Lista över installerade paket på INCA

Denna lista är helt enkelt bara kopierad från listan Christian skickade (som i sin tur var aktuell 2016-10-14).

pkgs<-
c("car", "caTools", "class", "cluster", "cmprsk", "codetools", "colorspace", "commentr", "compiler", "covr", "crayon", "curl", "datasets", "date", "DBI", "decoder", "dichromat", "digest", "dplyr", "DT2", "effects", "Epi", "evaluate", "fmsb", "foreign", "formatR", "Formula", "gdata", "ggplot2", "googleVis", "gplots", "graphics", "grDevices", "grid", "assertthat", "base", "base64enc", "bitops", "boot", "cairoDevice", "gridBase", "gridExtra", "gtable", "gtools", "highr", "Hmisc", "htmlTable", "httpuv", "httr", "incavis", "iterators", "itertools", "jsonlite", "KernSmooth", "lazyeval", "lubridate", "magrittr", "markdown", "MASS", "Matrix", "memoise", "methods", "mgcv", "mime", "munsell", "nlme", "nnet", "openssl", "parallel", "PKI", "plotrix", "plyr", "praise", "proto", "qcc", "R2HTML", "knitr", "KPL", "labeling", "lattice", "latticeExtra", "r2lh", "R6", "rccdates", "rccmisc", "RColorBrewer", "utils", "vcd", "withr", "xlsx", "xlsxjars", "XML", "xtable", "yaml", "zoo", "Rcpp", "RCurl", "relsurv", "reshape", "reshape2", "rex", "rJava", "RJSONIO", "RODBC", "rpart", "scales", "shiny", "shinyBS", "spatial", "splines", "stats", "stats4", "stringi", "stringr", "survival", "tcltk", "testthat", "tidyr", "tools", "translations")

Vilka paket finns i dagsläget på CRAN?

Detta ser man mha funktionen available.packages:

cran_pkgs <- names(as.data.frame(available.packages())$Package)

I denna lista finns (2016-10-14) 9336 paket.

Vilka av INCA:s paket finns inte på CRAN?

cran_pkgs <- names(as.data.frame(available.packages())$Package)

pkgs_not_on_cran <- pkgs[!pkgs %in% cran_pkgs]
pkgs_not_on_cran
##  [1] "compiler"     "datasets"     "DT2"          "graphics"    
##  [5] "grDevices"    "grid"         "base"         "incavis"     
##  [9] "methods"      "parallel"     "KPL"          "utils"       
## [13] "splines"      "stats"        "stats4"       "tcltk"       
## [17] "tools"        "translations"

r-base-paket

En del av dessa paket är helt enkelt inkluderade i R från början. Detta gäller:

base <- c("base", "compiler", "datasets", "grDevices", "graphics", "grid", 
          "methods", "parallel", "profile", "splines", "stats", "stats4", 
          "tcltk", "tools", "translations", "utils")

Denna lista kommer helt enkelt direkt från R:s källkod här: https://github.com/wch/r-source/tree/trunk/src/library

Övriga paket

Vilka paket blir då kvar som varken kommer med base-r eller CRAN?

pkgs_not_on_cran[!pkgs_not_on_cran %in% base]
## [1] "DT2"     "incavis" "KPL"

Dessa paket är mycket riktigt de paket som Christian nämner i mailet som våra egna. Vilket skulle bevisas!