🎯 Pregunta de investigación
¿Existen diferencias significativas en el rendimiento promedio (kg/parcela) entre las variedades de tomate, controlando la variabilidad entre invernaderos (bloques)?

Tratamientos (variedades):

Río Grande Santa Clara Cherry Gold Beefsteak

Bloques: 4 invernaderos (Norte, Sur, Este y Oeste).

Réplicas: Una observación por combinación variedad × bloque (diseño balanceado).

El análisis se estructura de la siguiente forma:

  1. Hipótesis estadísticas
  2. Verificación de los supuestos del ANOVA
  3. Análisis de Varianza (modelo aditivo)
  4. Gráficos exploratorios
  5. Estadísticos descriptivos
  6. Comparaciones múltiples (post-hoc)
  7. Conclusiones

1. Hipótesis estadísticas

Efecto de las variedades (factor de interés)

  • H₀: μ_RíoGrande = μ_SantaClara = μ_CherryGold = μ_Beefsteak
    (No existen diferencias en el rendimiento medio entre las cuatro variedades de tomate)
  • H₁: Al menos una variedad tiene un rendimiento medio diferente

Efecto de los bloques (factor de control / ruido)

  • H₀: μ_Norte = μ_Sur = μ_Este = μ_Oeste
    (No existen diferencias entre los invernaderos)
  • H₁: Al menos un invernadero difiere de los demás

Modelo utilizado: Modelo aditivo (sin interacción)
\[ Y_{ij} = \mu + \tau_i + \beta_j + \varepsilon_{ij} \] donde \(\tau_i\) es el efecto de la variedad \(i\) y \(\beta_j\) es el efecto del bloque \(j\).

Nivel de significancia: α = 0.05

2. Verificación de los supuestos del ANOVA

Antes de interpretar los resultados del ANOVA es fundamental verificar:

  • Normalidad de los residuales
  • Homogeneidad de varianzas (homocedasticidad)
  • Independencia de las observaciones (asumida por la aleatorización dentro de bloques)

2.1 Normalidad de residuales

Prueba de Shapiro-Wilk

Shapiro-Wilk → valor-p = 0.6103
✅ No se rechaza la hipótesis de normalidad (p > 0.05). Los residuales se distribuyen de forma aproximadamente normal.

Gráfico Q-Q e Histograma

Diagnóstico de normalidad de residuales

Diagnóstico de normalidad de residuales

2.2 Homogeneidad de varianzas

Prueba de Levene

Levene → valor-p = 0.5224
✅ No se rechaza la homogeneidad de varianzas (p > 0.05). Se cumple el supuesto de homocedasticidad.

Residuales vs Valores Ajustados

Residuales vs valores ajustados

Residuales vs valores ajustados

✅ Conclusión de supuestos
Los residuales cumplen razonablemente los supuestos de normalidad y homogeneidad de varianzas. Es válido proceder con el ANOVA paramétrico del Diseño en Bloques Completos al Azar.

3. Análisis de Varianza (modelo aditivo)

Tabla de Análisis de Varianza – Diseño en Bloques Completos al Azar
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
variedad 3 311.7169 103.9056 398.6787 0e+00
bloque 3 21.4569 7.1523 27.4428 1e-04
Residuals 9 2.3456 0.2606 NA NA

Resultado del ANOVA – Variedades
Valor-p del factor variedad = 6.935e-10
✅ Existen diferencias estadísticamente significativas entre las medias de rendimiento de las variedades (p < 0.05), después de controlar la variabilidad entre invernaderos. Se procede a realizar comparaciones múltiples.

Efecto de los bloques (invernaderos)
Valor-p = 7.343e-05
Los bloques aportan variabilidad significativa. El uso del diseño en bloques fue efectivo para reducir el error experimental.

4. Gráficos exploratorios

4.1 Boxplot de rendimiento por variedad

Distribución del rendimiento según variedad de tomate

Distribución del rendimiento según variedad de tomate

4.2 Rendimiento por bloque (invernadero)

Distribución del rendimiento según invernadero (bloque)

Distribución del rendimiento según invernadero (bloque)

5. Estadísticos descriptivos

Estadísticos descriptivos por variedad de tomate
Variedad n Media DE EE Mín Máx CV (%)
Río Grande 4 50.400 1.761 0.880 48.2 52.1 3.493
Santa Clara 4 56.025 1.147 0.574 54.8 57.1 2.047
Cherry Gold 4 43.775 1.063 0.531 42.7 45.0 2.427
Beefsteak 4 51.975 1.546 0.773 50.1 53.6 2.974

📊 Lectura rápida
• Santa Clara presenta la media de rendimiento más alta.
• Cherry Gold muestra el rendimiento más bajo.
• El diseño está balanceado: cada variedad aparece una vez en cada invernadero.

6. Comparaciones múltiples (Post-hoc)

Dado que el ANOVA del factor variedad resultó significativo, se realizan pruebas de comparación de medias para localizar las diferencias (el factor bloque no se post-compara porque es factor de control).

6.1 Prueba de Tukey HSD

##   Tukey multiple comparisons of means
##     95% family-wise confidence level
## 
## Fit: aov(formula = rendimiento ~ variedad + bloque, data = datos)
## 
## $variedad
##                            diff         lwr        upr     p adj
## Santa Clara-Río Grande    5.625   4.4980674   6.751933 0.0000004
## Cherry Gold-Río Grande   -6.625  -7.7519326  -5.498067 0.0000001
## Beefsteak-Río Grande      1.575   0.4480674   2.701933 0.0080697
## Cherry Gold-Santa Clara -12.250 -13.3769326 -11.123067 0.0000000
## Beefsteak-Santa Clara    -4.050  -5.1769326  -2.923067 0.0000066
## Beefsteak-Cherry Gold     8.200   7.0730674   9.326933 0.0000000
Intervalos de confianza de las diferencias entre variedades (Tukey HSD)

Intervalos de confianza de las diferencias entre variedades (Tukey HSD)

6.2 Grupos de significancia (agricolae)

Grupos de significancia según Tukey HSD (letras distintas = diferencias significativas)
Media Grupo
Santa Clara 56.025 a
Beefsteak 51.975 b
Río Grande 50.400 c
Cherry Gold 43.775 d

6.3 Pruebas LSD y Duncan

## === Prueba LSD (Fisher) ===
## 
## Study: modelo ~ "variedad"
## 
## LSD t Test for rendimiento 
## 
## Mean Square Error:  0.260625 
## 
## variedad,  means and individual ( 95 %) CI
## 
##             rendimiento      std r        se      LCL      UCL  Min  Max    Q25
## Beefsteak        51.975 1.545693 4 0.2552572 51.39757 52.55243 50.1 53.6 51.075
## Cherry Gold      43.775 1.062623 4 0.2552572 43.19757 44.35243 42.7 45.0 43.000
## Río Grande       50.400 1.760682 4 0.2552572 49.82257 50.97743 48.2 52.1 49.400
## Santa Clara      56.025 1.147098 4 0.2552572 55.44757 56.60243 54.8 57.1 55.175
##               Q50    Q75
## Beefsteak   52.10 53.000
## Cherry Gold 43.70 44.475
## Río Grande  50.65 51.650
## Santa Clara 56.10 56.950
## 
## Alpha: 0.05 ; DF Error: 9
## Critical Value of t: 2.262157 
## 
## least Significant Difference: 0.8166121 
## 
## Treatments with the same letter are not significantly different.
## 
##             rendimiento groups
## Santa Clara      56.025      a
## Beefsteak        51.975      b
## Río Grande       50.400      c
## Cherry Gold      43.775      d
## 
## === Prueba de Duncan ===
## 
## Study: modelo ~ "variedad"
## 
## Duncan's new multiple range test
## for rendimiento 
## 
## Mean Square Error:  0.260625 
## 
## variedad,  means
## 
##             rendimiento      std r        se  Min  Max    Q25   Q50    Q75
## Beefsteak        51.975 1.545693 4 0.2552572 50.1 53.6 51.075 52.10 53.000
## Cherry Gold      43.775 1.062623 4 0.2552572 42.7 45.0 43.000 43.70 44.475
## Río Grande       50.400 1.760682 4 0.2552572 48.2 52.1 49.400 50.65 51.650
## Santa Clara      56.025 1.147098 4 0.2552572 54.8 57.1 55.175 56.10 56.950
## 
## Alpha: 0.05 ; DF Error: 9 
## 
## Critical Range
##         2         3         4 
## 0.8166121 0.8523390 0.8729197 
## 
## Means with the same letter are not significantly different.
## 
##             rendimiento groups
## Santa Clara      56.025      a
## Beefsteak        51.975      b
## Río Grande       50.400      c
## Cherry Gold      43.775      d

7. Conclusiones

  1. Los supuestos del ANOVA se cumplen de manera adecuada (normalidad y homogeneidad de varianzas). Los resultados del análisis paramétrico son válidos.
  2. Existen diferencias estadísticamente significativas entre las variedades de tomate en cuanto a rendimiento (p < 0.05), después de controlar la variabilidad entre invernaderos.
  3. El uso del Diseño en Bloques Completos al Azar permitió aislar la variabilidad debida a los invernaderos y obtener una prueba más precisa del efecto de las variedades.
  4. Según la prueba de Tukey HSD, las variedades se agrupan de la siguiente forma (letras distintas indican diferencias significativas a α = 0.05):
##             rendimiento groups
## Santa Clara      56.025      a
## Beefsteak        51.975      b
## Río Grande       50.400      c
## Cherry Gold      43.775      d
  1. La variedad Santa Clara presenta el mayor rendimiento promedio, mientras que Cherry Gold muestra el desempeño más bajo.
  2. Se recomienda priorizar la variedad Santa Clara en futuros ciclos de producción bajo condiciones similares de invernadero.