Voy a terreno y recolecto individuos de terreno, estos pueden ser por ejemplo insectos, y obtengo una base de datos de este tipo por ejemplo:
spp | count | mass |
---|---|---|
blacchel | 1 | 4.7480 |
mecyocul | 1 | 1.6490 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 |
scapbrya | 1 | 0.0910 |
dicoperk | 1 | 0.0725 |
Esta base de datos en realidad tiene 76 especies que es el valor de \(S_0\), en la próxima tabla vemos la abundancia de las primeras 20 especies
spp | n |
---|---|
alapspu1 | 2 |
anagnigr | 14 |
anagspu2 | 3 |
anotspu2 | 1 |
anysgsu1 | 25 |
argyarge | 1 |
blacabax | 1 |
blacchel | 16 |
blaccons | 4 |
blacfrau | 73 |
blaclong | 20 |
blacspho | 4 |
blactric | 3 |
blacvaga | 2 |
campbryo | 7 |
campcalc | 2 |
cephholo | 1 |
cercperk | 3 |
chilspu1 | 2 |
coelspu2 | 1 |
En base a eso podemos calcular \(N_0\), que es 547 individuos.
Basados en la primera tabla, podemos aplicar teorÃa metabólica para calcular el metabolismo de cada individuo lo cual darÃa la siguiente tabla
spp | count | mass | Metabolic_rate |
---|---|---|---|
blacchel | 1 | 4.7480 | 3.2164961 |
mecyocul | 1 | 1.6490 | 1.4551759 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 |
scapbrya | 1 | 0.0910 | 0.1656842 |
dicoperk | 1 | 0.0725 | 0.1397184 |
En base a eso podemos calcular \(E_0\), pero antes calcularemos la tasa metabólica estandarizada, la cual consiste en dividir la tasa metabolica por la mas baja para que esa sea la unidad que es 0.0344281, el resultado se ve a continuación
spp | count | mass | Metabolic_rate | MR_c |
---|---|---|---|---|
blacchel | 1 | 4.7480 | 3.2164961 | 93.426379 |
mecyocul | 1 | 1.6490 | 1.4551759 | 42.267054 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
eurynsp1 | 1 | 0.2584 | 0.3624260 | 10.527030 |
scapbrya | 1 | 0.0910 | 0.1656842 | 4.812464 |
dicoperk | 1 | 0.0725 | 0.1397184 | 4.058261 |
En base a eso la suma de la columna MR_c que es tasa metabolica estandarizada obtenemos el valor de \(E_0\) que es 1.586826210^{4}
Como el área, es la que ya definimos, ya podemos calcular todo, y tenemos nuestros observables:
con esto \(\frac{N_0}{S_0}\) es igual a 7.197 idividuos promedio por especie y \(\frac{E_0}{S_0}\) es igual a 208.793 tasa metabólica total por especie. En base a eso ya podemos resolver con máxima entropÃa
## METE object with state variables:
## S0 N0 E0
## 76.00 547.00 15868.26
##
## with Lagrange multipliers:
## la1 la2
## 0.037929267 0.004960427
Esto inicialmente nos permite calcular la probabilidad de que una especie de abundancia \(n\), tenga una tasa metabólica \(\epsilon\), por ejemplo, el aca vemos las probabilidades de una especie con abundacia 10, tenga un individuo de tasa metabólica 0.01 o de que una especie con abundancia 3, tenga un indicido con tasa metabólica 3
abund | power | ESF.prob |
---|---|---|
10 | 0.01 | 0.0010703 |
3 | 3.00 | 0.0012461 |
Luego acá es donde se pone interesante, es posible desde este calculo, integrando sobre \(\epsilon\) calcular las distribución especie/abundancia, \(\phi(n_0|A_0,S_0,N_0)\) con lo que obtenemos el siguiente gráfico, en el que vemos en la izquerda ranking de abundancia de especies y su abundancia predicha y a la derecha la probabilidad acumulada de probabilidades de abundancia:
Si y sumando sobre \(n\) tenemos \(\psi(\epsilon|A_0,S_0,E_0)\) que es la distribución de metabolismo en individuos, como vemos acá abajo.