Este tutorial práctico está diseñado para guiar a estudiantes y jóvenes investigadores en el proceso riguroso y sistemático de diseñar, construir y ejecutar una estrategia de búsqueda de literatura biomédica en PubMed.
La búsqueda de información para revisiones de literatura o proyectos de investigación debe ser exhaustiva, reproducible y metodológicamente sólida. Para ilustrar este proceso, utilizaremos un caso de estudio real y muy relevante en salud pública y salud mental:
Pregunta de Investigación: ¿Cuál es la relación entre el uso de redes sociales y la calidad del sueño en adolescentes y adultos jóvenes? Diseño de Interés: Estudios transversales analíticos observacionales (Cross-Sectional Studies).
Para que una búsqueda sea exitosa, debemos descomponer nuestra pregunta clínica o epidemiológica en conceptos clave utilizando el enfoque de bloques temáticos:
El primer componente de nuestra “cuña” de búsqueda es el vocabulario controlado. En PubMed, esto se conoce como MeSH (Medical Subject Headings).
MeSH es un tesauro estructurado jerárquicamente por la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. (NLM). Al utilizar un término MeSH, PubMed recupera de forma uniforme todos los artículos indizados bajo ese concepto, independientemente de las palabras exactas que haya elegido el autor (por ejemplo, indexando bajo el MeSH de “neoplasias” artículos que usen “cáncer”, “tumor” o “neoplasia”).
Además, la búsqueda MeSH posee la propiedad de “explosión automática” (automatic explosion), lo que significa que buscar un término MeSH incluirá automáticamente todos los términos más específicos que se encuentren debajo de él en el árbol jerárquico.
Para identificar nuestros términos controlados, ingresamos a la base de datos de MeSH desde la página de inicio de PubMed o directamente en su portal.
Sleep Quality en MeSH. El descriptor oficial
es Sleep (o subconceptos como Sleep
Deprivation o Sleep Disorders).Cross-Sectional Studies en MeSH.Aunque MeSH es sumamente potente, no es suficiente para una búsqueda exhaustiva por dos motivos principales:
Los artículos de publicación muy reciente (ahead of print o en proceso de indización) aún no tienen asignados términos MeSH en la base de datos.
Los autores a veces emplean neologismos o terminología extremadamente específica que aún no se ha incorporado al tesauro MeSH.
Por ello, debemos complementar cada concepto con texto libre (palabras clave / keywords) que busquen en campos clave como el título y el resumen (abstract).
[tiab]Para limitar que PubMed busque nuestras palabras clave únicamente en
el título del artículo, su resumen y las palabras clave asignadas por el
autor, utilizamos la etiqueta [tiab]
(Title/Abstract) o su versión abreviada [ti] o
[tw] (Text Words).
"social media"[tiab],
"social network"[tiab],
"social networking"[tiab], "instagram"[tiab],
"facebook"[tiab], "tiktok"[tiab],
"twitter"[tiab], "youtube"[tiab]."sleep quality"[tiab], "sleep duration"[tiab],
"sleep deprivation"[tiab],
"sleep disturbance"[tiab],
"insomnia"[tiab]."cross-sectional"[tiab],
"observational"[tiab].Para capturar de forma eficiente variaciones de palabras (singulares,
plurales, variaciones gramaticales y sufijos), empleamos el
truncamiento mediante el asterisco
(*).
*:colo* es válido, pero cat* podría ser
demasiado corto o convertirse en espacio si PubMed no puede
procesarlo)."breast feed*" o
"social network*".network* \(\rightarrow\) Recupera: network,
networks, networking.sleep* \(\rightarrow\)
Recupera: sleep, sleeps, sleeping,
sleepiness.depriv* \(\rightarrow\) Recupera: deprive,
deprived, depriving, deprivation,
deprivations.disturb* \(\rightarrow\) Recupera:
disturbance, disturbances, disturbed,
disturbing.En ocasiones, buscar palabras clave de manera aislada con el operador
AND arroja mucho ruido. Por otro lado, buscar una frase
exacta entre comillas fijas puede ser demasiado restrictivo. PubMed
resuelve esto con la búsqueda de proximidad.
La estructura estándar de una búsqueda de proximidad es: \[\texttt{"término1 término2"[campo:~N]}\]
Donde: * "término1 término2": Dos o más
palabras encerradas entre comillas dobles. *
[campo]: El campo de búsqueda.
Solo está permitido en los campos Title
[ti], Title/Abstract [tiab], o Affiliation
[ad] (y sus versiones completas). *
N: El número máximo de palabras
intermedias permitidas entre los términos, sin importar el orden en que
aparezcan.
"social media"[tiab:~0]
buscará “social media” y “media social” de forma contigua.*) no es compatible con la búsqueda de
proximidad. Si intentas combinarlos (ej.
"social network*"[tiab:~1]), el operador de proximidad se
ignorará por completo."sleep quality"[tiab:~2] \(\rightarrow\) Recupera: “quality of sleep”,
“sleep quality”, “sleep and quality”."sleep disturbance"[tiab:~3] \(\rightarrow\) Recupera: “sleep
disturbances”, “disturbance of sleep”, “disturbed sleep pattern”."social media"[tiab:~0] \(\rightarrow\) Garantiza que las dos
palabras estén juntas, sin términos intermedios, pero en cualquier
orden.Con todas nuestras herramientas listas, es hora de construir los bloques individuales de búsqueda empleando los operadores booleanos AND, OR, NOT.
AND, OR, NOT). Si
se escriben en minúsculas, PubMed los ignorará o los tratará como texto
libre.(). PubMed resolverá primero el contenido de los
paréntesis internos y luego continuará hacia afuera, de igual manera que
en las operaciones matemáticas.Unifica los términos relacionados con trastornos, privación y calidad de sueño [15].
("Sleep"[Mesh] OR "Sleep Deprivation"[Mesh] OR "Sleep Wake Disorders"[Mesh] OR "sleep quality"[tiab] OR "sleep duration"[tiab] OR "sleep depriv*"[tiab] OR "sleep disturbance*"[tiab] OR "insomnia"[tiab])Focaliza la búsqueda hacia estudios transversales y observacionales en general.
("Cross-Sectional Studies"[Mesh] OR "Observational Studies as Topic"[Mesh] OR "cross-sectional"[tiab] OR "observational study"[tiab:~2] OR "observational"[tiab])Una vez que tenemos los tres bloques listos, realizamos la
intersección lógicamente estricta (AND)
entre ellos:
("Social Media"[Mesh] OR "social media"[tiab] OR "social network*"[tiab] OR "social networking"[tiab:~0] OR "instagram"[tiab] OR "facebook"[tiab] OR "tiktok"[tiab] OR "twitter"[tiab] OR "youtube"[tiab])
AND
("Sleep"[Mesh] OR "Sleep Deprivation"[Mesh] OR "Sleep Wake Disorders"[Mesh] OR "sleep quality"[tiab] OR "sleep duration"[tiab] OR "sleep depriv*"[tiab] OR "sleep disturbance*"[tiab] OR "insomnia"[tiab])
AND
("Cross-Sectional Studies"[Mesh] OR "Observational Studies as Topic"[Mesh] OR "cross-sectional"[tiab] OR "observational study"[tiab:~2] OR "observational"[tiab])Puedes ingresar esta estrategia de dos formas:
Copiar y pegar directamente la cadena completa en la caja de búsqueda de la pantalla principal de PubMed.
Utilizar el Advanced Search Builder (Constructor Avanzado):
Ve a la sección Advanced.
Introduce la cadena del Bloque 1 y haz clic en “Add to History”.
Haz lo mismo con el Bloque 2 y el Bloque 3 [130].
En la tabla de History, combina las búsquedas
utilizando sus identificadores numéricos (por ejemplo:
#1 AND #2 AND #3).
PubMed ofrece una robusta barra lateral izquierda con filtros que te permiten refinar los resultados por criterios predefinidos.
⚠️ ¡Cuidado! Muchos de los filtros avanzados de la barra lateral (como los de edad, sexo, especies o tipos específicos de estudios) funcionan basándose exclusivamente en la indización MeSH. Si aplicas el filtro “Observational Study” desde la barra lateral, PubMed añadirá de forma implícita el tag
[pt](Publication Type) o restrictores MeSH. Esto causará que se excluyan automáticamente todos los artículos muy recientes que aún se encuentran en fase de procesamiento (in process o publisher) y que no han sido indizados manualmente por los especialistas de MEDLINE.Recomendación para búsquedas exhaustivas: Si necesitas realizar una búsqueda sumamente exhaustiva (como en una revisión sistemática), es metodológicamente preferible no utilizar los filtros de la barra lateral y, en su lugar, incorporar los términos metodológicos y poblacionales directamente dentro de tu estrategia con operadores booleanos en texto libre, tal como hicimos en el Bloque 3.
Una vez que has ejecutado la búsqueda y tienes los resultados ideales en pantalla, es fundamental asegurar la reproducibilidad y el almacenamiento de los registros.
PubMed no exporta de manera nativa directa un archivo con la
extensión .ris desde su botón de descarga. En su lugar,
utiliza el formato estándar .nbib (MEDLINE/NCBI
format), el cual es perfectamente compatible y se convierte
automáticamente al formato RIS en cualquier gestor de referencias
bibliográficas.
.nbib (por ejemplo,
pubmed-SocialMedi-set.nbib).Para obtener tu archivo .ris final:
Abre tu gestor de referencias de preferencia (como Zotero, Mendeley o EndNote).
Haz clic en File \(\rightarrow\) Import y selecciona
el archivo .nbib descargado.
El gestor importará todos los metadatos de los artículos (autores, títulos, revistas, resúmenes, DOIs).
Selecciona la carpeta importada, haz clic derecho y elige “Export Library” (o “Exportar colección”).
En el formato de exportación, selecciona RIS y
guarda el nuevo archivo con la extensión .ris.
¡Listo! Ahora tienes tu archivo listo para plataformas de cribado como Rayyan o Covidence.