Proyecto estrictamente académico (Estadística y Probabilidades, FIGEMPA – UCE). Datos: EarthChem PetDB (CC BY 4.0), descargados el 13/10/2026. Web del proyecto: https://crisrumiguano-art.github.io/geoquimica-earthchem-ml/
Se usa la base completa (159 760 análisis). Para cada par se toman solo las filas que tienen los dos datos: no se inventa ningún valor que falte.
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE, message = FALSE, warning = FALSE, fig.align = "center")
if (!file.exists("data/earthchem_limpio.csv.gz")) {
dir.create("data", showWarnings = FALSE)
download.file("https://github.com/crisrumiguano-art/geoquimica-earthchem-ml/raw/main/data/earthchem_limpio.csv.gz", "data/earthchem_limpio.csv.gz", mode = "wb")
}
base <- read.csv(gzfile("data/earthchem_limpio.csv.gz", encoding = "UTF-8"), check.names = FALSE)
dim(base)## [1] 159760 75
x = Zr (ppm) (variable independiente) e y = Hf (ppm) (variable dependiente). El hafnio es el «gemelo» del circonio: los dos se alojan en el circón y casi nunca se separan.
x <- base[["Zr (ppm)"]]
y <- base[["Hf (ppm)"]]
completos <- !is.na(x) & !is.na(y) & x > 0 & y > 0 # filas con los dos datos
x <- x[completos]
y <- y[completos]
length(x) # número de pares## [1] 20521
knitr::kable(head(data.frame(x, y), 10), caption = "Tabla N° 1: primeros 10 pares de valores (Zr (ppm), Hf (ppm))")| x | y |
|---|---|
| 155.00 | 4.290 |
| 118.00 | 3.040 |
| 66.14 | 2.620 |
| 84.50 | 2.930 |
| 34.60 | 0.960 |
| 155.86 | 4.570 |
| 121.00 | 3.260 |
| 131.50 | 3.300 |
| 0.05 | 0.014 |
| 251.80 | 5.170 |
knitr::kable(data.frame(variable = c("Zr (ppm)", "Hf (ppm)"), minimo = c(min(x), min(y)), media = c(mean(x), mean(y)),
maximo = c(max(x), max(y))), digits = 2, caption = "Tabla N° 2: resumen de los pares")| variable | minimo | media | maximo |
|---|---|---|---|
| Zr (ppm) | 0 | 159.93 | 3843.2 |
| Hf (ppm) | 0 | 4.44 | 5089.0 |
plot(x, y, pch = 16, cex = 0.4, col = rgb(0.22, 0.53, 0.9, 0.25), las = 1, log = "xy",
main = "Gráfica N° 1: Diagrama de dispersión", xlab = "Zr (ppm)", ylab = "Hf (ppm)")Con ejes logarítmicos los puntos forman una recta. En escala normal la correlación lineal es de apenas 0,15, porque unos pocos valores extremos (más de 10 000 ppm) dominan; en logaritmos todos los órdenes de magnitud pesan igual.
Una recta en ejes log-log es un modelo potencial, y = a·x^b: log y = log a + b·log x. Antes de elegir se probaron los cinco modelos con este par (prueba y error): el coeficiente de correlación de cada uno sale de la recta ajustada a las variables transformadas.
r_modelos <- c(lineal = cor(x, y), # y = a + b·x
potencial = cor(log(x), log(y)), # y = a·x^b -> log y = log a + b·log x
exponencial = cor(x, log(y)), # y = a·e^(b·x) -> log y = log a + b·x
logaritmico = cor(log(x), y), # y = a + b·ln x
polinomico = sqrt(summary(lm(y ~ x + I(x^2) + I(x^3)))$r.squared)) # y = a + b·x + c·x² + d·x³
knitr::kable(data.frame(modelo = names(r_modelos), r = round(r_modelos, 3), r2_porcentaje = round(r_modelos^2 * 100, 1)),
row.names = FALSE, caption = "Tabla N° 3: correlación de cada modelo con este par")| modelo | r | r2_porcentaje |
|---|---|---|
| lineal | 0.148 | 2.2 |
| potencial | 0.966 | 93.3 |
| exponencial | 0.528 | 27.9 |
| logaritmico | 0.085 | 0.7 |
| polinomico | 0.148 | 2.2 |
modelo <- lm(log(y) ~ log(x))
a <- exp(coef(modelo)[[1]]) # a = e^(intercepto)
b <- coef(modelo)[[2]] # exponente
c(a = a, b = b)## a b
## 0.04022313 0.90582030
plot(x, y, pch = 16, cex = 0.4, col = rgb(0.22, 0.53, 0.9, 0.25), las = 1, log = "xy",
main = "Gráfica N° 2: Regresión potencial", xlab = "Zr (ppm)", ylab = "Hf (ppm)")
curve(a * x^b, from = min(x), to = max(x), add = TRUE, col = "#d95926", lwd = 3)
legend("topleft", c("datos", "y = a·x^b"), col = c(rgb(0.22, 0.53, 0.9), "#d95926"),
pch = c(16, NA), lwd = c(NA, 3), bty = "n")El coeficiente de correlación de Pearson (r) mide qué tan fuerte es la relación: |r| cerca de 1 es fuerte. El coeficiente de determinación (r² en %) dice qué parte de la variación de y explica el modelo.
r <- cor(log(x), log(y))
r2 <- r^2 * 100
knitr::kable(data.frame(modelo = "potencial", r = round(r, 4), r2_porcentaje = round(r2, 2),
fuerza = ifelse(abs(r) >= 0.7, "fuerte", ifelse(abs(r) >= 0.4, "moderada", "débil"))),
caption = "Tabla N° 4: test de aprobación")| modelo | r | r2_porcentaje | fuerza |
|---|---|---|---|
| potencial | 0.9662 | 93.35 | fuerte |
residuo <- log(y) - log(a * x^b) # lo que el modelo no explica
plot(x, residuo, pch = 16, cex = 0.4, col = rgb(0.22, 0.53, 0.9, 0.25), las = 1, log = "x",
ylim = quantile(residuo, c(0.0025, 0.9975)), # sin el 0,5 % más extremo, para que se vea
main = "Gráfica N° 3: Residuos del modelo", xlab = "Zr (ppm)", ylab = "Residuo en logaritmo (ln y real - ln y del modelo)")
abline(h = 0, col = "#d95926", lwd = 2)El modelo exige x > 0 (no existe el logaritmo de cero ni de un negativo) y da siempre y > 0. Se aplica dentro del rango medido.
## x_debe_ser_mayor_que x_min_datos x_max_datos
## 0.000 0.002 3843.200
Si una roca tiene 150 ppm de Zr, ¿cuánto Hf se espera?
## [1] 3.763773
Entre Zr (ppm) e Hf (ppm) existe una relación que se representa con un modelo potencial: y = 0.0402·x^0.906, donde x es Zr (ppm) e y es Hf (ppm). La correlación es fuerte (r = 0.966): Hf (ppm) depende de Zr (ppm) en un 93.3 % y el 6.7 % restante se debe a otros factores que este modelo no considera. Si Zr (ppm) vale 150, se espera Hf (ppm) ≈ 3.76. La razón Zr/Hf es casi constante (alrededor de 40) en las rocas de la Tierra.