Modelo espacialmente explícito COVID19

Introducción

Este repositorio tiene los datos y códigos necesarios para generar el modelo espacialmente explicito para la propagación del COVID19 en chile, a continuación se describen los distintos archivos que hay en el repositorio.

Bases de datos

Comunas.rds

Simple feature obtenido de los archivos de la biblioteca nacional con los poligonos de cada comuna, mas la población de cada una de acuerdo al último censo

Regiones.rds

Simple feature obtenido de los archivos de la biblioteca nacional con los poligonos de cada Región, mas la población de cada una de acuerdo al último censo, el número de infectados al 19 de marzo y la prevalencia calculada según ambos valores

Viajes_Regiones.rds

data.frame con el numero de viajes promedio realizados entre regiones por día, sacado de un promedio de 21 días. El script para genererlo es MigracionRegion.R. A continuación vemos las primeras 20 entradas en una tabla.

origen destino n_personas
Región de Valparaíso Región Metropolitana de Santiago 27176.10
Región Metropolitana de Santiago Región de Valparaíso 26876.81
Región Metropolitana de Santiago Región del Libertador Bernardo O’Higgins 20039.00
Región del Libertador Bernardo O’Higgins Región Metropolitana de Santiago 19877.19
Región Metropolitana de Santiago Región de Atacama 13219.24
Región de Atacama Región Metropolitana de Santiago 11941.95
Región del Libertador Bernardo O’Higgins Región del Maule 10899.86
Región de Ñuble Región del Bío-Bío 10309.14
Región del Maule Región del Libertador Bernardo O’Higgins 10300.38
Región del Bío-Bío Región de Ñuble 9997.76
Región del Libertador Bernardo O’Higgins Región de Atacama 7452.90
Región de Atacama Región del Libertador Bernardo O’Higgins 7330.76
Región del Maule Región de Ñuble 6617.57
Región de Antofagasta Región de Atacama 6193.43
Región de Atacama Región de Antofagasta 6190.33
Región de Ñuble Región del Maule 6186.14
Región de Los Lagos Región de Los Ríos 5268.05
Región de Los Ríos Región de Los Lagos 5208.00
Región de La Araucanía Región del Bío-Bío 4908.90
Región del Bío-Bío Región de La Araucanía 4763.05

Modelos

Outputs

Lineas de tiempo de infección

Tablas con peaks de infección

Region Time Proporcion_Infectados
Región de Antofagasta 2020-05-23 0.40
Región de Arica y Parinacota 2020-06-19 0.40
Región de Atacama 2020-05-21 0.41
Región de Aysén del Gral.Ibañez del Campo 2020-06-05 0.40
Región de Coquimbo 2020-05-25 0.40
Región de La Araucanía 2020-05-21 0.40
Región de Los Lagos 2020-05-16 0.40
Región de Los Ríos 2020-06-10 0.40
Región de Magallanes y Antártica Chilena 2020-05-17 0.40
Región de Ñuble 2020-05-11 0.40
Región de Tarapacá 2020-06-11 0.40
Región de Valparaíso 2020-05-28 0.40
Región del Bío-Bío 2020-05-20 0.40
Región del Libertador Bernardo O’Higgins 2020-05-26 0.40
Región del Maule 2020-05-18 0.40
Región Metropolitana de Santiago 2020-05-13 0.40