Resumen: La planta presenta alteraciones fisiomorfológicas según la condición del medio en que se encuentre, con la finalidad de satisfacer las necesidades fundamentales para su correcto desarrollo. El estudio consistió en determinar la relación de la densidad estomática, contenido de agua y concentración de clorofila en distintos estratos de la planta (alto, medio y bajo). Se trabajó con las especies Cavendishia bracteata y Virola koschnyi ubicadas en las localidades de la provincia de Heredia, San Rafael y Sarapiquí, respectivamente. Se encontraron diferencias significativas en las variables contenido de agua y concentración de clorofila, mientras que para la variable densidad estomática no se obtuvo significancia. Se determinó una relación de las variables con respecto a la ubicación en la planta, en base a la exposición lumínica que presenta, lo cual consiste en el principal factor de afectación.
Palabras clave: alteraciones fisiomorfológicas, densidad estomática, contenido de agua, concentración de clorofila, Cavendishia bracteata, Virola koschnyi.
Objetivo general
Objetivos específicos
Cuantificar el número de estomas y la concentración de clorofila presente en las hojas según la posición vertical que estos ocupen en la planta.
Comparar la concentración de clorofila y la densidad de estomas, según la ubicación vertical de las hojas.
Área de estudio: El estudio se realizó en la Estación Biológica La Selva, Sarapiquí, Heredia (10° 25’19”N, 84°00’54”O) y en San Rafael, Heredia (10°0’47.5”N, 84°6’0.6”O).
Diseño experimental: Se trabajó con una muestra de 45 hojas, de tres ejemplares de C. bracteata en San Rafael y V. koschnyi en la Estación Biológica La Selva, Sarapiquí, 15 hojas por cada ejemplar y 5 por cada estrato. Se extrajo un área conocía de cada hoja, la cual se pesó para obtener el peso fresco (PF), seguidamente se secó en un horno por tres días, se pesó y se obtuvo el peso seco (PS). Se aplicó una capa de esmalte en las hojas de C. bracteata, del cual, al secar, se extrajo la muestra y se colocó en un portaobjetos. Posteriormente se realizó el conteo de estomas presentes en un área conocida determinada mediante un portaobjetos graduado. Finalmente, se maceraron 27 hojas de cada especie con 10 mL de acetona (CH3CH3) y una punta de espátula de Carbonato de Calcio (CaCO3), para obtener un sobrenadante con los pigmentos fotosintéticos, el cual se centrifugó por dos minutos para y con ayuda del espectrofotómetro se obtuvieron las longitudes de absorción de la clorofila (646 - 663 nm).
Análisis de datos: Se calculó el contenido relativo de agua (CRA) mediante la ecuación,
CRA = (PS - PF) / PF (Ec 1).
Densidad estomática = Número de estomas / Área conocida [mm-2] (Ec 2).
CT = [(17.32 * A646) - (7.18 * A663)] (Ec 3).
Donde A663 y A646 corresponde a las longitudes de absorción de la clorofila.
Finalmente, se realizaron ANDEVAs de una vía (factores densidad estomática, concentración de clorofila y CRA, interacción altura según su localización).Letras iguales indican no diferencia estadísticamente significativa de la prueba post-hoc de TukeyHSD (KW) o LSD de Fisher (F). Media ± desviación estándar; KW: Kruskall-Wallis (p<0.05); F: prueba de Fisher (p>0.05); P: probabilidad; n.s.: no significativo; ** : p<0.01; *** : p<0.001; gl: grados de libertad.
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library(readxl)
library(outliers)
library(car)
## Loading required package: carData
Datos_del_proyecto <- read_excel("E:/Liquenes/Data/Datos del proyecto.xlsx", col_types = c("text", "text", "text", "text", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric"))
San_Rafael <- read_excel("E:/Liquenes/Data/San Rafael.xlsx", col_types = c("text", "text", "text", "text", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric"))
Clorofila <- read_excel("E:/Liquenes/Data/Clorofila.xlsx", col_types = c("text", "text", "text", "text", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric", "numeric"))
Relaciones estadísticas mediante ANDEVAS de una vía.
Densidad estomática respecto a la posición vertical en que se encontraban las hojas de la C. bracteata
densidad <- aov(San_Rafael$Densidad_estomatica~San_Rafael$Altura)
shapiro.test(densidad$residuals)
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: densidad$residuals
## W = 0.96437, p-value = 0.179
tapply(San_Rafael$Densidad_estomatica, San_Rafael$Altura, length)
## 1_Alta 2_Media 3_Baja
## 15 15 15
tapply(San_Rafael$Densidad_estomatica, San_Rafael$Altura, mean)
## 1_Alta 2_Media 3_Baja
## 0.3180623 0.3325466 0.2834775
tapply(San_Rafael$Densidad_estomatica, San_Rafael$Altura, sd)
## 1_Alta 2_Media 3_Baja
## 0.06073678 0.06464630 0.04394081
bartlett.test(San_Rafael$Densidad_estomatica~San_Rafael$Altura)
##
## Bartlett test of homogeneity of variances
##
## data: San_Rafael$Densidad_estomatica by San_Rafael$Altura
## Bartlett's K-squared = 2.1384, df = 2, p-value = 0.3433
summary(densidad)
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## San_Rafael$Altura 2 0.01907 0.009534 2.919 0.065 .
## Residuals 42 0.13718 0.003266
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
TukeyHSD(densidad)
## Tukey multiple comparisons of means
## 95% family-wise confidence level
##
## Fit: aov(formula = San_Rafael$Densidad_estomatica ~ San_Rafael$Altura)
##
## $`San_Rafael$Altura`
## diff lwr upr p adj
## 2_Media-1_Alta 0.01448425 -0.03621635 0.065184850 0.7682439
## 3_Baja-1_Alta -0.03458485 -0.08528544 0.016115753 0.2335445
## 3_Baja-2_Media -0.04906910 -0.09976970 0.001631501 0.0596276
Contenido de agua respecto a la posición vertical en que se encontraban las hojas de la planta, de diferentes localizaciones
Datos_del_proyecto$LA <-paste(Datos_del_proyecto$Locacion, Datos_del_proyecto$Altura, sep="*")
cont_agua<- aov(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja~Datos_del_proyecto$LA)
shapiro.test(cont_agua$residual)
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: cont_agua$residual
## W = 0.96813, p-value = 0.02617
tapply(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja,Datos_del_proyecto$LA, length)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 15 15 15
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 15 15 15
tapply(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja,Datos_del_proyecto$LA,mean)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 0.6754133 0.6746593 0.7188604
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 0.5904427 0.5953834 0.6882348
tapply(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja,Datos_del_proyecto$LA, sd)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 0.03804057 0.06365433 0.04727251
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 0.04868406 0.05349540 0.04383343
kruskal.test(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja~Datos_del_proyecto$LA)
##
## Kruskal-Wallis rank sum test
##
## data: Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja by Datos_del_proyecto$LA
## Kruskal-Wallis chi-squared = 42.971, df = 5, p-value = 3.746e-08
pairwise.wilcox.test(Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja,Datos_del_proyecto$LA, p.adjust.method = "b", exact=F)
##
## Pairwise comparisons using Wilcoxon rank sum test
##
## data: Datos_del_proyecto$Contenido_de_agua_en_la_hoja and Datos_del_proyecto$LA
##
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## San Rafael*2_Media 1.0000 - -
## San Rafael*3_Baja 0.0423 0.8459 -
## Sarapiqui*1_Alta 0.0046 0.0136 0.0002
## Sarapiqui*2_Media 0.0054 0.0117 0.0017
## Sarapiqui*3_Baja 1.0000 1.0000 0.5713
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media
## San Rafael*2_Media - -
## San Rafael*3_Baja - -
## Sarapiqui*1_Alta - -
## Sarapiqui*2_Media 1.0000 -
## Sarapiqui*3_Baja 0.0020 0.0028
##
## P value adjustment method: bonferroni
Concentración clorofilaca respecto a la posición vertical en que se encontraban las hojas de la planta, de diferentes localizaciones
Clorofila$LA <-paste(Clorofila$Locacion, Clorofila$Altura, sep="*")
clorofila <- aov(Clorofila$Clorofila_total~Clorofila$LA)
shapiro.test(clorofila$residual)
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: clorofila$residual
## W = 0.9658, p-value = 0.1254
tapply(Clorofila$Clorofila_total, Clorofila$LA, length)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 9 9 9
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 9 9 9
tapply(Clorofila$Clorofila_total, Clorofila$LA,mean)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 17.434287 14.828624 12.071178
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 6.856982 14.213436 17.490529
tapply(Clorofila$Clorofila_total, Clorofila$LA, sd)
## San Rafael*1_Alta San Rafael*2_Media San Rafael*3_Baja
## 9.523510 4.786784 6.685255
## Sarapiqui*1_Alta Sarapiqui*2_Media Sarapiqui*3_Baja
## 4.602742 3.153114 6.113439
bartlett.test(Clorofila$Clorofila_total~Clorofila$LA)
##
## Bartlett test of homogeneity of variances
##
## data: Clorofila$Clorofila_total by Clorofila$LA
## Bartlett's K-squared = 10.558, df = 5, p-value = 0.06089
summary(clorofila)
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## Clorofila$LA 5 713.2 142.7 3.774 0.00581 **
## Residuals 48 1814.4 37.8
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
TukeyHSD(clorofila)
## Tukey multiple comparisons of means
## 95% family-wise confidence level
##
## Fit: aov(formula = Clorofila$Clorofila_total ~ Clorofila$LA)
##
## $`Clorofila$LA`
## diff lwr upr
## San Rafael*2_Media-San Rafael*1_Alta -2.60566222 -11.207527 5.9962028
## San Rafael*3_Baja-San Rafael*1_Alta -5.36310889 -13.964974 3.2387561
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*1_Alta -10.57730444 -19.179169 -1.9754394
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*1_Alta -3.22085111 -11.822716 5.3810139
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*1_Alta 0.05624222 -8.545623 8.6581072
## San Rafael*3_Baja-San Rafael*2_Media -2.75744667 -11.359312 5.8444183
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*2_Media -7.97164222 -16.573507 0.6302228
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*2_Media -0.61518889 -9.217054 7.9866761
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*2_Media 2.66190444 -5.939961 11.2637695
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*3_Baja -5.21419556 -13.816061 3.3876695
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*3_Baja 2.14225778 -6.459607 10.7441228
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*3_Baja 5.41935111 -3.182514 14.0212161
## Sarapiqui*2_Media-Sarapiqui*1_Alta 7.35645333 -1.245412 15.9583183
## Sarapiqui*3_Baja-Sarapiqui*1_Alta 10.63354667 2.031682 19.2354117
## Sarapiqui*3_Baja-Sarapiqui*2_Media 3.27709333 -5.324772 11.8789583
## p adj
## San Rafael*2_Media-San Rafael*1_Alta 0.9448650
## San Rafael*3_Baja-San Rafael*1_Alta 0.4444003
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*1_Alta 0.0080224
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*1_Alta 0.8743264
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*1_Alta 1.0000000
## San Rafael*3_Baja-San Rafael*2_Media 0.9307027
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*2_Media 0.0837650
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*2_Media 0.9999367
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*2_Media 0.9398601
## Sarapiqui*1_Alta-San Rafael*3_Baja 0.4759997
## Sarapiqui*2_Media-San Rafael*3_Baja 0.9759391
## Sarapiqui*3_Baja-San Rafael*3_Baja 0.4326638
## Sarapiqui*2_Media-Sarapiqui*1_Alta 0.1334441
## Sarapiqui*3_Baja-Sarapiqui*1_Alta 0.0075848
## Sarapiqui*3_Baja-Sarapiqui*2_Media 0.8661446