Introducció a l'R
7 de juny de 2012
Lluís Ramon
Introducció a l'R
Que és l'R?
- L'
Rés una implementacó del llenguatge de programació específic d'estadística S - Ideat per Ross Ihaka and Robert Gentleman a la Universitat d'Auckland, New Zealand
- L'origen és del 1993 i a partir de l'any 2000 els seus desenvolupadors el consideren estable
- Funciona per línia de comandes però existeixen diverses interfícies gràfiques
Avantatges
Des del meu punt de vista les grans virtuts de l'R són:
- 'Free'
- Multi-plataforma
- Programable
- 'Reproducible Research'
- La comunitat d'usuaris d'R
- Llibreries gràfiques
La comunitat d'usuaris d'R
- Es calcula que hi ha més de 2 M d'usuaris
- Creixement exponencial del nombre de llibreries (mes de
4500) a l'any 2010 (~ 2000) - Ahir (6-6-12) es van publicar 3 nous packages i es van actualitzar 13
- Disciplines completament diverses
- Suport i voluntat de compartir entre tothom
Llibreries gràfiques
Algunes llibreries que em semblen interessants
- ggplot2
- RgoogleMaps
- igraph
- wordcloud
- ... molíssims més
ggplot2
RgoogleMaps
## [1] "http://maps.google.com/maps/api/staticmap?center=41.4,2.155&zoom=12&size=640x640&maptype=map&format=png32&sensor=true"
igraph
wordcloud
CRAN
The Comprehensive R Archive Network, el CRAN, és el repositori on es pot descarregar l'R i on es publiquen les darreres actualitzacions.
Allà també pots baixar les llibreries que els diferents desenvolupadors comparteixen. Aquestes llibreries cal que passin un controls del CRAN comprovant que tot funciona correctament.
També hi ha The R Journal on es presenten novetat i canvis a l'R. Així com manuals i altra documentació relacionada i útil.
Interfícies gràfiques
Per defecte l'R ja ve amb una interfície gràfica Base, tot i que n'hi ha d'altres millors. Personalment recomano les següents:
RStudio: Per treballar al dia dia quan ja es té una mica de soltura
Rcmdr: Per començar a perdre la por a l'R
On ampliar més informació?
- Sobre una funció concreta, a l'R, utilitzar
?(p.ex.?mean) - Google -> Cercar am
"R-help"o utilitzar el motor de cerca Rseek - Manuals al
CRANhi ha un apartat Manuals oficials o els contribuits pels usuaris d'R - R-Bloggers (agregador de més de 300 blocs d'R)
- Bloc de RUGBCN
On demanar ajuda?
- Al Google Group de RUGBCN
- A la llista d'ajuda en castellà
- A la llista d'ajuda en anglès
- Si el problema és d'una llibreria concreta, envia al desenvolupador o a la llista específica que tingui, p. ex. si tens un problema amb ggplot2 seria convenient escriure a la llista de ggplot2
Com demanar ajuda?
Si l'únic que preguntes és la funció ddply no em funciona, què passa? la resposta que rebràs no serà de gaire utilitat ja que sense més pistes no es pot deduir el problema que tens i per tant la solució. Al correu hauries de comentar el següent:
- Quin
sistema operatiu - Quina
versióde l'R fas servir - Afegeix el
codi necessariper entendre el problema. - Inclou un petit conjunt o equivalent de les
dadesnecesàries ( opció utilitzar?dputa l'script) - Si fas servir alguna
llibreriaconcreta, afegeix-la al codi
Exemple Reproduïble
Un bon exemple, és el correu enviat per l'Andreu al grup amb un dubte de ggplot2
library(ggplot2) g <- expand.grid(x = seq(0,5), y = seq(0,5)) # Fem un data.frame de prova A <- data.frame(x = g$x,y = g$y,z = rnorm(36)) # Cap problema per dibuixar-los pA <- ggplot(A, aes(x,y, z = z)) pA + geom_tile(aes(fill = z)) + scale_x_continuous(expand=c(0,0)) + scale_y_continuous(expand=c(0,0)) # Posem uns quants valors a NA # (faig servir una condició qualsevol) B <- A B[which(abs(B$z) > 0.8),]$z <- NA # Es dibuixen tots dos sense cap problema pB <- ggplot(B, aes(x,y, z = z))