Analisis Integrado productividad - biodiversidad
Manuel Gomez, Diego J. Lizcano, Carolina Giraldo, Ana Maria Ayala, Diego Navarrete, et al.
14 de enero de 2018
library(readxl) # lee excel
library(tidyverse)# manipula datos eficientemente
library(openxlsx) # escribe excel
library(sp) # spatial polygon
library(magrittr)
library(knitr)
library(colorspace)
library(DT)
library(kableExtra) # tables
library(corrplot) # plot correlations
library(broom) # tidy
library(sjPlot) # plot Results of statistical analyses
library(ggpubr) # more ggplot features
library(sessioninfo) # Preguntas de investigación e hipótesis
Datos provinientes de
Seis eco-regiones:
- Ecorregión cafetera
- Piedemonte Orinocense
- Boyacá-Santander
- Bajo Magdalena
- Valle del río Cesar
- Caquetá
Evaluaciones de productividad en el tiempo:
- Línea base (Planificación predial participativa)
- Siembra inicial
- Sistema actual
Variables:
Biodiversidad
- Riqueza de plantas
- Abundancia de plantas
- Riqueza de escarabajos
- Abundancia de escarabajos
- Riqueza de aves
- Abundancia de aves
Cambio de uso
- Áreas
Captura de carbono
- Toneladas de carbono
Productividad
- Litros de leche
- Capacidad de carga
Leer y Ver Tabla de Datos
kable(base_full, format = "html") %>%
kable_styling(bootstrap_options = c("striped", "hover", "condensed", "responsive",font_size = 8)) %>%
scroll_box(height = "600px")| CODIGO | cruce | Monitoreo | Region | Municipio | Finca | Categoria | Coordedas_N | Coordedas_O | Altura | Riqueza_Escarabajo | Abundancia_Escarabajo | Riqueza_Planta | Abundancia_Planta | Riqueza_Ave | Abundancia_Ave | RE_UT_1_2 | RE_UT_3 | RE_UT_5 | RE_UT_7 | RE_UT_8 | RE_UT_6 | AE_UT_1_2 | AE_UT_3 | AE_UT_5 | AE_UT_7 | AE_UT_8 | AE_UT_6 | RP_UT 1-2 | RP_UT 3 | RP_UT 5 | RP_UT 7 | RP_UT 6 | AP_UT 1-2 | AP_UT 3 | AP_UT 5 | AP_UT 7 | AP_UT 6 | RA_UT 1-2 | RA_UT 3 | RA_UT 5 | RA_UT 7 | RA_UT 8 | RA_UT 6 | AA_UT 1-2 | AA_UT 3 | AA_UT 5 | AA_UT 7 | AA_UT 8 | AA_UT 6 | Area_ha | Porcent_Area_UT_1_2 | Porcent_Area_UT_3 | Porcent_Area_UT_4_8 | Porcent_Area_UT_6 | Porcent_Area_UT_7 | Porcent_Area_UT_9 | Porcent_Area_UT_0 | % | linea_UT_5 | linea_UT_7S | Orientacion_hato | Litros leche_ha_yr | K_carne_ha-yr | Ingreso_COP_yr | Carga_UGGha_yr | Materia_seca_ha_yr | Carbono (t CO2e) | Orientacion_hato_SPP | Litros leche_ha_yr__SPP | K_carne_ha-yr__SPP | Ingreso_COP_yr__SPP | Carga_UGGha_yr__SPP | Materia_seca_ha_yr__SPP | Observaciones | Carbono (t CO2e)__1 | Carga animal UT 3 finca Dato muestral | Carga animal Bovinos por ha UT 3 Dato muestral | Producción leche UT 3 finca Dato muestral | Producción leche por ha UT 3 Dato muestral | Carga animal UT 7 finca Dato muestral | Carga animal Bovinos por ha UT 7 Dato muestral | Producción leche UT 7 finca Dato muestral | Producción leche por ha UT 7 Dato muestral | ESI LB | ESI Momento 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 225 | NA | CIPAV |
|
Charala - SANTANDER - Colombia | Parcela No. 15 La Reliquia | Finca Demostrativa | 06°11’45.09" | 73°08’80.04" | 1561 | 5 | 7 | 33 | 201 | 20 | 74 | 3 | 2 | NA | 3 | NA | 2 | 14 | 548 | NA | 337 | NA | 787 | 30 | NA | NA | 5 | 0 | 183 | NA | NA | 18 | 0 | 3 | 13 | NA | 7 | NA | 2 | 12 | 32 | NA | 20 | NA | 10 | 13.4800 | 0.000000 | 45.10400 | 0.000000 | 17.80400 | 37.092000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 0.0000 | 0 | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 189.5 | 5 | NA | 408.0 | 1410447.8 | 0.89 | NA | Costo por kg 3119 | NA | 17.78400 | 2.924991 | 112193.267 | 3.353062e+02 | 34.0000000 | 6.7999978 | 158556.2624 | 31711.242 | 422.8000 | 799.6000 |
| 1250 | NA | CIPAV |
|
San Diego - CESAR - Colombia | Villa Mariela | Finca Demostrativa | 10°14’15.03“N | 73°7’21.14“W | 592 | 17 | 722 | 45 | 210 | NA | NA | 4 | NA | NA | 15 | NA | 7 | 13 | NA | NA | 535 | NA | 176 | 41 | NA | NA | 4 | 1 | 100 | NA | NA | 109 | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0 | NA | NA | 40.0000 | 0.000000 | 53.25000 | 0.000000 | 28.00000 | 17.500000 | 0.0000 | 1.250000 | 100 | 8146.0000 | 0 | 2 | 1435.00000 | NA | 1594687.50 | 1.6000000 | NA | 3110.3 | 2 | 1435 | NA | 1594687.5 | 1.60 | NA | NA | NA | 65.17800 | 3.060000 | 17636.400 | 1.324800e+02 | 5.9568000 | 0.8509714 | 8066.1000 | 1152.300 | 1360.0000 | 2500.3000 |
| 1353 | NA | CIPAV |
|
Ambalema - TOLIMA - Colombia | Santaren | Finca Demostrativa | 4°52’42.63“N | 74°47’35.56“W | 235 | 15 | 1191 | 14 | 58 | 32 | 119 | 9 | 10 | NA | 9 | NA | 9 | 225 | 494 | NA | 183 | NA | 289 | 14 | 2 | NA | 0 | 0 | 56 | 2 | NA | 0 | 0 | 21 | 15 | NA | 15 | NA | 12 | 37 | 35 | NA | 30 | NA | 17 | 94.0000 | 2.659600 | 12.23400 | 57.446800 | 15.42560 | 12.234000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 370.0000 | 0 | 3 | NA | 187.000000 | 2700000.00 | 0.7500000 | NA | 440.1 | 5 | NA | 1100.0 | 8433333.3 | 3.30 | NA | Costo por kg 2653 | NA | 38.75500 | 3.370012 | 226594.620 | 1.741041e+04 | 36.3561404 | 3.1614145 | 285940.8300 | 24864.506 | 1032.5000 | 2011.0000 |
| 1383 | NA | CIPAV |
|
Pereira - RISARALDA - Colombia | La Esperanza | Finca Demostrativa | 04°43’32.09" | 75°40’83.07" | 1574 | 9 | 230 | 22 | 188 | 37 | 264 | 8 | NA | NA | 5 | NA | NA | 156 | NA | NA | 74 | NA | NA | 18 | NA | NA | 7 | NA | 174 | NA | NA | 14 | NA | 19 | NA | NA | 32 | NA | NA | 68 | NA | NA | 196 | NA | NA | 6.0000 | 25.500000 | 6.66670 | 0.000000 | 5.33330 | 60.000000 | 0.0000 | 2.500000 | 100 | 1930.0000 | 0 | 4 | NA | NA | 0.00 | 0.0000000 | NA | 202.3 | 5 | NA | 369.0 | 1080000.0 | 3.50 | NA | NA | NA | 1.34800 | 3.369983 | 7881.552 | 7.093361e+01 | 11.3810526 | 3.1614035 | 89511.9120 | 24864.420 | 228.5500 | 525.0500 |
| 1556 | NA | CIPAV |
|
San Martin - META - Colombia | Sion Parcela 26 | Finca Demostrativa | 3°42’31.31“N | 73°32’6.47“W | 317 | 14 | 285 | 53 | 131 | 37 | 333 | 7 | 6 | NA | 7 | NA | 4 | 7 | 6 | NA | 7 | NA | 4 | 51 | 2 | NA | 0 | 0 | 127 | 4 | NA | 0 | 0 | 10 | 19 | NA | 14 | NA | 24 | 61 | 123 | NA | 64 | NA | 85 | 20.4992 | 52.418600 | 36.18730 | 0.000000 | 7.31830 | 4.075800 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1800.0000 | 0 | 2 | 517.00000 | 43.000000 | 547000.00 | 0.2000000 | NA | 377.5 | 2 | 464 | 103.0 | 1420363.6 | 1.20 | NA | NA | NA | 20.75745 | 2.798214 | 5792.474 | 3.281292e+01 | 3.7647273 | 4.5059228 | 1440.5592 | 1724.175 | 1109.6400 | 1703.5670 |
| 1607 | NA | CIPAV |
|
Ulloa - VALLE - Colombia | San Jose | Finca Demostrativa | 4°41’39.73“N | 75°44’18.24“W | 1385 | 10 | 64 | 26 | 145 | 49 | 180 | 5 | NA | 6 | 5 | NA | 1 | 20 | NA | 33 | 8 | NA | 3 | 20 | NA | 5 | 2 | 0 | 117 | NA | 15 | 10 | 0 | 27 | NA | 23 | 20 | NA | 21 | 70 | NA | 40 | 32 | NA | 29 | 15.0300 | 12.441600 | 1.26400 | 0.000000 | 26.61340 | 59.681000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 6554.0000 | 240 | 2 | 5931.00000 | 308.000000 | 4692750.00 | 2.0000000 | NA | 582.3 | 5 | NA | 79.2 | 594500.0 | 2.40 | NA | NA | NA | 0.64030 | 3.370369 | 3743.737 | 4.451612e+02 | 28.3577895 | 3.1613844 | 223033.8474 | 24864.269 | 470.6500 | 1203.3500 |
| 1716 | NA | CIPAV |
|
Valledupar - CESAR - Colombia | Las Delicias | Finca Demostrativa | 10°26’36.08" | 73°23’00.02" | 294 | 15 | 1560 | 40 | 104 | 31 | 145 | 3 | 2 | NA | 2 | NA | 2 | 14 | NA | NA | 152 | NA | 787 | 40 | 2 | NA | 0 | 0 | 102 | 2 | NA | 0 | 0 | 14 | 15 | NA | 13 | NA | 0 | 36 | 72 | NA | 37 | NA | 0 | 110.0000 | 0.000000 | 79.54550 | 0.000000 | 18.40910 | 1.363600 | 0.0000 | 0.681800 | 100 | 3173.0000 | 0 | 2 | 345.09091 | NA | NA | 1.2363636 | NA | 4931.7 | 2 | 185 | 149.0 | 297215.4 | NA | 7687 | Costo por litro 893 y por kg 3793 | NA | 267.78060 | 3.060348 | 72458.280 | 1.001994e+03 | 0.0000000 | 0.0000000 | 1728.4500 | 1152.331 | 4291.1500 | 6591.1500 |
| 1775 | NA | CIPAV |
|
Duitama - BOYACA - Colombia | La Esperanza | Finca Demostrativa | 5 47 36,2 | 73 02 82,9 | 2511 | 2 | 15 | 2 | 34 | 13 | 70 | NA | NA | 3 | NA | NA | 1 | NA | NA | 7 | 0 | NA | 12 | NA | 1 | NA | 1 | NA | NA | 33 | NA | 1 | NA | NA | 6 | NA | 9 | NA | 9 | NA | 14 | NA | 34 | NA | 22 | 16.0000 | 0.000000 | 0.00000 | 0.000000 | 82.50000 | 13.125000 | 0.0000 | 4.375000 | 100 | 2794.0000 | 0 | 1 | 13573.43750 | NA | 12182625.00 | NA | NA | 178.2 | 2 | 7870 | 155.0 | 9144000.0 | 1.40 | 18382 | Costo por litro 600 y por kg 2000 | NA | 0.00000 | NA | 0.000 | NA | 14.2800000 | 6.8000000 | 66593.6302 | 31711.252 | 167.9000 | 418.7000 |
| 2388 | NA | CIPAV |
|
Villamaria - CALDAS - Colombia | Los Alpes | Finca Demostrativa | 5°0’44.7“N | 75°25’52.69“W | 2346m | 4 | 32 | 28 | 101 | NA | NA | 2 | NA | 1 | 1 | NA | 0 | 4 | NA | 23 | 4 | NA | 0 | 21 | NA | 3 | 2 | 0 | 82 | NA | 8 | 2 | 0 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0 | NA | NA | 46.0000 | 19.565200 | 1.95650 | 0.000000 | 61.08690 | 17.391400 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 8225.0000 | 7400 | 1 | 5631.00000 | 156.000000 | 5413371.43 | 0.9000000 | NA | 872.0 | 1 | 12600 | NA | 15145200.0 | 2.20 | NA | Costo por lt 664 | NA | 3.03300 | 3.370037 | 17733.492 | 4.169387e+03 | 25.2912281 | 3.1613861 | 198915.3600 | 24864.283 | 1273.7500 | 2718.2500 |
| 2414 | NA | CIPAV |
|
Ibague - TOLIMA - Colombia | Lagunilla | Finca Demostrativa | 4°27’41.47“N | 75°20’13.36“W | 1959m | 7 | 98 | 34 | 114 | NA | NA | 6 | 2 | 5 | 3 | NA | 0 | 51 | 11 | 23 | 13 | NA | 0 | 35 | 1 | 4 | 2 | NA | 95 | 1 | 16 | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0 | NA | NA | 17.0000 | 5.882400 | 23.52940 | 0.000000 | 28.52940 | 41.176400 | 0.0000 | 0.882400 | 100 | 3630.0000 | 1000 | 2 | 2555.00000 | 324.000000 | 3220000.00 | 1.3000000 | NA | 437.1 | 2 | 2502 | 176.0 | 2911428.6 | 1.10 | NA | NA | NA | 13.48000 | 3.370002 | 78815.520 | 5.694424e+02 | 22.1298246 | 3.1614089 | 174050.9400 | 24864.463 | 533.5000 | 1165.0000 |
| 2492 | NA | CIPAV |
|
Belen - BOYACA - Colombia | La Estancia | Finca Demostrativa | 6 00 13,25 | 72 53 52,03 | 2765 | 6 | 1966 | 23 | 158 | 12 | 96 | 3 | 2 | NA | 3 | NA | 2 | 14 | 548 | NA | 337 | NA | 787 | 21 | NA | NA | 2 | 1 | 145 | NA | NA | 9 | 4 | 9 | 9 | NA | 3 | NA | 3 | 28 | 46 | NA | 10 | NA | 12 | 10.5000 | 34.285700 | 41.90480 | 0.000000 | 17.14280 | 6.666700 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1680.0000 | 1000 | 2 | 1825.00000 | 60.833333 | 1413000.00 | 0.5000000 | NA | NA | 2 | 3406 | 235.0 | 3563000.0 | 1.30 | 14704 | Costo por lt 700 | NA | 12.87000 | 2.924997 | 81192.496 | 2.034424e+02 | 4.7600000 | 6.7999660 | 22197.8767 | 31711.094 | 645.5000 | 871.0000 |
| 2658 | NA | CIPAV |
|
San Estanislao - BOLIVAR - Colombia | El Palacio | Finca Demostrativa | 10°20’16.1’’ | 75°12’13.1’’ | 30 | 3 | 10 | 8 | 23 | 24 | 116 | NA | 0 | 1 | NA | 3 | 0 | NA | 0 | 1 | 0 | 9 | 0 | NA | 4 | 5 | NA | NA | NA | 6 | 17 | 0 | NA | NA | 10 | 6 | NA | 11 | 9 | NA | 24 | 18 | 0 | 40 | 34 | 63.0000 | 0.000000 | 49.20630 | 0.000000 | 47.61910 | 1.269800 | 0.0000 | 1.904800 | 100 | 2800.0000 | 1200 | 4 | NA | NA | 537600.00 | NA | NA | 1834.3 | 2 | 334 | 43.0 | 406000.0 | 0.60 | NA | Costo por kg 1078 | NA | 200.00000 | 6.451619 | 31871.100 | 4.080533e+02 | 11.3333333 | 14.1671271 | 4416.0000 | 5520.179 | 1018.0000 | 2750.0000 |
| 2918 | NA | CIPAV |
|
Santa Rosa de Viterbo - BOYACA - Colombia | La Pradera | Finca Demostrativa | 5°49’40.05“N | 72°57’30.39“W | 2734m | 13 | 81 | 24 | 181 | 51 | 492 | NA | NA | NA | 3 | NA | 1 | NA | NA | NA | 78 | NA | 3 | 24 | NA | NA | NA | NA | 181 | NA | NA | 0 | NA | 1 | 43 | NA | 24 | NA | 1 | 1 | 350 | NA | 112 | NA | 2 | 2.0000 | 0.000000 | 25.00000 | 0.000000 | 0.00000 | 75.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 881.0000 | 0 | 2 | NA | NA | 1425900.00 | 0.0000000 | NA | NA | 2 | 3598 | 211.0 | 4074929.6 | 2.80 | 9615 | Costo por lt 529 | NA | 1.46250 | 2.925000 | 9226.420 | 7.381136e+00 | 10.2000000 | 6.8000000 | 47566.8787 | 31711.252 | 50.0000 | 184.0500 |
| 3065 | NA | CIPAV |
|
San Martin - META - Colombia | Camaguey | Finca Demostrativa | 3°44’8.81“N | 73°39’45.29“W | 392m | 15 | 785 | 58 | 294 | 39 | 266 | 7 | NA | 6 | 8 | NA | 8 | 105 | NA | 171 | 260 | NA | 249 | 54 | NA | 2 | 3 | 0 | 255 | NA | 14 | 25 | 0 | 18 | NA | 16 | 17 | NA | 15 | 69 | NA | 59 | 60 | NA | 78 | 39.2901 | 11.759400 | 8.00460 | 0.000000 | 68.78270 | 10.180700 | 0.0000 | 1.272600 | 100 | 6500.0000 | 7000 | 2 | 1770.00000 | 123.000000 | 1490181.82 | 0.6000000 | NA | 740.6 | 2 | 1613 | 140.0 | 1785263.2 | 0.70 | 38798 | Costo por lt 970 | NA | 8.78415 | 2.793039 | 2451.263 | 1.203188e+02 | 17.9272727 | 4.4818101 | 6859.8058 | 1714.948 | 992.2559 | 2024.3265 |
| NA | NA | CIPAV |
|
El Cerrito | El Hatico | Finca referencia | 3°38’39.42“N | 76°18’51.05“W | 1005m | 6 | 80 | 24 | 139 | 39 | 251 | 3 | NA | 3 | 2 | NA | NA | 72 | NA | 81 | 39 | NA | NA | 16 | NA | 6 | 2 | 2 | 117 | NA | 15 | 5 | 2 | 19 | 23 | 18 | 18 | NA | NA | 43 | 97 | 32 | 79 | NA | NA | 135.0000 | 22.222222 | 0.00000 | 0.000000 | 37.03704 | 37.037037 | 0.0000 | 3.703704 | 100 | 0.0000 | 0 | 1 | 9057.60000 | NA | 8444444.44 | 1.5000000 | 24000 | 1159.7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 91.76940 | NA | 24831.720 | NA | 0.0000000 | 0.0000000 | 61290.8370 | 1225.817 | NA | 6850.0000 |
| NA | NA | CIPAV |
|
Agustín Codazzi | La Luisa | Finca referencia | 9°53’30.63“N | 73°21’24.97“W | 75m | 19 | 3892 | 13 | 132 | 28 | 254 | 20 | 11 | NA | 16 | NA | 12 | 1092 | 236 | NA | 639 | NA | 262 | 10 | 3 | NA | 1 | 0 | 77 | 12 | NA | 43 | 0 | 23 | 11 | NA | 20 | NA | 9 | 73 | 54 | NA | 95 | NA | 32 | 205.7000 | 29.168692 | 14.58435 | 0.000000 | 28.92562 | 25.862907 | 0.0000 | 1.458435 | 100 | 0.0000 | 0 | 4 | NA | 945.000000 | 4071428.57 | 1.2000000 | 5500 | 2651.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 91.76940 | 3.058980 | 24831.720 | 3.502306e+03 | 0.0000000 | 0.0000000 | 61290.8370 | 1152.083 | NA | 12117.7000 |
| NA | NA | CIPAV | Caquetá | El Doncello | El Volga | Finca exter | 1°44’33“N | 75°15’56“W | 338m | 4 | 49 | 41 | 216 | 30 | 91 | 5 | 3 | NA | 3 | NA | NA | 27 | 16 | NA | 1 | NA | NA | 40 | 3 | NA | 3 | NA | 181 | 18 | NA | 17 | NA | 16 | 13 | NA | 12 | NA | 8 | 41 | 20 | NA | 21 | NA | 9 | 110.0000 | 7.272727 | 52.72727 | 1.818182 | 31.81818 | 4.545454 | 0.0000 | 1.818182 | 100 | 0.0000 | 0 | 2 | 1859.00000 | 104.000000 | 1055598.00 | 1.1200000 | 6060 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 91.76940 | 1.582231 | 24831.720 | 5.180411e+02 | 0.0000000 | 0.0000000 | 61290.8370 | 12258.167 | NA | 5520.7000 |
| 51 | NA | TNC |
|
Filandia - QUINDIO - Colombia | El Cairo hoy La Alborada | NA | NA | NA | NA | 13 | 359 | NA | NA | 77 | 205 | 13 | NA | 10 | NA | NA | 9 | 159 | NA | 151 | NA | NA | 121 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 70 | NA | NA | NA | NA | NA | 105 | NA | NA | NA | NA | NA | 6.4760 | 31.025000 | 3.62900 | 2.316000 | 60.47700 | 0.000000 | 0.0000 | 2.553000 | 100 | 760.0000 | 0 | 1 | NA | 486.666667 | 1200000.00 | 1.0000000 | NA | 69.8 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.80880 | 3.441496 | 4728.931 | 8.438842e+01 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 247.9890 | 284.4890 |
| 197 | NA | TNC |
|
Encino - SANTANDER - Colombia | La Alegria | NA | NA | NA | NA | 12 | 168 | NA | NA | 55 | 169 | 12 | 12 | 12 | 12 | NA | 12 | 168 | 168 | 168 | 168 | NA | 168 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 55 | 34 | NA | NA | NA | NA | 150 | 45 | NA | NA | NA | NA | 10.8535 | 82.100000 | 0.00000 | 0.000000 | 17.90000 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 402.0179 | 0 | 4 | 370.00000 | NA | NA | 0.4900000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00000 | NA | 0.000 | NA | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 921.3259 | 930.6259 |
| 259 | NA | TNC |
|
Cubarral - META - Colombia | El Porvenir | NA | NA | NA | NA | 25 | 1501 | NA | NA | 81 | 291 | 25 | 21 | 19 | NA | NA | 12 | 1201 | 354 | 239 | NA | NA | 122 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 80 | 56 | 19 | NA | NA | NA | 210 | 76 | 239 | NA | NA | NA | 41.5918 | 28.260000 | 47.07000 | 0.000000 | 24.67000 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 290.9057 | 0 | NA | 97.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 65.98460 | 3.370472 | 15285.263 | 1.350630e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 2552.4678 | 2655.0438 |
| 330 | NA | TNC |
|
Encino - SANTANDER - Colombia | El Engaño | NA | NA | NA | NA | 11 | 179 | NA | NA | 51 | 173 | 11 | 11 | 11 | 11 | NA | 11 | 179 | 179 | 179 | 179 | NA | 179 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 51 | 37 | NA | NA | NA | NA | 150 | 77 | NA | NA | NA | NA | 21.3033 | 81.110000 | 13.13000 | 0.000000 | 5.76000 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1275.4355 | 0 | 4 | 188.00000 | NA | NA | 1.0100000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 8.19000 | 2.928008 | 51667.952 | 8.383076e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 1828.2798 | 1996.0638 |
| 350 | NA | TNC |
|
Salento - QUINDIO - Colombia | El Cortijo | NA | NA | NA | NA | 12 | 317 | NA | NA | 68 | 202 | 12 | NA | 11 | NA | NA | 8 | 221 | NA | 221 | NA | NA | 131 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 66 | NA | NA | NA | NA | NA | 125 | NA | NA | NA | NA | NA | 39.6605 | 33.139000 | 13.37200 | 0.000000 | 51.71300 | 0.701000 | 0.0000 | 1.075000 | 100 | 4194.2874 | 0 | NA | NA | NA | NA | 0.0000000 | NA | 477.5 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 17.86100 | 3.367838 | 104430.564 | 3.097344e+03 | 0.8851930 | 3.1839172 | 6962.0376 | 25041.490 | 2011.6114 | 2054.1114 |
| 452 | NA | TNC |
|
Encino - SANTANDER - Colombia | Los Nogales | NA | NA | NA | NA | 13 | 170 | NA | NA | 54 | 175 | 13 | NA | 9 | NA | NA | 11 | 121 | NA | 121 | NA | NA | 163 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 54 | NA | NA | NA | NA | NA | 110 | NA | NA | NA | NA | NA | 103.6151 | 79.491000 | 17.75000 | 1.794000 | 0.00000 | 0.965000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1000.4628 | 0 | 4 | NA | 152.083333 | NA | 0.8333333 | NA | 1187.3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 53.79075 | 2.924733 | 339347.728 | 1.980932e+04 | 6.8680000 | 6.8687850 | 32028.3650 | 32032.026 | 9384.9111 | 9713.8046 |
| 578 | NA | TNC |
|
Piojo - ATLANTICO - Colombia | Parcela No. 7 Campoalegre - El Paraiso | NA | NA | NA | NA | 17 | 399 | NA | NA | 44 | 191 | 17 | NA | NA | NA | NA | 11 | 399 | NA | NA | NA | NA | 125 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 44 | NA | NA | NA | NA | NA | 121 | NA | NA | NA | NA | NA | 16.1902 | 0.000000 | 96.91000 | 0.000000 | 0.00000 | 3.090000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 600.0000 | 0 | 2 | 248.00000 | NA | 173600.00 | 1.6200000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 101.22581 | 6.451645 | 16130.889 | 2.694895e+01 | 7.0833333 | 14.1588176 | 2760.0000 | 5516.942 | 598.2640 | 1163.3140 |
| 808 | NA | TNC |
|
Piojo - ATLANTICO - Colombia | Macondal Parcela 16 el Trebol - El Trebol Parcela No. 3 | NA | NA | NA | NA | 18 | 406 | NA | NA | 45 | 190 | 18 | NA | NA | NA | NA | NA | 406 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 42 | NA | NA | NA | NA | NA | 121 | NA | NA | NA | NA | NA | 17.0851 | 0.000000 | 98.38980 | 1.610200 | 0.00000 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 169.6579 | 0 | 2 | 1022.00000 | NA | 830400.00 | NA | NA | 811.9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 108.45161 | 6.451614 | 17282.361 | 3.001031e+01 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 1185.1829 | 1185.1829 |
| 820 | NA | TNC |
|
Piojo - ATLANTICO - Colombia | Parcela No. 62 Cielo Lirio | NA | NA | NA | NA | 19 | 593 | NA | NA | 55 | 177 | 19 | NA | NA | NA | NA | 5 | 593 | NA | NA | NA | NA | 25 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 45 | NA | NA | NA | NA | NA | 132 | NA | NA | NA | NA | NA | 12.7078 | 0.000000 | 63.97010 | 0.000000 | 15.73840 | 3.189400 | 15.5283 | 1.573800 | 100 | 2874.2624 | 1000 | 2 | 365.00000 | NA | 318333.33 | NA | NA | 731.7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 52.45161 | 6.452254 | 8358.453 | 1.660425e+01 | 5.8083333 | 14.3308573 | 2263.2000 | 5583.976 | 605.4491 | 831.1281 |
| 839 | NA | TNC |
|
Piojo - ATLANTICO - Colombia | Parcela No. 41 La Renuncia | NA | NA | NA | NA | 14 | 402 | NA | NA | 47 | 205 | 10 | 5 | 4 | NA | NA | NA | 325 | 55 | 42 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37 | 32 | NA | NA | NA | NA | 154 | 38 | NA | NA | NA | NA | 10.5568 | 0.000000 | 87.21110 | 2.368100 | 0.00000 | 7.089300 | 0.0000 | 3.331500 | 100 | 901.6807 | 0 | 2 | 146.00000 | NA | 219600.00 | NA | NA | 547.5 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 59.41935 | 6.453924 | 9468.801 | 1.146187e+01 | 10.6250000 | 14.1968924 | 4140.0000 | 5531.777 | 652.0630 | 741.9410 |
| 899 | NA | TNC |
|
Salento - QUINDIO - Colombia | Los Arboles | NA | 463144 | -7550469 | NA | 1 | 60 | NA | NA | 81 | 299 | 10 | 1 | 1 | NA | NA | 7 | 60 | 30 | 21 | NA | NA | 31 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 71 | 21 | NA | NA | NA | NA | 125 | 51 | NA | NA | NA | NA | 530.1645 | 70.427700 | 4.11650 | 0.000000 | 25.45580 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 450.0000 | 0 | 2 | 69.00000 | 6.601725 | NA | 0.2546379 | NA | 4017.4 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 73.60080 | 3.372436 | 430332.739 | 5.542260e+05 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 38348.6130 | 38371.1130 |
| 1053 | NA | TNC |
|
Piojo - ATLANTICO - Colombia | Palomar | NA | NA | NA | NA | 22 | 865 | NA | NA | 41 | 199 | 22 | NA | 10 | NA | NA | 16 | 850 | NA | 155 | NA | NA | 402 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 21 | NA | NA | NA | NA | NA | 132 | NA | NA | NA | NA | NA | 30.2102 | 3.990700 | 89.66080 | 0.000000 | 0.00000 | 1.655100 | 4.6934 | 0.000000 | 100 | 2505.6519 | 0 | 2 | 93.00000 | NA | 83657.14 | NA | NA | 1586.9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 174.77419 | 6.452397 | 27851.229 | 9.384159e+01 | 7.0833333 | 14.1664111 | 2760.0000 | 5519.900 | 2060.3836 | 2170.8836 |
| 1229 | NA | TNC |
|
San Martin - META - Colombia | La Cristali | NA | NA | NA | NA | 21 | 480 | NA | NA | 66 | 193 | 21 | 12 | 12 | NA | NA | 9 | 321 | 120 | 111 | NA | NA | 180 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 60 | 31 | NA | NA | NA | NA | 127 | 21 | NA | NA | NA | NA | 244.3700 | 26.926400 | 12.19460 | 0.000000 | 60.67440 | 0.000000 | 0.0000 | 0.204600 | 100 | 7930.0000 | 0 | 3 | NA | NA | 47600.00 | NA | NA | 1714.3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 83.33752 | 2.796566 | 23255.770 | 4.660270e+03 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 8031.7000 | 10216.2000 |
| 1298 | NA | TNC |
|
Fuente de Oro - META - Colombia | La Esperanza | NA | NA | NA | NA | 16 | 390 | NA | NA | 39 | 159 | 16 | 10 | 8 | NA | NA | 12 | 390 | 221 | 210 | NA | NA | 212 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 29 | 33 | NA | NA | NA | NA | 133 | 55 | NA | NA | NA | NA | 159.0500 | 37.539100 | 36.75070 | 0.000000 | 25.08140 | 0.000000 | 0.0000 | 0.628800 | 100 | 7609.0000 | 0 | 2 | 80.32065 | NA | NA | 0.1257466 | NA | 2244.9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 163.51388 | 2.797405 | 45629.398 | 1.974753e+03 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 6673.0100 | 10543.0800 |
| 1612 | NA | TNC |
|
Salento - QUINDIO - Colombia | La Bretaña-Britania | NA | NA | NA | NA | 19 | 475 | NA | NA | 41 | 177 | 18 | 11 | 11 | NA | NA | 7 | 321 | 125 | 90 | NA | NA | 121 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 41 | 32 | NA | NA | NA | NA | 131 | 75 | NA | NA | NA | NA | 240.7541 | 60.655000 | 2.43000 | 0.352800 | 36.48750 | 0.000000 | 0.0747 | 0.000000 | 100 | 7681.6684 | 0 | 5 | 1277.50000 | 58.552083 | 1192666.67 | 0.2333333 | NA | 1984.3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 19.71450 | 3.369813 | 115267.698 | 1.142023e+05 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 15422.1494 | 15557.1494 |
| 2229 | NA | TNC |
|
Salento - QUINDIO - Colombia | La Carelia | NA | 4639616 | -7550661 | NA | 14 | 159 | NA | NA | 76 | 255 | 11 | 10 | 10 | NA | NA | 9 | 159 | 121 | 85 | NA | NA | 135 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 74 | 51 | NA | NA | NA | NA | 132 | 120 | NA | NA | NA | NA | 51.8302 | 15.871600 | 8.02120 | 0.000000 | 0.00000 | 76.107200 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1161.9268 | 0 | 1 | 1454.16000 | 225.257143 | 1380816.00 | 0.4800000 | NA | 906.1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 14.01920 | 3.372104 | 81968.141 | 5.296496e+03 | 124.7173684 | 3.1616829 | 980901.3690 | 24866.617 | 3050.1557 | 3050.1557 |
| 2229 | NA | TNC |
|
Salento - QUINDIO - Colombia | La Carelia | NA | NA | NA | NA | 11 | 321 | NA | NA | 70 | 215 | 11 | 10 | 10 | NA | NA | 9 | 159 | 121 | 85 | NA | NA | 135 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 74 | 51 | NA | NA | NA | NA | 132 | 120 | NA | NA | NA | NA | 51.8302 | 15.870000 | 8.02000 | 0.000000 | 76.11000 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 2323.8536 | 0 | 1 | 77.00000 | NA | 57750.00 | 0.8200000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 14.01920 | 3.372609 | 81968.141 | 5.297288e+03 | 124.7173684 | NA | 980901.3690 | NA | 3050.1557 | 3050.1557 |
| 3189 | NA | TNC |
|
Cubarral - META - Colombia | La Rosania | NA | NA | NA | NA | 26 | 1491 | NA | NA | 79 | 275 | 25 | 16 | 16 | NA | NA | 16 | 725 | 231 | 141 | NA | NA | 259 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 77 | 30 | NA | NA | NA | NA | 152 | 35 | NA | NA | NA | NA | 175.9009 | 39.098000 | 7.72090 | 0.000000 | 53.18110 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1462.3200 | 0 | 2 | 72.62612 | NA | NA | 0.8527529 | NA | 962.6 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 37.99005 | 2.797267 | 10601.321 | 2.415239e+03 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 7984.3058 | 8672.6835 |
| 3861 | NA | TNC |
|
Fuente de Oro - META - Colombia | El Guamo | NA | NA | NA | NA | 23 | 1499 | NA | NA | 83 | 295 | 32 | 12 | NA | NA | NA | 21 | 689 | 436 | NA | NA | NA | 395 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 78 | 32 | NA | NA | NA | NA | 127 | 121 | NA | NA | NA | NA | 5.0000 | 16.000000 | 0.00000 | 50.000000 | 30.00000 | 4.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 1700.0000 | 0 | 2 | 803.00000 | NA | NA | 0.5300000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00000 | NA | 0.000 | NA | 0.8963636 | 4.4818182 | 342.9903 | 1714.951 | 102.5000 | 191.5000 |
| 3958 | NA | TNC |
|
Grada - META - Colombia | Los Cambulos | NA | NA | NA | NA | 18 | 621 | NA | NA | 87 | 245 | 18 | NA | 11 | NA | NA | 15 | 421 | NA | 120 | NA | NA | 121 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 79 | NA | NA | NA | NA | NA | 143 | NA | NA | NA | NA | NA | 48.0000 | 29.791700 | 22.06250 | 0.000000 | 47.62500 | 0.000000 | 0.0000 | 0.520800 | 100 | 2967.0000 | 0 | 1 | 342.18750 | NA | NA | 1.8958333 | NA | 543.1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 29.62552 | 2.797500 | 8267.157 | 1.798634e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 2188.0000 | 2476.7500 |
| 4166 | NA | TNC |
|
Riohacha - LA GUAJIRA - Colombia | Campo Merl | NA | NA | NA | NA | 15 | 432 | NA | NA | 56 | 179 | 22 | 15 | NA | NA | NA | 5 | 432 | 221 | NA | NA | NA | 120 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 55 | 45 | NA | NA | NA | NA | 153 | 55 | NA | NA | NA | NA | 50.0000 | 0.000000 | 36.00000 | 0.000000 | 63.00000 | 0.000000 | 0.0000 | 1.000000 | 100 | 1630.0000 | 0 | 2 | 730.00000 | NA | NA | NA | NA | 1037.0 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 55.08000 | 3.060000 | 14904.000 | 2.070000e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 1545.0000 | 1656.5000 |
| 4334 | NA | TNC |
|
Riohacha - LA GUAJIRA - Colombia | Finca El Paraiso | NA | NA | NA | NA | 12 | 355 | NA | NA | 46 | 189 | 21 | 12 | NA | NA | NA | 11 | 355 | 212 | NA | NA | NA | 132 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 46 | 43 | NA | NA | NA | NA | 121 | 59 | NA | NA | NA | NA | 55.3600 | 0.000000 | 30.70820 | 0.000000 | 68.38870 | 0.000000 | 0.0000 | 0.903100 | 100 | 300.0000 | 0 | 2 | 356.03324 | NA | NA | 0.9212428 | NA | 837.9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 52.02000 | 3.059989 | 14076.000 | 2.537587e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 1528.6000 | 1583.6000 |
| 4419 | NA | TNC |
|
Distraccion - LA GUAJIRA - Colombia | Finca Corralito | NA | NA | NA | NA | 16 | 332 | NA | NA | 45 | 175 | 27 | 16 | NA | NA | NA | 15 | 332 | 231 | NA | NA | NA | 129 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 44 | 40 | NA | NA | NA | NA | 143 | 58 | NA | NA | NA | NA | 36.2200 | 0.000000 | 88.95640 | 0.000000 | 11.04360 | 0.000000 | 0.0000 | 0.000000 | 100 | 700.0000 | 0 | 2 | 725.56599 | NA | NA | 2.4572060 | NA | 1591.4 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 98.59320 | 3.059999 | 26678.160 | 1.086243e+02 | 0.0000000 | NA | 0.0000 | NA | 2295.4000 | 2330.4000 |
| 4715 | NA | TNC |
|
Distraccion - LA GUAJIRA - Colombia | Finca Mis Viejos | NA | NA | NA | NA | 14 | 421 | NA | NA | 46 | 141 | 29 | 23 | NA | NA | NA | 12 | 321 | 331 | NA | NA | NA | 124 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 46 | 40 | NA | NA | NA | NA | 141 | 21 | NA | NA | NA | NA | 32.5000 | 0.000000 | 64.61540 | 0.000000 | 32.30770 | 0.000000 | 0.0000 | 3.076900 | 100 | 1050.0000 | 0 | 2 | 224.61538 | NA | NA | 2.1538462 | NA | 1112.4 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 64.26000 | 3.059999 | 17388.000 | 8.745748e+01 | 211.2281280 | NA | 0.0000 | NA | 900.0000 | 1627.5000 |
| 268 | NA | TNC/CIPAV |
|
Cubarral - META - Colombia | Lote No. 2 - El Porvenir | Finca Demostrativa | 03°47’09.00" | 73°49’17.00" | 523 | 12 | 139 | 54 | 269 | 26 | 98 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 51.9643 | 14.738000 | 47.52900 | 0.000000 | 26.10400 | 10.667000 | 0.0000 | 0.962000 | 100 | 3540.0000 | 0 | 2 | 228.00000 | 40.000000 | 46875.00 | 0.3000000 | NA | 897.0 | 5 | NA | 338.0 | 888800.0 | 1.80 | 36000 | NA | NA | 69.09825 | 2.797714 | 19282.226 | 2.108160e+02 | 24.8292727 | 4.4793668 | 9500.8311 | 1714.013 | 2911.9540 | 3157.0645 |
Correlación general
# elimina no numericas
M <- cor(base_full1[,7:28],
method ="pearson",
use="pairwise.complete.obs") # Makes pearson correlation
Mp <- cor.mtest(M, conf.level = .95) # estimate confidence level .95
corrplot(M,p.mat = Mp$p, type = "upper", method = "circle",
insig = "blank", sig.level = 0.05, main="Correlacion Biodiversidad-Productividad")
Los circulos en colores se muestran las correlaciones que son estadisticamente significativas. En azul se muestran las correlaciones positivas, en rojo las negativas. El tamaño del circulo representa que tan grande es la relación. Los interrogantes se originan en las variables que tienen muchos datos faltantes.
Preguntas de investigación:
Pregunta relacionada con ecosistemas naturales
Relacionadas con las variables 1, 2, 3, 4, 5, 6 (en bosques) ¿Cómo se relaciona el área de conservación de las fincas con la biodiversidad de plantas, escarabajos y aves?.
H0: No existe relación H1: A mayor área de conservación, mayor será la biodiversidad de plantas, escarabajos y aves.
Podríamos hacer un árbol de regresión. Correlación Pearson o Spearman si no es normal. GLM para mirar relación. Variable área: con riqueza y con abundancia.
p <- ggplot(base_full, aes(RE_UT_1_2, Porcent_Area_UT_1_2)) +
geom_point() +
geom_smooth(method = "glm") # +
# facet_grid(Orientacion_hato_SPP ~ .)
cors <- base_full %>%
# group_by(Orientacion_hato_SPP) %>%
summarise(cor = round(
cor(RE_UT_1_2, Porcent_Area_UT_1_2, method ="pearson",
use="pairwise.complete.obs"), 2))
# p + geom_text(data=cors, aes(label=paste("r=", cor, sep="")), x=4, y=61)
p + stat_cor(method = "pearson", label.x = 4, label.y = 60)
RTA: no hay relacion entre área de conservación de las fincas en usos 1 y 2 con la riqueza de escarabajos.
Información de la sesión en R
session_info()## - Session info ----------------------------------------------------------
## setting value
## version R version 3.4.0 (2017-04-21)
## os Windows 10 x64
## system x86_64, mingw32
## ui RTerm
## language (EN)
## collate Spanish_Colombia.1252
## ctype Spanish_Colombia.1252
## tz America/Bogota
## date 2019-01-18
##
## - Packages --------------------------------------------------------------
## ! package * version date lib
## assertthat 0.2.0 2017-04-11 [1]
## backports 1.1.2 2017-12-13 [1]
## bayesplot 1.6.0 2018-08-02 [1]
## bindr 0.1.1 2018-03-13 [1]
## bindrcpp * 0.2.2 2018-03-29 [1]
## broom * 0.5.0 2018-07-17 [1]
## carData 3.0-1 2018-03-28 [1]
## cellranger 1.1.0 2016-07-27 [1]
## cli 1.0.1 2018-09-25 [1]
## coda 0.19-1 2016-12-08 [1]
## codetools 0.2-15 2016-10-05 [2]
## coin 1.2-2 2017-11-28 [1]
## colorspace * 1.3-2 2016-12-14 [1]
## corrplot * 0.84 2017-10-16 [1]
## crayon 1.3.4 2017-09-16 [1]
## data.table 1.11.8 2018-09-30 [1]
## digest 0.6.17 2018-09-12 [1]
## dplyr * 0.7.6 2018-06-29 [1]
## DT * 0.4 2018-01-30 [1]
## effects 4.0-2 2018-06-19 [1]
## emmeans 1.2.3 2018-07-18 [1]
## estimability 1.3 2018-02-11 [1]
## evaluate 0.11 2018-07-17 [1]
## forcats * 0.3.0 2018-02-19 [1]
## foreign 0.8-67 2016-09-13 [2]
## ggeffects 0.5.0 2018-08-11 [1]
## ggplot2 * 3.0.0 2018-07-03 [1]
## ggpubr * 0.2 2018-11-15 [1]
## ggridges 0.5.0 2018-04-05 [1]
## glmmTMB 0.2.2.0 2018-07-03 [1]
## glue 1.3.0 2018-07-17 [1]
## gtable 0.2.0 2016-02-26 [1]
## haven 1.1.2 2018-06-27 [1]
## highr 0.7 2018-06-09 [1]
## hms 0.4.2 2018-03-10 [1]
## htmldeps 0.1.1 2018-08-27 [1]
## htmltools 0.3.6 2017-04-28 [1]
## htmlwidgets 1.2 2018-04-19 [1]
## httr 1.3.1 2017-08-20 [1]
## jsonlite 1.6 2018-12-07 [1]
## kableExtra * 0.9.0 2018-05-21 [1]
## knitr * 1.20 2018-02-20 [1]
## labeling 0.3 2014-08-23 [1]
## lattice 0.20-35 2017-03-25 [1]
## lazyeval 0.2.1 2017-10-29 [1]
## lme4 1.1-18-1 2018-08-17 [1]
## lubridate 1.7.4 2018-04-11 [1]
## magrittr * 1.5 2014-11-22 [1]
## MASS 7.3-47 2017-02-26 [2]
## Matrix 1.2-14 2018-04-09 [1]
## minqa 1.2.4 2014-10-09 [1]
## mnormt 1.5-5 2016-10-15 [1]
## modelr 0.1.2 2018-05-11 [1]
## modeltools 0.2-22 2018-07-16 [1]
## multcomp 1.4-8 2017-11-08 [1]
## munsell 0.5.0 2018-06-12 [1]
## mvtnorm 1.0-8 2018-05-31 [1]
## nlme 3.1-137 2018-04-07 [1]
## nloptr 1.0.4 2014-08-04 [1]
## nnet 7.3-12 2016-02-02 [2]
## openxlsx * 4.1.0 2018-05-26 [1]
## pillar 1.3.1 2018-12-15 [1]
## pkgconfig 2.0.2 2018-08-16 [1]
## plyr 1.8.4 2016-06-08 [1]
## prediction 0.3.6 2018-05-22 [1]
## psych 1.8.4 2018-05-06 [1]
## purrr * 0.2.5 2018-05-29 [1]
## pwr 1.2-2 2018-03-03 [1]
## R6 2.3.0 2018-10-04 [1]
## Rcpp 1.0.0 2018-11-07 [1]
## readr * 1.1.1 2017-05-16 [1]
## readxl * 1.1.0 2018-04-20 [1]
## rlang 0.3.0.1 2018-10-25 [1]
## rmarkdown 1.10.12 2018-08-27 [1]
## rstudioapi 0.7 2017-09-07 [1]
## rvest 0.3.2 2016-06-17 [1]
## sandwich 2.5-0 2018-08-17 [1]
## scales 1.0.0 2018-08-09 [1]
## sessioninfo * 1.1.1 2018-11-05 [1]
## sjlabelled 1.0.13 2018-08-11 [1]
## sjmisc 2.7.4 2018-08-04 [1]
## sjPlot * 2.6.0 2018-08-23 [1]
## sjstats 0.17.0 2018-08-20 [1]
## snakecase 0.9.2 2018-08-14 [1]
## sp * 1.3-1 2018-06-05 [1]
## stringdist 0.9.5.1 2018-06-08 [1]
## stringi 1.2.4 2018-07-20 [1]
## stringr * 1.3.1 2018-05-10 [1]
## survey 3.33-2 2018-03-13 [1]
## survival 2.41-3 2017-04-04 [2]
## TH.data 1.0-9 2018-07-10 [1]
## tibble * 1.4.2 2018-01-22 [1]
## tidyr * 0.8.1 2018-05-18 [1]
## tidyselect 0.2.4 2018-02-26 [1]
## tidyverse * 1.2.1 2017-11-14 [1]
## D TMB 1.7.14 2018-06-23 [1]
## viridisLite 0.3.0 2018-02-01 [1]
## withr 2.1.2 2018-03-15 [1]
## xml2 1.2.0 2018-01-24 [1]
## xtable 1.8-3 2018-08-29 [1]
## yaml 2.2.0 2018-07-25 [1]
## zip 1.0.0 2017-04-25 [1]
## zoo 1.8-3 2018-07-16 [1]
## source
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.1)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.3)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.2)
## CRAN (R 3.4.1)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.3)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## Github (rstudio/htmldeps@c1023e0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.1)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.2)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## Github (rstudio/rmarkdown@6e56ad8)
## CRAN (R 3.4.1)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.3)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.0)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
## CRAN (R 3.4.4)
##
## [1] C:/Users/diego.lizcano/Documents/R/win-library/3.4
## [2] C:/Program Files/R/R-3.4.0/library
##
## D -- DLL MD5 mismatch, broken installation.