1 Partea generală

2 Partea specială

2.1 Introducere

2.1.1 Obiective

2.2 Material și metode

2.2.1 Analiza statistică a datelor

Pentru descrierea variabilelor cantitative am folosit histograme și am calculat mediile aritmetice ± deviația standard (DS) [cu intervalul de încredere (IC) 95%], precum și valorile extreme și mediane. Pentru variabilele calitative, am folosit pie-uri sau bar-chart-uri și am calculat frecvențele absolute și relative ale categoriilor formate.

Pentru a studia relațiile dintre variabilele cantitative și cele calitative, am folosit testele T și Mann-Whitney (MW) dacă acestea au fost binare, respectiv ANOVA dacă acestea au avut mai multe categorii. Am prezentat valorile p generate de aceste teste precum și mediile ± DS ale grupurilor și diferența mediilor cu IC95% asociat. Am prezentat grafic rezultatele suooob forma unor box-plot-uri. Pentru a studia relațiile dintre variabilele cantitative am folosit coeficientul de corelație Spearman (R), cu valoarea p asociata și am prezentat grafic relațiile sub forma unor scatter-plot-uri pe care am adăugat linia de regresie cu IC95%. Pentru a descrie relațiile dintre variabilele calitative am folosit testul Chi2 sau Fisher și indicatorii Cramer phi sau V și Odds-Ratio (OR) / Risc relativ (RR) cu IC95%. Am prezentat grafic rezultatele sub forma unor bar-chart-uri.

Am folosit Microsot Excel 2016 pentru managementul bazei de date. Pentru toate analizele statistice și graficele ulterioare am folosit R 3.6.0. Am considerat p < 0.05 ca fiind semnificativ statistic și p < 0.1 ca prezentând doar o tendință spre semnificativitate statistică.

2.2.2 vs Tip tumora

Tabel 1: Sumarizarea caracteristicilor pricipale ale cazurior în funcție de tipul de tumoră

Factor

Levels

metastază

tumoră primară

Total

Statistics

Leziune

65 (46.4%)

75 (53.6%)

140

Sex

F

29 (44.6%)

39 (52.0%)

68 (48.6%)

OR=0.74 [0.38, 1.45], RR=0.86 [0.61, 1.21] (p=0.402)

M

36 (55.4%)

36 (48.0%)

72 (51.4%)

Vârsta (ani)

*M(R)

61 (40:80)

63 (14:79)

62 (14:80)

MW: p=0.718

Anul examinării

2015

19 (29.2%)

19 (25.3%)

38 (27.1%)

V=0.05 (p=0.955)

2016

11 (16.9%)

13 (17.3%)

24 (17.1%)

2017

2 (3.1%)

3 (4.0%)

5 (3.6%)

2018

33 (50.8%)

40 (53.3%)

73 (52.1%)

Județ de domiciliu

CJ

23 (35.4%)

21 (28.0%)

44 (31.4%)

V=0.44 (p=0.104)

SM

2 (3.1%)

12 (16.0%)

14 (10.0%)

BH

4 (6.2%)

7 (9.3%)

11 (7.9%)

SJ

5 (7.7%)

6 (8.0%)

11 (7.9%)

MM

3 (4.6%)

7 (9.3%)

10 (7.1%)

BN

6 (9.2%)

3 (4.0%)

9 (6.4%)

HD

6 (9.2%)

1 (1.3%)

7 (5.0%)

SB

4 (6.2%)

3 (4.0%)

7 (5.0%)

AB

4 (6.2%)

2 (2.7%)

6 (4.3%)

BV

4 (6.2%)

2 (2.7%)

6 (4.3%)

MS

1 (1.5%)

4 (5.3%)

5 (3.6%)

CS

2 (3.1%)

0

2 (1.4%)

AR

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

BC

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

BT

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

CV

1 (1.5%)

0

1 (0.7%)

GL

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

IS

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

NT

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

SV

0

1 (1.3%)

1 (0.7%)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

2.2.3 Anul examniării

Figure 1: Anul examinării în funcție de tipul de leziune.

2.2.4 Harta

[1] TRUE Shapefile type: Polygon, (5), # of Shapes: 1522 Shapefile type: Polygon, (5), # of Shapes: 1522

Figure 2: Distribuția geografică a cazurilor

Figure 3: Distribuția geografică a cazurilor cu metastaze.

2.2.5 Varsta, sex, leziune

Dintre cei 68 pacienți cu Sex: F (48.6%), 29 (42.6%) au avut Leziune: metastază față de 36 (50.0%) dintre cei 72 pacienți cu Sex: M. Rezultă că pacienții cu Sex: F au un risc relativ de 1.172 [IC95% = 0.8 la 1.7 ] ori mai mic de a avea Leziune: metastază decât cei cu Sex: M (phi=0.07, p=0.383 nesemnificativ statistic conform testului Chi²).

Vârsta pacienților (N=140) a avut valori între 14 și 80 ani (mediana: 62) cu o medie de 59.29 ±13.0 ani. În cazul femeilor (N=68, 48.6%) a avut valori între 14 și 80 ani (mediana: 62) cu o medie de 58.81 ±14.4 ani. În cazul bărbaților (N=72, 51.4%) a avut valori între 14 și 78 ani (mediana: 62) cu o medie de 59.75 ±11.7 ani. Această diferență de 0.941 ani nu a fost semnificativă statistic (p=0.943) conform testului Mann-Whitney. Vârsta pacienților cu Leziune: metastază (N=65, 46.4%) a avut valori între 40 și 80 ani (mediana: 61) cu o medie de 60.42 ±8.54 ani. Vârsta pacienților cu Leziune: tumoră primară (N=75, 53.6%) a avut valori între 14 și 79 ani (mediana: 63) cu o medie de 58.32 ±15.9 ani. Această diferență de 2.1 ani nu a fost semnificativă statistic (p=0.718) conform testului Mann-Whitney.

Figure  4: Distrbuția pe sexe si a varstei pe sexe. (| media, ¦ mediana).

Figure  5: Distrbuția pe leziuni si a varstei pe leziuni (| media, ¦ mediana).

Figure  6: Distrbuția pe leziuni si sex a pacienților.

2.2.6 Localizare ~ tip leziune

Tabel 2: Sumarizarea localizărilor vertebrale ale cazurior în funcție de tipul de tumoră

Factor

Levels

metastază

tumoră primară

Total

Statistics

Leziune

65 (46.4%)

75 (53.6%)

140

Localizare: cervical

6 (9.7%)

2 (3.2%)

8 (6.5%)

OR=3.21 [0.62, 16.59] (p=0.273)

Localizare: toracal

21 (33.9%)

11 (17.7%)

32 (25.8%)

OR=2.37 [1.03, 5.49] (p=0.064)

Localizare: lombar

18 (29.0%)

17 (27.4%)

35 (28.2%)

OR=1.08 [0.50, 2.37] (p=1.000)

Localizare: sacrat

4 (6.5%)

0

4 (3.2%)

OR=9.62 [0.51, 182.51] (p=0.119)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

Figure 7: Distribuția varstei la diferite localizari.

Tabel 3: Distribuția varstei la diferite localizari.

Subset

N

Media ±SD

Med (Min:Max)

Localizare: Vârsta (ani) (Shapiro-Wilk normality test: p<0.001)

(total)

140 (100.0%)

59.29 ±13.0

62.0 (14.0:80.0)

Localizare: cervical (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.915)

da

8 (6.5%)

61.62 ±6.7

61.5 (52.0:70.0)

nu

116 (93.5%)

59.32 ±13.2

62.0 (14.0:80.0)

Localizare: toracal (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.420)

da

32 (25.8%)

60.16 ±14.2

63.5 (16.0:80.0)

nu

92 (74.2%)

59.23 ±12.5

61.5 (14.0:79.0)

Localizare: lombar (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.356)

da

35 (28.2%)

57.94 ±12.8

61.0 (14.0:74.0)

nu

89 (71.8%)

60.07 ±13.0

62.0 (14.0:80.0)

Localizare: sacrat (Wilcoxon rank sum test with continuity correction: p=0.263)

da

4 (3.2%)

66.75 ±10.1

67.5 (55.0:77.0)

nu

120 (96.8%)

59.22 ±12.9

62.0 (14.0:80.0)

Tabel 4: Distribuția varstei la diferite localizari, la pacienții cu metastaze.

Subset

N

Media ±SD

Med (Min:Max)

Localizare: Vârsta (ani) (Shapiro-Wilk normality test: p=0.611)

(total)

65 (100.0%)

60.42 ±8.5

61.0 (40.0:80.0)

Localizare: cervical (Welch Two Sample t-test: p=0.956)

da

6 (9.7%)

60.17 ±6.9

59.5 (52.0:69.0)

nu

56 (90.3%)

60.34 ±8.9

61.5 (40.0:80.0)

Localizare: toracal (Welch Two Sample t-test: p=0.074)

da

21 (33.9%)

63.14 ±8.8

64.0 (44.0:80.0)

nu

41 (66.1%)

58.88 ±8.4

60.0 (40.0:77.0)

Localizare: lombar (Welch Two Sample t-test: p=0.092)

da

18 (29.0%)

57.67 ±7.1

60.0 (40.0:71.0)

nu

44 (71.0%)

61.41 ±9.1

62.5 (40.0:80.0)

Localizare: sacrat (Welch Two Sample t-test: p=0.268)

da

4 (6.5%)

66.75 ±10.1

67.5 (55.0:77.0)

nu

58 (93.5%)

59.88 ±8.5

60.5 (40.0:80.0)

Figure 8: Localizarea tumorii în funcție de tipul de leziune.

2.2.7 Vetebra ~ tip leziune

Tabel 5: Sumarizarea localizărilor vertebrale ale cazurior în funcție de tipul de tumoră

Factor

Levels

metastază

tumoră primară

Total

Statistics

Leziune

65 (46.4%)

75 (53.6%)

140

Vertebra: C2

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: C3

0

1 (1.6%)

1 (0.8%)

OR=0.33 [0.01, 8.21] (p=1.000)

Vertebra: C4

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: C5

2 (3.2%)

1 (1.6%)

3 (2.4%)

OR=2.03 [0.18, 23.02] (p=1.000)

Vertebra: C6

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: C7

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: D1

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: D2

0

2 (3.2%)

2 (1.6%)

OR=0.19 [0.01, 4.12] (p=0.496)

Vertebra: D3

1 (1.6%)

1 (1.6%)

2 (1.6%)

OR=1.00 [0.06, 16.35] (p=1.000)

Vertebra: D4

1 (1.6%)

0

1 (0.8%)

OR=3.05 [0.12, 76.30] (p=1.000)

Vertebra: D6

4 (6.5%)

1 (1.6%)

5 (4.0%)

OR=4.21 [0.46, 38.76] (p=0.365)

Vertebra: D7

2 (3.2%)

0

2 (1.6%)

OR=5.17 [0.24, 109.82] (p=0.496)

Vertebra: D8

3 (4.8%)

0

3 (2.4%)

OR=7.35 [0.37, 145.40] (p=0.244)

Vertebra: D9

4 (6.5%)

1 (1.6%)

5 (4.0%)

OR=4.21 [0.46, 38.76] (p=0.365)

Vertebra: D10

1 (1.6%)

1 (1.6%)

2 (1.6%)

OR=1.00 [0.06, 16.35] (p=1.000)

Vertebra: D11

0

1 (1.6%)

1 (0.8%)

OR=0.33 [0.01, 8.21] (p=1.000)

Vertebra: D12

4 (6.5%)

4 (6.5%)

8 (6.5%)

OR=1.00 [0.24, 4.19] (p=1.000)

Vertebra: L1

3 (4.8%)

8 (12.9%)

11 (8.9%)

OR=0.34 [0.09, 1.36] (p=0.205)

Vertebra: L2

5 (8.1%)

2 (3.2%)

7 (5.6%)

OR=2.63 [0.49, 14.11] (p=0.439)

Vertebra: L3

2 (3.2%)

2 (3.2%)

4 (3.2%)

OR=1.00 [0.14, 7.33] (p=1.000)

Vertebra: L4

6 (9.7%)

4 (6.5%)

10 (8.1%)

OR=1.55 [0.42, 5.80] (p=0.743)

Vertebra: L5

2 (3.2%)

1 (1.6%)

3 (2.4%)

OR=2.03 [0.18, 23.02] (p=1.000)

Vertebra: S1

4 (6.5%)

0

4 (3.2%)

OR=9.62 [0.51, 182.51] (p=0.119)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

Figure 9: Localizarea tumorii în funcție de tipul de leziune.

2.2.8 Origine

Tabel 7: Sumarizarea originii tumorilor în funcție de sex.

vs. Sex

Tip de metastaza vertebrala

F

M

(total)

adenocarcinom

2 (33.3% / 6.9%)

4 (66.7% / 11.1%)

6 (9.2%)

adenocarcinom colonic

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

adenocarcinom ducatal salivar

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

adenocarcinom intestinal

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

adenocarcinom mamar

2 (100.0% / 6.9%)

0 (0.0% / 0.0%)

2 (3.1%)

adenocarcinom mucinos

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

adenocarcinom prostatic

0 (0.0% / 0.0%)

3 (100.0% / 8.3%)

3 (4.6%)

adenocarcinom pulmonar

8 (66.7% / 27.6%)

4 (33.3% / 11.1%)

12 (18.5%)

carcinom hepatocelular

1 (100.0% / 3.4%)

0 (0.0% / 0.0%)

1 (1.5%)

carcinom mamar

9 (100.0% / 31.0%)

0 (0.0% / 0.0%)

9 (13.8%)

carcinom neuroendocrin pulmonar

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

carcinom ovarian

1 (100.0% / 3.4%)

0 (0.0% / 0.0%)

1 (1.5%)

carcinom pulmonar

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

carcinom renal

1 (10.0% / 3.4%)

9 (90.0% / 25.0%)

10 (15.4%)

carcinom scuamos

1 (50.0% / 3.4%)

1 (50.0% / 2.8%)

2 (3.1%)

carcinom scuamos keratinizant

1 (33.3% / 3.4%)

2 (66.7% / 5.6%)

3 (4.6%)

carcinom scuamos necheratinizant

0 (0.0% / 0.0%)

3 (100.0% / 8.3%)

3 (4.6%)

carcinom scuamos necheratinizant pulmonar

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

carcinom scuamos pulmonar

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

carcinom urotelial

0 (0.0% / 0.0%)

1 (100.0% / 2.8%)

1 (1.5%)

limfom

1 (50.0% / 3.4%)

1 (50.0% / 2.8%)

2 (3.1%)

melanom malign

2 (100.0% / 6.9%)

0 (0.0% / 0.0%)

2 (3.1%)

(total)

68 (48.6%)

72 (51.4%)

65 (100%)

V=0.77 (p=0.011)

Tabel 8: Sumarizarea Tipului histologic în funcție de sex.

vs. Sex

Tip histologic

F

M

(total)

adenocarcinom

12 (44.4% / 41.4%)

15 (55.6% / 41.7%)

27 (41.5%)

carcinom

14 (41.2% / 48.3%)

20 (58.8% / 55.6%)

34 (52.3%)

limfom

1 (50.0% / 3.4%)

1 (50.0% / 2.8%)

2 (3.1%)

melanom

2 (100.0% / 6.9%)

0 (0.0% / 0.0%)

2 (3.1%)

(total)

68 (48.6%)

72 (51.4%)

65 (100%)

V=0.20 (p=0.445)

Figure 10: Sumarizarea Tipului histologic în funcție de sex.

Tabel 9: Sumarizarea Organului de origine în funcție de sex.

vs. Sex

Organ de origine

F

M

(total)

plămân

8 (44.4% / 27.6%)

10 (55.6% / 27.8%)

18 (27.7%)

mamar

11 (100.0% / 37.9%)

0 (0.0% / 0.0%)

11 (16.9%)

rinichi

1 (10.0% / 3.4%)

9 (90.0% / 25.0%)

10 (15.4%)

prostată

0 (0.0% / 0.0%)

3 (100.0% / 8.3%)

3 (4.6%)

altele

5 (50.0% / 17.2%)

5 (50.0% / 13.9%)

10 (15.4%)

necunoscut

4 (30.8% / 13.8%)

9 (69.2% / 25.0%)

13 (20.0%)

(total)

68 (48.6%)

72 (51.4%)

65 (100%)

V=0.58 (p<0.001)

Figure 11: Sumarizarea Organului de origine în funcție de sex.

Tabel 10: Sumarizarea originii tumorii în funcție de sex.

vs. Sex

Origine

F

M

(total)

plămân

8 (44.4% / 27.6%)

10 (55.6% / 27.8%)

18 (27.7%)

mamară

11 (100.0% / 37.9%)

0 (0.0% / 0.0%)

11 (16.9%)

rinichi

1 (10.0% / 3.4%)

9 (90.0% / 25.0%)

10 (15.4%)

digestivă

1 (25.0% / 3.4%)

3 (75.0% / 8.3%)

4 (6.2%)

prostată

0 (0.0% / 0.0%)

3 (100.0% / 8.3%)

3 (4.6%)

altele

4 (66.7% / 13.8%)

2 (33.3% / 5.6%)

6 (9.2%)

necunoscută

4 (30.8% / 13.8%)

9 (69.2% / 25.0%)

13 (20.0%)

(total)

68 (48.6%)

72 (51.4%)

65 (100%)

V=0.60 (p<0.001)

Figure 11: Sumarizarea Organului de origine în funcție de sex.

2.2.9 * vs tip histologic

Tabel 11: Sumarizarea caracteristicilor populației în funcție de tipul histologic

Factor

Levels

adenocarcinom

carcinom

Total

Statistics

Tip histologic

27 (44.3%)

34 (55.7%)

61

Sex

F

12 (44.4%)

14 (41.2%)

26 (42.6%)

OR=1.14 [0.41, 3.17], RR=1.08 [0.61, 1.90] (p=1.000)

M

15 (55.6%)

20 (58.8%)

35 (57.4%)

Vârsta (ani)

*M(R)

60 (44:74)

62.5 (40:80)

61 (40:80)

T-test: p=0.451

Anul examinării

2015

6 (22.2%)

12 (35.3%)

18 (29.5%)

V=0.15 (p=0.693)

2016

5 (18.5%)

4 (11.8%)

9 (14.8%)

2017

1 (3.7%)

1 (2.9%)

2 (3.3%)

2018

15 (55.6%)

17 (50.0%)

32 (52.5%)

Județ de domiciliu

CJ

10 (37.0%)

12 (35.3%)

22 (36.1%)

V=0.39 (p=0.671)

SM

0

2 (5.9%)

2 (3.3%)

BH

1 (3.7%)

2 (5.9%)

3 (4.9%)

SJ

2 (7.4%)

3 (8.8%)

5 (8.2%)

MM

3 (11.1%)

0

3 (4.9%)

BN

2 (7.4%)

4 (11.8%)

6 (9.8%)

HD

3 (11.1%)

3 (8.8%)

6 (9.8%)

SB

1 (3.7%)

2 (5.9%)

3 (4.9%)

AB

1 (3.7%)

3 (8.8%)

4 (6.6%)

BV

2 (7.4%)

1 (2.9%)

3 (4.9%)

MS

1 (3.7%)

0

1 (1.6%)

CS

1 (3.7%)

1 (2.9%)

2 (3.3%)

CV

0

1 (2.9%)

1 (1.6%)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

Tabel 12: Sumarizarea caracteristicilor populației în funcție de tipul histologic

Factor

Levels

adenocarcinom

carcinom

Total

Statistics

Tip histologic

27 (44.3%)

34 (55.7%)

61

Localizare: cervical

3 (11.5%)

3 (9.4%)

6 (10.3%)

OR=1.26 [0.23, 6.84], RR=1.23 [0.31, 4.93] (p=1.000)

Localizare: toracal

8 (30.8%)

13 (40.6%)

21 (36.2%)

OR=0.65 [0.22, 1.93], RR=0.76 [0.38, 1.50] (p=0.584)

Localizare: lombar

9 (34.6%)

8 (25.0%)

17 (29.3%)

OR=1.59 [0.51, 4.95], RR=1.38 [0.64, 2.98] (p=0.563)

Localizare: sacrat

0

3 (9.4%)

3 (5.2%)

OR=0.16 [0.01, 3.22], RR=0.00 [0.00, 0.00] (p=0.245)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

Tabel 13: Sumarizarea caracteristicilor populației în funcție de tipul histologic

Factor

Levels

adenocarcinom

carcinom

Total

Statistics

Tip histologic

27 (44.3%)

34 (55.7%)

61

Organ de origine

plămân

12 (44.4%)

6 (17.6%)

18 (29.5%)

V=0.56 (p=0.002)

mamar

2 (7.4%)

9 (26.5%)

11 (18.0%)

rinichi

0

10 (29.4%)

10 (16.4%)

prostată

3 (11.1%)

0

3 (4.9%)

altele

3 (11.1%)

3 (8.8%)

6 (9.8%)

necunoscut

7 (25.9%)

6 (17.6%)

13 (21.3%)

Origine

plămân

12 (44.4%)

6 (17.6%)

18 (29.5%)

V=0.60 (p=0.001)

mamară

2 (7.4%)

9 (26.5%)

11 (18.0%)

rinichi

0

10 (29.4%)

10 (16.4%)

digestivă

3 (11.1%)

1 (2.9%)

4 (6.6%)

prostată

3 (11.1%)

0

3 (4.9%)

altele

0

2 (5.9%)

2 (3.3%)

necunoscută

7 (25.9%)

6 (17.6%)

13 (21.3%)

*M(R) = Mediana (min:max); MW = Test Mann-Whitney; OR/RR = odds-ratio / risc relativ [cu IC 95%] și p calculat prin testul Fisher); V = Cramer V (p calculat prin testul Chi²).

2.3 Discuții

2.4 Concluzii

3 Referințe

  1. R Core Team (2019). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL https://www.R-project.org/.