$ brew install boost

して、

install.packages('Rcpp')
library(Rcpp)

sourceCpp(code = '
#include <Rcpp.h>
#include <boost/math/common_factor.hpp>  // one file, automatically found here

using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
int computeGCD(int a, int b) {
    return boost::math::gcd(a, b);
}

// [[Rcpp::export]]
int computeLCM(int a, int b) {
    return boost::math::lcm(a, b);
}'
)

で、

> a <- 6
> b <- 15
> cat( c(computeGCD(a,b), computeLCM(a,b)), "\n")
3 30 
> 
> a <- 96
> b <- 484
> cat( c(computeGCD(a,b), computeLCM(a,b)), "\n")
4 11616 

こうなる。

ベンチマーク

> library(rbenchmark)
> library(numbers)
> 
> a <- 962
> b <- 4842
> 
> benchmark(r1 = c(computeGCD(a,b), computeLCM(a,b)),
+           r2 = c(GCD(a,b), LCM(a,b)),
+           replications = 1000)
  test replications elapsed relative user.self sys.self user.child sys.child
1   r1         1000   0.009    1.000     0.008    0.001          0         0
2   r2         1000   0.088    9.778     0.086    0.001          0         0

速い（numbers::GCDとか実装見てないけど）。