MicroRNAs que tienen como blanco a KAT2B

Alexandra Garcia
Octubre, 2017

Analisis de Datos

  • miRNAs
  • Son RNAs no codificantes que regulan la traduccion de transcritos. Poseen miles de blancos
  • Actualmente son estudiados en multiples modelos, y han sido descritos como marcadores de diversas patologias
  • Se pueden estudiar por individual, cluster o por blanco

MiRNAs mecanismo de accion

Fig1. Mecanismo de accion de los miRNAs

Fig2. Mecanismo de accion de los miRNAs

Fig 1, 2. Mecanismo de accion de los miRNAs.

MicroRNAs que poseen como blanco a KAT2B

plot of chunk unnamed-chunk-1

Figura 2. Distribucion de miRNAs (seed match vs context score) relativo a su afinidad al blanco KAT2B. Rojo: 7mer-1A, Verde: 7mer-m8 y Azul: 8mer.

Ranking mejor match miRNA::KAT2B

miRNA seed match context score
rno-miR-32-5p 8mer -0.45
rno-miR-363-3p 8mer -0.47
rno-miR-25-3p 8mer -0.46
rno-miR-1-5p 8mer -7.0000000000000007E-2

Tabla 1. Ranking de los microRNAs con el mejor seed match (8mer) y context score > -0.4 asociados al blanco KAT2B.

A partir de todos los miRNAS (mas de 2000), se seleccionaron unos pocos mediante el filtro de seed match y context score. Los miRNAs totales que fueron seleccionados son = 4

GRACIAS! :)