Allmän selektering: För samtliga sammanställningar (utom för antalet inrapporterade blanketter) har data begränsats till de fall där diagnosdatum ligger fr o m 2012-01-01 t o m 2012-12-31.
Denna information kommer inte att upprepas invid respektive frågeställning nedan.
Observera att det inte gjorts någon selektering på region, vilket kan ha betydelse då vi tittar på data från kirurgiblanketten!
OBS! För varje numrerat önskemål finns en rubrik och en kort refrens til vilken uppgift som avses. Den korta referensen innebär alltså inte att önskemålet i sig har förenklats (vilket det i vissa fall skulle kunna tolkas som)!
Vi tittar på varje blankett (alltså egentligen “registerpost”“, ej "originalhandling”, vilket kan vara flera) separat.
Observera att det i teorin kan finnas fler än en kirurgblankett per patient, detsamma för recidiv.
Selektion:
Antal per region
## --------------------------------------------------------------------
## -------------------------Region--------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Total
## Norr Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------
## 2011 0 1 0 0 4 5
## 2012 7 19 19 16 22 83
##
## Total 7 20 19 16 26 88
## --------------------------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## ---------------------------------------------------
## -----------------Region-----------------
## Diagnosår Region Region Region Total
## Syd Uppsala/Örebro Väst
## ---------------------------------------------------
## 2011 0 0 3 3
## 2012 3 2 18 23
##
## Total 3 2 21 26
## ---------------------------------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## --------------------------------------------------------------------
## -------------------------Region--------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Total
## Norr Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------
## 2011 0 1 0 0 1 2
## 2012 1 11 14 5 9 40
##
## Total 1 12 14 5 10 42
## --------------------------------------------------------------------
Selektion:
Finns ännu inga registrerade!
## ----------------------------
## -----Region------
## Diagnosår Region Total
## Syd
## ----------------------------
## 2011 1 1
##
## Total 1 1
## ----------------------------
Selektion:
Antal och andelar per region
## --------------------------------------------------------------------
## -------------------------Region--------------------------
## Diagnosår Region Region Region Region Region Total
## Norr Syd Sydöstra Uppsala/Örebro Väst
## --------------------------------------------------------------------
## 2011 0 0 0 0 1 1
## 2012 3 3 5 2 3 16
##
## Total 3 3 5 2 4 17
## --------------------------------------------------------------------
Hanteras separat.
Jag slänger in några deskriptiva mått också:
min/max = yngsta/äldsta pat
median = median
mean = medelvärde
1st/3rd Qu = första och tredje kvartil, dvs 25 resp 75 % av pat yngre (eller lika med) dessa åldrar
NA's = antal patienter för vilka åldersangivelse av ngn anledning saknas
## Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
## 31.0 69.0 76.0 73.9 82.0 95.0
Den bakomliggande processen är här att inrapportören anger “diagnosen” i klartext. Denna klartext tas inte med i redovisningen eftersom den kan skilja sig map tavfel [Sic! :-)] etc. Monitor översätter sedan denna beskrivning till en SNOMED-kod. Denna kod skrivs ut i tabellen före kolon. Sedan lägger jag på en beskrivande text hämtad från en officiell kodnyckel som används i cancerregistret i åtm region Väst (förmodligen är den nationell via SoS men jag vet faktiskt inte). I bästa fall bör den ursprungligt inmatade fritexten något så när överrensstämma med den officiella beskrivningen.
NA = Non Available, i just detta fall innebär det helt enkelt att information om både kod (och därmed per automatik) klartextöversättning saknas.
## ------------------------------------------------------------------
## SNOMED antal andel
## ------------------------------------------------------------------
## 80703: Skivepitelcancer 69 83.1
## 81403: Adenocarcinom UNS 1 1.2
## 85423: Morbus Paget (extramammärt) invasiv 4 4.8
## 87203: Malignt melanom UNS 4 4.8
## 88003: Odifferentierat sarkom, mesynkymal tumör 1 1.2
## 88323: Dermatofibrosarkoma protuberans 1 1.2
## 95083: Teratoid/rhabdoid tumör, atypisk 1 1.2
## NA: NA 2 2.4
##
## Total 83 100.0
## ------------------------------------------------------------------
Detta är fördelningen för FIGO-stadium så som den den inrapporterats.
## ------------------------
## FIGO antal andel
## ------------------------
## IA 9 10.8
## IB 29 34.9
## II 11 13.3
## IIIA 13 15.7
## IIIB 3 3.6
## IIIC 6 7.2
## IVA 1 1.2
## IVB 3 3.6
## X 8 9.6
##
## Total 83 100.0
## ------------------------
Samma uppgifter men nu grupperade i grövre stadium:
## ------------------------
## FIGO antal andel
## ------------------------
## I 38 45.8
## II 11 13.3
## III 22 26.5
## IV 4 4.8
## X 8 9.6
##
## Total 83 100.0
## ------------------------
Tom rad innebär att svaret är tomt (den första raden med 43 fall), dvs att frågan inte har besvarats (vilket tyder på att det i huvuda taget inte finns ngn primärbehandlingsblankett registrerad. Man skulle förstås kunna göra ett urval på detta och bara redovisa svar för befintliga blanketter. Jag resonerar dock somså att vi är intresserade av patienterna som hel grupp och att det då kan vara intressant även att redovisa hur många av dessa där variabeln helt saknas (men det är väl en smaksak).
## --------------------------
## Kirurgi antal andel
## --------------------------
## 43 51.8
## Ja 34 41.0
## Nej 6 7.2
##
## Total 83 100.0
## --------------------------
Jag utgår från behandlingsmodalitetsfrågan men ser att det inte finns några sekvenser angivna, antingen är frågan ej besvarad eller också har man valt “Ej använd”.
## ------------------------------
## Neoadjuvant antal andel
## ------------------------------
## 43 51.8
## Ej använd 40 48.2
##
## Total 83 100.0
## ------------------------------
Selektion:
## --------------------------------------------------
## KRT antal andel
## --------------------------------------------------
## 1 - första behandling i sekvens 1 16.7
## Ej använd 5 83.3
##
## Total 6 100.0
## --------------------------------------------------
Selektion:
## --------------------------------------------------
## KRT antal andel
## --------------------------------------------------
## 1 - första behandling i sekvens 2 33.3
## Ej använd 4 66.7
##
## Total 6 100.0
## --------------------------------------------------