CAPÍTULO 4 - Pacotes Utilizados para Realizar Metanálises

No R, existem diversos pacotes disponíveis para conduzir metanálises. Abaixo estão alguns dos mais utilizados.

1. meta

Esse é um pacote abrangente para metanálise, incluindo funções para estimar e visualizar efeitos, testar heterogeneidade, ajustar modelos de metarregressão e realizar análises de subgrupos.

Como citar:

Balduzzi S, Rücker G, Schwarzer G (2019). How to perform a meta-analysis with R: a practical tutorial. Evidence-Based Mental Health, 153–160.

2. metafor

Outro pacote amplamente utilizado para metanálises. Ele oferece funções para calcular e visualizar efeitos, testar heterogeneidade, ajustar modelos de metarregressão, realizar análises de subgrupos e muito mais.

Como citar:

Viechtbauer W (2010). Conducting meta-analyses in R with the metafor package. Journal of Statistical Software, 36(3), 1–48.

3. rmeta

Este pacote oferece funções para metanálises univariadas e multivariadas, incluindo modelos de efeitos fixos e aleatórios.

4. metaBMA

Utiliza a abordagem Bayesian Model Averaging (BMA) para metanálises. Possui funções para estimar pesos de cada estudo, ajustar modelos de metarregressão e realizar análises de subgrupos.

5. netmeta

Pacote projetado para metanálises em redes de tratamento, permitindo comparar múltiplos tratamentos simultaneamente. Possui funções para calcular e visualizar efeitos, testar heterogeneidade e realizar análises de subgrupos.

Como citar:

Rücker G, Krahn U, König J, Efthimiou O, Davies A, Papakonstantinou T, Schwarzer G (2022). netmeta: Network Meta-Analysis using Frequentist Methods. R package version 2.7-0.

6. robust

Fornece métodos robustos para metanálises em situações onde há outliers ou estudos influentes. Inclui funções para calcular e visualizar efeitos, testar heterogeneidade e realizar análises de subgrupos usando métodos robustos.

7. dmetar

Este pacote foi desenvolvido para análises diagnósticas e metanalíticas de estudos de Differential Item Functioning (DIF) e Differential Test Functioning (DTF). Possui diversas funções para diferentes abordagens de metanálises, incluindo modelos de efeitos fixos e aleatórios, além de ferramentas para criar forest plots, funnel plots e outras visualizações gráficas.

Como citar:

Harrer, M., Cuijpers, P., Furukawa, T. & Ebert, D. D. (2019). dmetar: Companion R Package For The Guide ‘Doing Meta-Analysis in R’. R package version 0.0.9000.

Como instalar o pacote dmetar

Este pacote não está disponível no CRAN, mas pode ser instalado diretamente do GitHub usando o código abaixo.

# Instalar o pacote "devtools" caso ainda não esteja instalado

if (!require("devtools")) {
  install.packages("devtools")
}

# Instalar o dmetar a partir do GitHub

devtools::install_github("MathiasHarrer/dmetar")

Outros Pacotes Úteis

Além dos pacotes específicos para metanálises, há outros que auxiliam na manipulação de dados, visualização gráfica e leitura de arquivos.

1. readxl

Permite importar dados de arquivos do Excel para o R. Suporta os formatos .xls e .xlsx, podendo ler tanto planilhas individuais quanto um livro inteiro.

2. ggplot2

Um dos pacotes mais populares para criar gráficos de alta qualidade no R. Baseado na gramática de gráficos, permite criar diversos tipos de visualizações, como gráficos de dispersão, barras, linhas, entre outros.

3. tidyverse

Uma coleção de pacotes que trabalham juntos para facilitar a manipulação e visualização de dados no R.

Inclui pacotes como:

  • dplyr — manipulação de dados;
  • ggplot2 — visualização de dados;
  • tidyr — organização e estruturação de dados.

4. readr

Permite a importação rápida e eficiente de arquivos de texto delimitados (.csv, .tsv e outros formatos). É especialmente útil para lidar com grandes conjuntos de dados.

5. remotes

Facilita a instalação e o gerenciamento de pacotes R hospedados em repositórios remotos, como o GitHub.

6. grid

Fornece um sistema poderoso e flexível para criar e organizar objetos gráficos no R. É útil para gerar layouts personalizados e organizar elementos visuais em diferentes formatos.