7
18 37 116.7 112.3 126.6
19 38 119.2 113.5 132.6
20 39 121.2 114.3 137
21 40 122.5 114.9 140.2
22 41 123.5 115.3 142.4
23 42 124.1 115.5 143.9
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Los.Lagos
  dia casos li ls
21 29 310.3 303.4 328
22 30 319.1 306.4 353.2
23 31 325.9 308.8 373.3
24 32 330.9 310.5 388.3
25 33 334.6 311.7 399.1
26 34 337.1 312.5 406.7
27 35 338.8 313.1 411.7
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Aysén
  dia casos li ls
8 36 8.49 8.05 9.1
9 37 10.39 9.31 11.99
10 38 13.62 11.39 17
11 39 19.04 14.84 25.52
12 40 29.97 21.75 42.79
13 41 53.31 36.49 79.74
14 42 110.6 72.66 170.6
Casos nuevos: tendencia + AR(1) : Magallanes
  dia casos li ls
19 36 273.8 247.2 398.1
20 37 304.7 253.4 551.9
21 38 338.2 260.1 719.5
22 39 372.2 266.9 889.4
23 40 406.7 273.8 1062
24 41 440.9 280.7 1233
25 42 474.6 287.4 1401
Exponencial : Arica.y.Parinacota
  dia casos li ls
14 36 46.91 21.45 102.6
15 37 59.76 26.7 133.8
16 38 76.14 33.14 174.9
17 39 97 41.05 229.2
18 40 123.6 50.76 300.9
19 41 157.4 62.65 395.7
20 42 200.6 77.2 521.2
Exponencial : Tarapacá
  dia casos li ls
16 36 27.36 21.69 34.5
17 37 31.39 24.76 39.8
18 38 36.02 28.24 45.93
19 39 41.32 32.2 53.03
20 40 47.41 36.7 61.26
21 41 54.4 41.81 70.79
22 42 62.42 47.61 81.84
Exponencial : Antofagasta
  dia casos li ls
20 36 94.59 70.71 126.5
21 37 107.5 80.02 144.4
22 38 122.2 90.52 164.9
23 39 138.9 102.4 188.4
24 40 157.8 115.7 215.2
25 41 179.4 130.8 246
26 42 203.9 147.8 281.2
Exponencial : Atacama
  dia casos li ls
8 36 6.91 4.18 11.41
9 37 7.72 4.47 13.33
10 38 8.62 4.75 15.66
11 39 9.63 5.02 18.47
12 40 10.76 5.29 21.86
13 41 12.02 5.57 25.94
14 42 13.42 5.84 30.84
Exponencial : Coquimbo
  dia casos li ls
20 36 84.31 49.66 143.2
21 37 98.88 57.78 169.2
22 38 116 67.19 200.2
23 39 136 78.09 236.9
24 40 159.5 90.7 280.5
25 41 187.1 105.3 332.3
26 42 219.4 122.2 393.9
Exponencial : Valparaíso
  dia casos li ls
21 36 454.7 203.6 1016
22 37 556.5 246.4 1257
23 38 681 298.1 1556
24 39 833.5 360.3 1928
25 40 1020 435.2 2391
26 41 1248 525.2 2968
27 42 1528 633.5 3685
Exponencial : Metropolitana
  dia casos li ls
29 29 6180 1926 19834
30 30 7500 2317 24269
31 31 9101 2788 29709
32 32 11043 3352 36387
33 33 13401 4028 44586
34 34 16261 4838 54657
35 35 19733 5809 67034
Exponencial : O’Higgins
  dia casos li ls
20 36 58.1 45.53 74.15
21 37 65.24 50.94 83.56
22 38 73.25 56.97 94.19
23 39 82.25 63.7 106.2
24 40 92.35 71.21 119.8
25 41 103.7 79.58 135.1
26 42 116.4 88.91 152.5
Exponencial : Maule
  dia casos li ls
29 29 149.2 111.5 199.7
30 30 168.1 125.3 225.4
31 31 189.4 140.9 254.5
32 32 213.3 158.4 287.4
33 33 240.3 178 324.5
34 34 270.7 200 366.5
35 35 305 224.7 414
Exponencial : Ñuble
  dia casos li ls
25 36 1046 360.9 3029
26 37 1262 431.1 3693
27 38 1523 514.7 4505
28 39 1838 614.1 5500
29 40 2218 732.2 6719
30 41 2677 872.5 8213
31 42 3231 1039 10045
Exponencial : Biobío
  dia casos li ls
26 29 1133 355.5 3613
27 30 1421 441.2 4577
28 31 1782 547.1 5801
29 32 2234 678.1 7358
30 33 2801 840 9339
31 34 3512 1040 11860
32 35 4403 1286 15070
Exponencial : Araucanía
  dia casos li ls
21 36 1405 544.1 3629
22 37 1769 676.2 4627
23 38 2227 839.5 5906
24 39 2803 1041 7544
25 40 3528 1290 9646
26 41 4441 1598 12344
27 42 5591 1977 15810
Exponencial : Los.Ríos
  dia casos li ls
17 36 214.2 95.62 479.9
18 37 264.2 116 601.7
19 38 325.8 140.5 755.5
20 39 401.8 169.9 950
21 40 495.5 205.3 1196
22 41 611.1 247.7 1508
23 42 753.6 298.5 1903
Exponencial : Los.Lagos
  dia casos li ls
21 29 501.2 351.7 714.4
22 30 594.7 415.3 851.6
23 31 705.5 490.1 1016
24 32 837.1 578.3 1212
25 33 993.1 682.2 1446
26 34 1178 804.4 1726
27 35 1398 948.2 2061
Exponencial : Aysén
  dia casos li ls
8 36 9.15 5.06 16.56
9 37 10.32 5.41 19.7
10 38 11.64 5.75 23.58
11 39 13.13 6.08 28.37
12 40 14.81 6.4 34.26
13 41 16.7 6.72 41.5
14 42 18.84 7.05 50.37
Exponencial : Magallanes
  dia casos li ls
19 36 475.1 289.3 780.1
20 37 620.3 374.7 1027
21 38 809.9 484.9 1353
22 39 1057 627.1 1783
23 40 1381 810.6 2351
24 41 1803 1047 3103
25 42 2353 1352 4097
ARIMA(1,1,0) con deriva : Arica.y.Parinacota
  dia casos li ls
14 36 67.34 38.7 117.2
15 37 85.66 40.32 182
16 38 109 43.76 271.4
17 39 138.6 48.64 395.1
18 40 176.3 54.91 566.3
19 41 224.3 62.68 802.7
20 42 285.3 72.16 1128
ARIMA(1,1,0) con deriva : Tarapacá
  dia casos li ls
16 36 26.18 21.12 32.46
17 37 29.69 22.24 39.62
18 38 33.68 23.77 47.71
19 39 38.2 25.63 56.94
20 40 43.33 27.79 67.56
21 41 49.15 30.26 79.82
22 42 55.75 33.06 94.02
ARIMA(1,1,0) con deriva : Antofagasta
  dia casos li ls
20 36 81.05 62.01 105.9
21 37 91.96 65.67 128.8
22 38 105.2 70.38 157.2
23 39 120.1 76.11 189.5
24 40 137.2 82.8 227.3
25 41 156.7 90.46 271.4
26 42 179 99.16 323
ARIMA(1,1,0) con deriva : Atacama
  dia casos li ls
8 36 6.61 4.32 10.11
9 37 7.49 4.47 12.53
10 38 8.4 4.55 15.53
11 39 9.46 4.73 18.9
12 40 10.64 4.95 22.85
13 41 11.97 5.22 27.44
14 42 13.46 5.52 32.8
ARIMA(1,1,0) con deriva : Coquimbo
  dia casos li ls
20 36 61.78 43.4 87.94
21 37 72.41 44.92 116.7
22 38 84.97 47.7 151.3
23 39 99.7 51.42 193.3
24 40 117 55.97 244.5
25 41 137.2 61.35 307.1
26 42 161 67.6 383.6
ARIMA(1,1,0) con deriva : Valparaíso
  dia casos li ls
21 36 261.1 172.3 395.6
22 37 321.5 174.5 592.2
23 38 396.2 185.5 846.1
24 39 488.2 202 1180
25 40 601.7 223.4 1620
26 41 741.5 249.7 2201
27 42 913.8 281.4 2967
ARIMA(1,1,0) con deriva : Metropolitana
  dia casos li ls
29 29 2718 1966 3758
30 30 3259 1885 5633
31 31 3958 1907 8216
32 32 4830 1994 11697
33 33 5904 2133 16344
34 34 7221 2316 22516
35 35 8835 2543 30687
ARIMA(1,1,0) con deriva : O’Higgins
  dia casos li ls
20 36 45.75 39.1 53.54
21 37 50.71 39.66 64.84
22 38 56.4 41.21 77.2
23 39 62.78 43.35 90.92
24 40 69.88 45.94 106.3
25 41 77.8 48.95 123.7
26 42 86.6 52.35 143.3
ARIMA(1,1,0) con deriva : Maule
  dia casos li ls
29 29 122.8 94.54 159.5
30 30 137.2 97.09 194
31 31 153.8 101.4 233.2
32 32 172.2 107 277.2
33 33 192.9 113.6 327.4
34 34 216 121.3 384.8
35 35 241.9 129.9 450.6
ARIMA(1,1,0) con deriva : Ñuble
  dia casos li ls
25 36 627.6 380.1 1036
26 37 768.8 349.4 1692
27 38 945.5 344.3 2597
28 39 1164 352.6 3841
29 40 1433 370.2 5547
30 41 1764 395.1 7878
31 42 2172 427.1 11048
ARIMA(1,1,0) con deriva : Biobío
  dia casos li ls
26 29 501.1 299.2 839.4
27 30 614.8 293.4 1288
28 31 754.2 303.5 1875
29 32 925.4 322.6 2654
30 33 1135 348.9 3694
31 34 1393 382 5079
32 35 1709 422.2 6919
ARIMA(1,1,0) con deriva : Araucanía
  dia casos li ls
21 36 691.5 562.9 849.4
22 37 802.5 532.2 1210
23 38 949.7 511 1765
24 39 1140 499.9 2600
25 40 1383 498.4 3836
26 41 1690 505.7 5644
27 42 2076 521.4 8265
ARIMA(1,1,0) con deriva : Los.Ríos
  dia casos li ls
17 36 125.3 92.44 169.9
18 37 150.4 87.63 258.3
19 38 184.3 87.46 388.5
20 39 228 90.55 574
21 40 283.2 96.23 833.7
22 41 352.6 104.2 1193
23 42 439.4 114.4 1688
ARIMA(1,1,0) con deriva : Los.Lagos
  dia casos li ls
21 29 356.5 291.1 436.6
22 30 414.8 319.5 538.7
23 31 484.9 354.7 663
24 32 566.3 396.6 808.7
25 33 661.5 445.6 982
26 34 772.6 502.4 1188
27 35 902.5 567.9 1434
ARIMA(1,1,0) con deriva : Aysén
  dia casos li ls
8 36 7.75 5.09 11.8
9 37 8.9 4.37 18.12
10 38 10.36 4.01 26.76
11 39 12.11 3.84 38.25
12 40 14.19 3.78 53.34
13 41 16.64 3.79 73.02
14 42 19.52 3.87 98.55
ARIMA(1,1,0) con deriva : Magallanes
  dia casos li ls
19 36 311 226.2 427.5
20 37 402.5 257 630.2
21 38 520.8 300.9 901.4
22 39 674 357.9 1269
23 40 872.3 429.9 1770
24 41 1129 520.1 2450
25 42 1461 632.7 3373