Allmän selektering: För samtliga sammanställningar (utom för antalet inrapporterade blanketter) har data begränsats till de fall där diagnosdatum ligger fr o m 2010-01-01 t o m 2011-12-31.
Denna information kommer inte att upprepas invid respektive frågeställning nedan.
Observera att det inte gjorts någon selektering på region, vilket kan ha betydelse då vi tittar på data från kirurgiblanketten!
OBS! För varje numrerat önskemål finns en rubrik och en kort refrens til vilken uppgift som avses. Den korta referensen innebär alltså inte att önskemålet i sig har förenklats (vilket det i vissa fall skulle kunna tolkas som)!
När en patient registreras i INCA hämtas vissa uppgifter från befolkningsregistret. Där framkommer till exempel en så kallad LKF-kod kopplat till personen. L = Län, K = kommun, F = församlingskod. Denna kod visar alltså var patientn vid tillfället var folkbokförd. Denna kod har ingen koppling till i vilken region patienten behandlades eller befann sig i vid det aktuella tillfället (studenter som pluggar i Göteborg men är skriva hos föräldrarna i Bastruträsk ses som bosatta i Bastuträsk).
Vi har i det följane flyttat patienter med länskod 4 och 19, dvs boendes i län Västmanland och Sörmland till region Sydöst. Gör vi en korstabell över boendelän och sjukvårdsregion så får vi följande:
## ------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Län Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ------------------------------------------------------------------------------
## 1 0 518 0 0 1 0 519
## 3 0 0 0 0 113 0 113
## 4 0 0 0 100 0 0 100
## 5 0 0 1 129 1 0 131
## 6 0 0 0 126 0 0 126
## 7 0 0 61 0 0 0 61
## 8 0 0 0 76 0 0 76
## 9 0 7 0 0 0 0 7
## 10 0 0 51 0 0 0 51
## 12 0 0 198 0 0 1 199
## 13 0 0 34 0 0 59 93
## 14 0 0 0 0 0 524 524
## 17 0 0 0 0 90 0 90
## 18 0 0 0 0 92 0 92
## 19 0 0 0 85 0 0 85
## 20 0 0 0 0 101 0 101
## 21 1 0 0 0 80 0 81
## 22 103 0 0 0 1 0 104
## 23 42 1 0 0 0 0 43
## 24 97 0 0 1 0 0 98
## 25 79 0 0 0 0 0 79
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## ------------------------------------------------------------------------------
Länskoderna översätts t ex här: http://sv.wikipedia.org/wiki/L%C3%A4n_i_Sverige
I de flesta fall finns alla länets patienter samlade i en sjukvårdsregion. Län 14 = Halland är ett “strukturellt undantag” där det officiellt går en skiljelinje inom länet mellan region väst och syd. I övrigt finns också några enstaka fall där personen kan ha flyttat mellan tiden för diagnos och behandling etc.
I vilket fall om helst kan vi nu konstatera att personer i län 4 och 19 nu ingår i region Sydöst (och inte Uppsala/Örebro). Detta gäller för hela rapporten!
Vi tittar på varje blankett separat.
Även om registret startade nationellt 2010 finns regioner som startade tidigare.
Observera att region väst började registrera fr o m september 2006 (2006 är alltså inget follständigt år).
Observera att det kan finnas fler än en kirurgblankett per patient, detsamma för recidiv.
Selektion:
Antal per region
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 2006 0 0 0 0 0 92 92
## 2007 0 0 0 0 0 232 232
## 2008 0 1 1 0 0 236 238
## 2009 0 55 6 7 0 273 341
## 2010 150 294 226 267 224 272 1433
## 2011 172 232 119 250 255 312 1340
## 2012 110 23 111 207 175 238 864
##
## Total 432 605 463 733 654 1667 4554
## ----------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 2007 0 0 0 0 0 1 1
## 2008 0 1 0 0 0 0 1
## 2009 0 13 2 1 0 39 55
## 2010 8 151 34 40 116 243 592
## 2011 12 191 45 31 85 289 653
## 2012 2 2 18 9 15 215 261
##
## Total 22 358 99 81 216 787 1563
## ----------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 2006 0 0 0 0 0 90 90
## 2007 0 0 0 0 0 226 226
## 2008 0 0 0 0 0 228 228
## 2009 0 50 4 7 0 272 333
## 2010 147 275 188 245 186 272 1313
## 2011 158 58 58 213 129 309 925
## 2012 27 5 30 146 51 159 418
##
## Total 332 388 281 623 366 1568 3558
## ----------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 2006 0 0 0 0 0 1 1
## 2007 0 0 0 0 0 3 3
## 2008 0 0 0 0 0 1 1
## 2009 0 5 0 1 0 3 9
## 2010 2 14 2 10 9 5 42
## 2011 1 4 0 4 3 3 15
## 2012 0 0 0 1 0 0 1
##
## Total 3 23 2 16 12 16 72
## ----------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 2006 0 0 0 0 0 91 91
## 2007 0 0 0 0 0 230 230
## 2008 0 0 1 0 0 234 235
## 2009 0 25 0 7 0 243 275
## 2010 140 140 75 233 168 228 984
## 2011 160 56 75 194 135 235 855
## 2012 47 3 29 73 24 65 241
##
## Total 348 225 183 521 327 1339 2943
## ----------------------------------------------------------------------------------
Hanteras separat.
Först vill jag redovisa fördelningen av olika ICD10-koder.
Totalt hela riket
## ------------------------------------------
## ICD antal andel
## ------------------------------------------
## 1 0.0
## C54.9 Adenosarcom 44 1.6
## C54.9 Annan morfologi 52 1.9
## C54.9 Carcinom 2476 89.3
## C54.9 Carcinosarcom 125 4.5
## C54.9 Leiomyosarcom 50 1.8
## C54.9 Stromacellssarcom 25 0.9
##
## Total 2773 100.0
## ------------------------------------------
Per region (med riket i marginalen)
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## ICD Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
## 0 0 0 0 0 1 1
## 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
##
## C54.9 Adenosarcom 7 3 8 14 9 3 44
## 2.2 0.6 2.3 2.7 1.9 0.5 1.6
##
## C54.9 Annan morfologi 5 13 10 9 14 1 52
## 1.6 2.5 2.9 1.7 2.9 0.2 1.9
##
## C54.9 Carcinom 279 479 300 463 421 534 2476
## 86.6 91.1 87.0 89.6 87.9 91.4 89.3
##
## C54.9 Carcinosarcom 21 20 16 15 22 31 125
## 6.5 3.8 4.6 2.9 4.6 5.3 4.5
##
## C54.9 Leiomyosarcom 6 9 8 10 9 8 50
## 1.9 1.7 2.3 1.9 1.9 1.4 1.8
##
## C54.9 Stromacellssarcom 4 2 3 6 4 6 25
## 1.2 0.4 0.9 1.2 0.8 1.0 0.9
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
Den bakomliggande processen är här att inrapportören anger klartext som sedan monitor omtolkar till en SNOMED-kod. Denna kod har jag nu ersatt tillbaka till klartext via en officiell kodnyckel.
Först visar jag fördelning av samtliga inrapporterade koder (med översättning till klartext). NA = Non available, vilket betyder att en ogiltig SNOMED-kod angivits:
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------------
## SNOMED antal andel
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------------
## 641: NA 1 0.0
## 80001: Ospecifierad malign/benign tumör 1 0.0
## 80003: Malign tumör ospecificerad 1 0.0
## 80103: Carcinom, malign epitelial tumör 5 0.2
## 80203: Odifferentierat carcinom eller cancer 19 0.7
## 80213: Anaplastisk cancer UNS 1 0.0
## 80703: Skivepitelcancer 1 0.0
## 81401: Misstänkt adenocarcinom UNS 3 0.1
## 81402: Adenocarcinom in situ 2 0.1
## 81403541: NA 2 0.1
## 81403: Adenocarcinom UNS 2238 80.7
## 82463: Neuroendokrina tumörer (oberoende av malignitetsangivelse) 1 0.0
## 82603: Papillärt adenocarcinom, UNS 3 0.1
## 82803: NA 1 0.0
## 83103: Klarcellig cancer 51 1.8
## 83801: Misstänkt endometrioid cancer 1 0.0
## 83803: Endometrioid cancer 35 1.3
## 84103: Talgkörtelcancer 1 0.0
## 84303: Mukoepidermoid cancer 1 0.0
## 84413: Kystadenocarcinom, seröst 22 0.8
## 84603: Seropapillär cancer 127 4.6
## 84613: Seropap adenoca peritoneum 1 0.0
## 84803: Mucinös (slembildande) cancer 5 0.2
## 85603: Adenoskvamös cancer 5 0.2
## 85703: Adenoakantom 1 0.0
## 88003: Odifferentierat sarkom, mesynkymal tumör 14 0.5
## 88013: Spolcelligt sarkom 1 0.0
## 88023: Jättecellssarkom 1 0.0
## 88903: Leiomyosarkom 46 1.7
## 89003: Rhabdomyosarkom 2 0.1
## 89303: Endometrialt stromacellssarkom 17 0.6
## 89313: Endometrialt stromacellssarkom, låggradigt (endolymfatisk stromamyos, endometrie 7 0.3
## 89333: Adenosarkom 4 0.1
## 89503: Müllersk blandtumör 40 1.4
## 89513: Mesodermal blandtumör 1 0.0
## 89803: Carcinosarkom 77 2.8
## 95813: Alveolärt mjukdelssarkom 1 0.0
## : NA 33 1.2
##
## Total 2773 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Sedan fanns önskemål om begränsning till enbart vissa koder:
Endometroida, klarcelliga, serösa.
Utifrån tabellen ovan (och med hjälp från Britt-Marie, som i sin tur rådfrågat Håkan Andersson) grupperar jag enligt följande:
## -------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## SNOMED Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## -------------------------------------------------------------------------------------
## Endometroida 267 450 286 417 376 477 2273
## 82.9 85.6 82.9 80.7 78.5 81.7 82.0
##
## Klarcelliga 3 10 2 8 11 17 51
## 0.9 1.9 0.6 1.5 2.3 2.9 1.8
##
## Serösa 6 25 3 28 34 31 127
## 1.9 4.8 0.9 5.4 7.1 5.3 4.6
##
## Övriga 46 41 54 64 58 59 322
## 14.3 7.8 15.7 12.4 12.1 10.1 11.6
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## -------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Eftersom det är väldigt små tal så skippar jag andelar eftersom jag upplever att det gör tabellen mer svåröverblickad men i detta fall inte ger så mkt
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## SNOMED Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------
## Ej angiven 3 1 7 3 10 7 31
## 1.2 0.4 3.4 0.8 3.8 1.5 1.7
##
## Ej tillämpligt 5 0 10 11 0 2 28
## 2.0 0.0 4.8 2.9 0.0 0.4 1.5
##
## Grad 1 104 117 108 143 155 155 782
## 41.1 41.1 51.9 38.3 59.2 32.8 42.2
##
## Grad 2 92 101 62 137 67 240 699
## 36.4 35.4 29.8 36.7 25.6 50.7 37.7
##
## Grad 3 47 65 20 74 27 69 302
## 18.6 22.8 9.6 19.8 10.3 14.6 16.3
##
## Odifferentierad/anaplastisk 2 1 1 5 3 0 12
## 0.8 0.4 0.5 1.3 1.1 0.0 0.6
##
##
## Total 253 285 208 373 262 473 1854
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Detta är en tabell över om datum för Fraktionerad abratio inns eller inte finns för de fall där diagnosdatum och operationsdatum sammanfaller (med en differens på max en dag).
## ---------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Fraktionerad_abratio Region Region Region Region Region Region Total
## Sthlm/Gotland Väst Sydöstra Norr Uppsala/Örebro Syd
## ---------------------------------------------------------------------------------------------
## Datum finns 2 16 1 0 5 1 25
## 1.7 18.6 20.0 0.0 27.8 10.0 10.3
##
## Datum saknas 115 70 4 7 13 9 218
## 98.3 81.4 80.0 100.0 72.2 90.0 89.7
##
##
## Total 117 86 5 7 18 10 243
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ---------------------------------------------------------------------------------------------
Detta är en tabell över om datum för endometribiopsi inns eller inte finns för de fall där diagnosdatum och operationsdatum sammanfaller (med en differens på max en dag).
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Endometribiopsi Region Region Region Region Region Region Total
## Sthlm/Gotland Väst Sydöstra Norr Uppsala/Örebro Syd
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## Datum finns 7 14 2 0 4 5 32
## 6.0 16.3 40.0 0.0 22.2 50.0 13.2
##
## Datum saknas 110 72 3 7 14 5 211
## 94.0 83.7 60.0 100.0 77.8 50.0 86.8
##
##
## Total 117 86 5 7 18 10 243
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Här kommer också en tabell om huruvida minst ett (men inte nödvändigtvis båda) av datumen ovan finns.
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Endometribiopsi Region Region Region Region Region Region Total
## Sthlm/Gotland Väst Sydöstra Norr Uppsala/Örebro Syd
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## Båda saknas 108 59 2 7 9 4 189
## 92.3 68.6 40.0 100.0 50.0 40.0 77.8
##
## Minst ett finns 9 27 3 0 9 6 54
## 7.7 31.4 60.0 0.0 50.0 60.0 22.2
##
##
## Total 117 86 5 7 18 10 243
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Kummulativ ledtidsgraf per region
OBS! Här skrev vi även brachy men jag kan inte hitta detta i registret, varför jag bara utgår från första datum av KT/RT/ET
Selektion:
Kummulativ ledtidsgraf per region
Selektion:
Kummulativ ledtidsgraf per region
Kan faktiskt inte hitta några Brachy-variabler, varken i variabelförteckning eller i blanketterna (vet att det finns i andra register men inte just för corpus verkar det som)!
Histogram för åldersfördelning, för hela riket samt därefter uppdelat per region.
Här också en tabell som anger uppgifter per region:
## region_namn Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
## 1 Region Norr 37 61 69 69.1 79 95
## 2 Region Sthlm/Gotland 30 63 70 69.5 78 95
## 3 Region Syd 39 63 70 70.4 78 95
## 4 Region Sydöstra 31 62 70 70.0 78 96
## 5 Region Uppsala/Örebro 26 62 69 69.6 77 99
## 6 Region Väst 32 62 69 69.2 77 95
Selektion:
FIGO finns angivet antingen som kirurgiskt eller kliniskt.
Här kommer först fördelningen mellan de två:
## ----------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_typ Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------
## 3 0 0 0 0 0 3
## 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
##
## Kirurgisk 305 481 318 376 405 525 2410
## 94.7 91.4 92.2 72.7 84.6 89.9 86.9
##
## Klinisk 14 45 27 141 74 59 360
## 4.3 8.6 7.8 27.3 15.4 10.1 13.0
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------
Detta är fördelningen för kirurgiskt FIGO-stadium.
Tabellen blir väldigt stor och svår att överblicka om andelar inkluderas, därav enbart antal.
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## 16 45 27 141 74 59 362
## IA 163 291 168 157 181 326 1286
## IB 70 90 68 105 118 86 537
## IC 2 1 2 4 2 1 12
## II 23 44 15 39 32 30 183
## IIA 0 0 1 0 1 0 2
## IIB 1 0 2 3 1 0 7
## IIIA 13 18 11 12 24 16 94
## IIIB 5 12 8 8 5 22 60
## IIIC 0 0 2 1 3 0 6
## IIIC1 3 4 10 8 4 14 43
## IIIC2 2 1 11 9 6 5 34
## IIICX 1 1 1 5 2 1 11
## IIIX 0 0 1 0 1 0 2
## IVA 4 0 1 0 2 2 9
## IVB 11 14 13 22 15 22 97
## IVX 1 1 1 1 1 0 5
## IX 1 0 0 2 1 0 4
## X 6 4 3 0 6 0 19
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Samma uppgifter men nu grupperade i grövre stadium:
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## I 236 382 238 268 302 413 1839
## 73.3 72.6 69.0 51.8 63.0 70.7 66.3
##
## II 24 44 18 42 34 30 192
## 7.5 8.4 5.2 8.1 7.1 5.1 6.9
##
## III 24 36 44 43 45 58 250
## 7.5 6.8 12.8 8.3 9.4 9.9 9.0
##
## IV 16 15 15 23 18 24 111
## 5.0 2.9 4.3 4.4 3.8 4.1 4.0
##
## saknas/X 22 49 30 141 80 59 381
## 6.8 9.3 8.7 27.3 16.7 10.1 13.7
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Detta är fördelningen för kliniskt FIGO-stadium.
Denna tabell skulle vara lättare att överblicka med andelar än för kirurgisk do men då antalen är så små känns det ändå naturligare med bara antal.
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## 295 466 323 382 408 526 2400
## IA 12 23 10 44 27 14 130
## IB 4 13 0 22 12 9 60
## II 4 2 3 16 2 3 30
## III 2 6 1 6 7 15 37
## IVA 1 0 1 2 2 1 7
## IVB 1 5 3 11 8 15 43
## IVX 0 0 0 0 2 0 2
## IX 0 0 2 34 10 0 46
## X 3 11 2 0 1 1 18
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Samma uppgifter men nu grupperade i grövre stadium:
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## I 16 36 12 100 49 23 236
## 5.0 6.8 3.5 19.3 10.2 3.9 8.5
##
## II 4 2 3 16 2 3 30
## 1.2 0.4 0.9 3.1 0.4 0.5 1.1
##
## III 2 6 1 6 7 15 37
## 0.6 1.1 0.3 1.2 1.5 2.6 1.3
##
## IV 2 5 4 13 12 16 52
## 0.6 1.0 1.2 2.5 2.5 2.7 1.9
##
## saknas/X 298 477 325 382 409 527 2418
## 92.5 90.7 94.2 73.9 85.4 90.2 87.2
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Här avses i första hand kirurgiskt stadium men i fall detta saknas har det ersatts av kliniskt stadium ist.
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## 6 10 5 9 5 5 40
## IA 169 301 178 199 206 338 1391
## IB 71 99 68 127 130 93 588
## IC 2 1 2 4 2 1 12
## II 24 46 18 55 34 33 210
## IIA 0 0 1 0 1 0 2
## IIB 1 0 2 3 1 0 7
## III 0 4 1 6 7 15 33
## IIIA 13 18 11 12 24 16 94
## IIIB 5 12 8 8 5 22 60
## IIIC 0 0 2 1 3 0 6
## IIIC1 3 4 10 8 4 14 43
## IIIC2 2 1 11 9 6 5 34
## IIICX 1 1 1 5 2 1 11
## IIIX 0 0 1 0 1 0 2
## IVA 5 0 2 2 4 3 16
## IVB 12 19 16 33 23 37 140
## IVX 1 1 1 1 3 0 7
## IX 1 0 2 35 11 0 49
## X 6 9 5 0 7 1 28
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Samma uppgifter men nu grupperade i grövre stadium:
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## FIGO_kirurgiskt Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------
## I 236 382 238 268 302 413 1839
## 73.3 72.6 69.0 51.8 63.0 70.7 66.3
##
## II 24 44 18 42 34 30 192
## 7.5 8.4 5.2 8.1 7.1 5.1 6.9
##
## III 24 36 44 43 45 58 250
## 7.5 6.8 12.8 8.3 9.4 9.9 9.0
##
## IV 16 15 15 23 18 24 111
## 5.0 2.9 4.3 4.4 3.8 4.1 4.0
##
## saknas/X 22 49 30 141 80 59 381
## 6.8 9.3 8.7 27.3 16.7 10.1 13.7
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Jag tar denna information från variabeln i början av blk 3 som frågar om “Primär terapeutisk kirurgi”
## --------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Primärkirurgi Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------------------------
## 18 193 99 61 165 3 539
## 5.6 36.7 28.7 11.8 34.4 0.5 19.4
##
## Ja 280 311 227 400 284 524 2026
## 87.0 59.1 65.8 77.4 59.3 89.7 73.1
##
## Nej 24 22 19 56 30 57 208
## 7.5 4.2 5.5 10.8 6.3 9.8 7.5
##
##
## Total 322 526 345 517 479 584 2773
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## --------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Jag tar denna information från variabeln i början av blk 3 som frågar om “Primär terapeutisk kirurgi”.
Först en tabell som visar samtliga val av behandling
## -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Primärkirurgi Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
## 0 1 0 0 0 0 1
## Adjuvant hormonell behandling 0 1 4 1 0 1 7
## Annan behandling 0 1 2 1 1 2 7
## Behandling ej indicerad 0 0 18 14 7 1 40
## Ej behandl pga dåligt AT 6 0 5 1 1 0 13
## Ej behandl pga pats önskan 1 0 6 1 0 0 8
## Kirurgi + kemoterapi 38 11 44 55 25 31 204
## Kirurgi + kemoterapi + radioterapi 31 49 5 40 11 99 235
## Kirurgi + radioterapi 43 103 2 19 40 170 377
## Kirurgi + radioterapi + kemoterapi 25 2 0 11 30 25 93
## Kirurgi enbart (blanketten klar) 135 143 140 256 169 185 1028
## Preoperativ radioterapi + kirurgi 0 0 0 0 0 1 1
## Radioterapi enbart 1 0 1 1 0 9 12
##
## Total 280 311 227 400 284 524 2026
## -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Men här också det som verkligen efterfrågas.
Med postoperativ behandlig menar vi nu ngt av följande:
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Primärkirurgi Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
## Enbart kirurgi 136 144 141 258 169 185 1033
## 49.1 46.5 73.4 67.0 61.2 36.2 52.9
##
## Postoperativ behandling 141 166 51 127 107 326 918
## 50.9 53.5 26.6 33.0 38.8 63.8 47.1
##
##
## Total 277 310 192 385 276 511 1951
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ------------------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
85+ år
Frågan utgår egentligen från kirurgidatum på bl 2 men eftersom det finns en fråga om kirurgi äv på blk 3 så utgår jag istf denna för att få med även de regioner som saknar kirurgiblankett.
## --------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Primärkirurgi Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------------------------
## Ej enbart ET 25 50 29 48 42 48 242
## 86.2 94.3 85.3 88.9 87.5 92.3 89.6
##
## Enbart ET 4 3 5 6 6 4 28
## 13.8 5.7 14.7 11.1 12.5 7.7 10.4
##
##
## Total 29 53 34 54 48 52 270
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## --------------------------------------------------------------------------------------
För sakens skull kommer här motsvarande tabell men inkluderar nu enbart de fall där blk 3 finns (tabell ovan utgick från samtliga anmälningar).
## --------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Primärkirurgi Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------------------------
## Ej enbart ET 23 29 23 39 22 48 184
## 85.2 90.6 82.1 86.7 78.6 92.3 86.8
##
## Enbart ET 4 3 5 6 6 4 28
## 14.8 9.4 17.9 13.3 21.4 7.7 13.2
##
##
## Total 27 32 28 45 28 52 212
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## --------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Selektionsvilkoret är lite komplicerat men uttrycks formellt så här (“&”“ = och, ”|“” = eller):
a_alder >= 85
& a_kirurfigostad_beskrivning == "IB"
&
( ( snomed_klartext_grupp == "Endometroida" & p_diffgradfigo_beskrivning == "Grad 3")
| snomed_klartext_grupp == "Klarcelliga"
| snomed_klartext_grupp == "Serösa"
)
“låg diffgrad” har alltså tolkats (efter kontakt med Håkan Andersson) som Grad 3.
Det visar sig vara enbart 7 registrerade kvinnor som uppfyller dessa urvalsvillkor.
Jag bedömmer därmed att det blir svårt att redovisa andelar, utan gör ist en tabell som visar antal per behandling och jag tar med samtliga givna behandlingar (vari de efterfrågade ingår)
## ------------------------------------------------------------------------------------------
## ------------------------Region------------------------
## Post_RT Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Uppsala/Örebro Väst
## ------------------------------------------------------------------------------------------
## 0 0 2 0 2
## Kirurgi + kemoterapi 1 0 0 0 1
## Kirurgi + radioterapi 0 1 0 0 1
## Kirurgi + radioterapi + kemoterapi 0 0 0 1 1
## Kirurgi enbart (blanketten klar) 0 0 1 0 1
## Radioterapi enbart 0 0 0 1 1
##
## Total 1 1 3 2 7
## ------------------------------------------------------------------------------------------
Efter kontakt med Enayat Mavadati (INCA-förvaltare) har jag förstått att uppdaterade dödsdatum ännu ej införts i INCA (det kommer men fortfarande lite oklart exakt när).
Vi utgår därför från dödsdatum angivna i uppföljningsblanketten.
Då det är relativt få i underlaget blev grafen väldigt otydlig uppdelad per region, varför jag tog hela landet samlat.
Selektion:
Tidpunkten för 3 månader (90 dagar) och 6 månader (180 dagar) har markerats i grafen med lodräta streckade linjer.
Andel som fortfarande lever x antal dagar efter diagnos (absoluta tal, ej relativt normalpopulation).
Selektion:
## --------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Uppfyller_minst_två Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------------------------------
## Ja 30 81 28 52 33 81 305
## 10.7 26.0 12.3 13.0 11.6 15.5 15.1
##
## Nej 250 230 199 348 251 443 1721
## 89.3 74.0 87.7 87.0 88.4 84.5 84.9
##
##
## Total 280 311 227 400 284 524 2026
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## --------------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
## ----------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Körtelutrymning Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ----------------------------------------------------------------------------------------------
## Ej lymförtelutrymning 1 1 0 1 0 1 4
## 2.0 1.3 0.0 1.2 0.0 1.0 1.1
##
## Körtelutrymning 3 12 13 55 18 34 135
## 5.9 15.2 72.2 66.3 40.0 35.1 36.2
##
## Uppgift saknas 47 66 5 27 27 62 234
## 92.2 83.5 27.8 32.5 60.0 63.9 62.7
##
##
## Total 51 79 18 83 45 97 373
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ----------------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## KT_behandling Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------
## Ja, paklitaxel/karboplatin 81 57 43 104 58 139 482
## 77.1 86.4 78.2 82.5 82.9 79.4 80.7
##
## Ja, övrigt 24 9 12 22 12 36 115
## 22.9 13.6 21.8 17.5 17.1 20.6 19.3
##
##
## Total 105 66 55 126 70 175 597
## 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0 100.0
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------
Selektion:
Jag är nu lite osäker på ifall dessa svarsalternativ skulle grupperas men jag tar med allt. Då blir det dock lite oöverskådligt med procentandelar också varför jag tar enbart antal.
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
## --------------------------------Region---------------------------------
## Kirurgiteknik Region Region Region Region Region Region Total
## Norr Sthlm/Gotland Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
## 0 1 0 0 0 0 1
## Kombinerad vaginal och laparoskopisk kirurgi 0 12 2 0 32 34 80
## Konvertering från laparoskopisk till öppen kirurgi 0 3 1 0 2 6 12
## Konvertering från vaginal till öppen kirurgi 0 0 0 0 1 1 2
## Laparoskopisk kirurgi enbart 0 4 2 0 1 6 13
## Robotassisterad laparoskopisk kirurgi 0 102 0 0 0 118 220
## Vaginal kirurgi enbart 0 1 0 3 2 9 15
## Öppen kirurgi 20 208 70 56 153 323 830
##
## Total 20 331 75 59 191 497 1173
## ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------